Heatmap: Cluster_146 (HCCA cluster)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Roots (apex), 7 DAG
Roots (differentation zone), 4 DAP
Roots (elongation zone), 4 DAP
Roots (meristematic zone), 4 DAP
Roots (stele cells), 7 DAS
Roots (tip)
Leaves (rosette), 21 DAG
Leaves (rosette), 29 DAG
Leaves (rosette), 35 DAG
Leaves (rosette), 42 DAG
Leaves (rosette), 57 DAG
Epidermis cells
Mature guard cells
Stems (internode)
Stems (internode), senescent
Meristem (M1-3), 7-9 DAG
Meristem (M4-6), 1-12 DAG
Meristem (M7-1), 13-16 DAG
Axis of the inflorescence
Pedicel
Flowers (receptacles)
Flowers (floral buds)
Flowers (sepals)
Flowers (petals)
Flowers (stamen filaments)
Flowers (anthers)
Flowers (carpels)
Flowers (ovules)
Stigmatic tissues
Pollen
Siliques
Siliques, senescent
Pods of Siliques
Pods of Siliques, senescent
Embryo
Endosperm
Seeds, dry
Seeds, from senescent siliques
Seeds, young
Seeds, germinating
Seedlings, 5 DAG
Seedlings, 11 DAG
Seedlings, 14 DAG
Seedlings, etiolated
AT1G04690 (KAB1)
0.55 -1.51 0.62 0.33 2.47 0.68 -0.46 -1.13 -0.9 -0.81 -0.73 -1.87 -1.74 0.18 0.4 -0.06 0.18 0.29 0.17 -0.26 0.47 -0.13 -0.37 -0.35 0.21 -1.66 0.09 0.5 0.68 -8.53 -0.2 -2.16 -0.46 -0.16 1.01 0.61 -2.41 -2.5 0.53 -0.28 -0.5 -0.73 -0.72 -0.3
AT1G08010 (GATA11)
0.52 -1.25 0.86 -0.24 1.59 0.3 -1.23 -1.06 -0.66 -0.58 -0.93 -2.21 -0.8 0.07 -1.3 0.49 0.52 0.67 -0.03 0.1 -0.11 -0.05 -0.54 0.68 1.0 -1.11 0.91 0.89 0.86 -2.74 -0.21 -2.4 -0.18 -1.36 0.7 0.33 -2.32 -2.35 0.42 -0.34 -0.21 -1.6 0.08 0.54
AT1G08660 (MGP2)
0.44 -0.27 1.49 1.04 2.56 0.54 -0.5 -0.83 -1.8 -2.84 -2.4 -3.24 -4.21 0.73 -0.33 -0.83 -0.34 0.25 0.45 0.24 0.26 -0.26 -0.2 0.63 0.05 -1.45 0.78 0.24 0.4 -6.17 0.0 -3.16 0.02 -2.31 -0.08 -0.15 -4.44 -3.61 0.26 -0.03 -0.25 -0.86 -0.19 0.26
AT1G10430 (PP2A-2)
0.61 0.17 0.85 0.23 2.41 0.54 -0.38 -0.39 -0.29 0.02 -0.21 -3.04 -3.25 0.14 0.41 -0.02 0.14 0.25 0.22 -0.13 -0.2 0.2 -0.4 0.16 0.38 -1.59 0.3 0.29 -0.1 -3.03 -0.24 -1.86 -0.35 -0.26 -0.16 -0.3 -2.28 -2.49 0.22 -0.27 -0.55 -0.41 -0.14 0.19
AT1G13060 (PBE1)
0.81 0.03 0.72 0.87 1.09 0.89 -0.55 -0.45 -0.77 -0.7 -0.46 -4.94 -4.4 -0.01 -0.18 0.62 0.75 0.66 0.32 -0.23 0.04 0.21 -0.5 0.06 0.08 -0.94 0.33 0.59 -0.17 -7.56 -0.05 -1.16 -0.44 -0.48 0.57 -0.21 -1.05 -1.14 0.59 0.59 -0.16 -0.17 -0.74 -0.27
0.91 0.7 1.55 0.37 1.83 0.81 -1.04 -2.06 -1.06 -0.77 -0.89 -2.9 -4.36 0.16 -0.95 -0.07 -0.26 -0.43 -0.67 -1.0 0.26 0.74 -0.66 0.31 0.49 -0.27 -0.03 0.34 1.75 -1.21 0.1 -2.89 -0.53 -0.68 -1.11 1.16 -2.7 -3.67 0.43 0.1 -1.24 -0.81 -0.67 -0.62
0.29 1.17 1.04 0.47 1.8 0.07 -1.15 -1.53 -1.07 -1.16 -1.24 -1.05 -2.56 -0.34 -0.62 -0.51 -0.52 -0.09 -0.1 -0.62 0.04 -0.74 -0.27 0.52 -0.38 1.01 0.63 0.68 0.78 1.24 -0.49 -2.78 -0.53 -0.27 0.11 0.99 -3.24 -3.79 0.44 0.25 -0.46 -1.86 -1.03 -0.28
AT1G21720 (PBC1)
0.62 0.05 0.68 0.6 2.19 0.81 -0.5 -0.19 -0.65 -0.6 -0.27 -4.84 -2.84 0.04 -0.42 0.45 0.71 0.68 0.21 -0.19 0.16 -0.97 -0.49 -0.06 0.23 -1.12 0.2 0.59 0.12 -8.86 0.1 -1.43 -0.27 -0.05 0.12 -0.53 -1.11 -1.19 0.68 0.58 -0.79 -1.52 -1.39 -0.53
AT1G29150 (ATS9)
0.73 0.08 0.3 0.26 2.01 0.87 -0.31 -0.83 -0.55 -0.27 -0.19 -3.45 -0.46 -0.44 -0.2 0.44 0.58 0.48 -0.08 -0.46 0.16 -0.65 -0.84 -0.18 0.16 -0.75 0.0 0.63 -0.05 -6.64 -0.4 -0.6 -0.81 -0.16 0.93 -0.33 -0.61 -0.75 0.44 0.32 -0.41 -1.0 -0.49 0.08
0.27 -0.2 -1.07 1.33 -4.83 0.17 -3.33 0.47 -0.71 -0.9 -0.3 1.59 -0.5 -1.01 -0.79 -0.13 -0.68 -0.52 0.68 0.31 1.39 0.33 -0.26 -0.65 -3.01 -0.54 1.88 -0.09 2.64 -2.7 -0.32 -4.74 0.0 -3.11 0.89 -1.29 -4.04 -5.32 -0.39 -1.11 -1.11 -1.37 -1.02 -1.24
0.15 -1.94 -0.95 1.36 - 1.19 0.48 -0.66 -0.68 -1.01 -0.99 -4.63 -4.04 -0.3 0.1 0.65 0.74 0.69 1.01 0.6 -0.08 0.42 -0.05 -0.82 -0.81 -0.8 0.75 0.8 0.3 -7.14 -0.22 -0.84 -0.69 -1.62 1.21 -1.52 -0.57 -0.71 0.65 0.66 -0.55 0.72 0.37 -0.92
AT1G47250 (PAF2)
0.65 -0.11 0.98 0.87 -1.31 0.92 -0.54 -1.23 -1.31 -1.13 -1.11 -4.71 -3.36 0.19 -0.81 1.01 1.13 0.93 0.38 -0.15 0.23 0.17 -0.69 0.04 0.34 -0.99 0.55 1.1 0.01 -7.57 0.02 -2.06 -0.39 0.12 1.1 -0.97 -2.07 -2.57 0.99 0.21 -0.4 -0.41 -0.7 0.05
AT1G51710 (UBP6)
0.83 0.26 0.41 0.63 0.97 0.69 -0.73 -1.01 -0.94 -0.58 -0.39 -1.52 -0.57 -0.14 0.11 -0.1 0.1 0.22 0.34 -0.12 0.32 0.05 -0.1 0.6 -0.38 -1.0 0.02 0.18 -0.08 -5.07 -0.22 -0.09 -0.5 0.09 0.09 1.52 0.13 -0.31 0.14 0.34 -1.19 -0.82 -0.9 -0.47
0.18 0.15 0.81 0.14 0.92 0.67 -0.95 -1.5 -1.56 -1.96 -1.7 -0.8 0.74 -0.28 -0.96 0.06 0.36 0.65 0.36 0.05 0.25 -0.02 0.23 1.01 0.14 -1.16 0.88 0.7 0.47 -5.08 -0.01 -2.15 -0.14 -0.71 0.62 0.96 -2.55 -2.59 0.58 -0.26 -0.78 -0.84 0.04 -0.02
AT1G53750 (RPT1A)
0.35 0.21 0.46 0.29 0.84 0.8 -0.56 -1.22 -1.13 -0.85 -0.56 -1.24 0.63 -0.67 -0.21 -0.03 -0.0 0.09 -0.12 -0.54 0.38 0.52 -0.52 -0.16 -0.03 -0.3 0.01 0.35 0.13 -5.7 -0.26 -0.31 -0.57 1.26 0.18 1.34 -0.23 -0.72 0.29 0.37 -0.95 -0.39 -0.74 -0.37
AT1G56450 (PBG1)
0.85 -0.23 0.56 0.42 1.56 0.82 -0.65 -1.65 -1.58 -1.29 -1.12 -3.75 -2.87 -0.01 -0.37 0.49 0.74 0.62 0.37 -0.19 0.01 -0.42 -0.58 0.06 0.09 -0.78 0.1 0.63 0.14 -9.53 -0.12 -1.0 -0.54 0.43 0.42 1.56 -1.66 -1.29 0.62 0.82 -0.85 -1.03 -0.62 -0.72
AT1G64440 (REB1)
1.83 1.08 2.48 -0.67 1.79 0.5 -0.92 -1.73 -0.83 -1.07 -1.04 -0.22 -2.65 -0.37 -1.14 -1.42 -1.44 -1.09 -0.37 -0.6 0.05 0.52 -0.32 1.39 0.83 -0.83 0.05 -0.11 0.53 -3.56 -0.56 -2.02 -0.57 -0.56 -0.8 -0.47 -1.73 -2.04 -0.5 -0.18 -0.94 -0.9 -0.76 -0.07
AT1G64520 (RPN12a)
0.78 -0.04 0.5 0.24 1.27 0.65 -0.95 -0.25 -0.44 -0.36 -0.18 -3.74 -3.1 0.43 -0.13 0.88 0.94 0.99 0.18 -0.17 -0.1 -1.24 -0.44 -0.01 0.33 -0.84 0.26 0.6 -0.04 -6.74 -0.16 -0.5 -0.59 -0.04 0.41 0.37 -0.87 -0.64 0.57 0.62 -1.16 -1.52 -1.05 -0.31
AT1G70490 (ARFA1D)
0.29 -0.15 1.0 -0.78 2.63 -0.04 -0.4 -1.6 -1.91 -1.55 -1.52 -3.06 -1.03 1.12 -0.3 0.16 0.33 0.2 -0.3 -0.43 0.06 0.96 -0.61 0.08 0.66 -0.83 -0.03 0.36 0.33 -1.33 0.36 -3.29 0.1 -0.12 -0.67 -0.03 -5.15 -5.06 0.47 -0.72 -0.17 0.29 -0.95 -0.09
0.85 0.84 1.22 0.46 1.91 1.05 -0.57 -2.15 -1.29 -0.95 -1.14 -3.46 0.54 -0.64 -1.0 0.79 0.5 0.28 -0.33 -0.88 -0.19 -1.53 -0.52 -0.26 0.48 -0.54 -0.18 0.4 0.38 -3.12 -0.44 -0.93 -0.98 -0.51 0.47 0.31 -0.33 -0.85 0.29 0.6 -0.47 -2.2 -0.72 0.03
AT1G71860 (PTP1)
0.23 0.46 0.49 0.47 3.08 0.06 -1.05 -0.36 -0.12 0.09 0.21 -2.59 -2.01 0.15 0.14 -0.56 -0.24 0.03 -0.39 -0.71 0.14 0.33 -0.46 -0.24 -0.78 -1.15 0.2 0.44 -0.06 -4.36 -0.52 -2.63 -0.59 -0.0 -0.95 -0.28 -4.56 -4.03 0.18 -0.36 -0.65 0.25 -0.28 0.22
AT1G74230 (GR-RBP5)
0.47 0.0 -0.06 0.6 -0.07 0.23 -0.42 -1.15 -0.67 -0.73 -0.91 -3.25 -2.71 0.01 0.04 0.53 0.69 0.72 0.75 0.51 -0.18 -0.59 -0.03 -0.78 -0.33 -0.66 0.52 0.88 0.23 -5.54 -0.09 -0.24 -0.2 -1.07 0.78 1.48 -0.94 -0.48 0.73 0.35 0.05 -0.31 -1.13 -0.27
1.13 -0.57 1.1 0.91 2.12 1.19 -0.47 -1.11 -0.82 -0.66 -0.6 -4.55 -4.75 -0.06 -0.84 0.39 0.7 0.71 0.51 -0.22 -0.02 -0.11 -0.76 -0.14 -0.04 -1.48 0.42 0.51 -0.22 -7.66 -0.34 -2.52 -0.61 -0.95 0.83 -0.7 -2.98 -2.28 0.41 0.07 -0.51 -0.65 0.07 -0.04
AT2G03680 (SKU6)
0.38 -0.08 0.97 -0.37 1.34 0.39 -0.5 -0.68 -0.8 -0.89 -0.8 -4.15 -3.18 1.09 -0.03 0.52 0.59 0.49 0.02 -0.02 0.27 -0.83 -0.38 0.65 0.9 -1.36 0.17 0.53 0.75 -8.16 0.25 -2.82 -0.16 -1.05 -0.36 0.25 -4.04 -2.9 0.53 -0.0 0.83 -1.37 -0.63 0.87
0.05 0.09 0.35 0.14 2.05 -0.4 -1.08 0.26 0.01 -0.18 -0.27 -1.57 -0.49 0.17 0.33 -0.83 -0.43 -0.15 0.17 -0.11 0.38 0.15 -0.09 0.33 -0.42 -0.4 0.54 0.64 -0.0 -1.12 0.14 -0.66 0.15 0.71 -0.18 -0.04 -0.75 -0.81 0.34 -0.15 -1.81 -0.49 -0.59 -0.66
0.79 -0.59 1.11 1.05 2.35 1.15 -0.46 0.0 -0.33 -0.35 -0.36 -3.7 -6.8 0.56 0.17 0.12 0.13 0.07 0.27 -0.17 0.2 -0.16 -0.74 -0.2 0.09 -1.14 0.39 0.29 0.08 -6.65 -0.2 -2.12 -0.5 -0.74 -0.02 -1.82 -2.21 -2.5 0.34 0.17 -0.76 -0.75 -0.47 -0.05
AT2G26590 (RPN13)
0.31 0.07 0.48 0.86 1.59 0.67 -0.57 -0.39 -0.04 0.15 0.31 -1.36 0.01 0.02 0.35 0.22 0.29 0.37 0.37 -0.21 0.19 -0.05 -0.54 -0.18 -0.47 -1.39 0.39 0.39 -0.5 -6.95 -0.28 -1.18 -0.62 -0.25 0.25 -0.1 -0.75 -1.26 0.3 0.19 -0.57 -0.24 -0.41 -0.04
0.57 0.25 1.25 0.16 1.75 0.79 -0.61 -0.79 0.24 0.36 0.4 -4.02 -2.91 0.16 0.08 0.0 0.05 0.0 -0.25 -0.53 -0.05 -1.01 -0.6 0.36 0.84 -0.52 -0.27 0.24 -0.13 -2.56 0.04 -1.27 -0.15 0.24 0.04 0.1 -2.48 -1.71 0.42 0.11 0.1 -1.52 -1.01 0.41
AT2G42680 (MBF1A)
-0.01 0.27 0.19 0.34 0.93 0.38 -0.8 -0.58 -0.5 -0.44 -0.3 -1.3 -0.75 -0.35 -0.66 0.46 0.2 0.33 -0.28 -0.95 0.51 0.31 -0.19 0.21 0.09 -0.31 0.08 0.5 0.12 -2.4 0.29 -0.73 -0.18 0.56 -0.26 1.4 -0.69 -1.06 0.53 0.14 -0.13 -0.22 -0.51 0.05
0.15 0.69 1.25 -0.17 -0.09 0.08 -0.76 -0.26 0.58 0.82 0.6 -4.16 -3.26 0.29 0.0 0.07 0.08 0.13 -0.45 -0.59 0.21 0.98 -0.15 0.29 0.18 -1.77 -0.38 -0.22 0.9 -6.08 -0.18 -0.5 -0.25 -0.07 -1.37 -2.78 -0.32 -0.35 -0.29 -0.06 -0.51 0.99 0.07 0.7
0.5 0.37 1.57 0.72 2.52 1.02 -0.58 -0.78 0.23 0.53 0.63 -1.65 -4.24 -0.09 -0.9 -0.38 -0.29 -0.18 -0.02 -0.57 0.12 -1.41 -0.68 -0.39 -0.24 -1.18 -0.05 0.11 -0.24 -2.78 -0.29 -3.08 -0.82 -0.97 -0.21 1.24 -3.16 -4.36 0.1 0.11 -0.59 -1.97 -0.16 -0.03
AT2G47170 (ARF1A1C)
0.52 -0.28 1.08 0.22 1.95 0.71 -0.27 -0.99 -1.16 -0.85 -0.71 -0.22 0.53 0.09 -0.55 0.22 0.24 0.16 -0.17 -0.43 0.15 0.83 -0.39 0.3 0.65 -0.57 0.05 0.32 0.27 -1.63 -0.1 -3.18 -0.32 -0.26 -0.73 -0.32 -6.13 -4.7 0.28 0.03 -0.23 0.1 -0.68 0.01
AT3G03110 (CRM1B)
0.32 -1.24 -0.63 1.02 1.47 0.46 -0.9 -1.25 -0.6 -0.58 -0.54 0.72 1.93 -0.48 -0.87 0.22 0.81 1.08 0.55 -0.44 0.27 -0.86 -0.75 -1.38 -1.32 -0.79 0.45 0.89 -1.26 -2.0 -0.5 -1.54 -0.79 -0.42 0.87 0.59 -2.06 -1.73 0.51 -0.08 -1.69 -0.65 -0.37 -0.77
0.98 0.25 0.31 1.54 -3.3 1.66 -0.34 -0.63 -0.58 -0.83 -0.59 -1.88 -1.06 0.01 0.1 0.31 0.39 0.42 0.67 0.23 -0.19 0.52 -0.39 -0.2 -0.07 -2.0 0.31 -0.08 0.23 -8.73 -0.38 -1.08 -0.73 -1.46 0.22 0.58 -1.94 -1.21 0.1 1.14 -1.11 0.47 -0.54 -0.45
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AT3G51260 (PAD1)
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AT3G54110 (UCP)
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AT3G56490 (HIT3)
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AT3G60820 (PBF1)
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AT4G14800 (PBD2)
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AT4G31300 (PBA1)
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AT4G39220 (ATRER1A)
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AT5G35590 (PAA1)
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AT5G38630 (CYB-1)
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AT5G40580 (PBB2)
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0.1 0.24 0.69 0.37 1.26 0.05 -1.06 0.03 0.01 0.01 0.06 -2.29 -1.7 0.31 0.6 -0.18 -0.08 0.44 0.15 -0.0 0.22 -0.37 0.09 0.4 -0.32 -1.03 0.76 0.74 0.5 -5.74 -0.02 -0.48 0.03 0.12 -0.38 -0.33 -0.49 -0.86 0.51 0.2 -0.75 -0.86 -0.76 -0.11
AT5G46860 (VAM3)
-0.04 0.82 0.44 -0.97 1.73 -0.6 -0.65 0.22 0.62 0.57 0.38 -2.33 -2.15 0.7 0.27 -0.44 -0.25 -0.14 0.18 -0.08 0.14 0.66 -0.33 0.11 0.53 -0.74 -0.06 -0.18 0.0 -1.87 -0.16 -0.76 -0.22 0.3 -0.59 -0.95 -0.68 -1.1 -0.26 -0.35 -0.47 0.06 -0.15 0.69
0.48 -0.03 0.69 0.64 2.62 0.35 -0.58 -1.23 -1.4 -1.41 -1.19 -1.41 -3.66 0.64 -0.19 0.1 0.39 0.66 0.61 0.17 0.01 -0.55 -0.46 0.05 -0.01 -1.17 0.64 0.76 -0.36 -4.61 -0.2 -1.93 -0.33 -0.8 0.45 -1.35 -2.81 -2.49 0.47 -0.03 -0.57 -1.05 0.27 -0.03
0.57 -0.77 1.41 -0.05 3.05 0.54 -0.27 -1.78 -1.17 -1.49 -1.49 -6.19 - 0.44 -0.06 -0.69 -0.4 -0.1 0.25 0.08 0.26 0.17 -0.01 0.22 0.54 -1.05 0.36 0.27 0.67 -4.92 0.2 -3.59 0.34 -0.79 -1.25 -1.18 -6.84 -4.75 0.43 -0.24 -0.9 -0.98 -0.23 -0.37
AT5G65270 (RABA4a)
0.23 -0.36 0.68 -0.82 2.19 0.04 -0.6 -2.02 -1.31 -1.03 -1.23 -3.1 -2.35 0.89 -0.21 0.14 0.29 0.29 0.05 -0.44 -0.03 0.43 -0.58 0.76 0.77 -2.27 0.05 0.18 0.29 - 0.31 -0.71 0.03 -0.27 -0.77 0.75 -0.9 -1.1 0.61 0.96 -0.42 -0.21 -0.74 0.11
0.3 -0.45 0.36 0.56 0.26 0.23 -0.66 0.05 0.14 -0.31 -0.21 -2.95 -5.31 0.0 0.55 -0.08 0.03 0.33 0.38 0.18 0.63 0.24 0.22 0.2 0.39 -0.97 0.93 1.06 0.8 -8.89 0.19 -1.61 0.13 -0.7 0.13 -1.23 -1.4 -1.47 0.8 0.01 -0.49 -0.7 -0.16 0.26

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.