Heatmap: Cluster_44 (HCCA)

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(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Fertile Leaflet with Sori	Primary Rachis	Secondary Rachis	Petiole	Crozier	Rhizome	Root
Msp_g11750	-1.09	-1.38	-3.13	-2.18	-1.15	-1.28	2.31
Msp_g18035	-2.55	-2.56	-1.95	-2.14	-3.04	-1.76	2.53
Msp_g18324	-	-	-	-3.45	-	-	2.79
Msp_g18353	-2.11	-1.59	-3.91	-2.51	-1.61	-2.78	2.52
Msp_g21777	-1.78	-	-2.16	-1.23	-2.01	-1.55	2.45
Msp_g23278 (PDR1)	-	-1.09	-3.18	-1.99	-2.64	-1.15	2.47
Msp_g30975	-	-	-	-	-	-1.58	2.74
Msp_g31058	-5.68	-9.19	-8.52	-6.46	-1.89	-2.66	2.71
Msp_g31909	-	-	-	-	-	-2.15	2.76
Msp_g32283	-5.62	-	-	-	-5.7	-0.89	2.68
Msp_g32745	-	-	-	-	-	-	2.81
Msp_g32747	-	-	-	-	-	-	2.81
Msp_g32750	-	-	-	-	-	-	2.81
Msp_g32764	-	-	-	-	-	-4.13	2.8
Msp_g32798	-	-	-	-	-	-	2.81
Msp_g32825	-	-	-1.76	-	-	-	2.75
Msp_g32857	-	-	-	-	-	-	2.81
Msp_g32865	-	-	-	-	-	-	2.81
Msp_g32878	-	-	-	-	-	-	2.81
Msp_g32886	-	-	-	-	-	-	2.81
Msp_g32904	-	-	-	-	-	-	2.81
Msp_g32940	-	-	-	-	-	-0.96	2.7
Msp_g32980	-	-	-	-	-	-	2.81
Msp_g33031	-	-	-	-	-	-	2.81
Msp_g33048	-	-	-	-	-	-	2.81
Msp_g33063	-	-	-	-	-	-	2.81
Msp_g33074	-	-	-	-	-	-	2.81
Msp_g33088	-	-	-	-	-	-	2.81
Msp_g33162	-	-	-	-	-	-1.87	2.75
Msp_g33170 (ARFA1B)	-	-	-	-	-	-	2.81
Msp_g33315	-	-	-	-	-	-	2.81
Msp_g33327	-	-	-	-	-	-	2.81
Msp_g33466	-	-	-	-	-	-4.7	2.8
Msp_g33517	-	-	-	-	-	-	2.81
Msp_g33545	-	-	-	-	-	-	2.81
Msp_g33602	-	-	-	-	-	-	2.81
Msp_g33612	-2.02	-1.64	-4.22	-1.61	-1.36	-0.81	2.35
Msp_g33625	-	-	-	-	-	-	2.81
Msp_g33645	-1.2	-1.95	-1.46	-2.59	-0.81	-0.33	2.14
Msp_g33655	-	-	-	-	-	-	2.81
Msp_g33751	-	-	-	-	-	-	2.81
Msp_g33839	-	-	-	-	-	-	2.81
Msp_g33913	-	-	-	-	-	-	2.81
Msp_g33993	-	-	-	-	-	-	2.81
Msp_g34170	-1.81	-2.01	-3.46	-3.0	-4.02	-3.26	2.61
Msp_g34197	-	-	-	-	-	-3.46	2.79
Msp_g34288	-	-	-	-	-	-1.78	2.75
Msp_g34362	-2.58	-1.5	-3.02	-2.2	-	-2.0	2.56
Msp_g34409 (CYP71B34)	-6.09	-4.8	-5.55	-	-6.25	-	2.79
Msp_g34500 (UBQ11)	-3.21	-3.87	-6.51	-3.38	-	-4.55	2.74
Msp_g34736	-1.42	-2.06	-1.6	-3.1	-	-	2.57
Msp_g34771	-	-	-3.34	-	-3.23	-	2.76
Msp_g34794	-	-	-	-	-	-	2.81
Msp_g34852	-	-4.83	-5.27	-3.39	-	-	2.77
Msp_g35034 (HA11)	-0.73	-0.61	-0.59	-0.76	-0.38	-0.52	1.59
Msp_g35078	-	-	-	-	-	-	2.81
Msp_g35158 (UBQ4)	-3.01	-1.68	-2.56	-1.83	-4.07	-5.01	2.59
Msp_g35260	-	-	-	-	-	-	2.81
Msp_g35342	-	-	-	-	-	-	2.81
Msp_g35381	-	-	-	-	-	-	2.81
Msp_g35464	-	-	-	-	-	-	2.81
Msp_g35508	-	-	-	-	-	-	2.81
Msp_g35521	-	-	-	-	-	-	2.81
Msp_g35562 (NLM2)	-5.49	-	-	-	-	-4.0	2.79
Msp_g35581	-3.37	-3.58	-2.57	-4.72	-4.45	-	2.72
Msp_g35700	-	-	-	-	-	-	2.81
Msp_g35734	-	-	-	-	-	-2.29	2.76
Msp_g35919	-4.94	-8.32	-6.6	-	-8.16	-1.22	2.71
Msp_g35936	-1.05	-0.8	-0.97	-1.14	-1.53	-1.8	2.12
Msp_g36046	-	-	-	-	-	-	2.81
Msp_g36094	-	-	-	-	-	-	2.81
Msp_g36298	-	-	-	-	-	-	2.81
Msp_g36308 (CYP704B1)	-	-	-3.88	-	-1.1	-3.71	2.68
Msp_g36372	-	-	-	-	-	-	2.81
Msp_g36375	-	-	-	-	-	-	2.81
Msp_g36471	-	-	-	-	-	-	2.81
Msp_g36479	-	-	-	-	-	-	2.81
Msp_g36519 (PAP29)	-0.63	-6.28	-4.67	-5.16	-	-0.99	2.53
Msp_g36522	-	-	-	-	-	-	2.81
Msp_g36571	-	-	-	-	-	-	2.81
Msp_g36719	-	-	-	-	-	-	2.81
Msp_g36736	-	-	-	-	-	-	2.81
Msp_g36822	-	-	-3.94	-	-4.43	-3.73	2.77
Msp_g36923	-	-	-	-	-	-	2.81
Msp_g37041 (ERD13)	-1.73	-	-	-3.54	-	-4.38	2.71
Msp_g37225	-	-	-	-	-	-	2.81
Msp_g37248	-	-	-	-	-	-0.91	2.69
Msp_g37262	-	-	-	-	-	-	2.81
Msp_g37363	-	-	-	-	-	-3.42	2.79
Msp_g37383	-	-	-	-	-	-	2.81
Msp_g37467	-	-	-	-	-0.75	-	2.68
Msp_g37487	-	-	-	-	-	-	2.81
Msp_g37492	-	-	-	-	-	-	2.81
Msp_g37535	-	-	-	-	-	-	2.81
Msp_g37672	-	-	-	-	-	-	2.81
Msp_g37954	-	-	-	-	-	-	2.81
Msp_g38112	-	-	-	-	-	-	2.81
Msp_g38200	-	-	-	-	-	-	2.81
Msp_g38351	-	-	-	-	-	-	2.81
Msp_g38372	-	-	-	-	-	-3.79	2.79
Msp_g38525	-	-	-	-	-	-	2.81
Msp_g38641	-	-	-	-	-	-	2.81
Msp_g38666	-	-	-	-	-	-	2.81
Msp_g38674	-	-	-	-	-	-	2.81
Msp_g38734	-	-	-	-	-	-	2.81
Msp_g38758	-	-	-	-	-	-	2.81
Msp_g38916	-	-	-	-	-	-1.38	2.73
Msp_g38996	-	-	-	-	-	-	2.81
Msp_g39082	-	-	-	-	-2.26	-2.12	2.71
Msp_g39156	-	-	-	-	-	-	2.81
Msp_g39168	-	-	-	-	-	-5.26	2.8
Msp_g39175	-	-	-	-	-	-	2.81
Msp_g39253	-	-	-	-	-	-4.31	2.8
Msp_g39262	-	-	-	-	-	-	2.81
Msp_g39270	-	-	-	-	-	-	2.81
Msp_g39360	-	-	-	-	-	-1.28	2.72
Msp_g39364	-	-	-	-	-	-	2.81
Msp_g39457	-	-	-	-	-	-	2.81
Msp_g39573	-	-	-	-	-	-	2.81
Msp_g39722	-	-	-	-	-	-	2.81
Msp_g39827	-	-	-	-	-	-	2.81
Msp_g39981	-4.38	-	-	-2.94	-	-3.36	2.75
Msp_g40019	-	-2.84	-	-3.04	-2.77	-1.71	2.65
Msp_g41914	-3.75	-	-4.9	-	-	-4.87	2.78

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.