Heatmap: Cluster_61 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Fertile Leaflet with Sori
Primary Rachis
Secondary Rachis
Petiole
Crozier
Rhizome
Root
Msp_g00042 (PIN1AT)
0.03 0.01 -0.05 0.0 -0.29 0.31 -0.07
0.18 0.05 -0.02 0.01 -0.33 0.15 -0.1
0.22 -0.19 0.08 0.03 -0.41 0.35 -0.23
Msp_g00319 (GLY2)
-0.01 0.04 0.01 0.04 -0.37 0.23 -0.01
Msp_g00566 (NPL41)
0.24 0.03 0.13 -0.0 -0.53 0.23 -0.25
Msp_g00581 (ZFWD1)
0.05 -0.0 -0.0 0.03 -0.17 0.12 -0.05
0.32 -0.07 -0.03 -0.04 -0.35 0.12 -0.02
0.1 0.02 -0.01 0.03 -0.53 0.25 0.03
0.17 -0.06 -0.05 -0.0 -0.22 0.21 -0.1
0.29 0.0 -0.13 -0.08 -0.38 0.21 -0.02
0.37 -0.05 -0.13 -0.09 -0.3 0.23 -0.15
0.42 -0.01 -0.01 -0.1 -0.12 0.14 -0.48
0.13 -0.04 -0.07 0.02 -0.16 0.14 -0.06
0.15 0.05 0.09 0.03 -0.36 0.02 -0.05
0.07 -0.04 -0.02 -0.01 -0.23 0.17 0.01
0.12 0.1 0.11 -0.05 -0.35 0.19 -0.2
0.13 0.01 -0.0 -0.04 -0.31 0.19 -0.04
Msp_g02976 (UBC7)
-0.06 -0.03 0.23 0.06 -0.67 0.32 -0.05
Msp_g03050 (GOS12)
0.22 -0.05 -0.12 -0.03 -0.35 0.29 -0.04
Msp_g03170 (CAK2AT)
0.09 -0.02 -0.03 0.02 -0.42 0.21 0.08
0.81 -0.16 0.02 -0.15 -0.15 0.4 -2.17
0.19 -0.1 -0.02 -0.01 -0.25 0.2 -0.06
0.25 -0.04 -0.13 -0.03 -0.28 0.23 -0.09
Msp_g05098 (CUM1)
-0.0 0.04 -0.09 0.06 -0.41 0.31 -0.01
0.24 -0.12 -0.11 -0.12 -0.14 0.27 -0.09
Msp_g05872 (TDT)
0.22 -0.03 -0.08 0.04 -0.17 0.16 -0.2
0.12 -0.12 0.02 0.02 -0.2 0.16 -0.03
Msp_g06552 (DIS2)
0.15 0.05 -0.05 -0.02 -0.25 0.17 -0.08
0.32 -0.25 -0.19 -0.21 -0.04 0.31 -0.06
0.18 -0.08 -0.16 -0.03 -0.1 0.22 -0.09
0.29 -0.02 -0.06 -0.11 -0.25 0.28 -0.24
0.47 -0.13 -0.1 -0.17 -0.46 0.38 -0.23
0.29 -0.27 -0.2 -0.2 -0.22 0.48 -0.05
0.25 -0.01 -0.03 -0.08 -0.09 0.07 -0.15
Msp_g09839 (RAR1)
0.08 0.02 -0.1 0.06 -0.49 0.31 0.0
0.26 -0.29 -0.08 -0.25 -0.19 0.62 -0.33
0.11 -0.08 0.05 -0.06 -0.41 0.34 -0.06
Msp_g10337 (VPS20.2)
0.35 -0.1 -0.09 -0.06 -0.38 0.14 0.03
Msp_g10497 (ARP4)
0.02 -0.05 -0.05 0.08 -0.15 0.08 0.05
0.25 -0.03 -0.01 -0.02 -0.32 0.1 -0.03
0.25 -0.26 0.03 -0.27 -0.19 0.5 -0.25
0.22 -0.04 -0.11 0.07 -0.21 0.14 -0.13
Msp_g10884 (PVA12)
-0.0 -0.05 -0.08 -0.02 -0.36 0.36 0.06
0.08 -0.05 0.13 0.06 -0.39 0.22 -0.14
0.38 -0.39 -0.54 -0.28 -0.4 0.84 -0.17
Msp_g11700 (EMB2751)
0.26 -0.06 -0.01 -0.18 -0.11 0.17 -0.14
0.05 0.03 -0.0 -0.04 -0.28 0.27 -0.08
0.28 0.0 0.05 -0.05 -0.06 0.09 -0.41
0.21 -0.03 0.11 0.04 -0.8 0.27 -0.04
0.12 0.06 -0.08 0.06 -0.32 0.29 -0.23
Msp_g13806 (MTN1)
0.02 0.03 -0.11 0.04 -0.39 0.3 0.02
0.07 0.09 -0.07 -0.02 -0.26 0.19 -0.05
Msp_g14340 (ELF9)
0.2 -0.06 -0.08 -0.02 -0.06 0.16 -0.19
0.21 -0.13 -0.06 0.03 -0.73 0.39 0.05
Msp_g15923 (GC2)
0.13 0.04 -0.05 0.06 -0.29 0.13 -0.05
0.37 -0.21 -0.81 -0.14 -0.4 0.87 -0.36
Msp_g18925 (TRANS11)
0.13 0.02 -0.08 0.02 -0.16 0.17 -0.14
Msp_g19391 (ATCOAE)
0.21 -0.04 -0.23 -0.0 -0.25 0.38 -0.19
0.11 -0.01 0.09 0.09 -0.54 0.19 -0.04
0.45 -0.02 -0.19 -0.08 -0.38 0.37 -0.38
Msp_g20678 (SK31)
0.06 0.04 0.01 0.02 -0.35 0.24 -0.09
0.3 -0.19 -0.25 -0.24 -0.07 0.34 -0.02
Msp_g24188 (VPS2.1)
0.19 -0.05 0.11 0.02 -0.87 0.32 0.0
0.25 -0.16 -0.18 -0.08 -0.38 0.56 -0.24
0.48 0.16 -0.24 -0.03 -0.9 0.36 -0.25
0.28 -0.04 -0.02 -0.12 -0.04 0.34 -0.59
0.26 0.05 -0.04 -0.05 -0.64 0.3 -0.07
0.16 -0.07 -0.06 0.02 -0.1 0.2 -0.18
Msp_g27376 (AP19)
0.11 0.01 -0.11 -0.01 -0.1 0.23 -0.17
Msp_g28961 (ACBP)
0.53 -0.11 -0.13 -0.15 -0.65 0.49 -0.38
0.24 -0.08 -0.0 -0.15 -0.19 0.14 -0.02
Msp_g29467 (VPS45)
0.25 -0.0 -0.06 0.0 -0.28 0.13 -0.09
Msp_g30374 (GRP4)
0.15 -0.02 0.05 0.02 -0.32 0.12 -0.06
0.35 -0.2 -0.31 -0.06 -0.27 0.4 -0.09
0.3 -0.12 -0.22 -0.17 -0.31 0.52 -0.22
0.24 0.01 -0.23 -0.02 -0.3 0.36 -0.19
Msp_g32019 (FUM1)
-0.0 0.07 -0.12 0.01 -0.12 0.25 -0.13
Msp_g32324 (SUT2)
0.19 -0.03 -0.09 0.01 -0.46 0.3 -0.04
0.43 -0.17 -0.21 0.01 -0.28 0.39 -0.39
0.33 -0.06 -0.24 -0.06 -0.22 0.27 -0.12
0.21 -0.07 -0.13 -0.03 -0.08 0.17 -0.11
Msp_g36792 (emb1345)
0.1 -0.01 -0.22 -0.08 -0.07 0.33 -0.11
0.15 0.06 -0.05 0.02 -0.28 0.15 -0.09
0.12 0.01 -0.07 -0.01 -0.28 0.28 -0.12
Msp_g42437 (TAF11)
0.01 0.1 -0.05 -0.0 -0.34 0.18 0.05
Msp_g44292 (UBC7)
0.24 -0.1 -0.01 -0.03 -0.43 0.36 -0.17
0.29 0.04 -0.05 -0.03 -0.33 0.18 -0.18

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.