1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_47 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
Fertile Leaflet with Sori
Primary Rachis
Secondary Rachis
Petiole
Crozier
Rhizome
Root
87.49 147.41 160.54 158.88 77.4 51.69 37.22
14.19 60.01 49.05 79.82 19.51 15.87 15.07
7.41 14.57 12.1 13.61 2.91 1.53 2.82
16.87 20.71 27.13 21.09 10.67 13.9 13.46
1.99 12.07 8.88 15.67 2.19 1.88 4.91
Msp_g01443 (PYL4)
 12.01 21.61 16.64 26.59 6.45 9.69 13.42
0.55 6.9 5.98 7.72 2.29 2.69 2.48
Msp_g01645 (BAG5)
 20.15 30.8 24.88 44.69 11.3 11.72 15.86
2.06 11.15 4.82 9.91 1.0 0.46 1.93
161.64 279.11 245.25 296.9 77.39 160.09 152.2
15.05 45.71 55.18 47.73 10.98 13.87 8.28
Msp_g05125 (WRKY11)
 2.0 6.96 5.21 6.44 0.62 0.79 1.49
48.61 106.21 96.5 126.77 28.8 31.87 57.01
71.89 155.61 129.21 166.08 35.6 55.47 76.39
7.29 14.45 12.01 13.74 6.09 4.03 6.86
199.73 414.17 328.23 478.22 127.75 138.46 94.58
Msp_g05973 (TSPO)
 7.03 33.59 8.29 43.83 0.75 1.46 2.63
9.79 49.8 51.28 70.32 14.17 14.23 12.86
Msp_g06505 (IBR5)
 17.71 21.74 21.93 31.99 7.17 6.21 6.03
13.62 21.38 21.36 21.83 10.17 6.3 11.53
Msp_g07297 (APRL6)
 18.68 21.25 20.92 22.84 15.8 18.93 16.04
12.99 17.61 21.34 19.15 8.45 12.29 11.36
Msp_g09603 (PBP1)
 94.2 196.16 177.55 218.76 29.42 25.13 108.07
31.04 59.76 60.1 60.96 32.27 23.86 17.01
282.85 1299.84 879.05 1520.2 526.94 363.15 437.04
0.95 26.31 15.77 31.43 7.77 6.68 4.24
Msp_g10420 (PAT1)
 20.77 28.68 27.92 38.24 9.22 14.5 20.03
4.93 23.7 24.84 25.47 5.0 4.03 11.02
5.49 24.41 28.12 31.21 8.93 5.65 8.98
7.79 24.95 31.12 30.93 1.55 2.06 3.71
7.82 99.7 54.62 112.72 11.43 11.63 10.69
Msp_g12641 (TLP3)
 32.9 45.16 55.84 46.62 21.89 20.98 27.52
0.43 5.69 8.36 5.23 0.86 0.21 0.0
18.52 34.58 37.58 36.73 18.95 12.7 9.17
8.41 31.54 29.93 33.88 6.03 5.47 7.72
Msp_g14672 (ACA8)
 9.96 37.24 32.21 41.95 4.8 4.67 8.25
2.65 6.79 4.85 6.54 0.62 1.06 1.87
0.11 9.0 4.14 11.12 0.26 1.45 2.61
54.16 100.05 106.27 113.87 34.84 47.54 68.48
8.21 10.23 9.56 10.6 4.99 6.7 6.77
6.41 17.65 13.11 18.1 4.43 6.08 4.46
1.45 14.21 12.03 10.72 0.11 0.0 0.0
Msp_g16577 (ZFP6)
 0.64 4.21 1.84 5.68 0.89 0.78 1.4
Msp_g16643 (PME31)
 0.18 2.5 2.07 2.64 0.68 1.03 0.4
10.36 39.8 40.23 44.84 0.45 1.62 2.09
8.4 20.13 14.5 20.93 5.87 4.97 2.07
4.81 7.0 8.64 7.89 3.01 2.19 3.93
0.0 15.81 7.78 22.15 0.12 0.37 0.0
3.2 5.25 4.55 5.16 2.84 2.38 2.29
Msp_g17144 (FBW2)
 2.23 8.18 8.83 7.38 1.84 2.27 1.33
2.27 3.26 2.71 3.27 1.65 1.72 2.03
1.62 21.12 29.99 31.18 0.38 0.1 0.43
43.82 135.36 126.8 132.22 10.35 12.79 15.58
33.29 46.7 44.57 49.8 7.22 8.29 14.38
4.08 16.16 13.43 13.66 1.64 0.57 1.28
2.8 6.3 6.67 7.1 1.63 2.52 3.67
2.0 3.82 5.59 4.27 0.46 0.44 0.78
2.5 2.86 3.15 3.99 0.47 0.37 0.92
1.41 2.65 1.78 2.21 0.36 0.78 0.65
Msp_g18561 (SDS)
 1.28 5.39 3.98 5.71 0.06 0.28 0.46
0.5 4.64 3.65 3.86 0.02 0.06 0.19
16.79 32.12 26.02 28.36 12.35 13.13 12.64
Msp_g19596 (SCZ)
 7.42 11.24 9.93 13.22 7.2 6.51 7.37
0.21 1.76 0.81 2.38 0.02 0.11 0.29
2.06 5.77 5.69 5.98 0.45 0.39 0.93
1.05 2.19 2.84 3.02 0.57 0.75 0.82
1.22 12.34 16.02 14.77 2.01 1.65 2.03
1.59 6.94 7.55 6.51 2.11 1.32 1.01
Msp_g21187 (FER)
 6.7 15.45 18.67 16.1 0.18 2.25 6.44
Msp_g21278 (NCED9)
 8.61 15.86 11.91 24.93 0.11 0.71 1.72
0.71 2.84 3.24 5.37 0.6 0.97 0.59
5.17 12.3 10.18 10.56 0.78 1.18 3.03
7.67 24.84 26.47 34.59 6.23 4.85 9.89
1.85 5.73 6.15 8.74 0.9 1.46 1.99
6.06 9.39 7.87 7.93 2.12 3.3 2.18
10.1 23.43 12.61 30.56 9.88 11.25 10.62
3.33 9.06 6.55 11.87 0.28 0.43 2.09
Msp_g24035 (TPS6)
 25.44 43.52 48.73 52.81 14.88 5.39 17.23
1.3 8.13 5.65 9.22 0.38 0.25 0.22
1.62 6.08 7.15 7.43 1.71 1.72 2.03
Msp_g24815 (HSF3)
 1.0 2.79 2.07 3.89 0.55 0.64 1.13
0.67 4.35 3.5 6.59 0.13 0.12 0.66
Msp_g25525 (PAT1)
 8.78 23.56 17.19 29.21 10.03 9.34 11.65
12.03 15.43 15.87 18.96 6.52 8.76 11.51
Msp_g26076 (PME31)
 6.96 9.89 8.75 10.71 5.26 8.23 5.51
12.54 18.61 20.13 21.46 9.28 7.88 6.57
18.88 24.82 29.1 33.47 9.12 5.62 12.86
26.68 39.3 52.06 43.03 13.04 15.38 8.79
6.79 11.42 13.87 11.19 4.73 4.68 3.48
63.16 105.13 97.2 103.1 33.94 30.76 51.58
16.22 51.64 47.49 53.3 0.41 1.03 1.34
3.07 8.87 8.03 8.94 4.11 3.12 2.62
4.05 7.64 12.55 11.53 0.69 3.36 2.3
Msp_g30591 (TINY2)
 7.97 27.64 40.42 43.98 0.81 1.85 15.83
37.56 132.67 83.23 181.5 17.38 20.43 56.83
2.33 6.95 7.76 7.33 2.8 1.87 2.44
3.0 8.68 7.69 10.86 0.51 0.85 1.6
3.2 4.59 4.23 5.22 2.33 2.45 1.48
0.63 4.38 1.68 4.95 0.33 0.25 1.28
1.89 3.87 5.1 3.58 0.17 0.86 1.05
0.72 16.82 8.9 22.75 0.32 0.69 1.77
180.94 289.26 301.09 366.86 91.32 110.07 167.32
14.41 22.6 25.11 25.94 12.24 9.65 10.55
1.39 3.68 5.21 4.51 0.24 1.22 1.29
3.61 12.78 8.29 12.9 1.88 1.2 3.34
1.8 5.06 6.86 4.44 0.78 0.78 0.71
1.12 4.04 2.95 6.96 0.23 0.58 0.3
4.01 7.28 6.28 8.77 2.24 2.48 2.82
4.9 9.62 7.26 12.12 3.03 1.77 2.16
2.08 5.22 4.03 4.63 0.0 0.71 0.37
9.75 36.1 50.23 58.86 2.6 2.52 10.34
5.77 18.26 12.35 22.93 8.68 7.34 9.43
1.16 3.57 3.13 1.93 0.43 0.5 0.0
0.29 3.28 4.06 2.29 0.07 0.32 0.07
6.61 16.13 9.09 19.31 4.29 1.6 6.63
28.78 55.44 52.88 56.5 11.51 12.83 33.65
Msp_g43146 (AGO1)
 21.66 37.79 43.81 42.53 6.56 7.78 22.66
4.24 52.47 36.4 58.71 4.35 7.06 6.56
2.6 28.4 11.57 32.72 1.81 3.7 5.61
1.36 4.05 2.4 5.55 0.35 1.06 2.03
4.25 6.46 6.49 7.36 2.06 1.33 1.27
2.24 5.2 7.94 4.38 0.59 0.86 1.98
2.92 20.2 16.44 21.57 3.91 2.99 3.16
1.68 2.85 4.45 2.47 0.64 0.26 0.79
13.71 29.7 23.66 40.54 6.6 6.73 7.6
13.09 23.06 21.89 30.95 6.11 4.88 5.3
Msp_g48128 (CYCA3;1)
 3.81 16.19 17.56 17.59 0.09 0.45 0.61
10.43 19.84 12.05 27.88 0.15 0.62 1.66

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)