1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_126 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
Fertile Leaflet with Sori
Primary Rachis
Secondary Rachis
Petiole
Crozier
Rhizome
Root
3.75 2.4 2.19 1.4 7.87 2.44 0.55
2.81 0.73 1.97 1.39 5.85 2.22 0.85
1.58 0.2 0.46 0.33 2.48 1.45 0.68
164.15 57.83 47.09 46.47 241.63 117.67 32.37
2.78 1.97 2.05 1.89 7.1 2.23 0.86
3.61 0.12 0.34 0.18 6.64 3.46 0.36
2.81 0.0 0.06 0.0 6.06 3.14 0.02
2.02 0.72 0.69 0.78 2.67 1.72 0.78
1.95 0.55 0.44 0.17 5.4 3.2 0.29
Msp_g03006 (WLIM1)
 54.47 27.46 33.15 27.33 109.24 61.55 19.71
1.68 0.0 0.0 0.0 3.92 1.44 0.0
1.41 0.22 0.17 0.08 4.5 1.48 0.3
11.65 8.77 9.49 8.47 21.89 10.49 6.04
28.65 13.32 18.96 12.84 48.76 16.45 10.09
2.23 0.17 0.71 0.18 5.16 3.19 0.57
Msp_g05193 (LHCB5)
 78.47 17.07 46.2 16.62 128.62 37.12 12.12
Msp_g05438 (HEMA1)
 25.11 11.01 22.56 14.05 58.38 26.06 9.31
Msp_g05468 (MAR1)
 6.7 4.39 4.97 4.45 9.66 7.38 5.4
26.9 8.94 13.09 8.15 39.54 16.2 8.87
Msp_g06361 (TLP3)
 4.63 3.15 3.6 3.34 6.94 4.9 3.3
Msp_g06369 (CP31)
 26.91 20.19 22.63 18.92 31.1 26.05 15.4
Msp_g06482 (ROPGEF1)
 3.14 1.2 1.37 1.36 6.04 4.02 0.75
Msp_g06547 (SKL2)
 8.22 5.96 6.74 5.39 10.23 7.44 4.08
107.4 42.41 83.12 37.48 230.15 124.43 22.31
17.06 14.04 15.52 13.73 24.36 17.88 11.78
17.22 11.95 9.84 13.11 22.65 16.68 9.43
13.72 5.66 7.54 5.47 17.12 8.45 6.1
10.21 7.51 6.65 7.19 11.65 9.87 7.07
Msp_g07778 (UGT85A7)
 9.79 0.86 1.86 0.72 14.36 6.88 1.42
Msp_g08003 (VSR4)
 43.26 27.56 32.7 27.64 58.59 36.27 19.75
1.66 0.63 0.34 0.53 3.19 1.89 0.37
Msp_g09429 (ERS)
 19.36 10.32 14.72 10.29 31.58 12.25 10.55
38.18 31.15 31.74 28.05 54.38 33.04 22.47
Msp_g10412 (CAF)
 7.4 5.67 5.33 5.54 8.63 7.1 4.41
4.28 1.3 2.09 1.17 6.46 3.52 0.86
Msp_g10954 (HEMA1)
 26.19 2.71 10.98 2.34 58.26 16.6 0.81
Msp_g11084 (EGY3)
 16.52 12.53 12.63 12.13 23.52 15.51 8.53
Msp_g11314 (PTAC2)
 6.84 5.51 5.64 5.75 7.2 6.14 4.63
3.81 0.61 1.51 0.63 7.88 5.65 0.85
Msp_g11405 (ERL1)
 5.32 0.02 0.07 0.0 6.81 3.44 1.12
3.58 2.31 2.15 2.53 3.9 3.42 2.17
Msp_g13972 (ATATH8)
 7.32 2.47 4.29 2.55 9.39 4.52 1.7
Msp_g14074 (HY3)
 1.17 0.76 0.67 0.75 2.31 1.35 0.84
17.64 1.85 3.02 2.93 28.57 11.84 0.57
Msp_g14796 (TT7)
 54.05 37.35 42.55 43.03 115.77 71.1 10.83
Msp_g15230 (CRR22)
 1.52 1.25 1.03 1.19 2.01 1.46 0.9
1.74 0.65 0.86 0.61 2.69 1.02 0.45
Msp_g15581 (ICE1)
 1.3 0.03 0.18 0.1 2.67 1.07 0.09
Msp_g15753 (PDF2)
 6.04 0.01 0.13 0.0 13.83 8.1 0.17
21.83 10.91 14.84 10.9 29.87 20.22 4.7
8.27 0.0 0.0 0.0 18.4 7.45 0.0
46.3 32.72 40.4 33.29 75.37 38.2 29.29
16.53 9.14 11.26 11.39 29.02 19.04 10.74
19.98 13.06 13.69 11.81 22.3 16.12 7.67
11.72 4.97 5.54 5.1 18.61 8.12 2.63
5.34 3.28 3.42 3.43 6.17 5.13 3.35
14.53 5.22 7.07 4.35 31.79 14.58 0.26
3.0 1.89 1.3 1.95 3.71 2.68 1.73
15.06 7.22 10.32 8.17 27.93 19.87 10.97
Msp_g23784 (ALMT12)
 1.8 0.22 0.08 0.0 4.81 1.71 0.23
Msp_g24116 (emb1075)
 24.8 5.02 16.03 3.09 67.16 46.27 0.33
80.1 61.97 55.4 58.45 98.14 77.62 46.86
Msp_g26741 (CPSAR1)
 7.81 4.05 5.32 4.37 14.01 4.31 2.72
Msp_g27255 (ACSF)
 16.9 6.24 9.24 4.55 31.74 10.43 1.88
1.58 0.0 0.1 0.11 4.97 3.53 0.21
5.77 2.72 3.84 2.72 9.2 6.32 2.95
18.59 3.64 5.08 4.43 24.77 18.67 4.78
6.83 2.81 2.75 2.98 10.98 4.12 1.01
43.92 23.6 28.44 21.35 69.19 37.54 9.47
Msp_g31203 (CFM2)
 4.6 2.39 3.23 2.47 6.38 3.91 2.19
14.2 9.19 9.97 8.36 17.9 12.16 4.69
9.75 5.55 7.3 5.77 14.03 7.94 5.73
34.66 20.67 26.29 20.35 48.66 33.46 9.37
5.76 0.11 0.07 0.07 8.18 4.36 1.48
5.23 4.83 4.5 4.34 7.21 5.34 3.31
11.16 0.47 0.42 0.48 15.6 9.82 1.73
11.8 8.33 8.59 9.47 14.36 10.19 7.69
15.64 8.58 11.58 8.53 18.38 11.76 6.34
3.31 2.72 2.78 2.68 4.44 3.43 2.07
3.19 1.73 1.26 1.04 7.18 2.77 1.2
13.92 11.28 9.37 9.76 22.76 17.38 7.88
114.61 35.39 25.78 26.85 145.97 78.09 24.08
5.3 1.96 2.85 0.88 10.77 5.31 1.27
2.35 0.38 1.07 0.44 7.09 2.16 0.68
8.42 1.28 1.38 1.55 15.56 9.97 1.74
4.46 4.17 3.92 3.74 8.42 5.32 2.58
19.76 11.25 9.62 12.2 30.82 20.17 9.09
Msp_g44210 (GRF5)
 2.07 0.01 0.01 0.01 4.51 2.73 0.38
Msp_g44452 (DFB)
 5.45 4.06 4.8 4.61 8.0 6.31 4.64
6.02 5.56 3.5 5.09 10.94 8.1 4.64
1.85 2.25 0.9 1.1 4.09 2.81 1.19
4.29 1.37 2.35 0.28 8.98 2.72 1.86
3.18 0.42 2.24 0.36 10.6 2.3 1.89
2.47 0.34 2.44 0.24 8.18 5.35 0.37
1.94 0.44 0.91 0.62 3.22 1.82 1.02
5.69 0.6 1.6 0.78 10.97 7.69 1.28
Msp_g47004 (TWN3)
 49.64 35.61 43.68 36.64 81.7 43.05 29.61
9.53 4.67 6.34 5.09 13.38 10.05 2.11
7.34 5.43 6.59 5.54 12.94 9.77 6.05
1.79 0.5 1.09 0.3 5.7 1.53 0.8
Msp_g47405 (EGY2)
 7.43 3.54 4.96 3.73 12.11 7.75 2.06
6.03 4.61 4.8 4.93 7.31 5.42 4.43
30.37 23.8 25.69 24.44 40.72 31.42 27.05
2.88 0.0 0.14 0.0 6.18 3.45 0.0
6.41 3.15 5.35 3.19 9.56 4.67 3.67
6.2 4.05 7.24 4.11 20.0 7.31 2.76
9.6 4.46 7.48 4.74 12.73 8.23 3.17
1.67 0.94 2.33 0.94 5.6 2.38 1.11
14.48 2.34 8.06 2.12 23.43 9.31 0.06
4.25 2.72 2.72 2.72 5.37 4.17 3.03

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)