Heatmap: Cluster_43 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Sterile Leaflet
Fertile Leaflet with Sori
Petiole
Crozier
Rhizome
Root
171.0 106.53 55.25 84.25 48.6 42.59
Len_g00370 (RPL27)
284.75 172.53 49.29 83.37 36.78 34.61
142.34 107.91 41.21 56.52 29.46 20.29
42.4 29.26 10.39 13.03 3.63 3.73
Len_g00549 (LPA1)
15.33 11.24 6.01 8.54 5.22 5.19
Len_g00588 (UGT85A1)
19.38 10.53 0.46 6.77 0.41 0.53
Len_g01005 (emb1473)
164.89 124.3 39.02 74.36 27.0 21.36
71.89 53.14 28.61 44.81 24.9 20.24
Len_g01244 (Deg1)
27.22 19.27 6.42 12.94 3.77 3.72
Len_g01326 (LUT2)
118.14 62.79 29.37 39.68 19.07 15.16
Len_g01683 (CLPP4)
59.81 36.18 18.92 30.54 16.59 17.28
Len_g02031 (GDC1)
120.64 76.95 30.81 65.47 21.62 17.49
Len_g02114 (PSB28)
143.95 95.69 25.63 74.03 20.81 14.3
34.04 26.58 17.45 17.15 11.83 13.96
47.17 29.63 9.95 18.4 8.7 8.27
17.37 12.46 5.1 10.2 5.03 4.34
26.75 15.54 6.33 8.84 4.87 4.37
100.46 80.25 27.83 66.44 28.34 27.41
57.76 43.76 22.76 24.81 18.66 14.89
Len_g03262 (GSA2)
38.73 26.14 10.12 22.5 10.91 8.32
Len_g03320 (HCF173)
67.96 46.35 7.6 20.84 4.18 4.79
40.02 27.95 12.85 21.75 10.97 7.36
61.46 43.75 17.58 42.29 21.81 13.18
226.8 164.97 38.47 91.46 29.99 24.57
Len_g04642 (GR2)
46.06 35.31 16.26 28.14 18.09 14.84
Len_g04986 (SEP1)
56.25 41.87 19.88 41.67 15.64 12.12
Len_g05004 (FD3)
62.42 45.13 14.68 17.02 9.33 11.0
72.0 55.45 18.27 39.58 21.5 12.78
58.92 34.42 13.78 18.45 9.76 8.26
189.66 120.1 34.44 84.47 19.6 14.54
87.56 64.51 23.51 46.71 14.93 12.48
Len_g05180 (YLMG2)
63.23 37.41 10.95 27.53 5.56 4.03
Len_g05437 (CR88)
79.96 64.22 31.53 63.63 30.44 20.55
1229.23 733.13 269.53 477.2 112.56 116.51
Len_g06317 (NDH-M)
123.91 93.22 25.1 36.51 16.04 15.57
40.65 34.37 22.26 33.01 27.76 23.05
Len_g06950 (OE23)
296.68 196.54 54.38 73.53 14.27 11.5
Len_g07417 (BOU)
106.8 75.48 20.06 45.59 12.99 16.68
Len_g07419 (GCH)
21.46 15.59 6.52 10.18 6.04 5.4
175.61 104.72 42.52 72.75 24.96 24.32
72.78 49.63 28.23 26.36 22.85 16.21
Len_g07860 (OE23)
368.79 201.1 68.47 155.62 41.73 22.0
47.19 34.37 10.31 12.88 9.63 6.55
31.98 21.89 8.56 15.94 8.67 6.95
Len_g08412 (emb2394)
105.57 65.78 20.91 44.53 11.03 9.74
Len_g08515 (PGR7)
55.38 43.48 20.24 32.4 18.46 17.98
1497.35 706.41 119.01 259.75 6.65 3.32
41.88 25.12 7.89 9.67 1.34 0.66
Len_g08716 (RPL15)
153.03 103.3 42.74 83.66 47.42 32.61
Len_g09216 (HEMA1)
102.66 49.76 21.93 37.48 15.43 10.88
Len_g09226 (GPX7)
42.33 28.48 10.48 12.98 6.58 8.92
73.09 45.54 17.77 19.57 13.49 12.91
Len_g09399 (CHLM)
69.9 39.27 8.78 23.05 5.55 2.15
Len_g09571 (HEME1)
22.09 16.13 4.44 15.32 4.81 3.52
Len_g09838 (LHCB5)
1098.56 723.94 179.8 339.74 78.52 35.71
27.6 18.0 8.93 17.34 4.62 3.44
76.87 63.03 33.7 57.77 29.25 28.78
Len_g10215 (PSRP6)
212.86 149.21 58.56 80.12 43.89 34.95
37.04 29.92 10.56 16.35 8.46 8.34
Len_g10550 (CHLI2)
87.53 64.31 24.77 48.74 20.23 14.83
58.45 36.25 13.68 31.61 13.79 10.03
36.2 21.58 11.66 17.96 9.74 6.13
Len_g10588 (TWN3)
108.48 67.08 22.87 51.18 21.15 17.49
26.52 15.13 4.19 10.64 1.69 2.71
43.19 27.01 15.5 24.35 12.36 8.68
109.03 68.48 17.96 60.39 11.09 8.52
Len_g11187 (PSB27)
235.08 121.2 39.92 79.23 18.15 5.86
27.15 20.92 5.18 12.47 1.72 2.0
210.57 140.34 54.81 115.69 35.85 42.1
Len_g11400 (HCF136)
132.69 94.71 28.15 52.75 23.12 18.24
34.88 26.79 12.41 19.24 10.89 10.34
50.49 31.86 11.35 20.98 6.57 5.12
143.35 81.45 22.39 60.42 12.64 13.57
Len_g11780 (GSA2)
106.8 68.51 22.91 53.71 18.62 12.68
Len_g11954 (RPH1)
36.01 22.43 8.65 9.72 6.74 6.04
Len_g12015 (CAB4)
1328.08 698.45 137.09 432.38 32.86 13.86
Len_g12035 (ATPRX Q)
698.03 377.6 73.02 366.81 7.22 3.1
23.26 16.98 5.33 11.12 4.87 3.47
Len_g12127 (V157)
28.55 20.42 8.67 15.28 9.64 6.49
7.75 5.16 1.6 2.2 1.37 0.4
Len_g12504 (TIC40)
29.94 25.96 16.85 25.05 18.96 15.3
78.22 43.41 14.79 34.8 14.84 11.62
17.2 11.49 5.22 7.43 4.38 4.7
5.01 2.59 0.48 1.76 0.26 0.3
41.09 33.46 12.76 22.22 13.06 8.0
Len_g13257 (RPL4)
66.13 51.21 18.86 29.61 16.1 15.15
Len_g13340 (SLP)
163.24 120.04 50.44 81.09 43.95 31.68
67.41 51.04 19.5 32.57 18.55 12.72
Len_g13373 (PSBX)
2703.58 1499.52 399.31 1199.87 118.86 55.96
Len_g13610 (PSAE-2)
1985.21 1097.81 257.29 737.03 88.12 46.26
34.71 22.9 7.42 11.39 5.88 6.85
2194.43 841.5 248.21 1041.09 72.15 21.12
39.39 22.26 9.74 17.45 7.74 6.1
29.31 22.32 10.49 24.03 11.36 9.1
18.87 16.06 5.16 9.24 4.08 2.85
226.3 129.17 66.46 68.2 56.21 35.67
25.55 19.7 8.56 11.95 7.62 5.29
Len_g15230 (PSAL)
1289.84 739.58 233.71 641.83 66.24 19.54
Len_g15396 (ARC5)
12.2 10.26 4.68 8.82 5.58 4.04
Len_g15569 (CYP20-2)
205.78 148.1 78.52 139.96 102.13 89.26
Len_g15635 (GC1)
73.53 40.37 9.04 32.3 6.97 4.18
161.39 134.96 58.2 87.72 51.88 42.85
47.7 31.29 13.47 20.8 8.23 8.83
99.4 75.69 32.19 46.47 30.18 20.72
23.57 16.47 7.13 9.3 4.01 3.17
Len_g16038 (NPQ1)
76.09 31.32 9.99 15.43 3.91 3.71
87.07 57.61 25.73 42.43 25.6 23.74
Len_g16047 (FKBP13)
111.44 80.35 19.05 38.24 14.43 8.94
Len_g16087 (HDS)
232.4 154.15 53.25 65.61 34.61 27.06
Len_g16123 (PPL1)
11.62 7.4 2.1 7.01 2.08 1.14
76.31 35.46 14.15 15.93 6.11 5.19
52.6 37.32 12.94 29.0 13.11 8.51
Len_g16711 (CAO)
20.49 17.7 7.25 13.21 7.91 5.15
139.05 85.08 19.62 62.25 13.57 12.24
Len_g17017 (PSAH2)
2670.32 1007.15 224.8 979.61 21.89 22.93
Len_g17078 (LHCA3)
1801.91 1197.55 286.21 792.01 81.24 36.46
Len_g17519 (HEME2)
50.08 34.97 13.48 32.08 14.53 7.6
Len_g18180 (RPL9)
160.22 103.83 44.02 91.4 37.56 29.52
Len_g18523 (UGT85A1)
11.47 8.06 2.25 2.07 1.28 1.5
Len_g18784 (2CPB)
235.98 146.45 60.44 126.45 48.78 50.33
20.29 17.72 6.62 10.4 5.32 4.65
Len_g18838 (CP24)
1117.4 444.85 109.66 341.05 18.37 4.53
Len_g19518 (PPL1)
118.61 64.6 20.64 48.13 17.2 9.11
Len_g19647 (PORB)
155.43 85.25 36.09 74.34 27.21 19.92
Len_g19967 (APX4)
95.63 55.1 10.89 40.81 5.73 2.45
83.46 55.37 23.77 37.14 17.56 18.46
18.41 13.53 5.13 5.66 2.78 2.8
153.65 110.66 50.9 83.43 45.03 34.41
Len_g20948 (DEGP2)
9.97 7.11 2.27 4.05 1.23 1.24
7.45 4.21 1.46 3.06 0.58 0.68
1764.92 1170.88 346.63 838.52 157.32 41.57
Len_g21734 (GUN4)
194.39 105.57 31.18 72.98 11.72 8.53
44.02 32.41 9.22 24.17 6.94 7.73
12.94 5.62 0.86 2.39 0.11 0.38
Len_g22517 (PSBQ)
1503.96 807.62 226.23 565.71 60.53 28.39
Len_g22728 (ENH1)
109.9 45.87 11.4 24.32 3.77 2.98
132.98 63.02 18.96 24.45 10.53 7.04
82.01 45.82 11.25 44.64 8.36 4.37
Len_g23483 (OVA6)
37.3 30.6 12.31 18.8 14.09 12.06
65.37 47.2 20.17 26.95 20.5 16.4
Len_g23521 (PSAF)
633.53 323.52 124.16 251.63 60.59 25.56
Len_g23522 (PSAF)
487.54 182.95 46.61 148.37 19.55 10.49
15.58 7.19 2.44 4.96 0.51 0.57
26.85 18.38 5.84 11.46 6.61 4.7
Len_g23888 (LHCB2)
3482.9 1930.68 383.85 1632.71 63.77 31.01
40.59 26.32 5.19 17.17 0.85 1.09
1184.36 866.82 240.0 514.97 120.33 123.66
Len_g25437 (PRPL11)
74.63 59.52 28.34 41.26 23.97 18.29
143.73 71.24 7.22 25.0 3.23 2.55
30.02 20.85 7.9 14.05 4.39 2.96
23.09 14.47 4.26 8.64 3.0 2.24
Len_g28860 (EMB2758)
15.68 9.81 1.57 4.57 0.83 0.47
Len_g28966 (LEN1)
174.9 135.16 56.94 116.87 68.01 45.51
85.59 50.39 16.35 21.4 7.95 8.55
56.59 35.57 17.19 24.1 17.22 17.41
110.35 70.44 34.92 51.78 13.6 15.74
Len_g30462 (LHCA1)
183.02 87.78 25.15 43.98 9.57 3.57
199.81 125.09 35.61 113.17 26.7 25.34
16.74 12.24 8.7 12.91 9.54 7.36
49.38 32.45 13.12 24.76 10.08 10.63
Len_g34078 (LHCB4.2)
592.51 226.5 84.99 266.65 45.53 14.3
33.62 23.95 10.74 22.39 11.13 10.18
67.65 52.39 12.63 34.57 5.71 4.72
Len_g41148 (SFD4)
114.35 71.15 22.34 67.97 14.0 14.95
Len_g41372 (PSBY)
400.1 214.91 46.08 209.54 26.9 19.69
68.74 38.58 11.31 40.49 8.53 4.65
207.32 106.69 40.98 94.29 23.77 12.22
9.66 7.3 3.09 4.83 1.88 1.85
586.8 270.8 61.22 241.92 11.21 4.57
52.58 34.39 14.26 15.8 8.79 9.18
4167.91 1492.24 349.34 1709.09 67.55 41.47
Len_g56603 (emb1138)
58.5 43.96 8.75 17.22 4.18 2.65
Len_g58000 (AAE14)
36.36 24.55 11.32 22.69 8.64 9.25
19.35 10.19 5.07 7.41 2.04 1.25
64.97 52.42 20.15 47.89 26.93 15.83
Len_g59339 (SOG1)
3.7 2.64 0.85 0.57 0.29 0.21

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)