Heatmap: Cluster_90 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Fertile Leaflet with Sori
Primary Rachis
Secondary Rachis
Petiole
Crozier
Rhizome
Root
-4.96 -5.78 -6.59 -5.81 -3.82 -3.97 2.76
- - - - -1.72 -4.45 2.73
Msp_g18274 (CCD8)
-4.6 -2.63 -4.2 -1.58 -6.45 -3.12 2.65
-3.23 -2.08 -3.36 -1.95 -3.82 -2.54 2.6
-3.77 -1.64 -2.98 -1.62 -6.38 -6.14 2.61
- -2.53 -5.7 -4.36 -3.98 - 2.74
-2.83 -3.9 -3.46 -3.45 -6.15 -3.59 2.7
-6.66 - - - -4.51 -1.85 2.74
- -3.18 -4.24 -2.58 -1.37 -2.45 2.61
Msp_g32529 (SLP2)
- -6.86 - - -6.7 -5.65 2.8
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
-3.4 -3.08 - -2.63 -2.34 - 2.68
-4.02 - - - -5.46 -5.36 2.78
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
-3.26 -2.96 - -2.62 -3.98 -2.53 2.67
Msp_g33595 (LRD2)
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
-3.76 - - -4.79 -2.44 -2.89 2.72
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- -2.02 -4.81 -4.67 -4.76 -3.45 2.71
-5.73 - - - - -4.2 2.79
Msp_g34534 (UGT85A7)
-4.07 -8.19 - - -3.81 -5.96 2.78
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
Msp_g35052 (scpl31)
-7.23 -9.23 - -9.6 -6.42 -3.56 2.79
- - - - - - 2.81
Msp_g35139 (CB5-A)
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - -8.67 2.81
- - - - - -3.42 2.79
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
-5.67 - -6.36 - - -6.09 2.8
- - - - - - 2.81
- - - - -2.86 - 2.78
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
Msp_g35609 (UGT85A7)
-5.95 -7.13 - -6.95 -3.37 -3.8 2.77
Msp_g35749 (ATL43)
- - - - - - 2.81
Msp_g35829 (STV1)
- - - - - - 2.81
Msp_g35839 (RGL)
-3.29 -3.85 -4.88 -4.86 -4.02 -4.71 2.74
Msp_g35998 (SVB)
-10.51 -10.67 -12.23 -10.83 -12.15 -10.51 2.81
-10.41 - - - -10.84 -10.37 2.81
Msp_g36005 (ADF9)
- - - - - - 2.81
Msp_g36038 (OLI7)
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- -10.49 - - - -9.36 2.81
- - - - - - 2.81
Msp_g36300 (MEK1)
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
-4.96 - - - -4.91 -4.71 2.79
- - - - - - 2.81
-3.83 -3.72 -4.47 -3.39 -3.21 -3.76 2.71
Msp_g36646 (CYP98A3)
-1.93 -2.5 -2.91 -2.13 -2.19 -2.24 2.53
- - - - - -6.1 2.8
Msp_g36746 (RAB)
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- -9.68 - - - -7.88 2.81
Msp_g36788 (UBQ11)
- -4.64 - -4.98 -6.6 - 2.79
Msp_g36832 (PUB17)
-4.65 -7.32 -5.96 -8.19 -6.39 -6.22 2.79
Msp_g36902 (TOR2)
-4.37 -2.73 -3.36 -2.94 -4.28 -4.37 2.69
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
Msp_g37066 (FATB)
- - - - - - 2.81
- - - - - -4.41 2.8
-4.29 - -7.25 - -6.37 -2.62 2.76
- - - - - - 2.81
Msp_g37167 (PDLZ2)
- - - - - - 2.81
-5.18 -4.34 -7.08 -4.95 -4.1 -2.99 2.74
- - - - - - 2.81
- -6.15 - -3.75 -5.12 - 2.78
-5.67 -7.88 -6.4 -5.72 - -7.72 2.8
-9.36 - - -7.79 - -7.81 2.81
- - - - - -5.27 2.8
- - - - - -5.48 2.8
Msp_g37998 (NUDT3)
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
Msp_g38154 (ARFA1B)
- -3.1 - - - - 2.78
- - - - - - 2.81
- - - - - -3.04 2.78
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
Msp_g38501 (CCD8)
-6.24 -6.15 -8.77 -9.38 -3.79 -3.96 2.77
-2.87 - -3.0 - -4.92 - 2.75
- - - - - - 2.81
Msp_g38511 (ROT3)
-7.56 -8.74 - -7.69 - -8.59 2.8
-3.53 -3.01 -2.7 -3.02 -3.11 -3.81 2.66
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
Msp_g38664 (CXE18)
-5.79 -5.16 -5.3 -5.41 -5.15 -4.54 2.77
- - - - - - 2.81
Msp_g38765 (SCR)
- -6.29 -5.4 - - - 2.8
- - - - - - 2.81
-4.09 -5.15 -4.26 -4.77 -5.2 -3.43 2.75
Msp_g38850 (GA5)
- -7.88 - -5.92 -6.85 -6.09 2.8
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
Msp_g38917 (CPH)
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - -7.48 2.81
-15.24 -4.1 -14.89 -3.4 -5.02 -17.33 2.77
- -5.31 -5.28 -5.18 - -3.67 2.77
- - - - - -6.16 2.8
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
Msp_g39297 (ATG8F)
- - - - - - 2.81
- - - - - -3.55 2.79
- - - - - - 2.81
Msp_g39397 (UGT85A7)
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
-4.13 -5.86 -6.08 -6.01 - -6.02 2.78
Msp_g39723 (GSTU25)
-7.92 - -9.05 - -8.09 - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
- - - - - - 2.81
-4.03 - -5.18 - - - 2.79
- -4.78 -2.85 - - - 2.77

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.