Heatmap: Cluster_98 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Sterile Leaflet	Fertile Leaflet with Sori	Petiole	Crozier	Rhizome	Root
Len_g34403 (B5 #4)	-	-	-	-	-3.52	2.56
Len_g34436 (PFL2)	-	-	-	-	-1.39	2.49
Len_g34556	-	-	-	-	-2.35	2.54
Len_g34757	-	-	-	-	-2.57	2.54
Len_g36060 (ACT11)	-	-5.05	-	-	-1.95	2.51
Len_g36111	-	-	-	-	-2.14	2.53
Len_g36359	-	-	-	-	-2.74	2.55
Len_g37134	-	-	-	-	-1.77	2.51
Len_g38134	-	-	-	-4.92	-2.5	2.53
Len_g38750	-	-	-	-	-1.97	2.52
Len_g42066 (BIOB)	-	-	-	-	-2.32	2.54
Len_g42238	-	-	-	-	-3.18	2.56
Len_g42652	-	-	-	-	-2.59	2.54
Len_g42753	-	-	-	-	-2.84	2.55
Len_g43089	-	-	-	-	-	2.58
Len_g43092	-	-	-	-	-4.08	2.57
Len_g43187 (ACT11)	-6.34	-	-	-	-2.0	2.52
Len_g43419 (ARFA1F)	-	-	-4.97	-	-2.5	2.53
Len_g43523	-	-	-	-	-2.4	2.54
Len_g43818	-	-	-	-	-3.43	2.56
Len_g43820	-	-	-	-	-3.26	2.56
Len_g43825 (RCI1)	-	-	-	-	-2.49	2.54
Len_g43866	-	-	-	-	-3.41	2.56
Len_g43875	-	-	-	-	-1.91	2.52
Len_g44015 (UBC30)	-	-	-	-	-3.29	2.56
Len_g44045	-	-	-	-	-	2.58
Len_g44110	-	-	-	-	-2.16	2.53
Len_g44200	-	-	-	-	-2.23	2.53
Len_g44293	-	-	-	-	-2.8	2.55
Len_g44326	-	-	-	-	-2.84	2.55
Len_g44329 (HTA10)	-	-	-	-	-2.36	2.54
Len_g44361 (RAB1C)	-	-	-	-	-2.06	2.53
Len_g44368	-	-	-	-	-	2.58
Len_g44379	-	-	-	-	-2.29	2.53
Len_g44380	-	-	-	-	-1.82	2.51
Len_g44639	-	-	-	-	-1.93	2.52
Len_g44664	-	-	-	-	-2.03	2.52
Len_g44808	-	-	-	-	-2.21	2.53
Len_g44819	-	-	-	-	-2.08	2.53
Len_g45339	-	-	-	-	-4.4	2.57
Len_g45345 (S1P)	-	-	-	-	-3.1	2.56
Len_g45469	-	-	-	-	-3.34	2.56
Len_g45497	-	-	-	-	-4.64	2.58
Len_g45538	-	-	-	-	-3.17	2.56
Len_g45600 (YLS8)	-	-	-	-	-1.98	2.52
Len_g45607	-	-	-	-	-3.82	2.57
Len_g45619 (BIP)	-	-	-	-	-1.68	2.51
Len_g45674	-	-	-	-	-3.5	2.56
Len_g45812	-	-	-	-	-3.98	2.57
Len_g45861	-	-	-	-	-2.01	2.52
Len_g45938	-	-	-	-	-3.47	2.56
Len_g45949 (DELTA-OAT)	-	-	-	-	-3.72	2.57
Len_g45954 (CNX1)	-	-	-	-	-3.06	2.56
Len_g46010	-	-	-	-	-3.65	2.57
Len_g46060	-	-	-	-	-	2.58
Len_g46104	-	-	-	-	-1.98	2.52
Len_g46142	-	-	-	-	-3.31	2.56
Len_g46171 (ACT7)	-	-	-	-	-2.35	2.54
Len_g46261	-	-	-	-	-3.84	2.57
Len_g46360 (ARA7)	-	-	-	-	-2.01	2.52
Len_g46363	-	-	-	-	-2.19	2.53
Len_g46367 (PFL)	-	-	-	-	-	2.58
Len_g46511	-	-	-	-	-2.51	2.54
Len_g46517	-	-	-	-	-2.23	2.53
Len_g46635	-	-	-	-	-3.38	2.56
Len_g46696	-	-	-	-	-3.93	2.57
Len_g46701	-5.22	-4.95	-4.97	-4.9	-2.93	2.52
Len_g46764 (AML1)	-	-	-	-	-2.55	2.54
Len_g46782	-	-	-	-	-3.16	2.56
Len_g46784	-	-	-	-	-3.92	2.57
Len_g46801	-	-	-	-	-2.82	2.55
Len_g46802 (PAD1)	-	-	-	-	-3.16	2.56
Len_g46839	-	-	-	-	-4.14	2.57
Len_g46896 (MSBP1)	-	-	-	-	-1.77	2.51
Len_g46934 (HMG)	-	-	-	-	-3.6	2.56
Len_g46953	-	-	-	-	-4.26	2.57
Len_g46994	-	-	-	-	-2.55	2.54
Len_g47002 (MAPR4)	-	-	-	-	-2.48	2.54
Len_g47065	-	-	-	-	-3.95	2.57
Len_g47093 (P40)	-	-	-	-	-	2.58
Len_g47105	-	-	-	-	-2.14	2.53
Len_g47108	-	-	-	-	-2.46	2.54
Len_g47180 (CAM6)	-	-	-	-	-2.43	2.54
Len_g47197	-	-	-	-	-4.58	2.57
Len_g47212	-	-	-	-	-2.3	2.54
Len_g47281	-	-	-	-	-2.41	2.54
Len_g47325	-	-	-	-	-2.58	2.54
Len_g47333	-	-	-	-	-2.88	2.55
Len_g47352	-	-	-	-	-3.25	2.56
Len_g47361	-	-	-	-	-	2.58
Len_g47374 (HAT1)	-	-	-	-	-2.12	2.53
Len_g47463	-	-	-	-	-3.42	2.56
Len_g47467	-	-	-	-	-	2.58
Len_g47492	-	-	-	-	-2.83	2.55
Len_g47544 (PAB8)	-	-	-	-	-3.42	2.56
Len_g47634	-	-	-	-	-	2.58
Len_g47781	-	-	-	-	-4.16	2.57
Len_g47826	-	-	-	-	-2.44	2.54
Len_g47831	-	-	-	-	-2.4	2.54
Len_g47871	-	-	-	-	-3.27	2.56
Len_g47878	-	-	-	-	-3.36	2.56
Len_g47895	-	-	-	-	-2.06	2.53
Len_g47922	-	-	-	-	-2.61	2.55
Len_g47934	-	-	-	-	-2.93	2.55
Len_g47936	-	-	-	-	-3.97	2.57
Len_g47943 (PBD1)	-	-	-	-	-2.36	2.54
Len_g48015	-	-	-	-	-2.83	2.55
Len_g48032	-	-	-	-	-	2.58
Len_g48034	-	-	-	-	-	2.58
Len_g48050	-	-	-	-	-3.8	2.57
Len_g48068	-	-	-	-	-2.02	2.52
Len_g48116 (ASN2)	-	-	-	-	-2.53	2.54
Len_g48124	-	-	-	-	-2.94	2.55
Len_g48167	-	-	-	-	-	2.58
Len_g48211	-	-	-	-	-3.77	2.57
Len_g48261	-	-	-	-	-3.7	2.57
Len_g48372	-	-	-	-	-3.11	2.56
Len_g48518 (UBC4)	-	-	-	-	-3.41	2.56
Len_g48592	-	-	-	-	-2.65	2.55
Len_g48661 (PBA1)	-	-	-	-	-2.41	2.54
Len_g48667	-	-	-	-	-1.92	2.52
Len_g48777	-	-	-	-	-3.23	2.56
Len_g48778 (RABA1f)	-	-	-	-	-3.48	2.56
Len_g48827	-	-	-	-	-1.44	2.49
Len_g48857	-	-	-	-	-3.49	2.56
Len_g48877	-	-	-	-	-2.79	2.55
Len_g48924	-	-	-	-	-3.52	2.56
Len_g48945	-	-	-	-	-2.12	2.53
Len_g48953 (CPK20)	-	-	-	-	-3.03	2.56
Len_g49045	-	-	-	-	-2.35	2.54
Len_g49109	-	-	-	-	-2.85	2.55
Len_g49197	-	-	-	-	-4.91	2.58
Len_g49269 (scpl47)	-	-	-	-	-3.22	2.56
Len_g49309 (HTA2)	-	-	-	-	-3.28	2.56
Len_g49349	-	-	-	-	-5.24	2.58
Len_g49357	-	-	-	-	-3.12	2.56
Len_g49391	-	-	-	-	-1.87	2.52
Len_g49479 (NIC2)	-	-	-	-	-2.87	2.55
Len_g49490 (UKL2)	-	-	-	-	-2.04	2.53
Len_g49602	-	-	-	-	-2.7	2.55
Len_g49609 (HSD2)	-	-	-	-	-2.47	2.54
Len_g49616 (PAB1)	-	-	-	-	-	2.58
Len_g49768	-	-	-	-	-2.68	2.55
Len_g49810	-	-	-	-	-2.55	2.54
Len_g49854	-	-	-	-	-1.92	2.52
Len_g49865	-	-	-	-	-2.78	2.55
Len_g49946	-	-	-	-	-3.3	2.56
Len_g49998	-	-	-	-	-3.24	2.56
Len_g50004	-	-	-	-	-4.03	2.57
Len_g50013	-	-	-	-	-2.72	2.55
Len_g50055	-	-	-	-	-3.18	2.56
Len_g50083	-	-	-	-	-1.91	2.52
Len_g50130	-	-	-	-	-4.91	2.58
Len_g50167 (GAPC)	-	-	-	-	-2.62	2.55
Len_g50189	-	-	-	-	-	2.58
Len_g50212	-	-	-	-	-6.05	2.58
Len_g50275	-	-	-	-	-3.37	2.56
Len_g50294 (EB1B)	-	-	-	-	-4.99	2.58
Len_g50441	-	-	-	-	-2.08	2.53
Len_g50477	-	-	-	-	-	2.58
Len_g50509	-	-	-	-	-2.5	2.54
Len_g50530 (STP9)	-	-	-	-	-3.98	2.57
Len_g50531	-	-	-	-	-2.79	2.55
Len_g50561 (RPL18)	-	-	-	-	-2.34	2.54
Len_g50691	-	-	-	-	-2.73	2.55
Len_g50710	-	-	-	-	-4.24	2.57
Len_g50738	-	-	-	-	-2.99	2.55
Len_g50753	-	-	-	-	-3.24	2.56
Len_g50760 (VHA-A2)	-	-	-	-	-2.35	2.54
Len_g50771 (EMB2296)	-	-6.04	-	-5.94	-1.8	2.51
Len_g50772	-5.52	-	-	-	-3.21	2.55
Len_g50793	-	-	-	-	-2.2	2.53
Len_g50849	-	-	-	-	-1.83	2.52
Len_g50930 (RAC2)	-	-	-	-	-3.93	2.57
Len_g50957 (SAR1)	-	-	-	-	-2.89	2.55
Len_g51170	-	-	-	-	-2.69	2.55
Len_g51193 (GATA19)	-	-	-	-	-2.79	2.55
Len_g51293	-	-	-	-	-2.52	2.54
Len_g51311	-	-	-	-	-2.25	2.53
Len_g51795	-	-	-	-	-2.91	2.55
Len_g51997	-	-	-	-	-	2.58
Len_g52624	-	-	-	-	-2.78	2.55
Len_g52723	-	-	-	-	-	2.58
Len_g52793	-	-	-	-	-	2.58
Len_g52847	-	-	-	-	-	2.58
Len_g52870	-	-	-	-	-	2.58
Len_g53058	-	-	-	-	-	2.58
Len_g53183	-	-	-	-	-4.11	2.57
Len_g53347 (CYTC-1)	-	-	-	-	-	2.58

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.