Heatmap: Cluster_84 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

CoNekT
Gene
Fertile Leaflet with Sori
Primary Rachis
Secondary Rachis
Petiole
Crozier
Rhizome
Root
- - -3.35 -3.09 - - 2.76
- - - - - -4.41 2.8
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - -5.13 2.8
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - -1.43 2.73
- - - - - -3.75 2.79
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- -4.86 - -2.89 -3.89 -4.73 2.75
- - - -2.45 - -2.1 2.72
- - - - - - 2.81
Msp_g33717 (CAM3)
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - -3.8 2.79
- - - - - - 2.81
Msp_g33859 (UBQ11)
-3.91 -3.11 - -1.68 -2.21 - 2.65
Msp_g34300 (HTB11)
- -2.59 - -2.5 - - 2.73
Msp_g34332 (UBC11)
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
Msp_g34576 (MSI1)
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
Msp_g34718 (UBQ6)
- - - - - - 2.81
Msp_g34734 (TUA1)
- - - - - - 2.81
Msp_g34762 (HTA13)
-- -3.83 - - -2.7 2.76
- - - - - - 2.81
Msp_g34925 (CYP735A1)
- - - - - - 2.81
- -3.73 - - - -3.57 2.77
Msp_g34932 (CAX2)
- - - - - - 2.81
Msp_g34988 (XI-1)
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - -2.7 2.78
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
Msp_g35418 (ROC2)
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - -4.01 2.79
- - - - - - 2.81
Msp_g35542 (NF-YB12)
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
-1.43 - - - - - 2.73
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
Msp_g35867 (SYT5)
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
Msp_g35979 (CYP735A1)
- - - - - - 2.81
Msp_g36074 (B5 #4)
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
Msp_g36290 (UBQ11)
-2.26 -3.94 -2.39 -1.51 -2.85 -3.86 2.58
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
Msp_g36645 (CAX2)
- - - - - - 2.81
- - - - - -3.91 2.79
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - -4.77 2.8
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
Msp_g37063 (ATMAP4K ALPHA1)
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
Msp_g37125 (AR2)
- - - - - - 2.81
Msp_g37154 (BIP3)
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - -3.23 - - 2.79
-2.52 -2.48 -3.48 -2.88 -2.83 -2.4 2.61
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
Msp_g37346 (ATFP8)
- - - - - - 2.81
Msp_g37380 (PFL2)
- - - - - - 2.81
- -2.03 - - - - 2.76
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
-2.15 -1.68 -1.56 -2.0 -1.87 -2.54 2.44
- - - - - - 2.81
- - - - - -4.42 2.8
Msp_g37499 (CYP705A27)
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - -5.14 2.8
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - -3.29 -5.26 2.78
- - - - - - 2.81
Msp_g38162 (PKT4)
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
Msp_g38335 (S1P)
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - -4.46 2.8
- - - - - - 2.81
Msp_g38454 (AAc1)
- - - - -4.29 - 2.8
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
Msp_g38668 (ATRAB)
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
Msp_g38826 (SK11)
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - -5.11 2.8
- - - - - - 2.81
Msp_g38925 (HMG)
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- -6.47 - -3.73 - -6.28 2.79
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
Msp_g39294 (ATG8F)
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - -3.9 2.79
- - - - - - 2.81
- - -4.64 - - -4.61 2.79
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
Msp_g39613 (TRX1)
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - -5.63 2.8
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
-1.63 -2.9 -5.22 -3.74 -2.54 -2.27 2.6

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.