1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_106 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
Fertile Leaflet with Sori
Primary Rachis
Secondary Rachis
Petiole
Crozier
Rhizome
Root
23.95 2.05 7.23 2.59 21.88 15.3 2.58
Msp_g01051 (MEE49)
 17.43 14.99 14.15 14.58 18.68 16.59 14.32
4.86 0.02 0.05 0.04 5.93 4.94 0.72
19.48 0.78 2.26 0.42 12.53 10.01 4.7
14.86 3.37 7.26 3.35 13.81 9.15 3.36
11.51 3.08 4.68 3.14 11.52 10.96 2.73
Msp_g01613 (LIN2)
 38.33 18.51 28.89 19.12 35.73 27.6 11.92
221.07 3.41 61.88 1.81 104.14 67.25 32.73
14.89 0.0 0.0 0.0 16.02 10.23 0.08
Msp_g01921 (CSD2)
 137.74 61.21 94.63 53.11 127.29 107.51 42.59
22.52 15.15 18.23 16.36 22.77 19.68 17.39
Msp_g02063 (RH39)
 7.57 4.35 5.17 3.91 8.05 7.76 4.01
5.35 2.91 3.31 3.02 4.6 4.42 2.93
118.62 43.42 68.67 41.23 89.79 78.46 36.81
Msp_g02704 (WCRKC2)
 12.86 2.88 7.32 2.6 11.71 8.86 2.07
Msp_g02800 (FTSZ2-2)
 7.71 2.86 4.62 3.12 7.87 6.36 2.85
1.39 0.95 0.71 0.35 2.65 1.32 0.08
Msp_g03192 (FMO1)
 9.7 0.4 2.14 0.48 10.32 8.21 0.52
8.49 3.73 3.03 4.67 7.67 8.23 3.57
9.81 0.5 0.36 0.13 9.09 8.43 0.06
23.5 8.12 12.97 8.31 17.92 13.73 8.43
688.72 59.31 85.11 73.11 752.48 645.04 42.24
Msp_g04670 (BGLU42)
 20.45 3.2 10.15 3.18 19.8 10.41 0.76
Msp_g04677 (NLM4)
 22.47 6.43 3.77 9.02 18.2 10.62 1.13
20.96 14.9 15.65 13.82 21.09 18.67 12.27
Msp_g05545 (PSAE-2)
 28.06 2.36 9.79 2.48 23.7 9.89 1.55
20.17 14.89 15.2 15.12 20.71 18.9 13.31
Msp_g05859 (GDC1)
 27.28 8.76 16.88 10.72 34.58 26.31 5.68
Msp_g06257 (crr1)
 3.99 1.33 1.72 1.09 3.52 2.63 1.02
4.63 3.17 2.52 3.18 4.25 3.57 2.28
Msp_g06437 (PSBY)
 23.17 8.77 14.64 7.73 27.26 20.48 4.36
Msp_g06438 (PSBY)
 20.21 8.29 14.35 8.18 28.89 16.67 3.64
59.2 9.97 28.9 9.61 49.61 28.36 6.01
Msp_g06582 (LIP1)
 3.12 0.06 0.11 0.04 3.3 2.75 0.24
3.01 0.0 0.02 0.0 2.66 2.48 0.0
209.01 98.42 132.95 99.17 187.96 153.17 113.77
71.94 35.19 50.04 36.43 64.84 43.59 33.21
9.54 5.84 5.3 6.43 8.48 8.6 6.01
1.8 0.01 0.0 0.0 2.06 2.39 0.03
3.39 0.0 0.01 0.02 3.64 3.55 0.14
24.72 5.38 5.64 7.12 35.49 21.36 8.87
12.52 5.18 4.07 5.23 18.71 14.62 7.71
18.39 13.2 13.54 13.03 17.05 15.21 10.63
87.79 33.84 43.29 31.41 84.82 49.23 25.65
Msp_g07813 (KCS4)
 6.45 0.0 0.01 0.0 6.47 6.11 0.04
283.18 19.15 92.29 15.98 213.97 151.46 25.77
Msp_g07999 (LHCB2)
 687.56 107.6 311.39 97.88 710.23 241.41 5.74
Msp_g08054 (PPOX)
 12.86 5.81 8.67 6.33 17.17 11.91 6.78
9.86 6.51 6.23 6.6 9.53 9.29 6.26
15.04 0.77 7.98 0.61 11.25 5.76 0.26
12.31 2.2 6.47 2.38 10.04 9.42 1.52
88.65 68.72 50.17 66.53 97.47 89.89 68.98
254.27 194.62 166.71 197.81 324.87 292.48 197.61
12.02 8.38 8.47 8.48 12.52 10.25 7.47
43.29 18.24 24.89 15.09 37.86 25.53 13.8
32.52 0.11 1.11 0.12 42.08 37.09 3.18
Msp_g09302 (KCS9)
 3.17 0.29 1.28 0.09 3.04 0.85 0.14
8.2 0.68 2.05 0.57 10.33 8.59 2.37
8.18 2.71 5.09 2.9 9.61 6.69 1.78
Msp_g10177 (GPAT6)
 10.02 0.0 0.01 0.0 9.72 6.98 0.09
39.92 22.02 30.63 20.54 35.97 34.27 21.04
14.56 4.13 4.7 5.61 12.27 14.44 6.6
77.75 30.24 41.79 29.86 73.0 47.37 16.13
Msp_g10664 (RPL12-C)
 27.09 8.0 11.93 6.9 30.79 13.82 5.86
9.01 0.0 0.0 0.0 13.41 6.12 0.27
Msp_g11492 (LIP1)
 2.99 0.08 0.49 0.32 3.0 2.88 0.15
Msp_g11708 (CPN21)
 88.18 55.65 67.39 52.81 93.9 79.17 55.76
36.61 11.35 21.45 11.33 35.39 18.51 9.82
22.31 12.74 15.47 11.16 29.16 19.6 8.62
Msp_g12356 (GR2)
 20.29 12.11 15.93 12.08 19.45 15.77 10.58
21.56 9.92 15.01 10.74 20.46 17.42 9.21
7.63 4.55 4.38 4.64 7.88 6.47 4.53
3.74 1.62 2.11 1.61 3.64 2.76 1.97
3.02 1.25 0.77 1.23 5.43 2.94 0.74
Msp_g15836 (LAC16)
 1.21 0.03 0.19 0.01 1.73 2.69 0.28
37.31 11.34 25.97 11.08 36.88 27.75 8.98
60.47 4.3 24.85 2.76 59.49 27.45 0.36
12.18 1.56 7.38 2.28 18.64 11.99 2.33
120.6 19.01 56.12 16.53 120.78 72.3 14.59
Msp_g18676 (TRP6)
 23.03 17.02 15.69 18.1 30.45 24.37 18.53
Msp_g19281 (HST)
 23.05 10.62 14.9 11.31 19.97 15.91 8.63
189.0 14.06 64.59 12.49 169.6 118.55 18.59
41.52 19.41 23.56 18.17 33.35 31.34 16.3
3.09 1.57 1.79 1.51 2.59 2.09 1.09
Msp_g19825 (RPL4)
 26.83 7.6 18.71 8.51 27.75 15.08 7.12
47.66 3.39 9.44 3.08 53.71 54.63 5.72
8.58 7.11 6.24 7.04 8.5 8.33 6.26
39.87 21.49 24.12 22.8 42.11 40.48 19.15
58.29 28.69 37.37 31.01 77.6 47.76 22.78
Msp_g22761 (LHB1B2)
 123.52 3.41 30.67 3.2 141.23 50.2 1.18
270.43 14.84 83.72 10.96 126.99 141.7 85.94
16.92 3.37 6.89 3.18 15.64 10.82 2.03
35.93 17.66 23.36 16.04 35.57 29.51 17.47
6.56 1.88 3.66 1.89 6.85 4.47 1.7
Msp_g24895 (STI)
 14.42 5.16 8.1 5.06 16.33 16.62 2.42
17.65 9.49 11.06 9.56 16.87 11.97 9.11
Msp_g25099 (LHB1B2)
 83.95 11.05 34.9 12.91 64.81 42.14 3.25
112.73 28.5 67.38 28.82 130.5 118.99 29.27
Msp_g25781 (SPT)
 14.35 2.27 3.72 2.63 15.43 10.09 3.3
Msp_g25902 (PUM23)
 5.38 3.81 3.38 3.55 6.89 5.92 4.57
5.74 2.15 2.56 2.44 6.06 4.89 2.06
Msp_g27103 (TRP1)
 37.44 19.6 22.52 21.06 37.56 35.41 13.86
Msp_g27216 (Deg1)
 9.25 4.13 6.61 4.4 8.7 8.24 5.2
3.69 1.03 0.43 0.08 4.71 2.32 0.42
4.35 0.0 0.0 0.0 2.2 2.77 0.0
21.67 7.18 7.78 7.57 16.89 16.75 4.28
6.52 0.05 0.75 0.0 5.52 3.02 0.0
22.73 8.89 16.76 8.33 21.47 18.49 8.34
14.0 0.85 3.34 0.23 9.72 3.91 0.79
6.08 0.32 2.0 0.63 11.59 6.32 0.43
24.86 7.52 13.46 6.98 17.7 11.99 6.74
6.1 2.85 3.44 3.33 5.54 4.72 2.79
3.05 0.69 1.34 1.07 2.68 1.83 1.05
4.56 0.0 0.18 0.0 2.86 4.26 0.0
13.09 7.46 8.4 8.69 12.27 10.01 7.78
1.79 0.53 0.49 0.97 5.44 7.58 1.46
13.9 9.92 10.73 9.96 13.57 12.45 8.9
31.07 1.4 5.05 0.58 20.5 16.35 3.04
7.22 0.71 1.78 0.81 6.22 4.46 1.46
4.76 3.41 3.8 3.36 4.68 4.1 3.43
111.05 28.46 15.38 36.17 84.46 64.47 12.51
4.29 2.31 2.82 2.68 5.84 5.4 2.98
48.36 9.11 11.95 6.5 36.09 29.39 10.63
22.68 2.44 10.78 1.73 23.01 11.58 3.68
13.18 5.21 4.99 6.16 18.06 16.04 7.61
71.52 1.96 20.84 0.8 45.94 28.3 14.05
14.34 8.69 9.33 8.21 13.88 13.17 10.14
13.66 0.0 0.67 0.0 13.06 17.47 0.91
2.39 1.3 1.22 1.24 2.11 2.03 1.42
28.18 5.0 7.93 5.32 23.05 13.78 2.62
63.42 0.45 1.13 0.22 62.93 47.04 0.9
3.61 0.0 0.0 0.0 3.57 6.18 0.76
9.93 0.49 3.56 0.0 7.9 2.46 0.3
Msp_g40384 (GPK1)
 5.67 1.41 0.91 1.35 6.41 6.79 1.03
6.72 0.04 0.16 0.0 6.57 2.48 0.12
2.54 0.51 0.67 0.82 4.67 4.01 0.39
363.99 22.94 154.39 23.13 260.06 169.42 24.06
2.24 0.44 0.96 1.25 3.36 1.71 0.21
30.86 9.2 9.22 8.33 30.98 24.37 13.4
22.41 3.98 4.41 3.98 19.74 14.8 8.95
Msp_g42564 (UGT85A1)
 14.54 1.67 4.93 1.16 15.79 13.34 1.4
Msp_g42575 (BETA-TIP)
 40.14 7.03 11.39 8.22 35.61 33.1 10.82
53.19 7.13 27.06 6.88 61.17 20.63 2.26
6.96 1.38 1.76 1.41 8.15 6.56 1.33
Msp_g44473 (SRS)
 9.01 4.17 6.31 4.26 7.6 6.1 4.25
3.96 1.39 2.89 1.81 3.63 2.64 1.53
10.32 0.21 1.95 0.1 9.41 7.46 0.2
2.59 0.11 0.23 0.15 2.12 1.16 0.05
1.48 0.16 0.42 0.46 2.39 1.98 0.43
7.08 0.44 2.67 1.41 6.1 4.42 1.27
17.34 6.85 10.82 9.59 13.94 14.73 8.06
Msp_g46879 (AGO1)
 10.01 5.15 4.65 4.99 11.32 8.4 6.3
5.29 3.2 2.67 3.41 5.17 5.21 3.01
3.73 0.02 0.6 0.01 3.69 2.76 0.09
17.19 10.38 10.39 11.1 17.5 14.77 11.23

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)