Heatmap: Cluster_77 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Sterile Leaflet
Fertile Leaflet with Sori
Petiole
Crozier
Rhizome
Root
Len_g34206 (LAC13)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.4 16.7
0.0 0.0 0.0 0.0 0.36 11.3
0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 7.27
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.17
0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 3.73
0.0 0.0 0.0 0.0 0.62 18.54
0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 9.4
0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 3.98
Len_g42404 (RAN1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 6.65
0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 3.18
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.56
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.28
0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 5.1
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 8.28
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.18
0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 7.11
Len_g42828 (CAT1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 3.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 3.91
0.0 0.0 0.0 0.0 0.35 11.81
0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 2.32
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 4.02
Len_g42988 (EXPB3)
0.05 0.14 0.05 0.06 0.2 14.93
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.33
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.52
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.51
0.0 0.12 0.0 0.0 0.21 6.31
0.0 0.0 0.0 0.0 0.37 15.33
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.17
0.0 0.14 0.0 0.0 0.4 12.7
Len_g44134 (ALDH2B)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 9.91
0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 2.7
0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 2.62
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 4.45
0.0 0.0 0.0 0.0 0.77 16.87
0.0 0.0 0.0 0.0 0.47 17.59
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 7.14
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.67
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 8.68
Len_g45334 (REF2)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 2.45
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 4.42
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.56
0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 3.15
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 7.76
Len_g45520 (CEL3)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.06
0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 14.03
Len_g45571 (FER1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.83
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 4.03
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 4.39
0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 2.98
Len_g45991 (PAB8)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 2.37
Len_g46019 (MAPR2)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 8.35
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.57
Len_g46053 (ELF5A-3)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 5.67
0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 3.35
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.92
0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 5.76
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.22
0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 6.41
0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 4.55
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.34
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 7.59
Len_g47028 (RPL23AB)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 5.86
0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 3.46
Len_g47672 (ATG8F)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 4.6
Len_g47674 (TIM)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 2.42
0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 5.46
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 4.09
Len_g48943 (SNL1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.46
Len_g49069 (ASK2)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 4.55
0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 6.31
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 9.62
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 5.05
Len_g49342 (SIRANBP)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 3.73
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.14
0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 4.83
0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 10.27
0.0 0.0 0.0 0.0 1.22 44.85
0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 3.36
0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 3.41
0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 2.39
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.19
0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 33.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 18.44
0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 11.5
0.0 0.0 0.0 0.0 0.25 10.98
0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 4.56
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.0
Len_g51152 (ERD13)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.27 9.04
0.0 0.0 0.0 0.0 0.32 6.75
Len_g51325 (TUA3)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 8.05
0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 2.35
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.29
0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 3.22
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.4
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.75
0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 2.51
0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 3.1
0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 11.85
0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 2.7
0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 4.86
Len_g52423 (ALDH2B)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 7.97
0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 2.86
Len_g52553 (TCTP)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 3.23
0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 3.32
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.63
0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 2.67
Len_g52705 (CRT1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 2.97
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.58
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.07
0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 5.57
0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 4.18
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 5.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 4.09
0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 3.29
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 4.49
0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 5.15
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 4.12
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 9.89
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.6
0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 3.53
0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 9.84
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.52
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.23
0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 5.1
0.0 0.0 0.0 0.0 0.29 4.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)