Heatmap: Cluster_56 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Ovule	Ovule, mature	Ovule, pollinated	Strobilus, female	Ovulate strobilus	Microstrobilus	Kernel	Leaf	Leaf, female	Leaf, male	Leaf, salicylic acid	Leaf, seedling	Leaf, truncation control	Leaf, truncation treatment	Leaf, water	Yellow-green stripe leaves	Green leaves	Stem	Cambium	Root
Gb_01638	1.0	0.3	0.68	0.84	0.56	0.09	0.32	0.48	0.52	0.46	0.98	0.23	0.23	0.25	0.89	0.75	0.71	0.66	0.73	0.17
Gb_02060 (CRR22)	1.0	0.35	0.81	0.82	0.53	0.06	0.33	0.49	0.52	0.48	0.57	0.33	0.32	0.32	0.54	0.67	0.69	0.39	0.42	0.1
Gb_04079 (OTP84)	0.98	0.29	0.53	0.49	0.4	0.11	0.28	0.42	0.48	0.45	1.0	0.24	0.25	0.22	0.85	0.7	0.56	0.7	0.49	0.34
Gb_05883 (VAC1)	1.0	0.21	0.64	0.53	0.58	0.06	0.25	0.47	0.55	0.45	0.75	0.28	0.38	0.3	0.66	0.37	0.5	0.34	0.37	0.23
Gb_06088	1.0	0.25	0.6	0.96	0.62	0.04	0.2	0.34	0.44	0.44	0.64	0.15	0.19	0.19	0.6	0.42	0.41	0.19	0.23	0.03
Gb_06897	1.0	0.28	0.66	0.84	0.5	0.08	0.33	0.33	0.47	0.38	0.56	0.17	0.11	0.1	0.59	0.85	0.57	0.23	0.61	0.09
Gb_07442	0.89	0.39	1.0	0.56	0.63	0.06	0.2	0.24	0.35	0.29	0.48	0.14	0.12	0.12	0.37	0.65	0.46	0.2	0.22	0.14
Gb_07570 (REME1)	1.0	0.11	0.53	0.55	0.5	0.06	0.21	0.36	0.39	0.41	0.75	0.15	0.16	0.18	0.69	0.52	0.47	0.33	0.25	0.11
Gb_07730	1.0	0.35	0.7	0.6	0.53	0.03	0.17	0.33	0.34	0.39	0.48	0.2	0.18	0.14	0.43	0.82	0.81	0.19	0.3	0.11
Gb_07755 (CRR22)	0.88	0.2	0.61	0.76	0.56	0.06	0.35	0.54	0.51	0.46	1.0	0.27	0.36	0.35	0.85	0.66	0.66	0.66	0.47	0.32
Gb_08518	1.0	0.3	0.64	0.84	0.51	0.06	0.28	0.38	0.4	0.36	0.56	0.16	0.1	0.15	0.57	0.88	0.71	0.31	0.29	0.15
Gb_10709 (CRR22)	1.0	0.24	0.66	0.72	0.43	0.02	0.31	0.3	0.44	0.34	0.52	0.15	0.17	0.2	0.44	0.63	0.65	0.12	0.28	0.07
Gb_11389 (CRR22)	1.0	0.55	0.79	0.65	0.52	0.04	0.21	0.31	0.49	0.37	0.74	0.14	0.11	0.11	0.68	0.99	0.72	0.2	0.41	0.1
Gb_11664	1.0	0.32	0.81	0.68	0.63	0.15	0.24	0.37	0.41	0.3	0.53	0.18	0.27	0.32	0.49	0.45	0.45	0.35	0.5	0.18
Gb_15644	1.0	0.17	0.59	0.65	0.41	0.04	0.21	0.35	0.42	0.32	0.47	0.18	0.24	0.27	0.38	0.5	0.33	0.27	0.28	0.17
Gb_15797 (CRR22)	1.0	0.29	0.53	0.48	0.4	0.07	0.33	0.34	0.36	0.34	0.49	0.18	0.22	0.22	0.5	0.59	0.46	0.29	0.33	0.1
Gb_21046 (CRR22)	1.0	0.22	0.65	0.46	0.47	0.05	0.39	0.38	0.56	0.52	0.9	0.2	0.12	0.2	0.82	0.72	0.5	0.3	0.52	0.05
Gb_21064 (CRR22)	1.0	0.26	0.6	0.61	0.43	0.06	0.38	0.38	0.49	0.44	0.85	0.22	0.21	0.21	0.75	0.64	0.52	0.3	0.39	0.28
Gb_22770	1.0	0.25	0.63	0.67	0.51	0.03	0.29	0.33	0.34	0.38	0.49	0.14	0.16	0.16	0.49	0.66	0.46	0.44	0.43	0.19
Gb_23084 (OTP84)	1.0	0.45	0.65	0.76	0.65	0.08	0.43	0.46	0.49	0.5	0.93	0.25	0.32	0.24	0.86	0.73	0.57	0.51	0.66	0.3
Gb_25869 (VAC1)	1.0	0.37	0.56	0.75	0.51	0.03	0.34	0.26	0.32	0.28	0.54	0.1	0.11	0.1	0.56	0.68	0.31	0.34	0.37	0.12
Gb_26130	1.0	0.25	0.69	0.56	0.54	0.1	0.23	0.41	0.46	0.43	0.83	0.22	0.21	0.22	0.62	0.68	0.65	0.33	0.4	0.21
Gb_26310 (VAC1)	1.0	0.2	0.59	0.89	0.67	0.05	0.22	0.49	0.47	0.46	0.73	0.23	0.26	0.28	0.69	0.64	0.76	0.45	0.45	0.15
Gb_28676 (CRR22)	1.0	0.41	0.74	0.83	0.89	0.07	0.33	0.46	0.53	0.49	0.73	0.2	0.27	0.25	0.66	1.0	0.71	0.63	0.53	0.11
Gb_28759	1.0	0.24	0.68	0.54	0.3	0.05	0.65	0.3	0.57	0.46	0.7	0.12	0.18	0.23	0.52	0.97	0.47	0.23	0.33	0.11
Gb_28764 (CRR2)	1.0	0.44	0.89	0.82	0.6	0.04	0.21	0.34	0.36	0.36	0.96	0.14	0.21	0.19	0.76	0.71	0.64	0.23	0.54	0.13
Gb_28769	1.0	0.2	0.61	0.65	0.52	0.07	0.31	0.4	0.59	0.67	0.68	0.18	0.23	0.24	0.57	0.67	0.78	0.37	0.68	0.23
Gb_29878 (CRR22)	1.0	0.24	0.72	0.99	0.37	0.07	0.39	0.29	0.41	0.43	0.58	0.1	0.17	0.14	0.61	0.62	0.41	0.21	0.29	0.1
Gb_31111 (EMB2758)	0.96	0.47	0.56	1.0	0.56	0.14	0.33	0.57	0.54	0.57	0.88	0.36	0.47	0.36	0.9	0.76	0.66	0.7	0.7	0.35
Gb_31188 (VAC1)	1.0	0.16	0.52	0.49	0.39	0.04	0.33	0.34	0.34	0.32	0.3	0.16	0.17	0.18	0.33	0.5	0.41	0.31	0.45	0.16
Gb_31319 (OTP84)	1.0	0.23	0.58	0.59	0.5	0.06	0.24	0.34	0.39	0.37	0.56	0.16	0.19	0.19	0.52	0.55	0.5	0.31	0.33	0.31
Gb_31599	1.0	0.14	0.46	0.83	0.52	0.05	0.23	0.36	0.38	0.3	0.37	0.18	0.19	0.2	0.36	0.57	0.4	0.33	0.35	0.1
Gb_32256 (REME1)	1.0	0.62	0.43	0.58	0.66	0.05	0.23	0.22	0.26	0.28	0.85	0.08	0.09	0.1	0.65	0.6	0.46	0.27	0.26	0.09
Gb_33070 (CRR22)	1.0	0.54	0.95	0.99	0.7	0.11	0.41	0.49	0.51	0.43	0.79	0.27	0.24	0.23	0.71	0.83	0.79	0.41	0.71	0.15
Gb_33311	1.0	0.24	0.48	0.64	0.7	0.07	0.31	0.34	0.39	0.35	0.54	0.21	0.3	0.25	0.52	0.6	0.34	0.34	0.49	0.2
Gb_34253	0.89	0.06	0.73	0.56	0.44	0.06	0.19	0.55	0.5	0.35	0.6	0.16	0.18	0.21	0.55	1.0	0.99	0.6	0.31	0.06
Gb_36140 (VAC1)	1.0	0.21	0.61	0.62	0.54	0.07	0.22	0.43	0.35	0.42	0.74	0.2	0.25	0.27	0.54	0.65	0.56	0.42	0.51	0.14
Gb_36177 (REME1)	1.0	0.3	0.8	0.67	0.59	0.07	0.33	0.51	0.55	0.55	0.71	0.29	0.27	0.29	0.71	0.61	0.54	0.31	0.56	0.12
Gb_36178	1.0	0.2	0.76	0.78	0.49	0.06	0.37	0.37	0.4	0.36	0.89	0.2	0.29	0.22	0.87	0.54	0.46	0.36	0.31	0.1
Gb_36460	1.0	0.36	0.69	0.55	0.4	0.03	0.25	0.32	0.41	0.36	0.54	0.15	0.14	0.14	0.53	0.9	0.57	0.31	0.32	0.24
Gb_38243 (REME1)	0.97	0.39	0.59	0.57	0.43	0.02	0.33	0.43	0.51	0.57	0.94	0.2	0.15	0.16	1.0	0.45	0.5	0.39	0.52	0.3
Gb_38504	1.0	0.33	0.69	0.58	0.61	0.05	0.37	0.42	0.52	0.48	0.7	0.26	0.23	0.24	0.65	0.56	0.53	0.29	0.53	0.15
Gb_38817	1.0	0.25	0.7	0.88	0.52	0.06	0.37	0.39	0.41	0.39	0.58	0.16	0.16	0.19	0.5	0.86	0.5	0.24	0.31	0.2
Gb_39298 (CRR22)	0.76	0.16	0.67	0.85	0.55	0.07	0.29	0.43	0.53	0.54	1.0	0.22	0.26	0.21	0.9	0.88	0.74	0.72	0.65	0.54
Gb_40121 (REME1)	1.0	0.24	0.7	0.84	0.48	0.03	0.28	0.45	0.44	0.42	0.49	0.19	0.22	0.21	0.47	0.59	0.48	0.24	0.41	0.08

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)