Heatmap: Cluster_98 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Sterile Leaflet
Fertile Leaflet with Sori
Petiole
Crozier
Rhizome
Root
Len_g34403 (B5 #4)
- - - - -3.52 2.56
Len_g34436 (PFL2)
- - - - -1.39 2.49
- - - - -2.35 2.54
- - - - -2.57 2.54
Len_g36060 (ACT11)
- -5.05 - - -1.95 2.51
- - - - -2.14 2.53
- - - - -2.74 2.55
- - - - -1.77 2.51
- - - -4.92 -2.5 2.53
- - - - -1.97 2.52
Len_g42066 (BIOB)
- - - - -2.32 2.54
- - - - -3.18 2.56
- - - - -2.59 2.54
- - - - -2.84 2.55
- - - - - 2.58
- - - - -4.08 2.57
Len_g43187 (ACT11)
-6.34 - - - -2.0 2.52
Len_g43419 (ARFA1F)
- - -4.97 - -2.5 2.53
- - - - -2.4 2.54
- - - - -3.43 2.56
- - - - -3.26 2.56
Len_g43825 (RCI1)
- - - - -2.49 2.54
- - - - -3.41 2.56
- - - - -1.91 2.52
Len_g44015 (UBC30)
- - - - -3.29 2.56
- - - - - 2.58
- - - - -2.16 2.53
- - - - -2.23 2.53
- - - - -2.8 2.55
- - - - -2.84 2.55
Len_g44329 (HTA10)
- - - - -2.36 2.54
Len_g44361 (RAB1C)
- - - - -2.06 2.53
- - - - - 2.58
- - - - -2.29 2.53
- - - - -1.82 2.51
- - - - -1.93 2.52
- - - - -2.03 2.52
- - - - -2.21 2.53
- - - - -2.08 2.53
- - - - -4.4 2.57
Len_g45345 (S1P)
- - - - -3.1 2.56
- - - - -3.34 2.56
- - - - -4.64 2.58
- - - - -3.17 2.56
Len_g45600 (YLS8)
- - - - -1.98 2.52
- - - - -3.82 2.57
Len_g45619 (BIP)
- - - - -1.68 2.51
- - - - -3.5 2.56
- - - - -3.98 2.57
- - - - -2.01 2.52
- - - - -3.47 2.56
Len_g45949 (DELTA-OAT)
- - - - -3.72 2.57
Len_g45954 (CNX1)
- - - - -3.06 2.56
- - - - -3.65 2.57
- - - - - 2.58
- - - - -1.98 2.52
- - - - -3.31 2.56
Len_g46171 (ACT7)
- - - - -2.35 2.54
- - - - -3.84 2.57
Len_g46360 (ARA7)
- - - - -2.01 2.52
- - - - -2.19 2.53
Len_g46367 (PFL)
- - - - - 2.58
- - - - -2.51 2.54
- - - - -2.23 2.53
- - - - -3.38 2.56
- - - - -3.93 2.57
-5.22 -4.95 -4.97 -4.9 -2.93 2.52
Len_g46764 (AML1)
- - - - -2.55 2.54
- - - - -3.16 2.56
- - - - -3.92 2.57
- - - - -2.82 2.55
Len_g46802 (PAD1)
- - - - -3.16 2.56
- - - - -4.14 2.57
Len_g46896 (MSBP1)
- - - - -1.77 2.51
Len_g46934 (HMG)
- - - - -3.6 2.56
- - - - -4.26 2.57
- - - - -2.55 2.54
Len_g47002 (MAPR4)
- - - - -2.48 2.54
- - - - -3.95 2.57
Len_g47093 (P40)
- - - - - 2.58
- - - - -2.14 2.53
- - - - -2.46 2.54
Len_g47180 (CAM6)
- - - - -2.43 2.54
- - - - -4.58 2.57
- - - - -2.3 2.54
- - - - -2.41 2.54
- - - - -2.58 2.54
- - - - -2.88 2.55
- - - - -3.25 2.56
- - - - - 2.58
Len_g47374 (HAT1)
- - - - -2.12 2.53
- - - - -3.42 2.56
- - - - - 2.58
- - - - -2.83 2.55
Len_g47544 (PAB8)
- - - - -3.42 2.56
- - - - - 2.58
- - - - -4.16 2.57
- - - - -2.44 2.54
- - - - -2.4 2.54
- - - - -3.27 2.56
- - - - -3.36 2.56
- - - - -2.06 2.53
- - - - -2.61 2.55
- - - - -2.93 2.55
- - - - -3.97 2.57
Len_g47943 (PBD1)
- - - - -2.36 2.54
- - - - -2.83 2.55
- - - - - 2.58
- - - - - 2.58
- - - - -3.8 2.57
- - - - -2.02 2.52
Len_g48116 (ASN2)
- - - - -2.53 2.54
- - - - -2.94 2.55
- - - - - 2.58
- - - - -3.77 2.57
- - - - -3.7 2.57
- - - - -3.11 2.56
Len_g48518 (UBC4)
- - - - -3.41 2.56
- - - - -2.65 2.55
Len_g48661 (PBA1)
- - - - -2.41 2.54
- - - - -1.92 2.52
- - - - -3.23 2.56
Len_g48778 (RABA1f)
- - - - -3.48 2.56
- - - - -1.44 2.49
- - - - -3.49 2.56
- - - - -2.79 2.55
- - - - -3.52 2.56
- - - - -2.12 2.53
Len_g48953 (CPK20)
- - - - -3.03 2.56
- - - - -2.35 2.54
- - - - -2.85 2.55
- - - - -4.91 2.58
Len_g49269 (scpl47)
- - - - -3.22 2.56
Len_g49309 (HTA2)
- - - - -3.28 2.56
- - - - -5.24 2.58
- - - - -3.12 2.56
- - - - -1.87 2.52
Len_g49479 (NIC2)
- - - - -2.87 2.55
Len_g49490 (UKL2)
- - - - -2.04 2.53
- - - - -2.7 2.55
Len_g49609 (HSD2)
- - - - -2.47 2.54
Len_g49616 (PAB1)
- - - - - 2.58
- - - - -2.68 2.55
- - - - -2.55 2.54
- - - - -1.92 2.52
- - - - -2.78 2.55
- - - - -3.3 2.56
- - - - -3.24 2.56
- - - - -4.03 2.57
- - - - -2.72 2.55
- - - - -3.18 2.56
- - - - -1.91 2.52
- - - - -4.91 2.58
Len_g50167 (GAPC)
- - - - -2.62 2.55
- - - - - 2.58
- - - - -6.05 2.58
- - - - -3.37 2.56
Len_g50294 (EB1B)
- - - - -4.99 2.58
- - - - -2.08 2.53
- - - - - 2.58
- - - - -2.5 2.54
Len_g50530 (STP9)
- - - - -3.98 2.57
- - - - -2.79 2.55
Len_g50561 (RPL18)
- - - - -2.34 2.54
- - - - -2.73 2.55
- - - - -4.24 2.57
- - - - -2.99 2.55
- - - - -3.24 2.56
Len_g50760 (VHA-A2)
- - - - -2.35 2.54
Len_g50771 (EMB2296)
- -6.04 - -5.94 -1.8 2.51
-5.52 - - - -3.21 2.55
- - - - -2.2 2.53
- - - - -1.83 2.52
Len_g50930 (RAC2)
- - - - -3.93 2.57
Len_g50957 (SAR1)
- - - - -2.89 2.55
- - - - -2.69 2.55
Len_g51193 (GATA19)
- - - - -2.79 2.55
- - - - -2.52 2.54
- - - - -2.25 2.53
- - - - -2.91 2.55
- - - - - 2.58
- - - - -2.78 2.55
- - - - - 2.58
- - - - - 2.58
- - - - - 2.58
- - - - - 2.58
- - - - - 2.58
- - - - -4.11 2.57
Len_g53347 (CYTC-1)
- - - - - 2.58

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.