1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_34 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
Gb_00171 (CP31B)
 1.0 0.28 0.67 0.84 0.42 0.23 0.27 0.48 0.49 0.41 0.46 0.31 0.33 0.32 0.39 0.95 0.58 0.33 0.18 0.14
0.88 0.39 0.69 0.78 0.35 0.13 0.13 0.4 0.47 0.39 0.48 0.24 0.32 0.41 0.43 1.0 0.44 0.3 0.16 0.14
1.0 0.54 0.69 0.85 0.39 0.17 0.08 0.31 0.33 0.24 0.3 0.18 0.1 0.1 0.31 0.77 0.35 0.26 0.22 0.11
Gb_02518 (pde194)
 0.97 0.48 1.0 0.88 0.48 0.36 0.17 0.57 0.5 0.32 0.47 0.26 0.39 0.33 0.41 0.87 0.52 0.48 0.36 0.26
Gb_03015 (UVR3)
 1.0 0.36 0.72 0.59 0.63 0.35 0.03 0.26 0.24 0.16 0.19 0.26 0.01 0.01 0.19 0.76 0.48 0.45 0.26 0.09
Gb_03016 (UVR3)
 0.91 0.54 0.83 0.82 0.7 0.3 0.06 0.41 0.29 0.15 0.49 0.29 0.12 0.15 0.26 1.0 0.5 0.46 0.14 0.22
Gb_03562 (CYP20-2)
 0.9 0.97 0.98 1.0 0.59 0.55 0.31 0.45 0.33 0.24 0.36 0.24 0.37 0.36 0.35 0.61 0.39 0.51 0.29 0.22
1.0 0.27 0.62 0.76 0.48 0.23 0.18 0.34 0.37 0.32 0.49 0.22 0.11 0.12 0.51 0.62 0.38 0.32 0.21 0.14
0.92 0.88 1.0 0.94 0.51 0.55 0.3 0.37 0.26 0.19 0.1 0.18 0.22 0.21 0.2 0.34 0.21 0.37 0.14 0.14
Gb_04790 (PDF1A)
 1.0 0.6 0.74 0.97 0.45 0.17 0.28 0.36 0.42 0.32 0.3 0.31 0.47 0.53 0.31 0.81 0.51 0.32 0.33 0.13
Gb_05076 (PDF2)
 1.0 0.49 0.48 0.55 0.54 0.05 0.04 0.29 0.24 0.29 0.32 0.32 0.33 0.2 0.27 0.35 0.42 0.14 0.0 0.0
Gb_05082 (PDF2)
 1.0 0.52 0.43 0.69 0.51 0.07 0.03 0.26 0.17 0.2 0.25 0.22 0.28 0.15 0.21 0.23 0.27 0.13 0.0 0.0
Gb_05959 (FLN1)
 1.0 0.37 0.61 0.77 0.32 0.06 0.08 0.19 0.35 0.28 0.35 0.08 0.1 0.14 0.31 0.53 0.39 0.31 0.11 0.13
Gb_06546 (GHS1)
 1.0 0.4 0.66 0.83 0.39 0.34 0.25 0.36 0.32 0.29 0.35 0.38 0.37 0.35 0.34 0.45 0.35 0.29 0.31 0.27
0.85 0.42 0.55 0.98 0.46 0.15 0.13 0.41 0.52 0.41 0.68 0.25 0.3 0.3 0.6 1.0 0.47 0.34 0.15 0.1
0.76 0.43 0.65 0.62 0.22 0.23 0.05 0.39 0.42 0.29 0.25 0.2 0.19 0.17 0.26 1.0 0.51 0.21 0.06 0.03
Gb_07834 (FLN1)
 1.0 0.39 0.6 0.97 0.5 0.05 0.1 0.34 0.54 0.38 0.49 0.15 0.22 0.22 0.43 0.88 0.55 0.32 0.15 0.1
1.0 0.32 0.66 0.68 0.36 0.4 0.05 0.42 0.31 0.16 0.3 0.22 0.21 0.19 0.24 0.5 0.46 0.22 0.17 0.08
0.55 0.47 0.51 0.78 0.23 0.28 0.01 0.28 0.21 0.13 0.16 0.2 0.15 0.22 0.12 1.0 0.61 0.26 0.01 0.12
1.0 0.58 0.91 0.88 0.52 0.39 0.06 0.48 0.34 0.24 0.38 0.24 0.37 0.38 0.34 0.97 0.58 0.46 0.23 0.17
0.82 1.0 0.83 0.67 0.5 0.32 0.1 0.47 0.59 0.44 0.29 0.33 0.31 0.4 0.29 0.85 0.57 0.52 0.23 0.13
Gb_13440 (FLN1)
 0.9 0.64 0.69 1.0 0.25 0.11 0.05 0.18 0.33 0.27 0.23 0.1 0.06 0.09 0.26 0.39 0.28 0.29 0.14 0.1
1.0 0.85 0.87 0.86 0.67 0.59 0.11 0.43 0.44 0.39 0.52 0.37 0.23 0.23 0.47 0.58 0.52 0.42 0.31 0.14
0.78 0.26 0.37 0.79 0.2 0.2 0.01 0.18 0.13 0.08 0.03 0.04 0.01 0.01 0.03 1.0 0.51 0.22 0.05 0.07
0.84 0.6 0.56 0.76 0.26 0.14 0.12 0.39 0.44 0.31 0.47 0.21 0.22 0.24 0.42 1.0 0.34 0.31 0.27 0.11
1.0 0.26 0.35 0.31 0.08 0.07 0.0 0.13 0.16 0.19 0.02 0.08 0.02 0.01 0.03 0.35 0.5 0.02 0.0 0.0
Gb_17836 (HSD1)
 1.0 0.11 0.42 0.65 0.06 0.05 0.0 0.22 0.21 0.22 0.09 0.18 0.14 0.08 0.03 0.42 0.53 0.03 0.0 0.0
Gb_18360 (CPN21)
 0.72 0.42 0.71 1.0 0.41 0.12 0.06 0.23 0.21 0.15 0.18 0.18 0.23 0.24 0.18 0.5 0.37 0.15 0.13 0.07
1.0 0.33 0.93 0.83 0.49 0.36 0.16 0.39 0.17 0.17 0.17 0.21 0.24 0.17 0.2 0.12 0.11 0.4 0.3 0.2
0.78 0.54 1.0 0.79 0.69 0.32 0.25 0.4 0.38 0.31 0.35 0.39 0.19 0.19 0.33 0.71 0.66 0.43 0.41 0.18
0.82 0.67 1.0 1.0 0.6 0.27 0.1 0.4 0.25 0.21 0.4 0.27 0.26 0.23 0.4 0.58 0.33 0.34 0.33 0.11
0.84 0.63 0.65 1.0 0.52 0.12 0.17 0.36 0.44 0.36 0.38 0.26 0.29 0.36 0.38 0.71 0.42 0.31 0.28 0.14
1.0 0.18 0.82 0.82 0.5 0.37 0.14 0.32 0.37 0.3 0.35 0.28 0.27 0.28 0.32 0.39 0.33 0.38 0.17 0.14
0.46 0.38 0.33 0.57 0.19 0.11 0.04 0.17 0.14 0.04 0.04 0.04 0.06 0.14 0.05 1.0 0.58 0.1 0.05 0.04
0.91 0.52 0.79 0.56 0.33 0.31 0.1 0.34 0.38 0.3 0.37 0.24 0.29 0.3 0.29 1.0 0.53 0.24 0.14 0.08
Gb_22884 (MYB6)
 0.52 0.11 0.37 1.0 0.34 0.02 0.0 0.28 0.2 0.13 0.09 0.11 0.14 0.12 0.07 0.31 0.24 0.13 0.03 0.0
Gb_24265 (mtACP2)
 1.0 0.41 0.86 0.82 0.48 0.41 0.2 0.42 0.33 0.3 0.36 0.34 0.27 0.24 0.32 0.39 0.53 0.4 0.26 0.15
1.0 0.55 0.64 0.71 0.25 0.08 0.03 0.33 0.37 0.28 0.23 0.13 0.18 0.19 0.18 0.58 0.58 0.51 0.18 0.2
1.0 0.4 0.72 0.99 0.82 0.36 0.27 0.45 0.51 0.42 0.6 0.51 0.14 0.18 0.49 0.78 0.68 0.66 0.58 0.23
Gb_27318 (TAAC)
 0.93 0.34 0.55 1.0 0.49 0.15 0.04 0.43 0.35 0.32 0.54 0.24 0.34 0.35 0.43 0.42 0.35 0.45 0.18 0.09
Gb_27853 (CJD1)
 0.91 0.96 0.94 1.0 0.65 0.23 0.24 0.38 0.51 0.43 0.35 0.29 0.2 0.26 0.4 0.96 0.42 0.57 0.49 0.33
1.0 0.22 0.37 0.6 0.31 0.14 0.12 0.33 0.49 0.3 0.29 0.15 0.2 0.26 0.34 0.96 0.68 0.2 0.06 0.05
1.0 0.64 0.36 0.81 0.56 0.02 0.0 0.23 0.06 0.04 0.04 0.19 0.03 0.05 0.04 0.53 0.37 0.39 0.0 0.05
Gb_28365 (FSD3)
 0.96 0.52 0.85 1.0 0.38 0.15 0.15 0.32 0.39 0.33 0.5 0.21 0.29 0.29 0.45 0.5 0.27 0.15 0.14 0.1
0.65 0.95 0.81 1.0 0.36 0.06 0.04 0.26 0.16 0.12 0.22 0.06 0.13 0.1 0.24 0.66 0.25 0.31 0.0 0.01
Gb_29721 (OVA4)
 0.78 1.0 0.54 0.79 0.46 0.25 0.32 0.4 0.4 0.31 0.32 0.25 0.23 0.25 0.33 0.8 0.39 0.44 0.26 0.12
1.0 0.38 0.79 0.84 0.3 0.12 0.09 0.46 0.5 0.38 0.33 0.27 0.39 0.39 0.32 0.91 0.5 0.17 0.09 0.05
1.0 0.24 0.63 0.76 0.32 0.08 0.08 0.32 0.23 0.11 0.1 0.22 0.08 0.12 0.12 0.55 0.29 0.25 0.16 0.14
0.56 0.56 0.66 0.74 0.36 0.32 0.09 0.37 0.4 0.32 0.36 0.3 0.08 0.11 0.37 1.0 0.64 0.21 0.14 0.05
Gb_32249 (EGL1)
 0.65 0.51 1.0 0.5 0.45 0.0 0.0 0.14 0.05 0.04 0.01 0.03 0.0 0.01 0.01 0.42 0.35 0.05 0.0 0.0
0.86 0.96 0.97 0.94 0.63 0.13 0.17 0.41 0.52 0.41 0.55 0.27 0.16 0.2 0.52 1.0 0.58 0.49 0.45 0.15
0.73 0.05 0.41 1.0 0.29 0.01 0.01 0.21 0.06 0.04 0.09 0.21 0.05 0.12 0.09 0.21 0.27 0.22 0.04 0.08
0.59 0.08 0.46 1.0 0.25 0.01 0.0 0.21 0.06 0.02 0.05 0.22 0.02 0.05 0.04 0.16 0.15 0.27 0.07 0.07
Gb_34727 (emb1417)
 1.0 0.26 0.61 0.67 0.38 0.11 0.09 0.31 0.28 0.27 0.37 0.25 0.04 0.04 0.39 0.49 0.46 0.38 0.16 0.08
0.79 0.43 0.75 1.0 0.51 0.44 0.12 0.43 0.38 0.28 0.23 0.27 0.46 0.44 0.23 0.74 0.58 0.52 0.29 0.18
0.78 0.52 0.95 1.0 0.37 0.24 0.05 0.47 0.49 0.33 0.48 0.37 0.24 0.21 0.41 0.99 0.69 0.33 0.15 0.11
0.88 0.5 0.86 1.0 0.58 0.35 0.13 0.57 0.5 0.47 0.42 0.33 0.45 0.47 0.37 0.93 0.65 0.58 0.27 0.22
Gb_39246 (ABC4)
 1.0 0.32 0.78 0.8 0.53 0.07 0.05 0.33 0.41 0.29 0.27 0.21 0.14 0.23 0.2 0.72 0.38 0.32 0.02 0.02
1.0 0.75 0.9 0.92 0.53 0.21 0.24 0.37 0.52 0.45 0.51 0.25 0.37 0.31 0.54 0.82 0.31 0.33 0.21 0.25
0.89 0.25 0.67 1.0 0.49 0.14 0.06 0.35 0.28 0.22 0.38 0.27 0.25 0.26 0.35 0.74 0.46 0.33 0.24 0.13
0.95 0.24 0.77 1.0 0.42 0.16 0.16 0.39 0.43 0.39 0.37 0.22 0.35 0.27 0.37 0.71 0.69 0.29 0.23 0.26

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)