1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_166 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
Fertile Leaflet with Sori
Primary Rachis
Secondary Rachis
Petiole
Crozier
Rhizome
Root
44.45 27.12 34.75 28.34 29.63 31.5 22.36
58.63 29.37 41.15 29.03 40.44 33.95 18.98
Msp_g01433 (CEST)
 26.44 10.99 16.15 11.27 15.85 13.56 6.24
Msp_g02445 (FLN1)
 7.08 4.49 5.35 4.91 5.38 5.55 4.32
60.09 28.0 37.9 32.35 40.42 38.29 24.66
22.74 7.65 16.9 5.05 12.31 8.32 1.14
7.48 5.45 6.19 5.51 6.66 5.9 3.98
56.75 35.88 42.08 37.33 43.96 42.73 31.41
Msp_g06586 (DEGP2)
 11.79 5.84 7.21 6.81 9.72 6.44 3.96
Msp_g06679 (CCB1)
 11.39 5.65 6.98 5.75 9.37 6.01 2.51
Msp_g07054 (ACD2)
 17.11 11.49 13.5 10.02 12.88 11.43 9.13
Msp_g07278 (DDL)
 28.26 16.96 22.85 17.21 23.84 18.41 12.21
12.91 7.55 9.55 7.59 9.32 6.12 3.54
11.3 7.52 8.0 6.93 8.45 7.35 3.59
Msp_g08445 (GPX7)
 54.54 27.41 43.28 25.67 31.87 39.77 21.61
Msp_g08626 (GNL)
 13.65 7.66 9.68 8.3 9.48 8.67 5.75
Msp_g08717 (ACHT1)
 147.94 40.82 54.64 63.29 87.59 73.25 19.01
Msp_g08826 (OTP84)
 3.71 2.53 3.01 2.38 2.68 2.22 1.76
37.09 19.58 24.91 19.85 26.93 17.13 13.47
4.58 1.57 2.88 1.74 2.43 2.36 1.11
6.21 4.38 5.55 4.15 4.52 4.28 3.03
Msp_g10192 (SRX)
 53.2 24.56 33.79 24.45 36.06 21.91 15.55
61.4 37.78 51.45 36.81 49.26 34.8 14.55
14.12 8.99 10.38 9.22 9.1 9.79 6.64
Msp_g10945 (CLPX)
 17.57 8.81 13.56 9.3 10.65 12.12 7.63
Msp_g11273 (GCR1)
 27.75 20.08 21.95 20.28 20.97 22.41 17.61
26.76 13.27 18.32 13.39 15.91 18.14 10.62
Msp_g11460 (RRF)
 41.21 21.12 28.7 19.4 29.99 26.81 12.82
19.76 12.67 15.89 12.1 12.95 13.17 10.36
Msp_g11864 (FBX2)
 19.44 14.44 14.67 13.73 15.41 15.09 12.11
47.77 20.72 33.31 20.65 26.29 19.22 3.84
62.0 41.7 44.78 40.13 46.77 37.34 27.39
9.06 3.99 6.41 4.09 5.73 4.33 2.52
3.13 1.6 2.17 1.78 2.09 1.48 0.8
Msp_g14615 (OVA6)
 17.82 11.66 13.84 11.59 14.33 13.09 10.56
Msp_g15010 (emb2746)
 7.36 4.11 5.43 4.32 6.6 4.58 2.12
4.56 2.13 3.44 2.67 3.26 2.97 1.6
9.44 3.72 5.57 5.06 5.48 4.58 2.66
3.62 2.1 2.44 2.13 2.32 1.91 1.27
Msp_g18583 (TOC132)
 7.04 4.02 5.54 4.06 4.31 4.56 3.28
7.79 5.08 6.12 4.96 5.32 5.17 3.25
32.68 16.76 21.29 14.38 18.87 20.03 10.77
Msp_g19741 (HGL1)
 6.73 2.86 3.8 2.87 2.59 1.79 0.93
16.39 6.72 11.78 6.59 11.66 8.78 3.75
Msp_g20546 (BE2)
 10.86 6.51 9.48 6.41 7.3 8.66 4.78
9.93 3.88 7.78 4.35 6.22 5.42 3.02
5.63 3.53 3.81 3.04 3.26 3.16 1.73
7.7 1.93 3.17 1.46 2.45 0.89 0.08
4.19 1.64 2.68 1.98 2.63 1.39 1.02
10.89 3.43 8.41 3.68 6.15 6.59 2.49
7.78 5.56 6.43 5.58 5.54 4.64 4.39
54.36 29.25 38.14 28.79 36.73 33.17 19.53
15.03 10.25 11.14 10.38 11.87 10.31 7.69
18.52 6.26 11.0 5.78 10.93 8.66 3.42
9.73 5.28 6.02 5.17 5.74 4.48 3.36
29.94 19.51 23.82 19.48 19.8 23.66 16.12
Msp_g26023 (DUF3)
 27.93 18.54 22.56 18.7 21.83 16.43 12.73
Msp_g26664 (OTP84)
 5.12 2.27 3.04 2.18 2.49 1.6 0.71
Msp_g26975 (CRK42)
 120.84 34.82 66.43 37.54 59.04 34.68 5.02
23.79 13.27 16.53 13.35 15.01 13.72 10.69
5.48 3.91 4.07 4.2 4.18 3.94 3.43
Msp_g31293 (RNL)
 9.28 6.17 7.51 6.74 7.02 6.18 4.91
Msp_g31518 (NAP8)
 5.17 2.45 2.8 2.25 2.88 1.99 1.2
Msp_g31558 (DFB)
 6.93 3.94 5.04 3.76 5.24 3.91 2.87
Msp_g32185 (SAMT1)
 10.53 5.63 7.68 6.16 6.64 6.88 4.56
Msp_g32772 (FdC2)
 79.94 51.66 58.56 51.37 57.72 45.13 28.09
22.9 4.08 12.19 4.72 12.52 6.28 0.67
Msp_g36232 (GLK1)
 28.27 10.99 17.84 10.18 12.68 12.89 6.37
Msp_g38859 (SSI)
 22.5 7.02 16.01 7.18 14.78 10.05 3.42
9.46 5.56 6.65 5.43 7.56 6.01 4.08
Msp_g40400 (ZDS)
 8.81 5.49 7.66 5.34 6.34 5.51 4.65
2.29 1.06 1.27 0.97 1.12 1.19 0.64
7.59 4.74 5.99 4.75 5.02 4.9 3.39
12.96 7.5 9.2 8.11 10.85 8.99 5.13
Msp_g42677 (PHS2)
 22.85 14.8 16.3 15.55 15.76 15.12 9.86
Msp_g44014 (VAC1)
 3.62 2.06 2.28 1.83 2.54 1.92 1.51
9.19 4.12 5.07 3.83 6.26 3.33 0.36
3.55 0.89 2.1 0.87 1.17 1.82 0.8
9.39 2.69 4.28 4.7 5.22 4.02 1.72
6.84 4.25 5.09 4.09 5.15 3.8 3.44
Msp_g47300 (FFC)
 18.23 12.64 14.0 12.89 14.77 12.39 8.92

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)