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Heatmap: Cluster_16 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
0.6 -0.17 0.13 0.41 0.29 0.05 -0.39 0.16 -0.39 -0.36 0.58 -0.68 -0.58 -0.82 0.61 -0.5 -0.21 0.23 0.19 -0.45
0.64 0.38 0.69 1.07 0.63 -0.53 -0.01 -0.09 -0.47 -0.51 -0.48 -0.75 -0.01 -0.02 -0.63 -0.81 -0.49 -0.08 -0.11 -0.44
Gb_00518 (MGT2)
 0.99 -0.2 0.41 0.6 0.53 0.89 -1.04 0.15 -0.77 -0.97 -0.74 -1.16 -0.02 -0.45 -0.52 -1.02 -0.79 0.48 0.51 -0.04
Gb_00939 (AXR6)
 1.05 0.05 0.52 0.46 0.86 0.45 -0.16 0.14 -0.53 -0.61 -0.19 -0.7 -1.49 -1.49 -0.34 -0.84 -0.43 0.13 0.16 0.06
Gb_01147 (NTMC2T5.2)
 1.21 -0.71 0.03 1.08 0.55 0.14 -0.94 0.55 -0.46 -0.63 -0.71 -0.48 -0.95 -0.25 -1.01 -0.07 -0.49 0.8 -0.19 -0.87
Gb_01148 (NTMC2T5.2)
 1.26 -0.32 0.29 1.16 0.61 0.19 -1.14 0.43 -0.5 -0.58 -0.68 -0.49 -1.69 -1.68 -0.92 -0.22 -0.34 0.7 0.41 -1.28
Gb_01207 (IWS1)
 0.66 -0.09 0.14 0.28 0.57 0.19 -0.32 0.09 -0.43 -0.49 -0.05 -0.48 -0.05 -0.53 -0.09 -0.97 -0.76 0.21 0.28 0.56
1.3 -0.34 0.55 0.83 0.06 0.39 -0.09 0.23 -0.67 -0.75 0.4 -1.35 -2.59 -2.49 0.5 -0.85 -0.57 0.16 0.07 -0.08
Gb_01914 (TOC64-III)
 0.48 0.22 0.17 0.58 0.41 0.27 -0.66 0.07 -0.28 -0.67 -0.26 -0.48 -0.22 -0.28 -0.25 0.4 -0.32 0.28 0.13 -0.63
Gb_02054 (RS41)
 1.12 0.82 1.16 1.44 0.83 0.22 -0.65 -0.3 -1.14 -1.18 -2.97 -1.3 -0.53 -0.96 -2.72 -2.26 -2.81 0.45 0.24 0.04
Gb_02056 (RS41)
 1.16 0.38 0.57 0.68 0.88 0.14 -0.57 0.25 -1.12 -1.08 -0.89 -1.35 0.21 -0.21 -0.71 -2.2 -2.34 0.48 0.08 0.25
1.24 -0.09 0.44 0.77 0.79 0.32 -0.21 0.15 -0.59 -0.84 -0.56 -0.92 -0.49 -0.43 -0.55 -0.82 -0.91 -0.03 0.27 -0.29
0.44 0.35 -0.28 0.69 0.16 -0.96 -0.87 -0.15 -0.73 -0.44 0.33 -0.55 0.42 0.11 0.12 -0.31 -1.06 0.27 0.83 -0.3
Gb_04671 (NPX1)
 0.93 0.11 0.25 0.22 0.45 -0.63 -0.27 -0.03 -0.37 -0.42 0.35 -0.86 -0.36 -0.66 0.25 -0.44 -0.94 0.21 0.11 0.49
Gb_04866 (UBP13)
 0.88 -0.11 0.04 0.52 0.7 0.58 -0.1 0.08 -0.79 -0.92 0.2 -0.72 -0.89 -1.11 0.27 -0.86 -1.02 0.55 0.29 -0.18
Gb_05713 (SPPL3)
 0.75 0.07 0.51 0.86 0.54 0.88 -1.03 0.05 -0.95 -0.92 -0.23 -0.69 -0.72 -0.6 -0.23 -0.46 -0.36 0.55 -0.62 -0.07
1.04 -0.11 0.53 1.14 0.33 -0.07 -1.36 0.09 -0.38 -0.71 0.45 -0.52 -0.1 -0.24 0.33 -0.43 -0.81 -0.35 -0.41 -1.44
0.83 -0.14 0.12 0.42 0.69 0.7 -1.06 0.11 -0.72 -0.87 -0.37 -0.24 -0.12 -0.29 -0.48 -0.77 -0.6 0.49 0.21 0.07
0.43 -0.06 -0.13 -0.2 0.64 -0.55 -0.24 -0.07 0.01 0.1 0.26 -1.16 0.19 -0.38 -0.01 -0.17 -0.22 0.32 -0.56 0.66
0.81 0.67 0.13 0.31 0.65 -0.28 -0.56 0.09 -0.2 -0.44 -0.04 -0.99 -0.49 -0.77 -0.11 -0.12 -1.01 0.32 -0.1 0.36
0.5 0.42 0.29 0.63 0.24 -0.76 -0.1 0.13 -0.46 -0.64 0.35 -0.64 0.38 0.19 0.23 -0.93 -0.96 -0.23 0.43 -0.83
0.88 -0.33 0.4 0.72 0.86 -0.55 -0.59 0.11 -0.41 -0.48 -0.68 -0.74 0.24 -0.29 -0.64 -0.98 -1.01 0.82 0.33 -0.31
0.67 0.17 0.12 0.03 0.32 -0.25 -0.11 0.04 -0.15 -0.37 0.59 -0.58 -0.49 -0.71 0.47 -0.19 -0.39 -0.19 0.12 -0.03
Gb_08527 (IPK1)
 0.83 -0.15 0.63 0.63 0.37 -0.89 -0.74 0.03 -0.31 -0.41 0.98 -0.8 -1.15 -1.58 1.07 -1.02 -1.41 0.35 0.02 -0.68
0.42 0.42 0.75 1.14 0.85 0.37 -0.72 -0.03 -0.97 -1.21 -0.8 -0.79 -0.1 -0.17 -0.77 -1.12 -1.07 0.11 -0.05 0.36
Gb_09606 (EIN5)
 1.16 -0.13 0.53 0.44 0.49 0.04 0.22 -0.11 -0.25 -0.34 -0.0 -1.15 -0.36 -0.45 -0.18 0.04 -0.6 -0.25 -0.54 -0.27
Gb_09607 (XRN3)
 1.08 -0.19 0.42 1.07 0.55 0.03 -0.02 -0.13 -0.34 -0.63 0.23 -1.13 -1.08 -1.34 0.04 -0.04 -0.84 -0.13 -0.26 -0.07
0.75 0.52 -0.14 0.58 0.95 0.59 -0.68 0.15 -0.7 -0.52 -0.61 -0.82 -0.49 -0.94 -0.72 -1.01 -0.9 0.6 0.74 -0.46
Gb_10311 (TFIIS)
 0.49 0.62 0.63 0.2 0.37 -0.19 -0.38 -0.28 -0.44 -0.42 0.24 -0.57 -0.1 -0.12 -0.05 -0.35 -0.31 0.16 -0.36 -0.07
1.14 -0.58 0.31 0.48 0.19 -0.36 -0.56 0.02 -0.18 -0.29 0.27 -1.48 -0.3 -0.65 0.23 -0.3 -0.2 0.09 0.29 0.02
0.65 -0.06 -0.23 0.3 0.8 -0.79 -0.67 0.07 0.14 -0.25 0.27 -1.15 -0.35 -0.62 0.33 0.15 -0.78 0.05 -0.68 0.8
Gb_13084 (TOP1)
 0.86 0.03 0.26 0.36 0.43 0.4 -0.14 0.01 -0.38 -0.48 0.47 -0.68 -0.59 -0.82 0.44 -0.56 -0.75 0.07 -0.15 -0.34
0.78 -0.47 -0.09 0.86 0.75 0.37 -0.97 0.17 -0.51 -0.63 -0.17 -0.57 -0.42 -0.58 -0.09 -0.37 -0.28 0.47 -0.19 0.09
Gb_14151 (HMG)
 0.58 -0.08 0.5 -0.01 0.38 -0.76 -0.49 0.07 -0.11 -0.29 0.53 -0.49 -0.14 -0.41 0.5 -0.54 -0.58 -0.1 0.37 -0.09
Gb_14410 (DFA)
 0.66 0.33 0.42 0.57 0.39 0.45 -2.43 0.03 -0.48 -0.95 -0.47 -0.72 -0.15 -0.19 -0.49 0.38 0.32 -0.29 0.53 -0.74
0.82 -0.04 0.24 0.41 0.24 -0.59 -0.21 0.02 -0.3 -0.31 0.41 -1.03 0.25 -0.11 0.46 -0.71 -0.93 -0.07 -0.05 0.07
Gb_16335 (PHP)
 0.75 0.66 0.56 0.52 0.82 -1.32 0.13 -0.11 -0.9 -0.88 -0.07 -0.55 0.06 0.27 -0.13 -0.65 -1.08 0.04 -0.01 -0.66
Gb_17194 (CPFTSZ)
 0.42 0.31 0.28 0.77 0.25 -0.24 -1.19 0.07 -0.21 -0.43 -0.1 -0.65 0.12 0.1 -0.08 0.26 -0.43 0.08 0.09 -0.64
0.57 0.55 0.57 0.35 0.28 -0.52 -0.23 -0.2 -0.36 -0.61 0.34 -0.27 -0.18 -0.25 0.3 -0.71 -0.57 -0.24 0.32 -0.31
1.37 0.7 0.19 0.36 0.88 -0.4 0.54 -0.07 -0.3 -0.42 -0.01 -2.28 -0.75 -1.21 0.05 -1.04 -2.23 0.04 -0.34 0.02
0.46 0.08 -0.21 0.47 0.38 -0.28 -0.05 0.19 -0.52 -0.6 0.1 -0.42 0.01 -0.19 0.11 -0.8 -0.37 -0.12 0.63 0.19
0.88 0.33 0.46 0.34 0.48 -0.23 -0.87 0.1 -0.35 -0.64 0.03 -1.03 0.19 -0.31 -0.05 -0.49 -0.89 0.41 -0.1 0.05
0.8 -0.16 0.21 0.45 0.6 0.01 -0.14 0.12 -0.53 -0.75 -0.25 -0.34 -0.32 -0.57 -0.14 -0.66 -1.13 0.64 0.06 0.42
0.81 0.32 0.01 0.26 0.38 -0.13 -0.06 0.17 -0.21 -0.13 -0.03 -1.0 -0.3 -0.69 -0.07 -0.24 -0.76 0.48 0.03 -0.01
0.9 0.36 0.53 0.73 0.37 -0.36 -0.84 0.26 -0.6 -0.55 -0.06 -0.57 0.26 -0.06 -0.12 -0.78 -1.18 0.12 0.11 -0.55
0.9 0.36 0.53 0.73 0.37 -0.36 -0.84 0.26 -0.6 -0.55 -0.06 -0.57 0.26 -0.06 -0.12 -0.78 -1.18 0.12 0.11 -0.55
0.94 -0.19 0.51 0.71 0.49 -0.74 -0.62 0.02 -0.34 -0.38 0.31 -0.87 0.19 -0.26 0.19 -0.74 -0.82 0.1 0.08 -0.47
Gb_22502 (VPS9)
 0.45 0.07 -0.06 0.3 0.12 0.05 -0.07 0.06 -0.13 -0.52 0.65 -0.3 -0.9 -1.02 0.56 -0.15 -0.22 -0.0 0.08 -0.04
0.38 -0.45 0.23 0.62 0.57 -0.16 -0.8 0.02 -0.72 -0.47 1.04 -0.84 -0.82 -1.37 1.02 -0.66 -0.62 0.15 0.59 -1.11
0.71 -0.27 0.31 0.71 0.49 -0.3 0.05 0.06 -0.26 -0.27 0.17 -0.57 -0.13 -0.33 0.09 -0.22 -0.49 -0.01 -0.19 -0.5
1.03 -0.11 0.22 0.73 0.84 -0.06 -0.63 0.33 -0.52 -0.77 -0.37 -0.58 -0.03 -0.39 -0.44 -0.75 -0.84 0.46 0.09 -0.42
0.52 0.58 0.52 -0.03 0.56 -0.01 -0.34 -0.02 -0.49 -0.49 0.02 -0.66 0.02 -0.25 0.03 -0.47 -0.61 -0.03 0.06 0.12
1.12 1.34 0.46 0.2 0.98 -0.18 0.59 -0.18 -0.26 -0.31 -1.38 -1.53 -1.48 -1.71 -0.46 -0.37 -1.71 -0.04 -0.14 -0.3
Gb_26149 (PRP40C)
 0.74 0.11 0.2 0.3 0.5 -0.33 -0.41 -0.14 -0.23 -0.48 0.34 -0.81 0.28 -0.25 0.26 -0.6 -0.84 0.2 0.24 -0.36
Gb_26775 (SDP6)
 0.98 -0.34 0.32 0.7 0.61 1.15 -1.09 -0.17 -0.74 -0.95 -0.68 -0.49 -0.4 -0.47 -0.77 -0.5 -0.16 0.41 -0.28 -0.03
0.23 0.06 -0.34 0.25 0.32 0.31 -0.3 0.01 -0.26 -0.18 0.5 -0.08 -0.51 -0.8 0.41 -0.34 -0.22 0.22 -0.15 0.13
1.04 0.46 0.22 0.59 0.38 -0.25 -0.46 -0.15 -0.7 -0.56 0.47 -1.23 -0.66 -0.97 0.44 -0.23 -0.57 -0.24 0.21 -0.02
0.7 0.34 0.37 0.18 0.56 -0.17 -0.33 0.28 -0.15 -0.17 0.03 -0.7 -0.2 -0.75 0.05 -0.51 -0.96 0.39 0.01 -0.23
Gb_28580 (FIO1)
 0.48 -0.2 0.05 0.39 0.29 -1.0 -0.41 0.04 -0.34 -0.27 0.47 -0.15 0.29 0.16 0.26 -0.33 -0.28 -0.21 0.0 -0.06
Gb_28673 (RAP74)
 0.75 0.51 0.48 0.42 0.72 -0.43 -0.32 0.01 -0.6 -0.49 -0.13 -0.44 -0.21 -0.23 -0.14 -1.3 -1.56 0.35 0.36 0.02
0.73 -0.22 0.2 0.58 0.23 0.01 -0.83 0.29 -0.23 -0.44 0.34 -0.63 0.24 0.06 0.12 -0.37 -0.86 0.25 -0.52 -0.22
Gb_30202 (GTE8)
 0.8 0.1 0.14 0.58 0.81 0.25 -0.63 0.16 -0.7 -0.7 -0.03 -1.0 -0.25 -0.57 -0.04 -0.62 -0.98 0.49 0.55 -0.59
Gb_32594 (CDKC;1)
 0.56 -0.1 0.35 0.52 0.8 0.21 -0.47 -0.03 -0.73 -0.74 -0.23 -0.63 -0.05 0.0 -0.14 -0.85 -0.73 0.24 0.52 -0.11
Gb_33608 (PUM12)
 0.69 -0.35 -0.38 0.51 0.5 0.37 -0.2 -0.32 -0.65 -0.52 0.44 -0.97 -0.24 -0.06 0.45 -0.2 -0.5 0.14 0.12 -0.16
Gb_34757 (ECT8)
 0.96 -0.11 0.08 0.3 0.78 -0.48 -0.75 0.03 -0.23 -0.26 -0.2 -0.94 0.28 -0.1 -0.09 -0.75 -0.77 0.61 0.3 -0.61
0.5 0.09 -0.07 0.35 0.4 -0.32 -0.39 -0.07 -0.32 -0.19 0.61 -0.81 0.01 -0.35 0.54 -0.57 -0.46 0.19 0.26 -0.51
Gb_35816 (UNE6)
 0.63 0.05 0.31 0.29 0.39 -0.66 -0.26 0.12 -0.2 -0.31 0.18 -0.41 0.33 -0.05 0.07 -0.41 -0.91 -0.06 0.08 -0.06
0.33 1.2 0.91 0.47 0.74 -0.63 -0.48 -0.11 -0.96 -0.75 -0.5 -0.72 0.05 -0.1 -0.44 -1.39 -0.85 0.52 -0.09 -0.36
0.42 0.08 0.43 0.33 0.45 -0.26 -0.07 0.0 -0.43 -0.55 0.52 -0.61 -0.25 -0.36 0.42 -0.68 -0.4 -0.16 0.25 -0.16
Gb_36872 (RH8)
 0.75 -0.35 0.23 0.62 0.57 0.41 -0.4 0.15 -0.39 -0.75 -0.03 -0.73 -0.3 -0.35 0.02 -0.53 -0.68 0.51 -0.12 -0.12
Gb_38056 (CYCT1;4)
 0.51 0.68 0.13 0.54 0.92 -0.51 -0.1 -0.1 -0.51 -0.62 0.15 -0.91 -0.07 -0.42 0.06 -0.82 -1.24 0.02 0.57 -0.44
Gb_38284 (ECT5)
 1.0 -0.05 0.23 0.55 0.57 -0.58 -0.33 0.12 -0.67 -0.72 -0.09 -0.77 -0.02 -0.43 -0.09 -0.85 -0.86 0.28 0.33 0.43
Gb_38603 (AKR2B)
 0.52 0.03 0.31 0.68 0.3 0.05 -0.42 0.12 -0.29 -0.58 -0.35 -0.71 -0.15 -0.16 -0.28 0.1 -0.14 0.36 0.32 -0.74
0.42 -0.45 -0.19 0.31 0.37 -0.12 -0.13 0.22 -0.19 -0.16 0.76 -0.47 -0.54 -0.93 0.7 -0.48 -0.39 0.19 0.13 -0.35
0.45 0.13 -0.13 0.5 0.53 0.35 -0.97 0.17 -0.21 -0.6 -0.48 -0.46 0.15 0.03 -0.37 -0.59 -0.9 0.56 0.58 -0.32

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.