Heatmap: Cluster_55 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Sterile Leaflet
Fertile Leaflet with Sori
Petiole
Crozier
Rhizome
Root
0.0 0.0 0.25 0.11 1.56 30.62
0.04 0.0 0.0 0.15 0.14 3.9
0.59 0.18 4.55 0.78 0.82 28.11
0.21 0.0 0.0 0.82 0.0 6.75
0.0 0.0 0.0 0.59 0.22 7.56
Len_g14529 (MFT)
0.32 0.16 0.48 0.88 1.5 15.27
1.88 6.55 4.14 0.88 4.14 56.06
0.2 0.04 0.03 0.0 0.26 11.55
1.21 2.36 1.45 1.89 1.68 20.98
Len_g21149 (MGT9)
1.27 0.61 1.29 1.07 1.93 13.04
Len_g22583 (ILR3)
0.6 0.83 0.0 0.41 0.58 14.99
0.51 3.1 2.28 0.87 2.72 18.41
Len_g24958 (UGT85A1)
0.3 0.41 0.01 0.11 0.22 12.26
Len_g26916 (MGT4)
6.23 11.33 8.26 7.61 8.4 57.56
1.38 0.36 2.69 0.0 1.22 99.75
Len_g29193 (MGT9)
0.31 0.58 2.3 0.82 2.46 64.94
0.16 1.2 0.49 0.28 2.03 31.38
0.0 0.0 0.24 0.0 0.36 3.09
0.0 0.44 0.34 0.45 0.49 37.58
0.0 1.34 0.0 0.0 2.79 52.98
Len_g34943 (CYP716A1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 4.73
0.0 0.84 1.04 0.7 1.41 35.56
2.61 1.11 4.31 5.72 3.26 39.67
0.03 0.03 0.1 0.19 0.56 21.92
Len_g35442 (RALFL33)
0.0 0.15 0.45 1.29 1.34 21.36
0.0 1.27 0.0 0.0 2.1 73.91
0.0 0.03 0.0 0.04 0.8 102.85
0.0 0.41 0.0 0.0 0.76 96.48
0.0 0.0 0.0 0.0 1.31 94.57
Len_g36526 (XTH6)
0.15 0.18 0.31 0.38 0.43 21.11
0.0 0.0 0.0 0.04 0.16 12.53
0.0 0.0 0.0 0.0 1.11 67.25
0.0 0.0 0.0 0.0 0.39 4.44
Len_g37570 (LOX1)
0.71 1.06 1.38 1.38 2.04 11.93
Len_g37679 (RHD6)
0.0 0.22 0.39 0.0 0.63 23.99
3.63 1.99 2.6 13.82 39.26 529.88
0.0 0.02 0.02 0.26 3.45 214.33
Len_g37948 (NLM1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.5 22.19
0.0 0.0 0.0 0.0 0.32 13.74
0.0 0.19 0.18 0.26 0.84 8.58
0.0 0.06 0.02 0.02 0.29 4.92
0.02 0.01 0.02 0.06 0.59 42.98
1.57 2.31 2.52 5.78 3.53 102.93
0.0 0.0 0.24 0.04 0.66 15.34
0.03 0.14 0.13 0.08 0.31 2.3
48.81 51.55 35.2 27.3 83.67 1034.67
Len_g40561 (bZIP44)
0.0 0.32 0.27 0.19 3.6 71.79
1.43 2.05 3.41 5.23 13.43 97.91
0.0 0.11 0.0 0.1 0.5 10.83
0.0 0.0 0.25 0.05 1.02 38.54
Len_g41218 (MGT9)
1.64 1.15 1.58 1.75 3.54 23.64
0.0 0.0 0.0 0.0 0.5 30.85
0.0 0.0 0.0 0.0 0.35 27.05
0.24 0.16 3.58 0.09 6.38 53.77
0.0 0.0 0.01 0.01 0.11 6.41
0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 13.99
0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 4.15
0.04 0.09 0.13 0.06 0.1 2.79
0.0 0.07 0.02 0.18 0.48 7.42
0.09 0.09 0.1 0.54 0.69 38.12
Len_g43201 (CHIA)
0.0 0.0 0.02 0.02 0.14 19.68
0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 4.28
0.03 0.0 0.03 0.03 0.23 16.55
Len_g43656 (MEE24)
0.01 0.42 0.07 0.06 0.17 3.35
0.0 0.0 0.0 0.0 0.35 39.72
0.11 0.95 1.77 1.37 0.54 23.23
0.0 0.21 0.05 0.0 0.08 26.53
0.04 0.76 1.55 0.62 1.45 22.03
0.05 0.18 0.12 0.19 0.18 8.41
0.15 0.23 0.43 0.12 0.41 10.91
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 7.0
0.27 0.36 0.07 0.0 0.12 8.15
0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 9.05
0.0 0.0 0.0 0.0 0.5 12.11
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 10.64
0.03 0.01 0.1 0.13 0.3 3.62
Len_g44434 (ALE)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.96
0.0 0.24 0.63 0.79 1.47 56.3
Len_g44573 (SOC1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.71
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 5.35
Len_g44713 (GGT1)
0.03 0.21 0.0 0.07 0.06 4.29
Len_g44821 (GSR 1)
0.06 0.54 0.5 0.54 0.39 8.11
Len_g44830 (HCT)
0.0 0.03 0.0 0.0 0.12 10.28
Len_g44852 (UGT85A7)
0.2 0.15 0.17 0.15 0.15 2.74
Len_g44855 (AMT2)
0.11 0.21 0.13 0.15 0.3 10.64
0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 4.36
0.0 0.0 0.0 0.0 0.29 21.75
0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 3.59
0.0 0.09 0.09 0.09 0.0 2.23
0.0 0.0 0.0 0.0 0.37 3.71
0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 10.23
Len_g45237 (UGT85A2)
0.0 0.09 0.31 0.0 0.38 14.32
0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 8.19
0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 3.15
0.0 0.03 0.04 0.05 0.05 2.29
0.33 0.29 0.26 0.0 0.57 62.53
Len_g45444 (MAX1)
0.14 0.35 0.08 0.29 0.4 21.51
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 4.52
0.0 0.0 0.0 0.0 0.3 14.51
Len_g45547 (Hop2)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 5.83
0.27 1.08 0.94 1.01 1.56 21.76
Len_g45677 (HSP70)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.25 11.32
Len_g45779 (PTR1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.28 15.65
3.21 1.01 2.55 3.28 6.5 95.38
0.48 0.11 2.9 1.04 3.56 72.29
Len_g45890 (sks4)
0.08 0.04 0.26 0.27 0.41 37.6
Len_g45925 (PTR2)
0.0 0.21 0.0 0.02 0.1 5.52
Len_g45930 (HB40)
0.03 0.22 0.14 0.19 0.18 4.26
0.01 0.0 0.42 0.17 0.37 12.56
Len_g46088 (P58IPK)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 5.08
0.01 0.06 0.1 0.0 0.55 6.84
0.0 0.27 0.43 0.36 0.17 14.67
0.38 0.29 0.51 0.41 0.33 9.97
0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 27.91
Len_g46641 (DCR)
0.0 0.02 0.02 0.07 0.07 5.42
0.93 0.43 0.62 0.49 1.63 177.67
0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 4.08
Len_g46895 (HCT)
1.46 0.83 1.8 2.42 2.05 23.07
0.0 0.15 0.0 0.0 0.82 52.17
0.0 1.42 1.27 0.6 1.36 11.62
Len_g47568 (PR3)
0.23 0.43 0.75 0.34 0.54 17.91
0.0 0.0 0.0 0.25 0.29 20.26
0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 5.42
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.65
0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 3.94
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.26
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 5.07
Len_g47751 (NDT1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 3.68
0.03 0.3 0.1 0.03 0.31 5.07
0.0 0.0 0.0 0.01 0.13 20.77
0.16 0.07 0.32 0.51 0.34 12.78
Len_g48038 (PTR2)
0.0 0.24 0.0 0.0 0.05 3.33
0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 4.53
0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 3.05
0.02 0.05 0.0 0.02 0.08 2.11
0.02 0.01 0.02 0.01 0.04 4.21
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 6.41
0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 13.45
0.0 0.0 0.0 0.1 0.45 3.89
0.33 0.08 0.09 0.0 0.0 15.47
Len_g48386 (PHT3)
0.29 0.38 0.03 0.29 0.09 7.76
Len_g48398 (WRKY42)
0.01 0.0 0.01 0.07 0.18 4.15
0.02 0.04 0.31 0.35 1.42 8.29
0.0 0.01 0.0 0.0 0.2 7.54
Len_g48772 (CRK)
0.12 0.32 0.27 0.7 0.17 7.27
0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 3.24
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.93
0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 5.69
0.0 0.11 0.06 0.05 0.55 25.72
0.0 0.09 0.0 0.0 0.31 11.81
Len_g49348 (FAD2)
0.08 0.12 0.03 0.07 0.09 10.57
Len_g49422 (CIPK2)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 7.61
0.0 0.0 0.0 0.0 1.66 36.68
0.08 0.64 0.0 0.26 0.85 7.95
Len_g49440 (UGT85A4)
0.05 0.28 0.1 0.32 0.07 7.03
Len_g49507 (RCI1)
0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 2.62
0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 8.49
0.3 0.19 0.0 0.94 0.45 7.99
0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 6.45
0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 7.59
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 4.18
0.0 0.0 0.0 0.0 0.5 7.55
0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 2.59
0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 4.02
0.01 0.05 0.11 0.01 0.46 7.7
0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 6.34
1.88 7.21 4.04 1.55 5.82 68.4
Len_g50254 (HAK5)
0.8 3.17 1.0 0.62 1.93 23.1
0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 2.89
Len_g50548 (NRT1.5)
0.0 0.04 0.0 0.08 0.23 16.77
0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 4.81
0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 9.67
Len_g51005 (CCD7)
0.01 0.01 0.0 0.02 0.14 7.37
0.0 0.0 0.0 0.0 0.38 29.05
0.0 0.02 0.0 0.02 0.74 70.28
0.03 0.42 0.03 0.05 0.16 4.26
0.65 0.2 0.0 0.0 0.52 14.29
0.44 0.0 0.0 0.0 0.63 36.66
2.89 1.66 0.27 0.87 14.56 1021.37
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 8.11
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.71
0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 2.52
Len_g51967 (UGT85A4)
0.13 0.23 0.0 0.09 0.15 6.48
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 25.06
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.35
0.0 0.0 0.0 0.0 0.35 32.92
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.24
0.06 0.52 0.2 0.17 0.1 6.39

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)