1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_161 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
1.0 0.35 0.85 0.81 0.48 0.09 0.18 0.2 0.16 0.16 0.15 0.15 0.11 0.13 0.14 0.19 0.21 0.42 0.24 0.26
0.84 0.45 0.88 1.0 0.67 0.3 0.3 0.21 0.14 0.15 0.12 0.18 0.16 0.18 0.12 0.16 0.23 0.54 0.27 0.35
0.58 0.22 0.8 1.0 0.44 0.13 0.09 0.19 0.12 0.1 0.13 0.19 0.23 0.23 0.16 0.16 0.16 0.31 0.25 0.19
1.0 0.55 0.85 0.66 0.61 0.18 0.36 0.24 0.14 0.13 0.22 0.17 0.25 0.23 0.24 0.21 0.17 0.52 0.48 0.31
1.0 0.28 0.72 0.77 0.55 0.26 0.27 0.32 0.2 0.19 0.24 0.25 0.22 0.23 0.23 0.2 0.28 0.46 0.41 0.34
1.0 0.42 0.92 0.72 0.65 0.47 0.27 0.37 0.26 0.24 0.25 0.25 0.2 0.19 0.24 0.25 0.3 0.53 0.37 0.27
0.79 0.2 0.78 1.0 0.63 0.12 0.23 0.27 0.15 0.13 0.17 0.19 0.13 0.14 0.15 0.24 0.24 0.51 0.49 0.16
1.0 0.35 0.78 0.71 0.56 0.28 0.29 0.32 0.23 0.21 0.27 0.22 0.23 0.16 0.28 0.35 0.31 0.55 0.4 0.31
1.0 0.37 0.83 0.72 0.75 0.28 0.19 0.26 0.14 0.14 0.15 0.27 0.18 0.2 0.16 0.14 0.21 0.67 0.44 0.39
1.0 0.49 0.94 0.73 0.62 0.25 0.34 0.29 0.17 0.17 0.25 0.23 0.17 0.16 0.25 0.23 0.23 0.49 0.42 0.32
0.7 0.46 0.99 1.0 0.3 0.06 0.1 0.18 0.24 0.18 0.24 0.13 0.07 0.06 0.26 0.32 0.22 0.33 0.29 0.21
1.0 0.49 0.88 0.71 0.59 0.26 0.23 0.3 0.19 0.16 0.21 0.18 0.17 0.16 0.19 0.28 0.22 0.47 0.38 0.24
0.84 0.37 1.0 0.82 0.55 0.26 0.29 0.29 0.18 0.18 0.21 0.22 0.16 0.14 0.19 0.27 0.3 0.4 0.41 0.24
Gb_04954 (RPS5B)
 1.0 0.35 0.99 0.99 0.53 0.24 0.15 0.21 0.1 0.09 0.13 0.14 0.1 0.11 0.13 0.12 0.15 0.41 0.31 0.16
0.8 0.5 1.0 0.74 0.49 0.15 0.18 0.24 0.11 0.11 0.13 0.17 0.24 0.21 0.16 0.23 0.19 0.38 0.45 0.2
0.82 0.51 1.0 0.8 0.5 0.24 0.23 0.29 0.21 0.19 0.2 0.25 0.28 0.27 0.22 0.24 0.33 0.41 0.26 0.23
0.66 0.23 0.67 1.0 0.51 0.12 0.18 0.19 0.13 0.14 0.12 0.18 0.12 0.12 0.11 0.15 0.18 0.34 0.25 0.18
Gb_06067 (RPL10B)
 0.93 0.3 0.83 1.0 0.61 0.37 0.19 0.29 0.14 0.13 0.13 0.2 0.23 0.21 0.13 0.16 0.22 0.47 0.26 0.23
0.83 0.71 1.0 0.58 0.62 0.25 0.26 0.33 0.2 0.18 0.24 0.25 0.23 0.18 0.26 0.28 0.22 0.55 0.44 0.32
0.7 0.36 0.56 1.0 0.43 0.17 0.17 0.23 0.14 0.14 0.24 0.22 0.23 0.22 0.22 0.19 0.2 0.39 0.45 0.21
0.81 0.29 0.74 1.0 0.54 0.16 0.19 0.3 0.19 0.15 0.25 0.23 0.26 0.26 0.21 0.17 0.2 0.52 0.43 0.27
0.83 0.34 0.96 1.0 0.63 0.27 0.2 0.29 0.16 0.14 0.2 0.23 0.23 0.24 0.19 0.21 0.26 0.57 0.49 0.3
0.69 0.46 1.0 0.38 0.49 0.2 0.12 0.22 0.12 0.13 0.12 0.18 0.13 0.12 0.11 0.13 0.13 0.42 0.23 0.16
0.86 0.4 0.98 1.0 0.43 0.24 0.17 0.28 0.12 0.1 0.24 0.19 0.11 0.09 0.22 0.16 0.22 0.42 0.3 0.18
Gb_13281 (RPS6B)
 0.97 0.31 0.88 1.0 0.64 0.19 0.19 0.29 0.16 0.14 0.18 0.19 0.21 0.21 0.17 0.21 0.27 0.46 0.43 0.24
1.0 0.58 0.84 0.73 0.63 0.25 0.28 0.28 0.15 0.14 0.18 0.21 0.22 0.21 0.19 0.25 0.26 0.48 0.5 0.29
0.94 0.4 1.0 0.76 0.65 0.27 0.17 0.33 0.18 0.18 0.26 0.25 0.27 0.24 0.25 0.22 0.28 0.48 0.32 0.29
0.98 0.2 0.65 1.0 0.55 0.1 0.17 0.25 0.14 0.15 0.37 0.15 0.12 0.12 0.38 0.23 0.29 0.4 0.33 0.14
1.0 0.26 0.74 0.79 0.59 0.12 0.19 0.24 0.14 0.13 0.19 0.11 0.12 0.12 0.21 0.28 0.24 0.4 0.31 0.16
Gb_14912 (EMB1080)
 0.61 0.3 0.68 1.0 0.44 0.23 0.13 0.19 0.09 0.09 0.14 0.14 0.06 0.05 0.14 0.1 0.1 0.33 0.25 0.18
0.88 0.34 0.9 1.0 0.62 0.29 0.23 0.29 0.15 0.17 0.27 0.19 0.11 0.09 0.26 0.15 0.23 0.52 0.52 0.3
Gb_15027 (UBQ6)
 0.86 0.32 0.88 1.0 0.52 0.15 0.21 0.24 0.13 0.13 0.19 0.14 0.16 0.14 0.18 0.16 0.16 0.39 0.24 0.2
Gb_15589 (GRP2)
 0.9 0.43 1.0 0.74 0.34 0.1 0.19 0.18 0.14 0.11 0.07 0.16 0.08 0.08 0.05 0.2 0.15 0.3 0.22 0.15
0.74 0.49 1.0 0.88 0.7 0.22 0.23 0.33 0.21 0.2 0.18 0.27 0.16 0.13 0.2 0.22 0.28 0.7 0.39 0.37
0.61 0.45 1.0 0.9 0.55 0.32 0.2 0.31 0.19 0.18 0.2 0.4 0.23 0.22 0.18 0.24 0.37 0.38 0.5 0.18
0.8 0.34 0.83 1.0 0.52 0.3 0.18 0.34 0.19 0.18 0.34 0.25 0.32 0.26 0.3 0.19 0.25 0.44 0.48 0.26
Gb_17740 (TRM10)
 0.77 0.65 1.0 0.85 0.68 0.3 0.3 0.35 0.32 0.26 0.4 0.23 0.24 0.24 0.31 0.4 0.4 0.56 0.39 0.35
Gb_18181 (PFL2)
 1.0 0.43 0.91 0.62 0.57 0.25 0.19 0.24 0.13 0.1 0.2 0.13 0.21 0.21 0.21 0.21 0.17 0.38 0.34 0.19
Gb_18935 (RPL23AB)
 0.73 0.19 1.0 0.82 0.53 0.19 0.08 0.21 0.1 0.09 0.13 0.14 0.07 0.08 0.13 0.18 0.3 0.41 0.2 0.13
Gb_18953 (BBC1)
 1.0 0.43 0.89 0.65 0.52 0.18 0.15 0.2 0.11 0.1 0.12 0.14 0.12 0.11 0.12 0.2 0.18 0.42 0.44 0.22
1.0 0.36 0.8 0.97 0.62 0.28 0.3 0.29 0.15 0.15 0.21 0.19 0.16 0.15 0.21 0.21 0.26 0.55 0.55 0.29
0.96 0.4 1.0 0.9 0.64 0.28 0.19 0.26 0.14 0.13 0.14 0.19 0.16 0.16 0.14 0.15 0.2 0.52 0.4 0.24
0.79 0.49 0.84 1.0 0.66 0.22 0.24 0.32 0.14 0.13 0.32 0.26 0.1 0.1 0.32 0.31 0.23 0.59 0.46 0.33
Gb_21005 (WEX)
 1.0 0.66 0.98 0.86 0.78 0.33 0.11 0.44 0.24 0.23 0.39 0.31 0.28 0.27 0.35 0.5 0.41 0.6 0.45 0.25
0.89 0.53 1.0 0.7 0.58 0.22 0.21 0.31 0.17 0.16 0.26 0.23 0.26 0.26 0.26 0.28 0.22 0.52 0.54 0.24
Gb_21375 (RSZ22a)
 1.0 0.41 0.97 0.78 0.71 0.14 0.12 0.19 0.2 0.16 0.15 0.13 0.14 0.15 0.17 0.21 0.2 0.51 0.2 0.36
0.79 0.43 1.0 0.77 0.54 0.19 0.13 0.23 0.1 0.1 0.14 0.19 0.16 0.17 0.13 0.22 0.2 0.47 0.32 0.22
0.68 0.33 0.88 1.0 0.5 0.22 0.2 0.27 0.12 0.12 0.16 0.21 0.22 0.22 0.16 0.18 0.2 0.54 0.39 0.23
Gb_22357 (RPL16A)
 1.0 0.4 0.91 0.8 0.49 0.31 0.17 0.24 0.11 0.1 0.12 0.14 0.16 0.12 0.12 0.12 0.11 0.33 0.32 0.15
1.0 0.62 0.92 0.91 0.76 0.27 0.4 0.43 0.26 0.28 0.38 0.31 0.44 0.41 0.39 0.22 0.27 0.5 0.42 0.4
0.92 0.5 0.95 1.0 0.72 0.27 0.17 0.27 0.13 0.12 0.22 0.24 0.18 0.19 0.2 0.18 0.26 0.55 0.49 0.26
0.97 0.51 0.98 1.0 0.69 0.18 0.24 0.36 0.32 0.27 0.28 0.29 0.13 0.13 0.28 0.36 0.37 0.44 0.39 0.33
1.0 0.28 0.9 0.7 0.41 0.21 0.09 0.18 0.07 0.07 0.07 0.11 0.09 0.1 0.07 0.1 0.14 0.34 0.16 0.13
0.85 0.39 1.0 0.83 0.59 0.32 0.19 0.3 0.22 0.19 0.29 0.19 0.19 0.16 0.29 0.22 0.25 0.48 0.5 0.37
Gb_27579 (EMB1080)
 0.63 0.63 1.0 0.8 0.59 0.22 0.21 0.28 0.15 0.14 0.26 0.23 0.09 0.08 0.26 0.24 0.26 0.55 0.49 0.27
1.0 0.58 0.81 0.75 0.59 0.22 0.36 0.31 0.21 0.19 0.22 0.21 0.29 0.26 0.22 0.32 0.24 0.56 0.36 0.32
1.0 0.46 0.83 0.89 0.61 0.27 0.25 0.21 0.09 0.09 0.12 0.13 0.12 0.13 0.13 0.14 0.14 0.49 0.3 0.25
Gb_28607 (ERG28)
 0.71 0.5 1.0 0.48 0.55 0.27 0.15 0.17 0.08 0.07 0.08 0.14 0.1 0.07 0.07 0.07 0.09 0.49 0.26 0.37
0.72 0.26 1.0 0.52 0.43 0.13 0.11 0.22 0.11 0.12 0.18 0.19 0.12 0.13 0.16 0.16 0.2 0.4 0.2 0.18
0.83 0.37 0.77 1.0 0.58 0.25 0.26 0.33 0.23 0.24 0.32 0.25 0.21 0.19 0.34 0.25 0.29 0.53 0.47 0.35
1.0 0.44 0.85 0.86 0.53 0.19 0.25 0.27 0.18 0.18 0.17 0.2 0.2 0.18 0.17 0.23 0.22 0.4 0.33 0.3
0.94 0.43 1.0 0.83 0.62 0.27 0.15 0.28 0.09 0.08 0.19 0.18 0.1 0.08 0.19 0.1 0.17 0.49 0.36 0.27
0.79 0.3 0.79 1.0 0.64 0.26 0.19 0.26 0.16 0.14 0.14 0.23 0.21 0.21 0.13 0.23 0.32 0.5 0.39 0.28
1.0 0.34 0.69 0.81 0.73 0.23 0.2 0.37 0.22 0.22 0.25 0.25 0.29 0.31 0.23 0.29 0.29 0.58 0.48 0.23
0.76 0.25 0.73 1.0 0.47 0.2 0.12 0.18 0.09 0.09 0.1 0.17 0.12 0.13 0.1 0.11 0.19 0.38 0.18 0.19
1.0 0.42 0.65 0.84 0.52 0.2 0.23 0.24 0.11 0.11 0.14 0.13 0.12 0.12 0.12 0.15 0.15 0.42 0.32 0.29
1.0 0.29 0.7 0.71 0.48 0.21 0.11 0.16 0.08 0.07 0.07 0.11 0.13 0.11 0.07 0.11 0.14 0.39 0.25 0.14
0.59 0.42 1.0 0.56 0.46 0.19 0.18 0.28 0.17 0.19 0.19 0.32 0.22 0.18 0.18 0.15 0.25 0.35 0.23 0.18
0.6 0.36 1.0 0.87 0.36 0.13 0.1 0.13 0.08 0.09 0.11 0.1 0.08 0.07 0.1 0.13 0.16 0.27 0.22 0.16
0.69 0.37 1.0 0.78 0.48 0.18 0.15 0.3 0.14 0.14 0.24 0.23 0.09 0.09 0.2 0.19 0.26 0.43 0.47 0.23
Gb_34582 (PFL2)
 1.0 0.5 0.9 0.67 0.61 0.3 0.14 0.27 0.1 0.09 0.19 0.16 0.2 0.17 0.19 0.2 0.18 0.51 0.29 0.19
0.83 0.28 1.0 0.62 0.57 0.25 0.12 0.26 0.12 0.12 0.15 0.24 0.12 0.12 0.13 0.15 0.21 0.45 0.24 0.22
1.0 0.31 0.8 0.5 0.43 0.19 0.16 0.2 0.08 0.09 0.13 0.18 0.14 0.18 0.13 0.15 0.17 0.37 0.16 0.16
Gb_35746 (RP1)
 1.0 0.22 0.69 0.98 0.52 0.21 0.12 0.19 0.07 0.08 0.13 0.12 0.09 0.09 0.12 0.11 0.16 0.44 0.27 0.27
1.0 0.41 0.96 0.79 0.77 0.16 0.23 0.3 0.2 0.21 0.21 0.3 0.22 0.19 0.19 0.23 0.3 0.51 0.3 0.23
Gb_36524 (RPS15)
 1.0 0.3 0.72 0.72 0.53 0.2 0.14 0.22 0.14 0.12 0.09 0.17 0.19 0.19 0.1 0.14 0.19 0.4 0.24 0.16
0.79 0.78 1.0 0.81 0.66 0.27 0.31 0.26 0.18 0.19 0.19 0.26 0.19 0.16 0.2 0.18 0.19 0.43 0.31 0.25
1.0 0.4 0.76 0.73 0.67 0.32 0.3 0.28 0.22 0.22 0.18 0.21 0.21 0.22 0.2 0.28 0.29 0.62 0.29 0.38
0.97 0.33 0.97 1.0 0.77 0.26 0.22 0.31 0.14 0.15 0.21 0.23 0.19 0.17 0.21 0.17 0.22 0.55 0.38 0.28
Gb_36985 (RPS6B)
 0.98 0.62 0.93 1.0 0.53 0.29 0.32 0.25 0.12 0.11 0.16 0.19 0.16 0.15 0.17 0.2 0.23 0.55 0.56 0.35
0.54 0.25 1.0 0.85 0.35 0.21 0.18 0.27 0.15 0.15 0.21 0.26 0.1 0.08 0.17 0.21 0.26 0.41 0.35 0.24
0.92 0.34 1.0 0.85 0.65 0.26 0.19 0.35 0.17 0.17 0.26 0.25 0.31 0.3 0.26 0.17 0.21 0.58 0.33 0.28
Gb_38537 (RPL23AB)
 1.0 0.27 0.89 0.84 0.4 0.18 0.2 0.24 0.11 0.11 0.17 0.15 0.09 0.11 0.14 0.11 0.17 0.38 0.49 0.19
1.0 0.28 0.83 0.51 0.51 0.23 0.15 0.25 0.14 0.13 0.16 0.13 0.21 0.19 0.16 0.24 0.22 0.44 0.3 0.22
0.85 0.35 0.81 1.0 0.59 0.32 0.13 0.36 0.23 0.21 0.28 0.28 0.27 0.19 0.27 0.31 0.37 0.5 0.41 0.23
0.96 0.45 0.93 1.0 0.66 0.26 0.28 0.32 0.14 0.14 0.19 0.27 0.26 0.27 0.19 0.19 0.24 0.61 0.62 0.29
0.76 0.36 1.0 0.98 0.59 0.24 0.18 0.23 0.12 0.12 0.12 0.18 0.15 0.12 0.12 0.13 0.17 0.45 0.49 0.26
Gb_40288 (UBQ6)
 1.0 0.5 0.88 0.92 0.63 0.24 0.16 0.37 0.16 0.16 0.28 0.23 0.36 0.28 0.24 0.21 0.31 0.48 0.33 0.29
1.0 0.5 0.83 0.7 0.68 0.25 0.3 0.27 0.24 0.21 0.3 0.3 0.21 0.22 0.27 0.23 0.21 0.51 0.49 0.38
0.77 0.26 0.72 1.0 0.5 0.18 0.17 0.24 0.13 0.12 0.19 0.21 0.22 0.22 0.18 0.18 0.24 0.41 0.49 0.24
0.89 0.36 1.0 0.91 0.57 0.21 0.15 0.32 0.17 0.14 0.17 0.3 0.29 0.26 0.17 0.19 0.29 0.42 0.32 0.22
1.0 0.52 0.7 0.77 0.61 0.21 0.3 0.29 0.23 0.2 0.22 0.24 0.28 0.27 0.23 0.33 0.24 0.6 0.38 0.31
Gb_41343 (ROC3)
 0.73 0.29 0.58 1.0 0.6 0.15 0.18 0.33 0.21 0.2 0.23 0.23 0.23 0.25 0.2 0.27 0.35 0.51 0.34 0.22

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)