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Heatmap: Cluster_134 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
Gb_00149 (MEE44)
 -0.16 -0.57 -0.81 -0.41 0.25 -2.0 -0.67 -0.12 0.09 0.17 0.7 -1.12 0.51 0.07 0.78 -0.01 -0.81 -0.16 0.46 0.87
-0.47 -0.19 -1.31 -0.17 0.44 -0.59 -0.35 0.49 -0.34 -0.32 0.67 0.18 0.02 -0.13 0.4 0.07 -0.19 0.33 0.59 -0.62
Gb_02506 (SPA1)
 0.2 -1.04 -0.51 -0.24 -0.24 -0.23 0.17 0.22 -0.29 -0.39 0.89 -0.87 -0.08 -0.02 0.75 0.26 0.24 -0.35 0.27 -0.22
Gb_02946 (LUG)
 -0.2 0.08 -0.34 -0.11 0.18 -0.28 -0.8 0.0 -0.05 -0.28 0.58 -0.8 0.43 0.11 0.56 -0.1 -0.56 0.01 0.38 0.19
Gb_03476 (NLP7)
 -0.36 -0.59 -0.88 -0.29 -0.72 -0.9 -0.78 0.21 0.13 -0.07 1.22 -0.23 -0.07 -0.48 1.06 0.13 -0.27 -0.58 0.6 0.3
Gb_03497 (XRN3)
 -0.15 -0.41 -0.92 -0.25 0.19 -0.03 -0.86 0.21 0.11 -0.01 0.46 -0.46 0.3 0.08 0.5 -0.33 -0.86 0.09 0.88 0.02
Gb_03499 (XRN3)
 -0.27 -0.62 -1.43 -0.37 0.3 -0.28 -0.6 0.19 0.29 0.13 0.81 -0.57 -0.04 0.02 0.79 -0.03 -0.68 0.09 0.11 0.38
-0.13 0.05 -0.76 -0.0 0.66 0.22 0.09 0.16 -0.22 -0.18 0.18 -0.34 -0.26 -0.38 0.11 -0.23 -0.68 0.5 -0.04 0.4
Gb_04139 (SDG25)
 0.04 -0.73 -0.92 -0.5 0.09 -0.39 -0.62 -0.01 -0.06 -0.2 0.88 -0.58 0.18 0.04 0.96 -0.32 -0.48 -0.13 0.29 0.64
Gb_04924 (YDA)
 -0.07 -0.26 -0.57 0.04 0.18 -0.33 -1.23 0.34 0.07 -0.09 0.43 0.04 0.01 -0.18 0.42 0.01 -0.18 0.15 0.16 0.24
-1.19 0.12 -0.63 -0.64 -0.93 -1.73 -0.35 0.02 0.64 0.48 0.86 -0.31 0.29 0.22 0.7 0.84 0.1 -0.95 -0.02 -0.71
Gb_05868 (XRN3)
 0.17 -0.46 -0.45 -0.38 -0.6 -0.46 -0.42 0.05 0.21 0.09 0.82 -0.59 0.46 0.22 0.84 0.54 0.22 -0.97 -0.74 -0.4
-0.86 0.06 -0.6 -0.8 -0.23 -0.84 -0.55 0.18 0.23 0.1 0.56 -0.49 0.34 0.17 0.56 0.66 0.34 0.14 -0.17 -0.31
-0.91 -2.39 -0.87 -1.46 -1.11 -4.01 -1.78 0.09 0.91 0.79 1.31 -0.21 -1.24 -0.76 1.29 0.82 0.65 -1.72 0.53 0.02
Gb_06438 (Fes1A)
 -0.14 -0.44 -0.27 0.22 0.23 -0.41 0.12 -0.05 -0.27 -0.38 0.55 -0.47 0.28 0.15 0.7 -0.57 -0.18 -0.35 0.54 -0.22
0.22 1.13 -0.82 1.03 0.53 -0.88 -2.54 -0.19 -0.25 -0.11 0.07 -1.87 0.36 -0.02 0.47 0.2 -0.68 -0.19 0.56 -2.76
Gb_07926 (HK1)
 -1.06 -0.28 -1.76 -0.32 -0.05 -2.09 -1.26 0.31 0.2 0.34 0.98 0.24 0.08 -0.4 0.74 -0.32 0.33 -0.58 0.34 0.77
Gb_07928 (HK1)
 -0.54 0.22 -1.03 -0.92 0.28 -1.43 -1.04 0.37 -0.04 -0.1 0.96 0.42 -0.65 -1.17 0.79 -0.69 0.21 -0.76 1.2 0.14
Gb_08556 (ERD4)
 -1.21 -1.77 -1.84 -1.45 -1.41 -2.15 -0.88 0.05 0.14 0.14 1.42 -0.17 0.13 -0.35 1.63 -0.04 -0.48 0.07 1.03 -0.1
-2.62 -6.44 -2.88 -4.31 -4.03 -4.6 -3.41 0.21 0.8 0.38 1.73 -0.07 -0.06 -0.13 1.74 0.94 1.32 -2.12 -0.6 -1.08
-0.77 -0.23 -0.66 -0.69 -1.2 -0.75 -1.16 0.23 0.68 0.43 0.43 0.1 0.74 0.4 0.5 0.43 0.37 -1.07 0.29 -0.84
Gb_09571 (HK1)
 -0.74 -1.21 -1.49 -0.39 -0.19 -1.78 -1.15 0.14 0.3 0.26 0.89 0.06 -0.23 0.03 1.06 -1.1 -0.5 0.13 0.84 0.85
Gb_11371 (PUB9)
 -0.65 -1.07 -0.97 -0.65 -0.54 -1.2 -0.95 0.62 0.44 0.22 1.25 -0.36 0.14 -0.08 1.11 0.31 0.32 -0.86 -0.27 -0.29
-0.74 -0.27 -1.5 -1.6 -0.84 -1.09 -1.09 0.09 0.44 0.36 1.33 -0.38 0.46 0.31 1.37 -0.43 -0.28 -0.59 0.13 -0.15
-0.04 -0.92 -0.44 -0.18 0.07 -0.26 -0.25 0.3 -0.04 -0.18 0.63 0.04 -0.76 -0.88 0.74 -0.2 -0.01 -0.33 1.06 -0.09
-3.79 -1.99 -2.89 -1.91 -1.58 -2.74 -0.57 -0.16 0.61 0.76 1.51 -0.35 0.31 0.06 1.33 0.66 0.88 -2.13 0.27 -0.47
Gb_13242 (ABCA1)
 -0.27 -0.24 -0.89 -0.09 0.49 -0.43 -0.25 0.21 0.01 -0.07 0.88 -0.5 -0.61 -0.74 0.9 -0.07 -0.24 -0.58 0.45 0.33
Gb_13633 (MEF1)
 0.6 0.03 -0.03 0.26 -0.02 -2.28 -0.54 0.01 0.4 0.37 0.43 -0.95 0.2 -0.24 0.34 -0.15 -0.6 -0.13 0.53 -0.44
-0.18 0.4 -0.32 -0.15 0.2 -0.59 -1.0 -0.02 0.44 0.41 0.33 -0.19 -0.14 -0.22 0.44 -0.01 -0.39 -0.09 0.41 -0.27
0.64 -0.17 -0.02 0.38 0.53 -0.9 -0.16 0.05 -0.21 -0.2 1.05 -0.17 -0.49 -0.66 0.96 -1.0 0.02 -0.85 -0.75 -0.49
0.01 -0.53 -0.6 -0.01 0.28 -0.3 -0.34 0.2 -0.08 -0.09 0.8 -0.07 -0.46 -0.67 0.76 -0.15 -0.26 0.13 0.07 0.22
-1.07 -0.86 -1.09 -1.76 -0.36 -1.2 -0.02 -0.04 0.68 0.61 0.92 -0.06 -0.75 -0.77 0.76 0.73 0.87 -0.49 0.58 -0.98
-0.52 -0.38 -0.29 -0.37 -0.51 -1.82 -1.16 0.04 0.61 0.46 0.72 -0.25 0.28 0.5 0.64 0.41 -0.12 -0.57 0.34 -0.48
Gb_16881 (CCR2)
 -0.7 -0.58 -0.81 -0.5 -0.34 -0.42 -1.18 0.25 0.2 0.04 1.18 -0.15 -0.01 -0.12 1.24 0.38 -0.04 -0.27 -0.37 -0.38
-0.3 -0.03 -0.34 -0.03 -0.05 -0.83 -0.5 0.16 0.1 0.07 0.73 -0.36 -0.15 -0.39 0.57 0.36 0.21 0.07 0.0 -0.16
Gb_17353 (CDF3)
 -0.15 -0.89 -1.27 -1.0 -0.45 -1.46 -0.61 0.24 0.92 0.62 0.59 0.31 0.52 0.18 0.64 -0.52 -0.49 -0.59 1.0 -1.53
Gb_19146 (RKP)
 -0.34 -0.75 -1.2 -0.26 0.18 0.03 -0.66 0.59 -0.04 -0.09 0.49 0.12 0.34 -0.0 0.34 -0.38 -0.38 0.24 0.21 0.33
-0.24 -0.61 -0.19 -0.3 0.26 -1.11 -1.99 0.1 -0.38 -0.47 1.32 -0.77 0.15 -0.13 1.38 -0.68 -1.02 0.95 -0.33 -0.36
0.21 -0.23 -0.29 0.31 0.02 -0.82 -0.66 0.18 0.33 0.17 0.47 -0.23 0.02 -0.14 0.34 -0.16 0.18 -0.24 0.19 -0.36
Gb_21093 (UPF3)
 -0.27 -0.79 -0.73 -0.66 0.03 -0.22 -0.15 0.12 -0.05 -0.08 0.72 -0.19 0.0 -0.08 0.7 0.05 -0.02 -0.06 0.68 -0.15
Gb_21281 (CPSF30)
 -1.12 -1.34 -0.95 -0.46 -0.28 -0.36 0.06 0.16 0.25 -0.44 0.29 -0.53 0.46 0.32 0.57 -0.31 -0.14 0.29 0.96 0.38
-0.56 -0.99 -0.88 -0.36 0.36 -0.56 -1.61 0.04 -0.18 -0.39 1.23 0.3 0.09 0.18 1.22 -0.25 -0.27 -0.15 0.03 -0.26
Gb_21699 (SMG7)
 -0.08 -1.01 -0.83 -0.04 0.39 -0.99 -0.89 0.1 -0.12 0.03 1.16 -0.76 0.43 0.15 1.11 -0.61 -0.31 -0.29 -0.14 0.04
-0.54 -0.27 -0.85 -1.05 -0.75 -0.16 -0.78 0.23 -0.28 -0.07 1.13 -0.11 -0.37 -0.31 0.97 0.09 0.36 0.33 0.18 0.03
Gb_22319 (PTR2)
 -0.11 0.01 0.05 -0.33 -0.21 0.16 -2.34 0.14 0.16 -0.19 1.28 -0.4 -1.7 -1.41 1.35 0.29 0.51 -0.83 -0.39 -0.8
0.76 -0.63 0.29 -0.09 -0.25 -2.95 -1.08 -0.01 0.39 0.3 0.58 -1.15 -0.31 -0.52 0.21 0.46 -0.07 -0.29 0.56 0.39
-0.25 -0.65 -0.64 -1.25 -0.12 -0.14 -1.05 0.2 0.27 0.01 0.95 -0.56 0.65 0.42 0.67 0.18 -0.65 -0.4 0.3 -0.12
-0.58 -0.41 -1.37 -0.88 -0.13 0.3 -0.95 0.16 0.11 -0.12 0.83 -0.67 0.19 -0.12 0.89 -0.16 -0.67 -0.03 1.16 -0.29
Gb_23280 (PUM1)
 0.17 -0.25 -0.82 -0.14 0.17 -0.35 -0.87 0.12 -0.07 -0.31 0.72 -0.8 0.18 -0.21 0.76 0.15 -0.16 -0.23 0.74 -0.3
Gb_23458 (XDH1)
 -0.61 -0.85 -0.68 -0.16 0.07 0.17 -0.24 0.08 -0.07 -0.16 1.14 -0.48 -0.8 -1.23 1.08 0.26 -0.19 -0.25 0.49 -0.01
Gb_23646 (PUB44)
 -0.55 -0.62 -1.3 -0.47 -0.72 -0.87 -1.67 0.81 0.28 0.16 0.82 -0.11 0.37 0.03 0.61 0.01 0.14 0.81 -0.27 -0.41
0.13 0.2 -0.2 -0.1 0.34 -0.31 -2.24 -0.13 0.25 0.4 1.15 -0.62 -0.19 -0.49 1.21 -0.38 -0.48 -0.79 -0.77 -0.25
Gb_24507 (Z-ISO)
 -0.69 -0.36 -0.9 -0.5 -0.39 -0.62 -0.7 0.12 0.7 0.34 0.22 0.18 0.22 0.26 0.23 0.87 0.18 -0.75 0.23 -0.34
Gb_24983 (PUB45)
 -0.8 -0.75 -1.7 -0.31 0.06 0.27 -0.66 0.59 0.31 0.28 1.08 0.22 -0.3 -0.2 0.89 -0.97 -1.27 -0.57 0.35 0.25
-0.89 -0.75 -1.55 -0.71 -0.35 -1.1 -0.79 0.24 -0.15 -0.33 0.94 -0.67 0.91 0.57 0.95 -0.27 -0.79 -0.52 1.15 0.07
-0.28 -0.19 -0.89 -0.45 -0.12 -4.5 -0.98 0.07 0.47 0.31 0.7 -0.7 0.63 0.05 0.45 0.0 -1.06 -0.72 1.02 0.65
-0.19 - -0.71 1.92 -1.01 -1.61 -3.17 1.41 0.94 0.39 -1.47 -2.76 -1.68 -2.31 -1.04 -0.58 - 0.01 2.16 -2.01
Gb_26822 (PHL1)
 -1.53 -2.65 -2.72 -2.11 -1.01 -0.9 0.3 0.41 0.32 0.14 1.07 -0.54 0.86 0.57 0.94 -0.78 -0.48 -0.33 1.29 -0.69
-1.5 -2.89 -2.43 -1.93 -0.71 -1.04 0.42 0.35 0.32 0.2 1.12 -0.38 0.18 0.16 1.16 -0.66 -0.39 0.1 1.28 -0.65
0.38 0.47 -0.05 0.71 0.88 -2.99 -1.61 -0.09 0.19 -0.0 0.16 -0.04 -1.87 -1.58 0.14 0.5 -0.28 0.04 0.88 -1.18
-0.39 0.17 -0.35 -0.29 -0.14 -1.54 -1.1 0.3 0.3 0.23 0.89 -0.28 0.3 0.04 0.86 0.2 0.11 -0.82 -0.05 -0.66
-0.02 -0.01 -0.64 0.05 0.25 -0.34 -0.69 0.32 0.08 -0.15 0.57 -0.32 0.38 -0.02 0.53 -0.3 -0.67 -0.04 0.34 -0.26
Gb_27637 (PTR5)
 -0.09 -0.38 -0.11 -0.01 0.07 0.14 -2.72 0.39 -0.42 -0.3 1.18 -0.74 -1.3 -1.13 1.42 -0.05 -0.36 -0.59 0.95 -1.11
Gb_27958 (DOT4)
 0.72 -1.39 -0.26 -0.22 -0.04 -1.5 -0.29 -0.03 0.38 0.27 0.39 -0.59 0.08 -0.18 0.46 0.53 -0.49 -0.34 -0.41 0.73
Gb_27991 (TPR2)
 0.05 -0.14 -0.54 -0.12 0.38 -0.33 -2.68 -0.21 0.18 -0.09 0.66 -1.1 0.18 -0.18 0.81 0.28 -0.08 -0.24 0.56 -0.05
Gb_28025 (ABCA1)
 -0.44 0.16 -0.83 -0.16 0.21 -0.75 -0.48 -0.04 0.08 -0.05 1.11 -0.42 -0.28 -0.78 1.01 -0.0 -0.54 0.06 0.3 -0.07
-0.6 -1.23 -1.07 -0.01 -0.1 -0.58 -0.09 0.28 0.08 0.03 0.27 -0.48 1.0 0.79 0.32 -0.78 -0.66 -0.0 0.98 -0.89
Gb_28479 (MTK)
 1.06 0.09 0.71 0.58 0.04 -0.83 -0.41 0.09 -0.51 -0.46 0.62 -0.84 -0.23 -0.43 0.72 -0.34 -1.06 -0.37 -0.39 -0.47
Gb_28655 (FH6)
 -0.51 -0.22 -0.81 -0.87 -0.26 -0.78 -0.25 -0.01 0.01 0.21 1.28 -0.49 -0.29 -0.69 1.13 -0.26 -0.69 -0.64 0.68 0.53
0.01 -0.35 -0.42 0.35 0.47 0.5 -0.23 -0.0 -0.24 -0.28 0.63 -0.68 -0.53 -0.69 0.56 0.03 0.11 -0.03 -0.05 -0.2
-1.72 -2.38 -2.79 -1.6 -1.01 -1.26 -0.29 0.54 0.69 0.55 0.76 -0.28 0.5 0.39 0.77 0.22 -0.08 -0.84 1.07 0.08
0.25 -0.06 0.21 0.25 0.09 -0.22 -0.38 0.16 -0.17 -0.29 0.5 -0.78 -0.38 -0.74 0.45 -0.08 0.33 0.01 -0.08 0.14
Gb_31243 (CNGC14)
 -0.06 -0.24 -0.53 -0.24 0.59 0.42 -0.77 0.11 -0.39 -0.48 0.67 -0.88 -0.45 -0.96 0.74 -0.24 -0.17 0.19 0.31 0.57
Gb_31623 (CNGC5)
 -0.41 -0.17 -0.8 -0.45 0.31 -0.13 -1.03 0.21 -0.16 -0.21 0.96 -0.28 -0.06 -0.47 1.0 -0.66 -0.35 0.29 0.21 0.34
-0.62 -0.03 -0.7 -0.31 0.01 0.02 -0.5 0.17 -0.05 -0.18 0.72 -0.53 -0.16 -0.27 0.84 -0.43 -0.44 0.06 0.99 -0.19
Gb_33773 (PAP18)
 -0.95 -0.56 -0.98 -0.5 0.15 -0.18 0.16 0.18 -0.01 0.05 0.02 0.34 0.44 0.5 0.21 -0.48 0.47 -0.43 0.01 0.34
0.22 0.78 -0.46 -0.13 -0.82 -2.84 -0.25 -0.13 -0.05 -0.14 0.5 -0.05 -0.03 0.03 0.47 -0.05 -0.5 0.25 0.89 -0.6
-0.5 -0.45 -0.7 0.09 0.28 -0.34 -0.55 0.2 -0.06 0.06 0.72 -0.22 0.04 -0.2 0.72 -0.21 -0.12 -0.08 0.16 0.18
Gb_36764 (NAC028)
 -0.59 -0.39 -1.14 -0.33 0.1 -1.27 -1.57 0.08 0.3 0.13 0.58 -0.45 0.63 0.38 0.6 -0.0 -0.82 -0.32 0.33 0.93
-0.54 0.13 -0.87 -0.14 0.1 -0.89 -1.73 0.22 0.09 -0.1 0.81 -0.36 -0.4 -0.68 0.9 -0.09 -0.77 -0.03 0.67 0.84
-1.52 -4.43 -2.79 -1.29 -3.97 -2.14 -1.05 0.32 0.97 0.6 1.57 -0.8 1.24 0.74 1.18 0.6 -0.25 -2.52 -0.64 -0.88
Gb_37254 (OTP84)
 0.81 -0.92 0.09 0.24 0.48 -3.13 -1.02 -0.01 0.72 0.23 -0.15 -0.4 -0.37 -0.63 -0.26 0.43 0.31 -0.01 -0.04 0.24
Gb_37358 (IRX3)
 -1.27 -1.97 -0.51 -0.55 -0.18 -1.48 -1.83 0.44 0.03 0.4 1.35 -0.44 -0.57 -0.57 1.43 -1.18 -0.25 0.79 0.12 0.4
Gb_37508 (SS4)
 -0.22 -0.07 -0.37 -0.04 0.2 -0.75 -0.76 0.16 0.32 0.17 0.7 -0.05 -0.15 -0.3 0.6 0.12 0.0 -0.49 0.23 -0.26
Gb_37812 (RLK)
 -2.0 -2.11 -2.76 -1.23 -0.18 -0.92 -2.87 -0.2 0.25 0.24 1.3 -0.15 -0.82 -0.47 1.47 0.59 0.33 0.4 0.57 0.22
0.05 -0.47 -0.77 -0.2 0.03 -0.79 -1.01 0.06 0.14 0.06 0.78 -0.64 0.55 0.3 0.76 0.12 -0.37 -0.39 0.4 -0.29
Gb_38606 (PHO2)
 0.03 -0.75 -1.01 0.17 0.18 -0.42 -1.33 0.29 0.31 0.08 1.1 -0.36 -0.39 -0.43 0.74 0.34 -0.4 0.28 0.02 -0.7
Gb_38715 (CRK16)
 -2.55 -3.45 -2.44 -1.43 0.08 -1.85 -3.73 0.66 0.05 0.43 1.36 0.93 -0.34 -0.47 1.46 -0.29 0.76 -0.49 0.46 -1.1
-0.31 -0.63 -0.58 0.08 0.0 0.51 -0.26 0.15 -0.05 -0.14 0.2 -0.1 -0.66 -0.71 0.06 0.21 0.08 0.21 0.83 0.06
Gb_40772 (BAM4)
 0.3 0.55 -0.06 0.23 0.19 -0.78 -1.09 0.14 0.06 -0.08 0.14 -0.29 -0.04 -0.05 0.2 0.12 -0.48 -0.31 0.62 -0.44
Gb_41801 (REME1)
 0.52 -0.63 0.49 -0.24 0.02 -3.89 -0.34 -0.16 0.37 0.05 0.34 -0.88 -0.44 -0.55 0.21 0.75 0.4 0.05 -0.26 0.37

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.