1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_9 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
Fertile Leaflet with Sori
Primary Rachis
Secondary Rachis
Petiole
Crozier
Rhizome
Root
14.86 0.32 0.25 0.88 27.42 20.53 6.97
Msp_g00225 (ROC7)
 117.55 78.12 70.05 77.15 154.82 204.33 136.39
9.85 5.52 5.88 6.37 10.65 10.47 7.74
8.05 5.42 5.69 5.91 11.1 9.9 8.14
44.77 33.05 33.39 32.44 45.7 49.98 42.05
3.26 0.02 0.04 0.03 5.53 4.92 0.21
7.27 5.54 5.55 5.51 9.12 8.34 6.77
1.98 0.08 0.6 0.47 3.58 4.15 0.99
3.62 0.0 0.0 0.0 7.61 9.11 1.46
53.06 46.15 44.34 46.29 83.86 79.43 56.83
32.68 19.02 19.78 19.51 33.02 36.04 26.64
3.83 0.05 1.22 0.1 4.6 4.25 1.02
10.95 4.15 5.15 3.54 17.48 19.24 8.22
4.45 0.58 0.21 0.67 7.71 8.91 2.3
45.82 21.66 23.97 22.88 52.28 51.89 28.17
Msp_g02452 (MAC3B)
 24.09 19.64 19.64 20.76 24.67 27.92 22.46
138.67 96.66 95.06 106.17 193.37 170.1 144.57
2.79 0.23 0.43 0.24 5.74 4.71 3.41
48.8 31.9 30.68 33.1 59.34 61.61 33.66
Msp_g03435 (TPI)
 120.98 69.75 84.49 69.85 150.87 176.06 105.88
Msp_g03464 (GAMMA CA1)
 32.49 26.92 21.52 23.92 45.58 52.96 35.81
3.33 0.48 0.81 0.55 8.62 8.4 3.26
Msp_g04518 (ARIA)
 15.62 10.8 11.16 11.82 15.39 17.56 13.57
Msp_g04751 (HSC70-5)
 31.09 24.64 28.05 23.24 40.06 45.14 28.63
Msp_g04759 (PDF1A)
 3.35 1.35 1.46 1.49 5.3 6.81 4.23
64.35 41.64 45.68 44.42 85.96 92.28 69.82
Msp_g05164 (PAC)
 7.4 4.68 4.77 4.7 8.29 8.93 5.94
5.65 3.53 3.65 4.08 8.24 10.31 6.21
36.42 29.05 28.38 30.57 40.1 44.05 33.86
Msp_g05439 (BPC3)
 15.83 11.11 10.39 12.04 18.49 20.86 17.19
Msp_g05825 (EMB3003)
 11.78 7.38 8.62 7.83 14.4 17.59 13.71
3.74 1.31 1.59 1.35 5.08 5.81 2.29
Msp_g06012 (VAT1)
 5.97 4.14 4.83 4.26 7.03 7.71 5.12
2.13 0.95 1.17 1.37 4.73 4.05 2.34
6.75 0.0 0.0 0.13 7.9 15.99 6.61
Msp_g06804 (MAP65-1)
 10.71 2.5 6.27 2.17 19.62 17.73 5.27
8.66 3.4 4.99 3.47 11.14 11.31 3.56
19.02 6.71 6.96 9.27 41.56 36.72 22.01
1.11 0.37 0.28 0.54 2.62 1.95 0.93
8.54 6.09 5.9 6.03 9.9 9.94 8.25
3.88 2.52 2.66 2.74 5.56 6.36 4.03
Msp_g08065 (AGD2)
 9.58 5.9 6.85 6.09 11.9 11.87 9.71
Msp_g08544 (XT2)
 1.56 0.18 0.07 0.19 3.89 5.32 2.35
20.16 13.27 10.61 13.44 25.27 35.75 18.21
5.26 2.82 2.85 3.08 7.45 6.18 4.14
Msp_g09018 (MURE)
 5.18 3.1 3.63 3.03 7.73 7.75 3.08
4.11 2.49 2.2 2.72 3.77 4.45 3.25
5.17 3.6 3.71 3.42 6.74 6.87 5.4
2.56 0.68 1.15 0.71 3.18 4.19 2.08
7.89 4.65 4.3 5.23 9.93 11.45 7.4
Msp_g09348 (BTR1)
 1.92 0.47 0.65 0.3 3.26 3.82 2.75
Msp_g09432 (TLP8)
 2.4 1.05 0.52 1.47 5.77 6.16 3.67
Msp_g09656 (HISN1A)
 15.83 9.14 8.63 9.28 25.78 27.53 14.61
Msp_g09740 (KOR)
 52.27 18.66 26.68 19.39 75.87 69.68 17.77
8.63 4.91 4.1 5.58 12.9 13.07 6.42
Msp_g09796 (ATSAC1)
 7.94 5.09 5.7 5.31 9.55 10.48 5.64
7.17 1.5 1.87 1.13 10.66 11.4 6.4
30.19 21.9 23.85 22.71 31.47 36.58 30.69
35.75 25.89 15.01 15.57 65.72 47.44 36.55
Msp_g10304 (EIF4B2)
 18.2 13.16 12.27 13.84 24.46 23.9 12.83
1.81 0.79 1.11 0.79 3.39 3.49 1.46
23.2 18.59 19.87 19.95 24.11 25.19 22.36
2.24 0.42 0.49 0.47 5.95 5.41 2.65
Msp_g11394 (FLK)
 0.87 0.18 0.39 0.2 1.42 2.0 0.62
2.36 0.0 0.0 0.0 2.66 2.63 0.71
Msp_g12602 (ZOU)
 7.07 4.84 4.51 4.46 8.52 9.04 7.17
1.83 0.16 0.27 0.14 2.9 3.75 1.97
2.2 1.02 1.34 1.18 2.7 3.58 1.84
2.2 0.21 0.41 0.28 5.15 4.64 1.88
Msp_g13204 (RBOHF)
 3.3 0.07 0.15 0.04 6.24 7.38 0.19
Msp_g13403 (MSH2)
 3.52 2.11 2.1 2.0 4.28 4.57 2.36
7.26 4.7 4.3 5.43 8.97 8.13 5.66
6.34 3.42 3.22 3.44 12.1 10.99 6.33
Msp_g13602 (FBW2)
 14.94 9.32 9.81 10.42 24.97 20.34 14.73
Msp_g13664 (NOV)
 5.97 3.97 3.43 4.02 6.6 6.85 4.27
64.0 44.19 44.56 45.24 67.95 72.49 60.77
7.36 5.74 5.16 5.05 8.89 8.95 6.79
7.22 5.03 5.49 5.34 8.17 8.97 6.36
Msp_g13877 (CARA)
 35.95 28.27 28.55 30.33 37.61 43.37 33.5
8.05 3.26 4.61 3.34 8.53 10.14 5.72
4.64 1.54 2.85 1.46 8.62 9.0 2.97
Msp_g14221 (HAC12)
 3.92 2.52 2.86 2.75 4.2 4.01 3.11
5.42 3.01 2.95 3.18 6.24 5.63 3.81
1.51 0.03 0.03 0.22 1.9 2.76 0.75
3.66 0.43 0.83 0.56 7.91 6.11 2.82
Msp_g14765 (PEX1)
 2.99 2.29 2.39 2.55 3.45 4.03 3.19
8.85 5.89 6.04 5.68 10.63 10.17 6.09
3.76 1.3 1.69 1.39 4.85 5.68 3.31
7.29 4.12 3.05 5.37 12.43 14.86 9.1
Msp_g15003 (YDA)
 6.57 3.99 5.62 4.4 8.86 8.71 5.41
Msp_g15158 (CYP94D2)
 1.9 1.26 1.55 1.41 2.73 2.68 1.74
10.86 8.6 9.27 9.1 12.27 14.53 11.92
31.49 24.09 24.1 25.73 36.04 42.06 36.2
Msp_g15481 (IPP2)
 140.59 85.53 105.57 80.51 179.81 207.27 99.08
13.34 8.2 9.99 9.23 18.51 19.25 11.23
9.09 6.27 6.45 6.48 9.13 10.88 8.32
Msp_g15983 (AFB2)
 6.56 2.74 3.68 2.89 8.66 7.07 4.87
Msp_g16152 (APAO)
 17.47 8.12 12.35 8.84 23.22 27.71 17.19
2.04 1.15 1.29 1.24 2.44 2.88 1.95
Msp_g16702 (PLDDELTA)
 6.81 3.97 3.5 4.44 10.29 8.8 5.44
Msp_g16807 (IBO1)
 3.11 0.66 0.83 0.8 5.52 6.46 1.43
60.15 27.64 21.82 23.51 104.85 94.05 47.33
23.72 3.34 5.2 3.6 37.01 39.14 18.31
11.02 2.42 6.15 4.52 13.18 13.25 5.17
8.52 0.7 1.84 1.14 11.29 13.59 9.44
6.74 4.06 4.4 3.02 10.04 12.68 8.34
6.25 2.92 3.91 2.98 7.67 8.63 4.36
1.11 0.36 0.64 0.47 2.03 1.86 1.57
Msp_g20080 (CRT1)
 254.97 114.83 126.03 113.6 353.52 434.89 309.06
Msp_g20128 (DML1)
 12.36 7.41 7.14 7.87 14.61 14.01 10.58
5.71 2.12 2.91 2.78 6.44 7.45 5.69
6.74 3.36 4.66 3.79 8.14 9.75 5.92
Msp_g20518 (LACS7)
 4.96 0.95 1.67 1.35 6.4 6.95 1.59
8.73 5.89 5.96 5.98 12.46 12.26 6.1
Msp_g20592 (WOL)
 3.63 0.55 0.29 0.77 9.87 9.35 3.6
23.67 15.23 12.35 14.54 33.9 48.73 29.05
Msp_g21006 (SK13)
 10.42 2.18 2.59 2.88 20.57 25.15 6.65
Msp_g21586 (DRD3)
 5.18 3.51 3.25 3.64 5.32 5.09 3.92
3.94 2.03 2.57 2.28 5.28 5.71 2.67
Msp_g22398 (BGT)
 13.98 13.14 12.42 13.35 15.3 16.49 14.93
21.68 4.36 4.61 3.58 37.04 39.25 11.24
10.15 6.75 6.8 7.45 11.11 12.19 10.69
1.34 0.66 0.74 0.63 1.83 2.1 0.61
9.54 5.41 6.55 5.33 12.2 12.19 6.17
Msp_g24595 (CMT2)
 7.14 1.8 2.56 1.64 9.15 6.93 4.37
Msp_g24839 (TSL)
 7.04 5.79 6.49 6.03 7.54 8.3 7.02
2.65 1.61 1.77 1.68 4.41 4.31 2.38
3.78 2.79 2.78 3.0 3.84 4.22 3.27
Msp_g25350 (F2KP)
 10.28 8.3 7.35 7.89 12.02 13.34 9.43
29.04 13.31 13.14 14.3 38.07 34.65 20.2
Msp_g25493 (DRP4C)
 11.23 6.9 7.18 7.06 11.66 14.08 9.75
Msp_g25878 (CUL4)
 18.21 14.99 13.58 14.47 18.49 19.52 16.21
7.48 3.55 3.55 3.58 12.95 13.63 5.36
3.46 3.12 2.41 2.64 5.08 5.2 3.24
15.55 7.36 7.97 7.14 18.72 20.8 11.46
Msp_g26606 (TAF2)
 6.42 3.98 4.55 4.15 7.16 6.72 4.89
3.53 2.04 2.11 2.36 4.57 4.78 2.65
5.8 4.4 2.89 3.4 15.33 13.8 4.38
15.37 9.77 10.04 9.78 18.32 17.58 11.99
18.5 6.25 7.47 6.44 24.61 24.48 6.04
Msp_g27398 (ATPPR5)
 3.97 3.23 3.1 3.31 4.61 5.24 3.48
121.39 73.52 82.74 75.07 164.37 167.32 111.06
4.97 1.83 2.14 1.98 8.23 7.93 4.84
7.79 0.31 1.27 1.1 13.99 13.81 1.42
20.69 4.74 12.48 4.12 39.47 38.01 14.07
38.89 25.12 27.61 27.31 58.02 65.03 32.34
6.57 2.25 1.63 2.34 10.69 10.11 3.86
3.62 2.6 2.62 3.06 5.0 5.59 4.2
12.48 3.45 3.85 4.08 16.0 24.39 7.28
5.95 4.19 4.18 3.87 8.23 7.63 4.3
1.32 0.09 0.0 0.0 3.4 2.87 0.78
4.1 2.56 2.48 2.96 6.09 5.29 3.87
1.48 0.13 0.19 0.16 2.71 2.78 0.19
4.01 2.93 2.56 3.12 5.76 5.07 3.31
Msp_g31813 (DSO)
 17.11 6.33 8.33 6.35 18.98 22.11 10.06
4.12 1.83 2.25 2.01 5.02 4.91 2.43
7.57 2.85 4.81 4.68 12.84 13.47 4.77
Msp_g33207 (MPK9)
 18.22 8.99 12.57 8.85 19.59 19.69 13.18
4.5 1.02 2.0 1.11 7.38 6.84 3.76
2.6 0.13 0.18 0.41 6.09 6.72 1.92
1.96 0.96 0.81 0.81 2.23 2.78 1.26
3.93 0.69 1.85 1.31 7.61 7.8 5.08
4.05 0.72 0.5 0.81 5.21 3.89 2.06
11.83 8.53 8.15 9.68 14.73 16.53 12.04
3.63 2.31 2.29 3.14 5.76 7.44 5.26
Msp_g37728 (GRF2)
 6.83 0.0 0.04 0.01 9.42 12.84 2.65
2.69 1.59 1.37 1.63 4.09 3.67 2.2
6.21 2.34 5.39 3.99 10.02 11.35 7.75
Msp_g38191 (RACK1C_AT)
 49.16 37.97 38.51 38.44 58.77 54.83 41.32
Msp_g38627 (APM1)
 3.99 2.38 1.75 2.17 4.82 4.99 3.32
9.65 0.55 0.58 0.46 19.56 18.63 7.81
11.66 2.59 2.1 4.98 26.51 20.11 11.14
1.3 0.2 0.13 0.29 4.02 4.09 1.45
4.05 1.98 1.75 1.56 4.82 4.74 2.87
Msp_g42752 (POK1)
 1.52 0.42 0.47 0.42 2.51 3.08 1.34
Msp_g42783 (SWC2)
 5.86 4.1 4.05 4.63 7.32 7.66 4.72
Msp_g43094 (TBL22)
 1.18 0.68 0.79 1.02 2.05 1.78 1.0
10.76 6.79 6.09 6.31 18.65 18.54 10.5
Msp_g43775 (emb1427)
 2.6 1.79 1.83 2.07 3.47 3.79 2.41
3.49 0.93 0.69 1.13 6.47 7.68 1.42
1.19 1.0 0.89 0.91 2.24 2.25 1.38
35.36 7.74 17.51 7.87 56.5 60.73 22.13
18.34 1.7 4.06 2.15 28.02 26.78 11.06
2.81 1.03 1.2 1.26 3.42 2.64 1.35
Msp_g44755 (MENG)
 7.05 3.73 3.14 4.08 9.3 8.66 5.29
6.41 5.26 4.4 4.76 9.62 9.56 6.27
6.62 3.12 2.99 3.8 13.75 8.39 5.81
Msp_g46514 (RCK)
 3.1 0.81 0.53 0.81 4.13 4.95 1.16
1.56 0.79 0.84 0.19 2.29 2.97 1.03
Msp_g47929 (BUBR1)
 7.3 4.65 5.09 4.75 10.77 10.38 6.89
Msp_g48628 (RAG1)
 14.85 5.96 5.9 5.82 16.52 16.93 9.07
2.17 1.41 1.52 1.56 2.22 2.54 1.96

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)