Heatmap: Cluster_163 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Fertile Leaflet with Sori
Primary Rachis
Secondary Rachis
Petiole
Crozier
Rhizome
Root
Msp_g00614 (ABC1)
80.26 39.24 53.27 38.77 22.33 26.49 35.01
82.76 23.32 39.93 20.71 6.31 5.43 27.85
24.64 6.17 9.97 6.53 3.0 4.09 7.44
294.8 96.83 145.44 95.38 22.0 27.78 94.1
Msp_g02037 (RP1)
13.51 6.04 8.17 6.0 2.76 3.01 4.82
37.29 21.86 27.72 22.32 16.3 17.15 23.49
Msp_g02775 (OPR2)
18.39 10.13 15.03 10.57 5.35 7.2 9.39
96.26 68.44 73.53 66.66 44.83 47.86 57.12
Msp_g03968 (TGA2)
50.15 25.9 38.04 26.27 15.33 17.04 24.94
12.69 3.69 5.93 3.64 2.22 1.87 4.62
61.52 25.81 22.86 31.16 6.1 6.11 22.66
61.89 31.28 43.61 33.16 20.32 20.99 28.57
4.98 2.57 2.39 2.02 0.55 0.89 2.15
28.1 13.32 19.38 14.55 8.01 9.6 13.96
35.69 21.54 27.38 20.73 9.75 11.34 14.09
34.8 22.48 28.59 22.13 9.79 13.05 17.11
65.73 43.54 53.85 43.89 20.32 27.9 35.02
75.36 30.77 45.42 33.33 1.5 3.23 23.62
Msp_g07290 (CPK30)
17.68 9.35 8.38 9.85 5.97 5.15 9.41
17.47 4.99 7.77 4.5 4.07 4.23 5.76
108.01 77.88 88.4 78.72 57.96 54.67 65.91
Msp_g08387 (AAT1)
7.8 2.48 3.91 2.48 0.76 0.84 3.16
Msp_g08791 (PKP1)
27.29 14.45 19.31 13.76 4.57 5.71 9.86
Msp_g09140 (GPX6)
136.98 59.54 90.14 52.85 23.19 34.06 55.53
Msp_g09391 (NF-YA7)
16.73 6.2 9.64 7.32 2.16 2.73 4.88
36.8 22.01 28.17 23.52 8.42 12.94 19.45
Msp_g09436 (ZIP2)
243.18 71.37 106.57 68.63 14.62 20.43 84.22
25.73 14.38 18.01 15.68 10.22 12.15 13.67
18.65 11.49 13.91 11.54 5.44 7.89 9.04
Msp_g10060 (BAT1)
14.75 5.29 9.67 5.21 1.95 1.76 5.3
Msp_g10064 (LYC)
66.15 39.59 48.09 40.66 25.68 29.67 39.94
8.9 5.42 6.9 6.29 3.94 4.27 5.19
14.61 8.86 10.58 8.5 6.16 6.76 8.57
29.61 14.29 15.8 14.03 5.8 4.29 9.59
Msp_g12432 (CYP716A1)
51.18 17.11 32.62 15.58 6.06 5.15 19.32
Msp_g13038 (UGT74E2)
34.41 21.92 25.02 22.41 14.83 14.97 22.55
24.86 7.27 12.73 7.02 3.45 3.89 7.85
Msp_g13320 (UKL1)
13.4 6.94 8.13 6.51 4.52 4.78 5.72
Msp_g14395 (MRP10)
20.5 14.67 18.19 14.36 9.78 9.98 12.51
Msp_g14593 (CLC-C)
8.58 3.54 4.45 3.51 1.56 1.84 3.46
38.9 12.15 19.48 11.46 5.44 3.41 14.45
Msp_g15981 (PAH1)
19.31 13.61 16.84 13.47 8.75 10.38 11.96
84.99 31.16 53.5 31.93 13.09 15.84 31.0
19.38 6.1 9.61 6.14 1.21 0.87 5.09
36.36 13.27 20.47 14.22 4.75 4.64 7.3
14.23 5.78 7.86 7.07 1.35 2.72 4.72
8.91 4.8 5.15 4.93 2.27 2.55 3.97
30.34 13.74 21.43 15.12 6.35 9.85 11.53
72.04 33.71 56.05 32.9 4.76 5.31 29.06
25.69 11.62 16.72 11.26 8.05 8.67 12.07
3.91 2.19 2.44 1.88 0.27 0.53 1.47
25.32 17.31 19.47 16.88 10.52 12.36 14.23
Msp_g24600 (PLDP1)
11.44 8.13 9.3 8.33 4.95 5.95 7.67
35.16 19.32 18.91 20.93 6.52 10.1 19.5
12.0 4.85 7.06 5.86 2.01 2.19 5.78
134.37 56.54 76.21 52.03 24.18 40.41 51.51
24.2 14.58 16.92 15.06 9.41 10.17 13.82
14.59 7.43 8.58 7.57 4.03 3.57 6.86
208.25 87.91 122.88 88.44 17.58 11.79 67.74
Msp_g26739 (GGT2)
11.96 6.22 5.81 5.68 1.54 1.27 4.45
57.83 28.07 39.52 28.27 13.42 14.99 20.22
47.06 24.23 30.93 23.89 11.02 13.94 22.47
46.87 26.13 33.63 26.24 14.33 15.62 25.26
20.12 10.32 12.79 10.4 8.65 8.33 10.86
27.36 20.44 24.34 19.83 12.51 14.29 15.72
Msp_g29201 (FIM5)
13.85 8.54 9.94 9.2 6.14 5.01 9.1
8.04 5.35 5.93 5.04 3.12 3.52 4.88
29.58 11.29 19.77 10.38 2.87 2.9 9.89
10.06 6.09 8.5 7.13 3.72 4.88 5.26
39.68 9.84 15.62 7.02 2.08 2.85 9.58
90.71 49.96 53.06 51.41 35.02 35.21 49.47
Msp_g37717 (MLO5)
13.59 5.24 8.23 4.0 0.2 0.37 3.49
Msp_g38480 (GEX1)
7.74 2.9 4.32 2.5 0.57 1.25 2.74
Msp_g43448 (LON2)
35.11 20.7 27.49 20.77 12.05 15.65 18.33
12.7 4.79 7.01 4.75 0.71 0.94 3.06
53.61 28.72 32.14 27.04 14.49 17.44 23.92
149.03 76.9 113.4 79.72 29.52 40.67 61.56
Msp_g46518 (IVD)
11.63 6.53 6.51 6.42 3.32 3.14 5.33
10.15 2.32 4.2 2.41 0.89 1.32 2.63
3.88 1.65 2.11 1.84 0.62 0.73 1.11
Msp_g47539 (J20)
80.03 26.53 39.78 29.28 2.35 2.38 14.86
32.62 21.21 21.24 21.56 12.69 11.68 21.11
20.86 4.87 9.58 4.87 0.37 0.87 4.53

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)