Heatmap: Cluster_16 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Sterile Leaflet
Fertile Leaflet with Sori
Petiole
Crozier
Rhizome
Root
0.0 1.0 0.49 0.13 0.49 0.05
0.59 1.0 0.54 0.19 0.55 0.26
0.0 1.0 0.38 0.42 0.53 0.19
0.46 1.0 0.94 0.61 0.74 0.93
0.55 0.9 1.0 0.84 0.55 0.28
0.41 1.0 0.87 0.16 0.19 0.58
0.0 1.0 0.32 0.1 0.28 0.64
0.01 0.6 0.37 0.25 1.0 0.55
0.78 0.76 1.0 0.48 0.99 0.68
0.01 1.0 0.87 0.26 0.56 0.37
0.0 1.0 0.26 0.42 0.57 0.18
0.37 1.0 0.56 0.48 0.5 0.71
0.43 0.77 1.0 0.76 0.64 0.72
0.18 1.0 0.59 0.44 0.55 0.19
Len_g07471 (CPK1)
0.44 0.71 1.0 0.66 0.52 0.39
0.33 1.0 0.64 0.68 0.59 0.3
Len_g07758 (TMKL1)
0.52 0.73 1.0 0.76 0.64 0.52
0.47 0.75 1.0 0.75 0.54 0.57
Len_g07922 (WRKY71)
0.3 0.84 0.86 0.27 0.36 1.0
0.15 1.0 0.33 0.18 0.39 0.59
0.08 0.82 1.0 0.25 0.77 0.55
0.66 1.0 0.84 0.59 0.56 0.65
0.16 0.76 0.36 0.14 0.32 1.0
Len_g09113 (RPS5B)
0.0 1.0 0.0 0.0 0.54 0.54
0.61 1.0 0.74 0.75 0.5 0.84
0.44 0.63 1.0 0.61 0.91 0.64
0.53 0.87 1.0 0.73 0.68 0.67
0.47 0.89 0.56 0.46 0.41 1.0
0.64 0.77 1.0 0.63 0.57 0.5
0.47 0.82 1.0 0.66 0.74 0.74
0.54 1.0 0.5 0.13 0.63 0.39
0.04 1.0 0.08 0.15 0.16 0.53
0.0 1.0 0.42 0.24 0.67 0.39
0.61 0.92 1.0 0.61 0.62 0.62
Len_g12089 (CLI1)
0.64 1.0 0.88 0.81 0.63 0.49
0.91 1.0 0.89 0.29 0.65 0.8
0.59 0.35 0.72 0.32 0.51 1.0
Len_g14516 (MPK6)
0.62 1.0 0.79 0.53 0.54 0.66
0.55 1.0 0.72 0.42 0.3 0.5
0.41 0.66 1.0 0.43 0.44 0.33
Len_g15323 (DDE1)
0.61 0.73 1.0 0.42 0.37 0.48
0.59 0.88 1.0 0.45 0.66 0.45
0.36 0.87 0.6 0.31 1.0 0.4
0.88 0.91 1.0 0.48 0.88 0.65
0.39 0.63 1.0 0.45 0.53 0.35
0.32 0.97 1.0 0.4 0.65 0.69
0.55 0.63 1.0 0.68 0.55 0.6
Len_g18513 (SNP33)
0.67 0.96 1.0 0.43 0.56 0.82
0.54 1.0 0.92 0.47 0.55 0.49
0.7 1.0 0.85 0.7 0.75 0.58
0.45 1.0 0.48 0.08 0.3 0.44
0.23 1.0 0.54 0.09 0.21 0.1
0.25 1.0 0.65 0.56 0.7 0.53
Len_g23138 (NHX4)
0.67 0.64 1.0 0.18 0.88 0.43
0.42 1.0 0.6 0.34 0.64 0.72
0.62 1.0 0.92 0.17 0.45 0.8
0.6 1.0 0.72 0.48 0.54 1.0
0.46 0.81 0.64 0.45 0.42 1.0
0.09 1.0 0.23 0.22 0.32 0.81
0.02 1.0 0.74 0.17 0.64 0.47
0.6 0.85 1.0 0.74 0.88 0.91
0.0 0.77 0.59 0.3 1.0 0.49
0.48 1.0 0.53 0.52 0.52 0.4
0.07 1.0 0.21 0.09 0.16 0.69
Len_g28544 (DREB2C)
0.84 0.96 0.81 0.46 0.64 1.0
0.56 0.94 1.0 0.61 0.74 0.78
0.0 1.0 0.61 0.36 1.0 0.15
0.59 0.91 0.3 0.82 0.78 1.0
0.56 0.98 1.0 0.32 0.52 0.75
0.22 0.68 1.0 0.34 0.69 0.53
0.05 1.0 0.34 0.09 0.25 0.43
0.0 1.0 0.49 0.03 0.5 0.48
0.1 0.8 0.19 0.39 1.0 0.41
Len_g33077 (WRKY6)
0.57 1.0 0.75 0.47 0.53 0.87
0.33 1.0 0.74 0.37 0.8 0.78
0.39 1.0 0.52 0.15 0.31 0.31
Len_g34104 (TL2)
0.25 1.0 0.62 0.46 0.56 0.63
0.76 0.49 0.64 0.3 0.54 1.0
0.56 1.0 0.89 0.55 0.97 0.69
0.53 0.68 1.0 0.84 0.56 0.46
0.34 1.0 0.73 0.65 0.59 0.85
0.49 0.78 0.74 0.59 1.0 0.6
Len_g36919 (ERF12)
0.01 1.0 0.64 0.47 0.72 0.43
Len_g37596 (MYC2)
0.54 0.92 0.74 0.7 1.0 0.71
0.58 0.54 1.0 0.42 0.63 0.54
0.47 1.0 0.37 0.16 0.37 0.25
0.05 1.0 0.33 0.1 0.61 0.42
0.75 0.79 1.0 0.09 0.69 0.44
0.23 0.9 0.41 0.43 1.0 0.32
0.53 0.71 1.0 0.54 0.69 0.56
0.18 0.7 1.0 0.34 0.55 0.48
Len_g43002 (PK1B)
0.59 0.92 1.0 0.68 0.44 0.7
0.78 1.0 0.99 0.22 0.31 0.53
0.14 0.95 1.0 0.27 0.82 0.41
Len_g44181 (UGT85A7)
0.0 0.99 0.64 0.5 1.0 0.46
0.53 0.62 1.0 0.68 0.57 0.51
0.59 0.79 1.0 0.75 0.82 0.33
0.65 1.0 0.95 0.4 0.49 0.53
0.06 1.0 0.38 0.17 0.43 0.49
0.7 1.0 0.76 0.28 0.55 0.83
0.32 1.0 0.33 0.18 0.41 0.89
0.42 1.0 0.7 0.13 0.43 0.77
0.0 1.0 0.23 0.01 0.18 0.42
0.49 0.71 1.0 0.67 0.61 0.52
Len_g51089 (PDLP7)
0.48 1.0 0.45 0.14 0.27 0.15
0.0 1.0 0.32 0.14 0.4 0.18
0.52 0.87 1.0 0.51 0.76 0.37
0.71 0.68 1.0 0.35 0.88 0.68
0.77 0.58 0.84 0.45 0.97 1.0
Len_g54148 (CIF1)
0.0 0.92 0.75 0.26 1.0 0.28
0.03 1.0 0.27 0.24 0.41 0.46
0.31 1.0 0.59 0.3 0.65 0.56
Len_g54488 (VAC1)
0.65 0.89 1.0 0.61 0.89 0.69
0.59 1.0 0.26 0.82 0.88 0.92
Len_g54869 (ACA8)
0.01 0.83 0.7 0.22 1.0 0.29
0.7 0.72 1.0 0.96 0.71 0.47
0.67 1.0 0.71 0.41 0.89 0.16
Len_g55765 (UGT85A1)
0.53 0.74 1.0 0.31 0.55 0.95
0.0 1.0 0.01 0.14 0.65 0.0
0.01 1.0 0.37 0.11 0.31 0.54
0.45 0.82 0.41 0.29 0.32 1.0
0.15 1.0 0.24 0.0 0.07 0.58
0.23 0.8 0.48 0.36 1.0 0.28
0.05 0.97 0.28 0.4 1.0 0.75
Len_g57140 (SD2-5)
0.53 1.0 0.81 0.47 0.36 0.48
0.55 1.0 0.92 0.69 0.57 0.68
0.06 1.0 0.58 0.02 0.6 0.64
0.82 0.83 1.0 0.56 0.99 0.58
0.28 0.82 0.71 0.61 1.0 0.63
0.57 1.0 0.99 0.98 0.68 0.67
0.16 1.0 0.56 0.41 0.68 0.46
0.75 0.69 1.0 0.58 0.88 0.55
0.14 1.0 0.56 0.33 0.85 0.49
0.3 1.0 0.53 0.33 0.69 0.44
Len_g59751 (CIF1)
0.55 0.71 1.0 0.61 0.83 0.28
0.43 1.0 0.84 0.14 0.4 0.71

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)