1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_17 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
Fertile Leaflet with Sori
Primary Rachis
Secondary Rachis
Petiole
Crozier
Rhizome
Root
14.27 8.73 10.05 8.09 7.49 11.65 9.66
18.79 10.64 13.71 10.8 9.43 14.18 10.96
Msp_g00395 (CLPP5)
 117.08 55.43 83.19 52.28 47.44 55.07 51.59
17.47 9.36 11.54 9.31 10.6 11.18 10.84
17.45 14.66 16.44 13.69 11.66 12.91 13.93
101.98 69.57 95.28 73.81 48.78 74.33 23.65
43.15 22.56 25.31 20.38 18.61 25.53 25.47
75.73 26.86 42.37 25.59 22.66 27.9 20.54
Msp_g01188 (EGY1)
 16.09 5.38 11.4 5.7 4.95 6.18 5.97
Msp_g01231 (ORP1C)
 27.44 10.49 14.08 10.4 8.44 15.47 14.37
36.5 14.38 21.48 14.17 14.14 18.1 13.65
Msp_g01684 (CTS)
 17.08 9.76 13.2 10.06 6.82 10.49 12.28
Msp_g01856 (PRA1.A1)
 51.41 27.7 38.28 30.64 23.46 31.49 29.89
Msp_g01890 (ERD2B)
 32.22 17.52 22.26 19.03 16.0 24.59 17.15
Msp_g02013 (LIP1)
 19.49 11.42 15.99 12.51 9.0 12.07 13.31
Msp_g02077 (PPOX)
 21.28 11.4 14.18 11.1 10.48 12.4 12.42
Msp_g02347 (VTC4)
 38.86 23.84 40.41 22.34 9.42 18.18 20.83
Msp_g02401 (QPT)
 38.96 28.47 31.59 27.78 18.19 25.47 23.34
Msp_g02579 (UBC1)
 550.66 384.46 395.75 381.85 303.3 462.79 385.71
Msp_g02713 (CLPP6)
 33.8 14.61 22.06 14.72 14.45 19.23 14.52
16.32 7.63 9.3 6.25 6.25 6.78 8.05
Msp_g02789 (TGD3)
 14.89 9.99 11.43 10.39 9.11 10.26 10.08
Msp_g02848 (OVA9)
 51.99 30.64 36.68 30.22 22.77 28.47 29.97
44.45 28.15 31.68 26.7 23.02 30.31 28.92
Msp_g03124 (NAP9)
 12.83 5.67 8.16 4.8 3.64 5.78 7.13
Msp_g03184 (PGM3)
 98.46 50.51 83.85 50.64 36.52 67.49 43.92
Msp_g03447 (PEX22)
 34.84 24.29 30.36 23.96 19.58 28.4 23.84
Msp_g03494 (Z-ISO)
 29.59 13.63 16.47 12.87 9.9 13.64 16.3
28.39 16.59 22.86 16.92 16.89 19.17 18.88
Msp_g03789 (CUM1)
 61.8 38.27 41.75 35.13 29.46 44.01 42.03
Msp_g03810 (CAM3)
 371.2 180.71 217.55 183.76 166.74 226.75 182.7
Msp_g03994 (EMB2758)
 4.14 2.86 3.62 3.06 2.42 2.89 2.24
45.49 27.75 31.03 23.81 18.28 22.2 23.75
6.82 4.94 6.07 4.99 3.93 4.96 3.17
Msp_g04588 (HER1)
 43.53 24.45 31.7 26.19 21.21 26.33 24.74
84.99 40.99 45.46 41.97 34.86 43.19 50.49
32.61 23.58 26.8 23.06 18.34 27.95 22.77
32.27 17.88 21.26 18.3 16.47 23.37 21.03
30.14 12.91 18.47 13.11 6.24 12.1 16.25
Msp_g05104 (SDH2-1)
 65.91 34.34 49.51 31.86 23.13 40.75 42.82
18.7 9.36 13.18 9.37 8.8 9.95 10.63
45.26 19.26 26.9 20.51 20.56 22.02 20.6
39.08 26.35 28.13 25.02 23.84 33.22 28.98
Msp_g05514 (RIC7)
 27.3 15.2 18.87 15.6 9.91 14.12 14.78
19.75 8.33 12.07 8.66 7.3 12.62 10.26
27.54 18.63 29.3 16.97 12.37 18.87 14.41
Msp_g05953 (PPa6)
 162.56 107.43 133.72 102.85 82.01 106.05 73.59
Msp_g06115 (AXR6)
 60.32 36.2 46.99 37.11 29.37 40.27 45.78
Msp_g06121 (NHX6)
 25.85 17.31 17.91 17.13 12.87 16.59 16.2
21.28 14.41 15.86 13.82 10.52 13.95 14.37
46.65 30.9 38.23 30.23 26.98 34.09 30.22
29.83 21.25 26.84 21.77 18.34 21.7 18.58
19.64 10.17 13.1 9.88 10.03 9.72 9.53
22.3 15.68 16.36 14.89 12.13 15.15 15.1
Msp_g07225 (G6PD6)
 39.89 31.76 41.05 30.14 22.66 28.33 24.01
Msp_g07680 (SEC22)
 21.97 11.51 16.2 13.15 11.32 16.21 15.14
Msp_g07757 (QSO2)
 13.68 8.74 8.86 8.56 7.13 10.72 9.86
22.97 13.91 15.66 14.46 11.24 16.92 15.49
24.08 11.9 14.81 11.58 11.28 12.69 11.16
8.67 4.93 5.63 5.09 3.86 5.78 5.55
52.38 32.86 36.41 34.39 23.46 34.6 34.41
24.96 7.16 13.28 7.18 6.48 9.14 8.07
61.28 46.12 60.18 43.94 40.16 48.14 35.63
Msp_g08233 (UBC19)
 67.04 37.85 43.28 38.24 33.23 52.96 39.84
12.04 8.81 9.04 9.08 6.46 10.26 8.42
18.39 9.65 15.23 9.94 8.68 13.02 7.24
Msp_g08542 (emb2731)
 72.74 54.31 54.5 53.71 42.01 65.55 54.92
6.97 2.83 4.27 1.83 1.36 2.12 0.68
Msp_g08665 (GST10)
 24.39 15.03 19.9 15.2 15.33 19.82 13.51
25.82 13.59 18.42 13.96 8.95 12.04 11.56
Msp_g08980 (GST18)
 47.55 19.84 28.33 19.49 15.39 24.78 24.8
Msp_g08981 (GST18)
 47.0 21.44 27.79 19.94 20.49 27.89 20.24
21.47 12.11 15.27 12.09 8.81 12.77 11.3
15.67 8.63 10.4 8.77 8.63 11.24 8.65
Msp_g09528 (ORG4)
 17.7 10.69 12.74 8.41 4.81 9.22 8.21
Msp_g09594 (SPP)
 66.31 40.23 47.45 42.86 30.06 47.8 44.54
Msp_g09631 (IMPL1)
 17.51 10.6 10.74 9.7 9.18 10.36 9.8
30.59 9.27 16.37 9.06 9.59 11.09 10.09
Msp_g10166 (LACS6)
 18.19 9.27 12.25 9.43 9.0 12.56 9.86
Msp_g10214 (CLP2)
 50.93 27.32 36.02 26.08 25.68 31.09 28.51
71.07 40.76 56.12 41.04 37.69 42.19 40.34
16.01 10.67 11.37 11.43 8.86 12.0 11.54
Msp_g10439 (CDS4)
 11.22 4.48 6.35 4.6 3.84 5.0 4.04
52.83 2.93 15.82 3.23 1.96 5.79 9.35
18.2 7.02 10.57 7.73 6.29 8.94 8.05
74.34 44.26 45.81 44.73 31.38 46.53 43.03
61.59 34.23 39.92 35.52 23.85 36.28 33.76
Msp_g11017 (NUDT2)
 69.64 32.45 38.02 32.79 23.12 41.42 32.43
25.42 8.19 17.49 4.97 10.13 14.38 1.9
Msp_g11212 (ZTP29)
 20.65 15.3 16.31 13.62 12.49 14.17 15.49
33.82 16.01 22.23 15.86 10.9 15.4 11.2
24.88 12.59 16.85 13.78 9.93 11.39 9.75
1135.41 790.72 977.31 762.77 557.72 709.75 476.66
Msp_g11869 (ACX1)
 20.55 13.42 16.34 13.78 10.94 14.86 15.15
Msp_g11901 (SIRB)
 13.26 7.3 8.86 7.23 6.19 9.72 7.97
Msp_g12135 (SPPL2)
 39.71 26.4 30.43 27.77 24.35 28.35 27.92
Msp_g12265 (DER1)
 56.73 36.26 38.41 36.74 29.86 43.49 38.21
Msp_g12287 (CXIP2)
 18.56 9.68 13.42 8.61 9.01 10.82 8.58
157.58 86.19 103.54 90.13 50.25 85.39 101.19
Msp_g12375 (DSP4)
 46.29 34.11 45.1 30.72 24.37 30.47 17.4
Msp_g12433 (DECR)
 26.64 12.39 15.44 11.55 8.5 13.27 12.72
Msp_g12456 (THX)
 69.26 34.31 46.94 32.18 20.53 34.25 41.72
29.44 20.11 23.35 19.34 15.28 20.86 20.09
23.18 10.93 13.46 10.48 6.25 10.54 11.1
9.92 6.03 7.06 6.16 5.2 5.95 6.66
7.7 3.88 5.24 4.04 3.34 3.66 4.21
Msp_g12668 (mtLPD1)
 67.04 34.01 49.84 34.65 24.57 41.33 33.62
Msp_g12796 (GPT)
 25.03 17.69 19.0 16.97 13.19 17.98 18.73
Msp_g12811 (HISN1A)
 22.61 12.73 16.98 13.54 9.02 12.12 16.03
20.5 15.74 17.59 15.51 13.07 16.19 15.77
13.61 8.37 9.59 8.49 7.47 9.21 9.13
Msp_g13384 (ADL2)
 14.47 9.37 10.7 9.78 6.83 9.81 8.82
24.45 17.15 19.52 18.19 14.26 18.08 17.31
Msp_g14220 (HD1)
 20.31 14.69 18.51 15.11 12.3 14.98 13.85
31.38 26.52 31.22 25.33 20.5 25.0 17.63
Msp_g15051 (PS2)
 12.77 8.68 9.74 8.95 7.89 9.23 8.25
7.98 5.39 5.9 5.41 4.53 5.45 5.27
Msp_g15472 (RKP)
 23.1 15.01 17.46 16.14 13.31 17.45 15.44
5.97 3.85 5.15 3.99 3.19 4.12 3.92
Msp_g16176 (LACS9)
 91.66 62.5 80.98 64.0 46.02 63.89 49.68
15.53 4.27 8.38 4.73 6.73 7.83 5.42
6.52 4.36 6.21 3.94 3.04 3.84 2.4
Msp_g17297 (KUP3)
 20.27 12.98 13.34 13.85 8.75 16.13 14.19
Msp_g18618 (UGT85A7)
 12.86 7.2 8.93 7.72 5.63 7.17 8.2
21.99 10.59 14.31 10.51 8.57 9.65 10.75
Msp_g20060 (ASN3)
 49.94 28.23 37.51 27.75 27.26 30.99 30.11
Msp_g20078 (CCX4)
 15.87 7.31 10.02 7.07 4.94 8.16 8.5
Msp_g20334 (UCH3)
 21.66 13.93 13.93 13.93 12.01 17.78 15.08
42.53 24.58 27.9 23.32 13.98 23.26 24.58
Msp_g20686 (E37)
 142.32 92.8 123.28 96.41 76.88 96.86 40.64
93.15 37.96 47.68 40.51 39.52 54.87 40.53
47.44 30.34 37.2 30.82 20.83 35.42 27.87
Msp_g22077 (MSRB2)
 123.91 61.79 83.45 60.57 43.4 61.12 38.42
48.61 29.61 36.06 23.26 25.33 25.12 29.93
33.7 16.67 24.32 17.21 11.15 15.23 18.17
12.26 6.25 8.26 6.89 4.21 6.13 6.47
Msp_g24167 (PDK)
 13.39 5.99 8.53 6.35 5.74 7.61 6.83
Msp_g24463 (SS3)
 31.28 14.13 22.79 13.7 13.2 16.11 11.75
13.88 7.94 10.23 8.6 5.3 7.58 8.64
11.13 6.3 8.06 5.93 4.75 6.07 7.13
27.15 13.19 17.98 14.63 10.5 12.45 10.7
20.1 10.51 12.59 10.63 10.74 13.37 12.39
17.64 10.18 17.45 9.4 5.34 8.61 9.65
Msp_g25918 (CLPP4)
 16.45 8.6 12.79 8.68 7.46 11.56 11.15
2.96 1.65 2.01 1.75 0.94 1.53 1.37
11.37 6.83 8.02 7.22 5.74 7.13 7.36
8.99 5.03 5.93 5.0 4.62 5.81 5.63
Msp_g26541 (CPFTSZ)
 13.36 8.13 9.8 8.08 8.26 9.89 7.18
16.55 4.71 8.03 5.08 4.47 6.99 7.7
17.12 7.89 10.48 7.98 7.54 12.2 8.26
Msp_g27194 (BMY5)
 2.66 1.74 2.35 1.71 1.48 1.68 1.24
Msp_g27273 (scpl42)
 41.25 16.99 23.96 16.82 14.47 23.43 21.97
Msp_g27364 (NFU1)
 30.07 12.19 19.14 11.63 10.72 11.98 10.31
43.83 28.7 29.98 30.28 21.76 36.75 27.03
12.17 6.45 8.55 6.07 5.41 7.29 6.77
33.57 24.57 24.89 24.72 19.15 29.4 26.21
11.07 6.15 8.23 6.42 5.34 6.62 6.21
Msp_g31460 (UGT85A7)
 10.72 6.53 8.78 6.92 6.28 7.27 7.35
24.15 13.91 16.04 13.82 12.99 18.82 15.14
50.73 26.23 38.42 29.77 21.57 33.56 27.34
8.03 6.21 6.56 6.01 5.1 6.57 6.33
4.19 0.16 1.08 0.07 0.58 0.67 0.43
10.36 3.45 5.7 4.02 3.1 5.79 3.68
Msp_g35276 (OEP80)
 10.22 6.03 7.4 5.95 6.18 7.27 6.5
71.18 43.6 46.75 42.71 27.75 42.83 37.44
58.58 41.5 44.82 41.62 32.14 42.14 44.15
23.35 8.38 12.07 9.31 7.42 9.46 6.51
3.42 1.58 2.14 0.95 1.08 1.49 1.89
31.73 10.9 16.74 11.03 12.82 14.19 11.54
3.29 0.14 1.09 0.2 0.27 0.97 0.18
41.21 26.39 44.95 24.25 14.53 22.19 6.24
3.75 2.28 3.0 2.24 1.36 1.74 0.79
16.04 7.77 9.38 8.11 7.4 8.9 7.42
Msp_g45240 (RBL15)
 26.27 15.3 19.68 15.86 14.65 20.51 16.42
129.62 78.56 118.53 85.99 61.64 86.3 26.9
Msp_g45885 (CRR2)
 7.25 5.41 6.71 4.63 3.94 4.51 4.23
5.13 0.5 2.27 0.46 0.5 0.97 0.68
23.78 16.04 17.05 15.64 14.46 20.13 15.63
Msp_g47290 (COAB)
 25.37 18.48 22.5 19.09 16.27 17.93 13.92
Msp_g47316 (PRORP1)
 11.66 8.51 9.33 8.3 7.46 8.88 8.51
39.64 20.46 26.31 21.36 13.92 21.83 21.88
35.12 13.06 22.67 12.59 12.47 22.65 19.35
23.05 10.93 17.35 11.59 11.0 12.48 11.05

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)