1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_36 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
Fertile Leaflet with Sori
Primary Rachis
Secondary Rachis
Petiole
Crozier
Rhizome
Root
127.15 207.71 135.41 244.47 298.78 506.94 372.37
17.58 13.81 11.71 16.48 14.99 21.48 21.47
Msp_g01084 (MCB1)
 40.14 35.17 34.28 36.46 38.5 52.44 45.86
Msp_g01130 (RPT3)
 62.57 62.62 53.13 64.06 65.23 82.62 67.89
26.04 26.7 24.75 27.5 26.94 38.36 38.97
Msp_g01515 (MES18)
 4.73 5.28 3.28 5.34 5.6 7.61 7.39
Msp_g01817 (CSD1)
 539.97 511.89 402.39 517.25 473.1 656.83 664.85
3.03 4.51 2.12 5.44 5.47 11.97 10.56
8.47 51.74 16.69 71.26 96.35 232.17 205.97
105.79 106.3 81.26 104.77 105.13 158.16 104.19
46.91 39.25 26.7 38.18 50.8 76.93 66.8
25.77 22.45 19.87 21.51 20.89 34.87 33.55
1.54 1.33 1.11 1.69 1.69 2.25 2.38
11.84 11.12 8.26 10.82 9.88 18.56 18.89
Msp_g04412 (MMZ3)
 272.29 242.51 255.36 248.83 227.68 326.75 334.93
6.57 5.41 4.33 6.51 5.49 8.69 8.84
Msp_g05235 (ACLB-1)
 81.21 70.49 88.63 76.87 72.81 138.34 132.93
Msp_g05786 (SYP52)
 38.3 43.35 32.93 45.8 52.66 63.45 57.13
13.46 15.94 12.57 15.92 18.11 20.56 17.06
Msp_g06720 (I9H)
 10.47 8.7 8.17 10.71 7.71 19.64 15.35
1.95 1.56 1.42 1.3 1.77 3.4 2.71
Msp_g07285 (HB5)
 17.78 34.72 24.01 35.34 36.54 51.52 53.74
9.78 9.7 8.26 9.78 9.27 12.64 12.99
Msp_g07751 (TPT)
 6.98 28.91 17.98 30.44 31.23 56.7 48.24
Msp_g07892 (DLS1)
 7.58 7.37 6.81 7.63 8.21 10.78 10.29
Msp_g07905 (TOR2)
 36.52 282.96 96.47 363.1 617.57 1158.62 806.86
14.19 11.14 10.34 12.4 11.08 15.63 15.75
6.1 5.96 4.73 5.86 6.09 8.98 7.16
11.05 12.57 10.49 13.51 11.38 16.87 14.13
1.02 1.56 0.67 1.89 1.19 2.07 2.47
9.69 8.15 7.28 8.17 7.13 13.98 13.21
Msp_g09681 (ASP1)
 51.61 38.37 33.83 41.79 35.9 78.94 65.04
10.57 8.56 8.24 8.5 7.94 15.04 13.35
Msp_g10475 (URH1)
 13.28 16.42 7.97 19.86 17.49 33.3 22.26
11.06 31.58 15.23 34.7 30.07 57.22 48.94
24.81 30.79 22.02 32.51 34.3 41.68 37.67
9.59 15.63 11.59 16.07 17.66 23.9 19.94
4.88 4.49 4.02 5.09 4.33 6.15 6.18
6.8 10.16 6.75 9.58 8.59 12.61 13.05
2.41 2.08 1.59 2.14 2.55 4.28 2.4
38.77 44.26 35.86 49.36 48.9 83.76 83.43
57.25 47.06 44.29 47.17 47.84 82.09 76.77
1.61 3.13 2.01 3.73 2.57 4.88 4.33
41.2 38.59 25.91 41.08 38.36 69.29 46.02
Msp_g12504 (MGT6)
 4.18 4.7 4.17 5.42 5.12 6.65 5.39
39.37 37.58 32.98 39.27 40.61 54.96 51.02
Msp_g13024 (SMT2)
 48.2 59.64 43.76 62.06 59.51 83.6 81.21
Msp_g13268 (HRB1)
 43.94 38.9 26.48 42.64 45.26 72.26 60.17
5.61 15.3 6.06 21.41 26.75 42.01 29.12
5.62 25.63 7.55 30.13 35.98 56.8 41.45
63.45 65.91 44.06 59.07 63.68 97.97 67.66
Msp_g13863 (ARA12)
 1.41 4.09 2.4 4.77 5.43 11.57 10.15
Msp_g13880 (EMB2754)
 9.16 10.95 8.37 11.46 10.74 12.83 13.49
12.83 22.33 12.76 26.06 32.98 43.88 39.31
8.2 7.45 6.85 8.04 8.5 10.89 9.52
0.66 3.04 1.04 4.27 1.76 7.3 6.12
Msp_g14929 (PEX3-1)
 11.46 12.2 11.15 13.09 12.88 16.44 14.55
Msp_g15200 (CCC1)
 6.4 7.29 6.31 7.52 7.44 9.02 8.5
0.53 1.13 0.79 1.64 1.4 3.28 2.38
9.04 8.05 6.04 7.78 9.13 15.34 13.26
0.78 1.78 0.78 2.15 2.92 6.83 2.27
103.0 99.78 77.35 90.52 116.39 150.64 99.11
Msp_g18940 (SK1)
 20.58 24.31 19.93 24.64 21.75 40.2 38.31
1.98 2.2 1.54 2.73 2.78 3.89 3.62
3.17 3.32 3.06 3.82 3.5 5.08 4.55
Msp_g20782 (DMS1)
 1.31 1.75 1.35 2.09 2.02 3.0 2.66
Msp_g21091 (MDH)
 10.09 19.17 12.7 27.28 27.02 51.57 48.14
0.64 2.36 0.88 2.67 4.49 9.37 5.38
1.39 7.78 1.94 10.79 5.64 21.9 14.16
Msp_g21470 (JAZ1)
 0.61 4.03 0.67 4.0 2.01 8.91 6.92
Msp_g21690 (UBC5)
 30.98 24.4 25.39 25.22 22.11 46.1 50.93
6.6 4.03 1.46 2.51 9.84 12.83 11.2
Msp_g22775 (CPK13)
 14.45 13.23 11.64 13.57 13.5 23.15 18.24
Msp_g23963 (GAPCP-1)
 99.08 178.49 129.5 177.15 179.88 323.38 312.52
6.51 4.95 5.61 5.28 4.95 9.45 7.98
Msp_g24786 (NAGS2)
 12.34 15.31 11.04 15.26 17.52 21.29 20.14
13.16 11.69 10.9 12.56 12.1 16.21 16.26
4.29 4.61 3.49 4.29 4.76 6.44 5.97
Msp_g25309 (HINT4)
 4.84 6.33 4.64 6.39 7.61 10.39 9.32
19.18 25.12 22.29 26.09 29.61 34.84 33.89
3.92 5.09 3.11 5.25 5.98 8.81 7.45
16.91 19.37 16.02 19.97 21.35 24.19 21.86
7.72 9.74 5.59 10.38 8.76 12.57 12.97
Msp_g28834 (SOBER1)
 21.12 18.32 14.89 19.14 21.37 35.77 33.31
16.2 17.38 13.4 17.47 16.43 19.92 19.44
Msp_g29758 (TOR2)
 3.34 16.74 5.98 22.07 39.01 75.91 69.61
2.81 3.52 1.64 3.64 4.03 9.04 6.62
3.57 2.95 2.83 3.46 3.59 4.93 4.23
5.31 5.33 4.04 6.65 7.09 10.74 9.81
13.63 12.88 9.79 14.59 15.05 26.15 22.07
4.22 5.16 3.97 4.96 4.75 5.99 6.06
Msp_g36320 (TOR2)
 28.43 81.04 38.58 98.35 164.06 283.62 234.55
3.02 5.85 3.45 6.66 8.68 9.82 8.56
6.84 7.81 6.41 8.4 7.93 10.36 8.38
63.29 57.91 58.34 58.01 50.83 121.16 114.17
23.8 21.55 19.78 25.23 27.19 33.4 30.76
39.34 41.73 33.06 44.42 45.83 62.27 48.63
3.28 4.02 2.88 4.63 6.77 8.21 6.63
13.29 10.97 9.97 9.99 11.72 21.39 15.81
268.23 301.09 239.98 294.64 328.43 429.61 330.09
2.37 5.3 2.41 4.82 10.77 20.03 19.58
28.45 23.97 20.01 28.4 24.46 36.23 37.93
Msp_g47130 (GlcNAc1pUT2)
 14.56 16.83 9.66 20.33 14.97 28.98 22.79
13.51 12.13 9.35 12.16 13.63 22.79 9.9
7.59 9.37 7.57 9.55 10.72 14.79 10.37

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)