Heatmap: Cluster_58 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
- - - - - - - 1.09 - - - - - - - - - - 4.16 -
-1.01 1.0 - - -0.16 0.16 0.92 -0.07 -1.69 -0.9 0.23 - - - - 2.58 - - 0.12 1.83
- - - - - - - 0.64 - - - 2.97 3.41 - - - - - - -
Gb_01258 (SVB)
- - - 3.87 1.8 -11.82 -1.6 0.11 -5.24 -2.62 - - -5.33 -6.36 - - - -2.58 - -3.62
-1.97 - 3.25 - - - -1.8 2.16 -4.5 -2.24 - -3.19 - -3.07 - 1.67 0.39 - -5.04 -1.15
- - - - - - - 2.95 3.6 - - - -3.64 - - -4.89 - - -14.9 -
- - - - 1.85 - 1.02 -0.73 0.39 - - - - - 1.09 - - 3.13 0.64 -
- - - - - 3.24 - -4.53 -1.05 -3.7 - 0.1 0.66 - - - - 2.87 - -
3.85 - - - - - - -0.13 2.23 - - - - - - - - - - -
- - - - - - - 2.95 3.6 - - - -3.64 - - -4.89 - - -14.9 -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
4.32 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
1.81 - - - - - - -1.71 -0.07 1.04 - - 0.39 - 3.57 - - - - -
Gb_04995 (ALDH11A3)
- - - - - - - 0.02 1.54 1.31 - - 0.78 - 1.89 - - - - 3.03
0.03 -0.14 -1.3 - - - 1.55 -0.15 0.75 0.49 0.65 -0.83 0.7 -0.73 1.98 -0.01 0.02 - -1.21 -
- - - 4.14 - - - -1.9 - - - - - 1.05 - - - - - -
-0.1 - -0.12 1.58 - - - 0.64 -0.29 -0.93 1.84 -2.1 1.38 -0.52 0.65 0.17 0.38 - -1.74 -0.21
- - - - - - - 2.95 3.6 - - - -3.64 - - -4.89 - - -14.9 -
2.82 - - - - - - 0.27 - - - - - - 3.56 - - - - -
- - - - - - - 2.95 3.6 - - - -3.64 - - -4.89 - - -14.9 -
Gb_07271 (BAM1)
3.92 - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.27 -
-3.31 - - 0.17 -2.49 - - -0.27 -0.37 -1.54 2.83 -0.13 - - 2.92 -1.05 -3.34 -3.87 -2.0 -2.79
3.89 - - - - - - - - - - - - - - - - - 2.36 -
- - - - 4.07 - - 1.69 - - - - - - - - - - - -
0.25 0.78 0.69 - -0.23 - -0.0 -0.86 -1.18 -0.22 1.57 -2.34 - - 2.41 0.9 - 0.51 - -
0.36 0.82 -0.01 - -0.96 - -1.08 -0.08 0.43 -0.31 1.2 -2.23 -0.41 -0.54 2.01 0.36 -0.7 0.93 -3.28 -
0.77 - - - - - - 2.1 2.13 - 2.54 - -10.7 1.93 - - -25.26 - - -26.1
1.2 - - - - - - -0.95 - - 1.07 - - - 2.95 2.46 - - - 0.88
Gb_10202 (EXO70G1)
2.77 - - - - - - 1.09 1.13 2.7 - - - - - - - - 1.25 -
0.84 - - 1.21 -0.34 -0.3 -1.11 -0.36 -1.97 - - - 0.38 -0.39 1.42 2.71 - -0.54 -0.3 -
- - -1.12 1.59 - - - -1.5 -0.13 -0.32 0.84 - 1.37 0.88 -1.34 2.04 -1.0 -1.3 0.7 0.25
- - 0.19 - 1.74 - - -0.9 -0.14 0.21 - -1.93 - - 1.4 2.32 - 1.99 0.06 -
- - - - - - - 1.6 - 4.08 - - - - - - - - - -
- - 1.49 - - - - -1.31 - 0.68 1.45 - - - 1.27 3.19 - - -0.12 -
- - - - - - - 2.95 3.6 - - - -3.64 - - -4.89 - - -14.9 -
Gb_11982 (INT1)
- - - 3.47 - - - - - - - - - - 1.54 - - 2.6 - -
- - - 3.44 - - - 0.92 0.99 - - - - - 0.99 - - - 1.72 -
- - - - - - - - - - - - - - 4.32 - - - - -
-3.96 - - - -2.86 0.05 - -0.19 0.72 0.31 0.68 0.5 0.39 1.25 0.07 0.2 -0.74 2.45 -4.45 -
0.78 -1.4 2.77 -0.27 1.73 - -2.35 -3.02 - 1.24 - - - - - - - -0.45 1.69 -1.73
- - - - - - - -1.87 - - - - - - 3.43 - 2.57 - 1.59 -
- - - - - - - - - - - - - - 3.41 - - - 3.22 -
- - - - - - - -0.09 2.69 - - - - - - - - - 3.66 -
-0.51 - - - - - - -2.75 0.41 - 2.41 - - -1.01 3.04 1.74 - - -1.16 -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
1.54 - - - -0.32 - -0.1 -1.02 -0.97 1.22 1.24 -1.2 0.35 -0.77 2.28 - - - 1.33 -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.32 -
Gb_17696 (HDA5)
- - - 3.71 - - 1.24 - - - - - 0.67 - - - - - 1.59 -
3.31 - - - 3.28 - - -1.34 - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - -1.61 0.42 - 0.9 - 1.96 1.86 1.77 2.29 - - -0.64 -
- - - - - - - 0.29 - - - - - - - - - 4.23 - -
Gb_19219 (LOX5)
4.32 - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - 4.32 - - - - - - - - - - - -
- - - - -1.26 - -2.03 -0.12 -0.13 0.24 2.14 -0.55 -0.54 0.09 2.36 -0.97 0.44 - -0.42 0.82
- - - - - - - -1.1 - - - - 1.59 1.53 2.7 - - - - 2.84
- - - - - - - 2.95 3.6 - - - -3.64 - - -4.89 - - -14.9 -
0.99 - - - - - -0.68 -1.55 0.6 1.15 -0.17 -2.02 - -0.52 2.32 0.63 1.25 - 0.75 -0.16
- - - - - - - 2.26 - - - - - - - - - - 3.93 -
- - - - - - - 4.32 - - - - - - - - - - - -
Gb_22228 (MSH6)
0.95 - - - - - - 0.17 - - 0.78 - -0.29 - 3.29 - 2.2 - - -
- - - - - - - 4.32 - - - - - - - - - - - -
- 0.61 - - - -1.94 -2.76 -1.45 0.49 -0.19 - -2.41 -0.57 2.47 - - - 3.13 -3.78 -2.4
1.33 - - - - - - -0.06 -0.05 - - - 1.28 0.16 0.56 - 0.76 3.06 -1.0 -
- - -0.18 2.53 -0.08 - - -0.86 -0.22 0.61 0.77 - 0.51 - 1.6 1.33 - -0.34 - -
-0.33 0.22 - 0.76 - 0.25 - -0.35 0.78 -0.2 -1.05 - -2.34 0.57 1.83 1.08 1.37 - -1.37 -0.03
- - - - - - - 4.32 - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - 2.95 3.6 - - - -3.64 - - -4.89 - - -14.9 -
- - 3.77 - - - - -1.01 - - - - - - - - - - 2.54 -
- - - - - - - -0.97 - - - - - - - - - 4.28 - -
1.6 - - - - - - -0.86 - - - - - - 3.26 2.77 - - - -
Gb_28505 (TPI)
3.52 - 3.02 - - - - -1.39 - - - - - - - - - - - -
1.95 - - - - - - -2.02 - - - - - - 3.73 - - - 1.37 -
- - - - - - - 1.14 - - - - - - - - - - 4.15 -
- - - - - - 0.92 -0.06 0.88 0.76 - -0.18 0.38 1.94 - - - 2.61 0.58 -
0.66 0.07 -0.67 2.76 - - 0.09 0.31 0.3 - - - 0.75 -6.42 -0.14 1.93 - - - -
Gb_30229 (UGT85A1)
- - - - - - - - - - 3.41 - - - 3.23 - - - - -
- - - - - - - 0.97 2.28 - - - 3.72 - - - - - - -
0.96 - - 2.64 - - - -0.67 -0.1 - - -1.04 0.13 1.08 0.85 1.44 - - 1.03 -
Gb_31398 (TPI)
- - - - - - - -0.21 - - - -0.02 - 0.53 3.74 - - 1.74 - -
- - - - - - -5.39 0.62 - - - - 4.2 - - - - - - -
- - - - - - - 0.06 2.39 - - - - - 3.78 - - - - -
-0.7 -1.17 -1.34 - -0.69 -2.14 -1.0 0.1 0.37 -1.17 1.42 -1.68 -3.5 -1.16 2.34 0.89 -1.22 0.83 -0.68 0.16
- - - 2.98 - - - 0.84 0.67 2.09 - -0.7 1.94 - - - - - - -
0.02 - - - 1.08 2.18 - -0.45 - - - -0.99 - - - - - 2.39 2.55 -
- - - - - - - 4.32 - - - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - 4.32 - - - - -
-2.88 - -0.12 - - -3.14 -2.26 -2.77 -0.99 -0.47 -2.51 -5.28 -4.81 -4.87 -3.7 - - - 4.08 -
- - - - - - - 2.95 3.6 - - - -3.64 - - -4.89 - - -14.9 -
Gb_33610 (HSC70-5)
- - - - - - - - - - - - - - 3.8 - - - 2.61 -
Gb_33679 (CLA)
- - - - - - - -0.02 - - - - - - - - - - 4.25 -
Gb_33703 (CHS)
0.14 - - - - - 3.47 -3.94 - - -0.07 - - - 0.88 2.32 - - - -
1.09 - - 1.45 - - -1.02 -0.42 -2.14 -1.07 -0.27 - -0.59 -0.68 2.7 - 0.24 - 1.43 -0.55
4.25 - - - - - - 0.03 - - - - - - - - - - - -
3.05 - - - - - - -0.08 - - - - - - 2.23 2.12 - - 0.8 -
0.85 - 0.46 - 1.59 - 0.28 -0.27 - -1.27 - -2.51 1.13 0.6 - - -0.42 2.47 0.23 -
- - - - - - - - - - - - - - 4.32 - - - - -
- - - - - - -0.25 -0.47 0.67 0.83 2.11 0.43 -0.46 0.41 2.23 1.02 -1.03 - -2.64 -
- - - - - - - 0.52 - - - - - - - - - - 4.21 -
- - -0.35 1.36 - -0.07 -1.05 0.15 0.39 1.16 0.63 - -0.08 - -0.43 - 0.15 2.29 0.43 -
Gb_38776 (KINESIN-13A)
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
0.91 - - 3.33 - - -1.32 -1.32 - 0.8 - - -1.87 -2.09 0.08 - - - 1.76 -0.79
Gb_39312 (KOR)
- - - - 2.75 - 2.26 0.83 1.41 - -3.95 - 1.07 -14.67 -2.58 - - 0.02 -0.52 -
2.66 - - - - -15.43 0.62 -0.21 - - - - - - - - - - 3.49 -
- - - - - - - - - - 3.86 - - - - - - - 2.46 -
1.8 - - - 1.29 - - 0.39 - - 2.09 - - - - - - 2.97 -0.51 -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.32 -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.