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Heatmap: Cluster_13 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

 Transpose table  Download table
Gene
Fertile Leaflet with Sori
Primary Rachis
Secondary Rachis
Petiole
Crozier
Rhizome
Root
0.14 -0.09 -0.11 -0.02 -0.27 0.02 0.28
0.1 0.02 -0.32 -0.03 -0.36 0.15 0.32
Msp_g00562 (SNL4)
 0.57 -0.08 -0.18 -0.13 -0.65 -0.31 0.41
0.5 -0.07 0.03 -0.06 -0.94 -0.17 0.32
0.44 0.0 -0.05 -0.02 -0.7 -0.23 0.29
0.42 -0.14 0.05 -0.08 -1.01 -0.45 0.63
0.5 -0.15 -0.3 -0.1 -0.3 -0.21 0.33
Msp_g01498 (PUB14)
 0.57 0.04 -0.15 0.16 -1.14 -0.9 0.57
0.35 -0.2 -0.0 0.0 -0.59 -0.21 0.42
0.69 -0.33 -0.09 -0.24 -1.01 -0.27 0.57
0.33 0.0 -0.05 -0.05 -0.49 -0.08 0.2
0.45 -0.28 -0.18 -0.03 -0.47 -0.02 0.32
0.33 -0.14 -0.04 -0.05 -0.47 -0.17 0.37
0.77 -0.54 -0.05 -0.01 -2.17 -2.36 1.16
0.45 -0.13 -0.28 -0.14 -0.62 -0.12 0.5
Msp_g02802 (AOS)
 0.8 -0.15 -0.43 -0.21 -1.72 -0.71 0.88
0.73 -0.2 -0.25 -0.11 -1.83 -0.52 0.78
0.44 -0.08 -0.37 -0.22 -0.33 -0.02 0.36
0.46 -0.06 -0.09 -0.05 -0.67 -0.11 0.25
Msp_g03923 (BCDH BETA1)
 0.31 0.02 -0.14 0.07 -0.53 -0.24 0.32
0.41 -0.08 -0.04 0.02 -0.83 -0.43 0.52
0.18 -0.06 -0.13 -0.01 -0.16 -0.09 0.23
0.36 0.0 -0.15 0.25 -0.8 -0.3 0.3
0.54 0.13 -0.08 0.11 -1.48 -0.37 0.37
0.34 -0.07 0.01 -0.07 -0.71 -0.12 0.37
0.44 0.03 0.11 -0.12 -0.68 -0.38 0.29
Msp_g05401 (APA1)
 0.51 -0.1 0.1 -0.09 -0.85 -0.22 0.27
0.48 -0.19 -0.51 0.07 -0.61 -0.05 0.44
Msp_g05513 (NADK3)
 0.41 -0.18 -0.2 -0.04 -0.42 -0.18 0.39
0.7 -0.4 -0.16 -0.3 -0.62 -0.31 0.54
0.53 -0.19 -0.07 -0.13 -0.77 -0.09 0.36
0.34 -0.03 -0.09 -0.04 -0.63 -0.2 0.4
0.77 -0.16 -0.95 -0.17 -1.02 -0.12 0.66
Msp_g06465 (MYC2)
 0.56 -0.19 -0.45 -0.23 -2.14 -1.65 1.33
Msp_g06548 (VTC2)
 0.26 -0.01 -0.18 -0.0 -0.37 -0.31 0.43
Msp_g07249 (XCP1)
 0.34 -0.07 -0.13 0.02 -0.74 -0.09 0.39
0.75 -0.33 0.0 -0.4 -1.04 -0.57 0.67
0.3 0.06 0.06 -0.01 -0.56 -0.23 0.21
0.44 -0.06 0.07 0.06 -0.83 -0.41 0.36
0.4 0.04 0.07 -0.02 -1.28 -0.25 0.44
0.41 -0.07 -0.21 0.03 -0.56 -0.15 0.33
0.49 -0.25 -0.09 -0.16 -0.77 -0.17 0.53
Msp_g08577 (PGSIP6)
 0.4 -0.06 0.12 -0.02 -0.71 -0.36 0.34
0.58 -0.17 0.02 -0.13 -0.84 -0.49 0.5
0.45 -0.01 -0.02 -0.06 -0.76 -0.43 0.45
0.0 0.01 -0.53 -0.14 -0.57 0.2 0.65
Msp_g09096 (BGAL17)
 0.37 -0.12 0.12 -0.08 -0.58 -0.45 0.45
0.65 -0.19 -0.12 -0.29 -0.89 -0.28 0.55
Msp_g10003 (LPP2)
 0.44 -0.1 0.03 -0.05 -0.79 -0.36 0.45
0.34 -0.14 -0.15 -0.12 -0.59 0.06 0.37
0.29 -0.06 0.03 -0.04 -0.44 -0.06 0.18
0.27 -0.15 -0.08 -0.11 -0.12 -0.03 0.15
0.59 -0.37 -0.05 -0.1 -1.84 -0.61 0.92
Msp_g10888 (COV1)
 0.44 -0.16 -0.17 -0.22 -0.52 -0.12 0.47
Msp_g10961 (LPP2)
 0.54 -0.07 -0.2 -0.04 -1.31 -0.3 0.62
0.39 0.05 -0.19 -0.08 -0.35 -0.22 0.25
0.47 -0.1 0.1 0.02 -0.89 -0.5 0.43
Msp_g11104 (KCO5)
 0.48 -0.13 -0.07 0.0 -0.72 -0.21 0.35
0.4 -0.04 -0.03 0.03 -0.67 -0.12 0.21
Msp_g11200 (ATL5)
 0.26 -0.06 -0.02 -0.04 -0.34 -0.31 0.37
Msp_g11556 (ALIS1)
 0.41 -0.18 -0.16 -0.12 -0.69 -0.0 0.44
0.74 -0.16 -0.35 -0.17 -0.51 -0.23 0.28
0.32 0.04 0.11 -0.09 -0.89 -0.17 0.35
0.34 -0.09 0.08 -0.05 -0.88 -0.13 0.4
0.36 -0.26 -0.45 -0.14 -1.2 0.11 0.78
0.22 -0.26 -0.2 -0.09 -0.27 0.09 0.37
Msp_g12359 (CSY2)
 0.45 -0.03 0.24 -0.04 -0.97 -0.35 0.27
Msp_g12360 (CSY2)
 0.37 -0.14 0.05 -0.03 -0.67 -0.19 0.35
0.38 -0.07 -0.12 0.0 -0.56 -0.18 0.34
0.26 0.07 -0.01 0.21 -0.83 -0.2 0.23
0.51 -0.4 0.1 -0.37 -1.0 -0.16 0.66
Msp_g12901 (MPK4)
 0.76 -0.18 0.16 -0.07 -2.42 -1.1 0.76
0.4 -0.14 -0.37 -0.02 -0.35 0.03 0.28
0.38 -0.11 -0.05 -0.07 -0.48 -0.18 0.32
0.3 -0.07 0.01 -0.01 -0.61 -0.27 0.41
0.33 -0.24 -0.12 -0.13 -0.48 -0.12 0.51
0.3 -0.01 -0.05 -0.08 -0.54 -0.12 0.33
Msp_g14154 (CNGC15)
 0.25 -0.04 0.12 -0.03 -0.53 -0.12 0.22
Msp_g14603 (ISPF)
 0.83 -0.32 0.21 -0.35 -1.61 -1.11 0.75
0.53 -0.36 -0.11 -0.21 -0.63 -0.13 0.51
0.35 -0.15 -0.28 -0.09 -0.43 -0.08 0.45
Msp_g15292 (UPS1)
 0.68 -0.19 -0.31 -0.19 -1.24 -1.05 0.95
0.47 -0.18 -0.09 -0.05 -0.49 -0.16 0.29
0.6 -0.57 -0.2 -0.62 -1.67 -0.01 0.99
0.86 -0.17 -0.34 -0.48 -0.84 -0.48 0.6
0.33 -0.08 -0.06 0.22 -0.97 -0.0 0.22
0.36 -0.12 -0.03 -0.13 -0.6 -0.22 0.47
0.29 -0.19 -0.21 0.08 -0.34 -0.21 0.4
0.53 -0.34 -0.11 -0.03 -0.65 -0.72 0.7
0.65 -0.32 -0.46 -0.11 -0.39 -0.31 0.49
Msp_g20274 (PED2)
 0.32 -0.06 -0.0 -0.08 -0.48 -0.1 0.26
Msp_g20371 (RAT5)
 0.16 -0.1 -0.66 0.1 -0.64 0.15 0.58
0.54 -0.32 -0.16 -0.0 -1.44 -0.38 0.77
0.44 -0.03 -0.61 0.04 -0.75 -0.09 0.53
0.35 -0.11 -0.07 -0.06 -0.41 -0.03 0.21
0.5 -0.11 -0.21 0.01 -0.61 -0.4 0.46
0.01 0.06 -0.37 0.01 -0.46 0.01 0.52
0.38 -0.06 -0.05 -0.04 -0.78 -0.06 0.34
Msp_g23826 (NF-YA7)
 0.32 -0.13 -0.74 -0.01 -1.14 0.32 0.63
0.57 -0.38 -0.18 -0.12 -0.93 -0.36 0.72
Msp_g24602 (CNBT1)
 0.65 -0.26 -0.18 -0.26 -1.04 -0.32 0.67
Msp_g24794 (CAD1)
 0.23 -0.16 -0.17 0.05 -0.34 -0.27 0.48
0.46 -0.18 -0.42 -0.09 -0.79 -0.25 0.71
0.53 -0.15 0.06 -0.03 -0.82 -0.32 0.33
0.41 -0.16 -0.04 -0.05 -0.73 -0.45 0.6
Msp_g26165 (DPBF3)
 0.29 -0.05 -0.31 0.1 -0.37 -0.17 0.34
0.39 -0.05 -0.27 -0.05 -0.42 -0.18 0.36
0.96 -0.25 -1.28 -0.12 -3.6 -0.36 1.01
Msp_g26583 (CNGC5)
 0.33 -0.08 -0.21 -0.06 -0.35 -0.4 0.52
Msp_g27156 (VPS32)
 0.08 -0.04 -0.11 0.05 -0.48 0.11 0.27
0.55 -0.25 -0.14 -0.24 -0.7 -0.15 0.51
0.57 -0.12 -0.75 0.21 -2.35 -0.08 0.77
0.06 -0.16 -0.41 -0.3 -0.65 0.26 0.73
0.64 -0.19 -0.38 0.13 -2.36 -0.47 0.84
0.13 0.05 -0.18 -0.01 -0.18 -0.08 0.22
0.61 -0.36 0.11 -0.18 -2.2 0.22 0.43
0.09 -0.02 -0.45 0.16 -0.45 -0.25 0.61
0.43 -0.21 -0.07 -0.16 -0.7 -0.25 0.57
0.22 -0.12 0.07 -0.04 -0.45 0.06 0.16
0.38 -0.12 -0.69 0.16 -0.46 -0.05 0.43
1.0 -0.03 -0.84 -0.33 -1.91 -1.61 1.05
Msp_g32158 (GST8)
 1.04 -0.44 0.18 -0.38 -2.97 -2.42 0.99
0.8 -0.58 0.12 -1.34 -2.59 -0.68 1.22
0.52 -0.03 -0.62 0.2 -0.58 -0.02 0.17
0.37 -0.05 -0.36 -0.02 -0.68 -0.21 0.57
Msp_g35739 (NUDX1)
 0.68 -0.27 -0.06 -0.36 -1.19 -0.49 0.75
Msp_g36325 (MPK4)
 0.53 -0.28 -0.19 -0.25 -1.07 -0.31 0.8
0.54 -0.11 0.01 0.02 -0.97 -0.28 0.34
Msp_g37340 (MAMI)
 0.59 -0.19 0.06 -0.13 -0.93 -0.78 0.64
Msp_g37472 (XBAT35)
 0.23 0.03 -0.03 0.06 -0.42 -0.13 0.17
0.36 -0.08 -0.08 -0.02 -0.65 -0.28 0.46
0.44 -0.11 -0.13 -0.09 -0.52 -0.12 0.32
0.66 -0.11 0.11 -0.22 -1.28 -0.69 0.6
Msp_g38007 (NLP7)
 0.51 -0.13 -0.12 0.17 -1.07 -0.47 0.5
Msp_g38927 (HTA3)
 0.07 0.05 -0.33 -0.06 -0.76 0.09 0.6
0.4 -0.11 -0.31 0.02 -0.87 -0.03 0.49
0.71 -0.18 0.14 -0.33 -1.8 -1.2 0.89
Msp_g43811 (VPS32)
 0.48 -0.05 0.1 -0.06 -0.89 -0.32 0.34
Msp_g44479 (ATG18D)
 0.51 -0.16 -0.16 -0.17 -0.57 -0.28 0.49
Msp_g44795 (CXE17)
 0.25 -0.32 -0.25 -0.07 -0.83 0.11 0.65
0.38 0.06 -0.08 0.05 -0.92 -0.14 0.3
0.59 0.03 -0.54 -0.03 -0.63 -0.32 0.44
0.15 0.09 -0.36 -0.02 -0.92 0.26 0.42
0.25 -0.01 -0.3 0.01 -0.33 -0.2 0.42
0.61 -0.24 -0.47 -0.38 -1.69 -0.27 0.99
Msp_g47832 (DMC1)
 0.62 -0.04 -1.03 -0.02 -3.01 -0.12 0.98
0.82 -0.37 -0.72 -0.1 -1.66 -0.05 0.7
Msp_g48843 (MKP1)
 0.43 -0.13 -0.05 -0.09 -0.35 -0.43 0.39

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.