Heatmap: Cluster_35 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Fertile Leaflet with Sori	Primary Rachis	Secondary Rachis	Petiole	Crozier	Rhizome	Root
Msp_g00032	0.18	1.0	0.19	0.7	0.27	0.25	0.51
Msp_g00233	0.33	1.0	0.4	0.8	0.33	0.25	0.68
Msp_g00254 (ARR7)	0.15	0.99	0.43	1.0	0.16	0.25	0.4
Msp_g02048 (TLP3)	0.25	0.86	0.36	1.0	0.34	0.24	0.76
Msp_g04610	0.38	0.98	0.56	0.85	0.1	0.19	1.0
Msp_g05053	0.05	0.83	0.2	1.0	0.15	0.29	0.75
Msp_g05645 (SPT)	0.21	0.88	0.61	1.0	0.43	0.41	0.28
Msp_g06650	0.76	1.0	0.79	0.94	0.49	0.56	0.48
Msp_g07911 (MYB8)	0.31	0.85	0.41	1.0	0.13	0.38	0.66
Msp_g07913	0.01	0.83	0.14	1.0	0.04	0.0	0.0
Msp_g09568 (EXL2)	0.14	0.69	0.23	1.0	0.12	0.19	0.99
Msp_g11503	0.04	0.64	0.39	1.0	0.1	0.05	0.42
Msp_g14582	0.0	0.82	0.27	1.0	0.06	0.31	0.65
Msp_g15857 (HSS)	0.32	0.91	0.66	1.0	0.59	0.45	0.29
Msp_g15858	0.27	0.85	0.55	1.0	0.56	0.41	0.3
Msp_g16111	0.0	1.0	0.13	0.45	0.05	0.03	0.36
Msp_g16377	0.08	0.62	0.04	1.0	0.0	0.04	0.0
Msp_g16415	0.27	0.64	0.24	0.83	0.08	0.09	1.0
Msp_g16830	0.04	0.15	0.25	1.0	0.0	0.0	0.0
Msp_g16912	0.01	0.84	0.37	1.0	0.03	0.0	0.09
Msp_g17005 (RR3)	0.11	1.0	0.27	1.0	0.11	0.24	0.28
Msp_g17171	0.2	0.69	0.45	0.96	0.33	0.29	1.0
Msp_g17569	0.03	0.9	0.36	1.0	0.08	0.2	0.16
Msp_g17631	0.31	0.5	0.37	0.65	0.35	0.35	1.0
Msp_g17714	0.0	0.75	0.23	1.0	0.04	0.14	0.3
Msp_g17823	0.2	0.71	0.58	0.86	0.22	0.2	1.0
Msp_g18146	0.09	0.69	0.39	1.0	0.01	0.05	0.92
Msp_g18153	0.13	0.69	0.36	0.87	0.11	0.13	1.0
Msp_g18165	0.1	0.87	0.49	1.0	0.16	0.18	0.68
Msp_g18269	0.06	0.59	0.34	0.73	0.03	0.04	1.0
Msp_g18288	0.03	0.61	0.46	1.0	0.0	0.0	0.54
Msp_g18314	0.04	0.55	0.38	0.7	0.02	0.06	1.0
Msp_g18371	0.06	0.47	0.26	0.67	0.05	0.06	1.0
Msp_g18374	0.0	0.74	0.1	1.0	0.0	0.02	0.2
Msp_g18612	0.3	0.46	0.33	0.56	0.13	0.12	1.0
Msp_g19159	0.0	0.64	0.27	1.0	0.03	0.02	0.35
Msp_g20350 (HSP81-3)	0.34	0.73	0.65	1.0	0.11	0.1	0.64
Msp_g20355 (CYTC-1)	0.14	0.58	0.17	1.0	0.0	0.0	0.35
Msp_g20398	0.01	0.9	0.48	1.0	0.01	0.08	0.6
Msp_g20589	0.01	0.95	0.09	1.0	0.04	0.08	0.63
Msp_g21242	0.32	0.81	0.5	1.0	0.5	0.37	0.54
Msp_g21527	0.11	0.2	0.07	1.0	0.0	0.0	0.0
Msp_g21555 (PHT3;1)	0.14	0.03	0.06	1.0	0.0	0.0	0.04
Msp_g22278	0.0	0.4	0.21	0.53	0.03	0.07	1.0
Msp_g22904	0.4	1.0	0.5	0.88	0.05	0.13	0.56
Msp_g23081	0.01	0.72	0.25	1.0	0.02	0.14	0.19
Msp_g23159	0.02	0.64	0.25	0.64	0.05	0.05	1.0
Msp_g23220	0.03	0.84	0.4	1.0	0.05	0.06	0.48
Msp_g23260	0.24	0.56	0.45	0.67	0.18	0.18	1.0
Msp_g23285	0.0	0.49	0.03	1.0	0.0	0.0	0.0
Msp_g23455	0.23	1.0	0.32	0.67	0.07	0.22	0.9
Msp_g23488	0.04	0.51	0.33	0.58	0.03	0.04	1.0
Msp_g23886	0.15	1.0	0.39	0.86	0.03	0.0	0.75
Msp_g24050	0.33	0.79	0.49	1.0	0.12	0.14	0.45
Msp_g24216	0.06	0.81	0.41	1.0	0.1	0.19	0.74
Msp_g24239	0.05	0.37	0.12	1.0	0.0	0.0	0.0
Msp_g24268	0.06	0.79	0.34	1.0	0.01	0.06	0.42
Msp_g24313	0.07	0.45	0.26	0.51	0.08	0.04	1.0
Msp_g25657	0.16	0.5	0.25	0.58	0.12	0.2	1.0
Msp_g27277	0.0	0.63	0.3	0.7	0.0	0.0	1.0
Msp_g27325	0.06	0.57	0.2	1.0	0.0	0.0	0.0
Msp_g27379	0.03	1.0	0.48	0.63	0.09	0.45	0.87
Msp_g29589	0.32	0.7	0.59	1.0	0.4	0.45	0.59
Msp_g30047	0.04	0.4	0.26	0.52	0.03	0.03	1.0
Msp_g30464	0.03	0.43	0.28	0.51	0.03	0.04	1.0
Msp_g33710	0.2	0.71	0.47	1.0	0.09	0.1	0.85
Msp_g34049	0.3	0.91	0.64	1.0	0.67	0.45	0.32
Msp_g34368	0.01	0.65	0.33	0.9	0.0	0.02	1.0
Msp_g34563	0.06	0.58	0.05	0.23	0.03	0.0	1.0
Msp_g34652	0.01	0.79	0.34	1.0	0.01	0.0	0.45
Msp_g34747	0.02	0.3	0.33	0.43	0.02	0.03	1.0
Msp_g34836	0.07	0.65	0.33	1.0	0.04	0.03	0.45
Msp_g34838	0.05	0.42	0.25	0.53	0.09	0.08	1.0
Msp_g34843	0.0	0.48	0.26	1.0	0.0	0.0	0.9
Msp_g34859	0.01	0.56	0.35	0.84	0.02	0.03	1.0
Msp_g34869	0.02	0.63	0.36	1.0	0.01	0.03	0.67
Msp_g34916	0.17	0.54	0.36	0.62	0.23	0.22	1.0
Msp_g34953	0.03	0.63	0.34	1.0	0.0	0.0	0.4
Msp_g34979	0.0	0.8	0.35	1.0	0.0	0.05	0.42
Msp_g35746	0.25	0.83	0.49	1.0	0.3	0.22	0.48
Msp_g35822	0.0	0.76	0.15	1.0	0.3	0.06	0.15
Msp_g35823	0.04	1.0	0.21	0.84	0.0	0.0	0.29
Msp_g36087	0.15	0.59	0.46	0.66	0.17	0.15	1.0
Msp_g36379	0.04	0.49	0.29	0.6	0.02	0.03	1.0
Msp_g36434	0.01	0.28	0.11	0.53	0.03	0.02	1.0
Msp_g36949	0.55	0.96	0.52	1.0	0.28	0.41	0.55
Msp_g37021	0.13	1.0	0.72	0.69	0.03	0.27	0.52
Msp_g37089	0.05	0.51	0.27	0.74	0.0	0.01	1.0
Msp_g37130	0.22	0.49	0.44	0.73	0.25	0.19	1.0
Msp_g37823	0.12	0.28	0.31	0.57	0.13	0.15	1.0
Msp_g38114	0.08	0.32	0.18	0.45	0.03	0.03	1.0
Msp_g39133	0.02	0.21	0.1	0.36	0.02	0.04	1.0
Msp_g39600	0.31	0.65	0.45	1.0	0.27	0.12	0.93
Msp_g39624	0.0	1.0	0.34	0.96	0.03	0.06	0.45
Msp_g39676	0.01	0.43	0.21	0.62	0.01	0.08	1.0
Msp_g39685	0.02	0.82	0.37	1.0	0.03	0.02	0.42
Msp_g39692	0.02	0.36	0.25	0.46	0.01	0.04	1.0
Msp_g39734	0.0	0.75	0.35	1.0	0.0	0.02	0.65
Msp_g39755	0.08	0.58	0.42	0.65	0.01	0.02	1.0
Msp_g39780	0.04	0.53	0.37	0.7	0.01	0.0	1.0
Msp_g41427	0.0	0.98	0.24	1.0	0.05	0.19	0.23
Msp_g43988	0.19	0.49	0.31	0.65	0.08	0.11	1.0
Msp_g45602	0.05	0.81	0.26	1.0	0.39	0.12	0.14
Msp_g45643	0.28	0.96	0.55	1.0	0.22	0.16	0.53
Msp_g45755	0.02	1.0	0.11	1.0	0.07	0.0	0.0
Msp_g46095	0.0	0.9	0.29	1.0	0.04	0.14	0.15
Msp_g46186	0.04	0.41	0.28	0.54	0.02	0.03	1.0
Msp_g46282	0.21	0.53	0.45	0.71	0.3	0.14	1.0
Msp_g46348	0.28	0.65	0.41	0.74	0.27	0.29	1.0
Msp_g46458	0.27	0.72	0.42	1.0	0.2	0.12	0.46
Msp_g46668	0.13	1.0	0.61	0.69	0.06	0.31	0.58
Msp_g47007	0.05	0.43	0.32	0.62	0.01	0.03	1.0
Msp_g47041	0.16	1.0	0.54	0.87	0.06	0.28	0.61
Msp_g47155	0.08	0.91	0.58	1.0	0.12	0.07	0.8
Msp_g47636	0.04	0.41	0.22	0.5	0.01	0.03	1.0
Msp_g47828	0.55	0.82	0.39	1.0	0.51	0.52	0.51

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)