1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_90 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
2.18 0.47 0.75 6.54 0.55 0.39 1.12 1.39 1.17 0.79 1.33 0.17 2.0 1.29 1.21 6.09 1.1 0.59 3.7 0.83
2.33 2.96 0.89 4.71 0.52 0.39 0.96 1.84 1.49 1.19 2.41 0.15 0.89 0.88 3.69 6.39 1.35 0.23 3.54 1.58
0.18 0.07 0.01 0.05 0.09 0.0 0.04 0.1 0.09 0.06 0.06 0.0 0.14 0.09 0.11 0.55 0.05 0.05 0.19 0.05
Gb_03194 (CRK8)
 1.75 0.54 0.37 4.73 0.64 0.4 0.56 1.4 1.25 0.89 2.44 0.2 0.54 0.41 2.41 4.33 1.64 0.47 2.69 0.8
0.31 0.2 0.12 1.22 0.1 0.13 0.14 0.31 0.22 0.18 0.28 0.02 0.32 0.24 0.28 1.32 0.31 0.13 0.49 0.27
1.98 1.81 0.9 6.28 1.85 0.82 1.26 2.35 1.27 1.46 1.85 0.16 2.27 1.4 2.72 7.88 2.24 1.04 6.2 2.26
5.09 3.3 2.11 6.47 3.92 1.47 3.11 4.04 2.94 2.6 4.53 0.5 2.32 1.97 6.17 13.85 3.44 3.84 9.84 3.16
0.75 0.48 0.08 1.04 0.43 0.16 0.5 0.72 0.58 0.42 0.77 0.09 0.62 0.37 0.75 2.8 0.67 0.32 1.16 0.53
1.01 0.15 0.27 2.67 0.28 0.13 0.42 0.65 0.44 0.14 0.87 0.11 0.35 0.31 1.03 2.46 0.54 0.12 1.66 0.47
Gb_07919 (ORF240B)
 2.03 0.67 0.61 3.92 0.72 0.38 0.49 1.34 0.9 0.72 1.09 0.14 0.83 0.76 1.45 4.13 1.27 0.28 2.36 0.56
4.49 1.82 2.5 7.08 0.3 2.31 1.99 3.31 1.34 1.71 4.18 0.14 1.87 1.83 7.5 16.77 1.74 1.82 8.2 1.02
0.53 0.33 0.08 0.81 0.18 0.0 0.07 0.32 0.19 0.22 0.42 0.02 0.38 0.31 0.47 1.22 0.37 0.05 0.53 0.11
0.17 0.0 0.04 0.16 0.0 0.02 0.02 0.08 0.02 0.05 0.17 0.0 0.08 0.05 0.15 0.25 0.08 0.02 0.14 0.06
1.93 1.23 0.41 3.84 0.51 0.2 0.97 1.65 1.23 0.95 1.97 0.08 1.84 1.61 2.3 4.26 1.75 0.62 3.06 0.83
0.36 0.41 0.26 1.02 0.27 0.1 0.25 0.37 0.37 0.28 0.55 0.03 0.13 0.1 0.71 1.52 0.36 0.1 0.59 0.23
1.62 0.82 0.66 2.86 0.85 0.36 0.98 1.29 1.06 1.0 1.57 0.13 0.74 0.6 1.67 3.74 0.78 0.49 2.95 1.04
0.77 0.36 0.3 1.48 0.15 0.15 0.34 0.76 0.49 0.35 0.97 0.06 0.48 0.37 1.14 2.68 0.74 0.29 1.58 0.7
Gb_10780 (ORF158)
 1.35 0.76 0.59 2.72 0.81 0.08 0.66 0.82 0.52 0.55 1.32 0.06 0.48 0.38 1.16 2.74 1.17 0.39 1.91 0.63
0.13 0.0 0.03 0.27 0.04 0.02 0.04 0.1 0.05 0.03 0.07 0.01 0.23 0.12 0.11 0.48 0.04 0.03 0.16 0.07
Gb_11409 (CRK8)
 0.23 0.39 0.09 0.71 0.33 0.0 0.24 0.33 0.21 0.27 0.42 0.01 0.05 0.03 0.56 1.89 0.2 0.04 0.55 0.18
Gb_12566 (CRK8)
 0.26 0.2 0.14 0.51 0.19 0.18 0.11 0.27 0.22 0.12 0.52 0.02 0.08 0.06 0.54 0.81 0.36 0.1 0.46 0.05
1.23 1.02 0.37 3.78 0.43 0.25 0.92 1.05 0.76 0.46 1.07 0.21 1.57 0.61 1.43 5.16 1.11 0.37 1.87 0.81
0.54 0.17 0.2 1.06 0.21 0.05 0.11 0.4 0.22 0.15 0.54 0.03 0.12 0.05 0.6 1.87 0.28 0.2 1.14 0.13
0.36 0.35 0.13 0.63 0.18 0.06 0.19 0.37 0.19 0.22 0.55 0.04 0.06 0.06 0.79 1.88 0.21 0.12 0.85 0.25
4.29 1.45 2.07 5.98 2.02 0.9 1.05 2.9 1.02 0.92 2.6 0.15 2.05 1.37 4.13 10.61 1.7 0.88 4.81 1.26
Gb_17811 (HSC70)
 0.29 0.19 0.1 0.58 0.1 0.08 0.12 0.23 0.14 0.14 0.24 0.04 0.35 0.24 0.3 0.63 0.16 0.04 0.27 0.25
0.02 0.02 0.0 0.09 0.0 0.0 0.02 0.04 0.02 0.02 0.05 0.0 0.0 0.0 0.08 0.28 0.03 0.0 0.13 0.02
4.49 2.29 1.34 6.42 1.53 0.43 1.55 3.68 2.16 1.94 3.88 0.22 2.76 2.56 4.98 15.02 2.76 1.08 6.67 2.34
0.09 0.0 0.04 0.14 0.04 0.0 0.01 0.07 0.03 0.03 0.1 0.01 0.01 0.01 0.11 0.25 0.04 0.02 0.17 0.01
Gb_18708 (ORF158)
 0.18 0.1 0.2 0.21 0.0 0.02 0.04 0.12 0.12 0.09 0.27 0.03 0.06 0.01 0.33 0.59 0.11 0.06 0.28 0.11
0.36 0.31 0.07 0.66 0.09 0.07 0.12 0.32 0.2 0.22 0.36 0.04 0.08 0.09 0.41 1.35 0.4 0.09 0.63 0.16
Gb_18961 (ORF170)
 0.28 0.11 0.05 0.55 0.03 0.0 0.14 0.24 0.13 0.08 0.19 0.01 0.04 0.02 0.28 0.75 0.08 0.06 0.5 0.24
Gb_18985 (CRK8)
 0.75 0.47 0.29 1.79 0.26 0.08 0.36 0.71 0.55 0.53 0.66 0.08 0.28 0.22 0.91 2.32 0.61 0.21 1.59 0.43
1.49 0.29 0.27 3.8 1.03 0.26 0.37 0.95 0.66 0.52 0.42 0.15 1.22 0.76 0.94 2.77 0.89 0.08 2.04 0.42
1.44 0.71 0.32 4.13 0.45 0.0 0.66 1.43 1.11 0.95 2.22 0.32 0.62 0.39 2.0 3.24 1.32 0.68 3.38 0.4
1.64 2.64 0.78 4.95 1.26 0.59 0.88 1.88 1.21 0.85 2.32 0.17 1.13 1.09 3.01 7.1 0.81 0.79 4.98 1.29
0.38 0.82 0.48 1.79 0.65 0.21 0.76 1.07 0.63 0.84 0.79 0.05 1.46 0.98 1.82 3.23 0.75 0.24 1.32 0.24
1.35 0.51 0.54 2.4 0.48 0.0 0.39 0.96 0.44 0.45 0.34 0.1 0.95 0.64 1.18 4.15 0.9 0.21 2.36 0.45
0.7 0.16 0.11 2.03 0.35 0.13 0.14 0.41 0.31 0.35 0.54 0.11 0.51 0.24 0.62 1.53 0.91 0.13 0.7 0.13
Gb_24217 (ORF240B)
 1.42 0.96 0.34 3.07 0.46 0.24 0.41 0.96 0.66 0.49 1.04 0.11 0.17 0.17 0.81 3.47 0.81 0.24 1.96 1.04
0.29 0.18 0.0 0.71 0.18 0.07 0.21 0.32 0.12 0.09 0.42 0.01 0.54 0.55 0.44 0.54 0.1 0.05 0.48 0.3
2.68 1.63 1.11 6.66 1.62 0.55 0.99 2.24 1.89 2.01 1.59 0.16 3.52 3.38 2.03 7.72 2.3 1.03 3.4 1.23
Gb_28015 (ORF158)
 0.32 0.16 0.07 0.39 0.01 0.07 0.11 0.22 0.1 0.06 0.27 0.03 0.03 0.01 0.33 0.92 0.21 0.06 0.53 0.16
0.2 0.09 0.14 0.49 0.08 0.04 0.08 0.17 0.13 0.18 0.27 0.0 0.05 0.1 0.27 0.62 0.12 0.13 0.43 0.14
0.68 0.15 0.1 1.8 0.25 0.12 0.28 0.62 0.33 0.29 0.62 0.08 0.63 0.67 0.76 1.5 0.74 0.2 0.93 0.37
0.58 0.08 0.14 1.45 0.29 0.25 0.21 0.42 0.19 0.29 0.17 0.01 0.48 0.49 0.44 1.84 0.38 0.26 0.9 0.38
0.5 0.25 0.06 0.73 0.12 0.0 0.03 0.24 0.12 0.16 0.11 0.04 0.28 0.2 0.1 1.81 0.68 0.21 0.42 0.18
1.17 0.46 0.25 1.61 0.47 0.22 0.88 0.85 0.62 0.23 0.7 0.2 0.32 0.23 1.43 3.39 0.79 0.26 1.3 0.52
0.09 0.09 0.02 0.15 0.0 0.0 0.03 0.08 0.05 0.04 0.31 0.02 0.0 0.01 0.35 0.32 0.14 0.06 0.25 0.02
0.13 0.0 0.0 0.13 0.07 0.0 0.08 0.1 0.04 0.06 0.08 0.0 0.08 0.05 0.07 0.63 0.13 0.04 0.22 0.06
1.81 1.2 0.61 2.84 0.42 0.24 0.62 1.13 0.77 0.71 1.6 0.11 1.09 0.63 1.24 3.48 1.29 0.62 2.13 1.01
1.35 0.83 0.33 2.6 0.28 0.0 0.58 0.89 0.48 0.71 0.98 0.04 2.08 1.24 0.74 4.75 1.07 0.29 1.64 0.53
0.24 0.1 0.07 0.21 0.07 0.03 0.13 0.14 0.06 0.1 0.18 0.0 0.08 0.1 0.14 0.46 0.1 0.07 0.4 0.05
2.13 1.3 1.52 2.6 0.43 0.61 0.69 1.29 0.88 0.84 0.79 0.23 1.72 1.17 1.38 3.6 1.08 1.12 2.59 1.31
1.24 0.0 0.04 4.17 0.75 0.0 0.39 0.88 0.34 0.78 1.02 0.03 0.28 0.28 0.31 3.77 1.65 0.0 1.41 1.09
0.31 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.19 0.13 0.0 0.02 0.25 0.0 0.21 0.39 0.26 0.22 0.42 0.07
1.29 0.82 0.31 2.88 0.64 1.09 0.38 1.11 0.82 0.81 0.52 0.08 1.9 1.19 1.01 3.57 1.51 0.19 1.72 1.29

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)