1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_131 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
0.29 0.63 0.73 0.24 0.8 0.02 1.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.61 0.42 0.22
0.68 1.0 0.47 0.29 0.44 0.11 0.92 0.13 0.36 0.29 0.23 0.13 0.07 0.07 0.31 0.25 0.38 0.09 0.06 0.81
0.1 0.59 0.37 0.11 0.24 0.27 1.0 0.16 0.12 0.17 0.25 0.14 0.09 0.08 0.24 0.11 0.13 0.28 0.56 0.66
0.12 0.44 0.32 0.13 0.27 0.29 1.0 0.2 0.17 0.18 0.27 0.14 0.12 0.11 0.25 0.11 0.1 0.27 0.33 0.41
0.55 1.0 0.33 0.49 0.55 0.41 0.77 0.13 0.07 0.07 0.12 0.08 0.1 0.12 0.06 0.09 0.11 0.2 0.82 0.19
Gb_04843 (CDC20.2)
 0.33 0.82 0.38 0.28 0.55 0.3 1.0 0.23 0.17 0.18 0.17 0.05 0.18 0.24 0.12 0.06 0.09 0.21 0.36 0.21
0.63 1.0 0.52 0.52 0.54 0.17 0.95 0.23 0.27 0.27 0.31 0.19 0.24 0.26 0.23 0.19 0.07 0.43 0.07 0.19
Gb_07452 (KT2)
 0.17 0.0 0.13 0.53 0.58 0.1 1.0 0.31 0.37 0.24 0.23 0.1 0.12 0.18 0.22 0.94 0.33 0.52 0.22 0.84
Gb_07453 (KT2)
 0.33 0.16 0.11 0.23 0.42 0.22 1.0 0.34 0.21 0.19 0.15 0.12 0.07 0.07 0.3 0.56 0.33 0.82 0.39 0.78
0.3 1.0 0.39 0.25 0.35 0.11 0.59 0.14 0.14 0.18 0.16 0.14 0.1 0.11 0.18 0.12 0.04 0.26 0.09 0.17
Gb_09058 (UGP2)
 0.33 0.35 0.37 0.5 0.7 0.23 1.0 0.33 0.3 0.3 0.47 0.26 0.39 0.4 0.49 0.28 0.36 0.52 0.61 0.52
Gb_09598 (FPN2)
 0.63 0.67 0.49 0.38 1.0 0.58 0.93 0.37 0.4 0.35 0.38 0.35 0.27 0.27 0.36 0.37 0.4 0.2 0.23 0.6
Gb_09599 (FPN2)
 0.61 0.69 0.41 0.47 1.0 0.58 0.86 0.38 0.43 0.33 0.5 0.34 0.18 0.14 0.49 0.35 0.36 0.24 0.38 0.48
Gb_09600 (FPN2)
 0.54 1.0 0.49 0.33 0.78 0.8 0.87 0.3 0.35 0.28 0.3 0.42 0.19 0.16 0.27 0.23 0.4 0.18 0.44 0.45
Gb_09715 (JR3)
 0.58 1.0 0.88 0.73 0.67 0.61 0.47 0.1 0.06 0.05 0.22 0.22 0.04 0.04 0.22 0.06 0.09 0.29 0.38 0.49
Gb_09719 (JR3)
 0.97 0.82 0.98 1.0 0.83 0.67 0.71 0.17 0.1 0.11 0.35 0.37 0.24 0.31 0.4 0.1 0.19 0.33 0.34 0.86
0.61 0.3 0.48 0.82 1.0 0.35 1.0 0.35 0.2 0.2 0.4 0.34 0.27 0.3 0.3 0.22 0.36 0.52 0.23 0.48
0.18 0.2 0.3 0.13 0.64 0.52 0.98 0.45 0.52 0.6 0.7 0.43 0.36 0.3 0.69 0.37 0.45 0.36 1.0 0.72
0.56 0.57 0.68 0.38 1.0 0.17 0.87 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.05 0.01
Gb_10705 (EXPL2)
 0.04 0.02 0.01 0.06 0.05 0.06 1.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.26 0.5 0.6
Gb_10986 (PGM3)
 0.38 0.29 0.3 0.45 0.44 0.74 0.75 0.41 0.34 0.31 0.57 0.26 0.31 0.32 0.52 0.33 0.47 0.44 1.0 0.47
Gb_11700 (MGT2)
 0.34 0.64 0.34 0.35 0.57 0.68 1.0 0.36 0.48 0.44 0.2 0.38 0.41 0.53 0.23 0.77 0.2 0.91 0.43 0.26
Gb_12445 (CLC-C)
 0.26 0.11 0.31 0.27 0.6 1.0 0.63 0.25 0.18 0.15 0.13 0.1 0.16 0.15 0.15 0.04 0.15 0.54 0.49 0.23
Gb_13111 (GME)
 0.23 0.27 0.38 0.62 0.54 0.14 1.0 0.12 0.03 0.1 0.16 0.07 0.06 0.06 0.23 0.04 0.08 0.34 0.74 0.07
Gb_14616 (RB)
 0.7 0.19 0.58 0.46 0.57 1.0 0.93 0.23 0.14 0.12 0.24 0.07 0.06 0.06 0.22 0.11 0.17 0.3 0.92 0.25
Gb_14724 (SSL4)
 0.18 1.0 0.49 0.34 0.45 0.34 0.82 0.24 0.21 0.24 0.32 0.25 0.18 0.17 0.33 0.33 0.27 0.16 0.03 0.05
Gb_14742 (SSL4)
 0.18 1.0 0.46 0.37 0.42 0.22 0.83 0.16 0.19 0.24 0.15 0.12 0.15 0.16 0.13 0.18 0.14 0.13 0.01 0.04
0.72 0.48 0.68 0.58 0.56 0.06 1.0 0.19 0.16 0.17 0.18 0.23 0.18 0.12 0.16 0.28 0.19 0.25 0.36 0.35
Gb_15598 (ENO2)
 0.39 0.36 0.35 0.47 0.44 0.21 1.0 0.2 0.13 0.15 0.17 0.16 0.12 0.12 0.19 0.16 0.24 0.34 0.69 0.53
0.89 0.77 0.86 0.65 1.0 0.71 0.7 0.41 0.35 0.27 0.29 0.28 0.3 0.29 0.35 0.74 0.45 0.64 0.5 0.33
0.8 0.54 0.73 0.86 1.0 0.66 0.68 0.32 0.3 0.29 0.32 0.29 0.2 0.24 0.31 0.45 0.42 0.67 0.53 0.3
Gb_19962 (TAR2)
 0.32 0.18 0.35 0.25 0.48 0.57 1.0 0.48 0.42 0.44 0.65 0.42 0.42 0.46 0.62 0.49 0.59 0.65 0.7 0.27
Gb_20597 (TBL16)
 0.66 0.32 0.59 0.65 0.98 0.45 0.54 0.52 0.3 0.26 0.33 0.37 0.49 0.45 0.36 0.25 0.4 1.0 0.54 1.0
0.21 0.34 0.24 0.13 0.22 0.01 1.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0
Gb_22725 (MGT2)
 0.34 0.65 0.4 0.42 0.68 0.88 1.0 0.44 0.41 0.33 0.09 0.37 0.18 0.28 0.24 0.66 0.3 1.0 0.69 0.2
0.88 0.5 0.83 0.78 0.62 1.0 0.97 0.28 0.23 0.19 0.24 0.23 0.27 0.21 0.35 0.34 0.32 0.53 0.66 0.34
Gb_23903 (SYTF)
 0.17 0.2 0.25 0.06 0.49 0.33 1.0 0.09 0.03 0.06 0.16 0.11 0.06 0.06 0.05 0.02 0.02 0.7 0.32 0.15
0.39 0.4 0.28 0.3 0.48 0.27 1.0 0.36 0.34 0.38 0.5 0.28 0.2 0.17 0.4 0.33 0.31 0.46 0.52 0.66
0.46 0.47 0.45 0.79 0.87 0.14 0.62 0.13 0.05 0.03 0.14 0.04 0.07 0.03 0.06 0.07 0.15 1.0 0.66 0.45
0.78 0.85 0.61 0.67 0.71 1.0 0.76 0.31 0.22 0.2 0.36 0.21 0.25 0.2 0.33 0.45 0.34 0.54 0.85 0.38
0.34 0.62 0.45 0.37 0.64 1.0 0.65 0.33 0.29 0.23 0.31 0.22 0.24 0.26 0.22 0.26 0.15 0.34 0.7 0.26
Gb_29121 (SSN1)
 0.31 1.0 0.79 0.55 0.61 0.22 0.97 0.28 0.33 0.27 0.3 0.29 0.19 0.2 0.38 0.14 0.21 0.53 0.48 0.4
0.66 1.0 0.82 0.67 0.65 0.45 0.84 0.45 0.45 0.37 0.5 0.21 0.28 0.29 0.66 0.44 0.2 0.81 0.63 0.29
Gb_29966 (KT1)
 0.24 0.52 0.53 0.17 1.0 0.04 0.77 0.22 0.31 0.25 0.38 0.22 0.02 0.1 0.39 0.3 0.22 0.82 0.69 0.11
0.24 0.21 0.2 0.13 0.13 0.03 1.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.06 0.52
Gb_33333 (LKS1)
 0.46 1.0 0.45 0.49 0.7 0.21 0.85 0.22 0.22 0.21 0.41 0.22 0.15 0.15 0.46 0.3 0.23 0.4 0.05 0.22
0.45 0.66 0.57 0.43 1.0 0.34 0.61 0.1 0.06 0.07 0.04 0.05 0.18 0.25 0.04 0.03 0.05 0.23 0.35 0.24
Gb_35803 (NTT1)
 0.83 0.42 0.56 0.79 0.96 1.0 0.63 0.21 0.07 0.11 0.05 0.16 0.06 0.06 0.05 0.05 0.23 0.5 0.46 0.16
Gb_36335 (ARLA1C)
 0.37 1.0 0.58 0.45 0.96 0.34 0.71 0.21 0.22 0.18 0.19 0.2 0.25 0.22 0.21 0.17 0.18 0.37 0.54 0.32
0.42 0.22 0.39 0.39 0.44 0.28 1.0 0.31 0.26 0.26 0.36 0.2 0.27 0.28 0.39 0.16 0.21 0.4 0.59 0.36
0.33 0.31 0.35 0.46 1.0 0.23 0.75 0.12 0.13 0.12 0.11 0.12 0.16 0.17 0.14 0.12 0.13 0.12 0.12 0.46
0.29 0.68 0.17 0.14 0.16 0.67 1.0 0.05 0.03 0.01 0.03 0.01 0.01 0.01 0.02 0.0 0.0 0.04 0.56 0.09
0.01 0.0 0.04 0.05 0.18 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Gb_40122 (RBOHF)
 0.45 0.57 1.0 0.26 0.21 0.0 0.64 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.01 0.0 0.03 0.0 0.0
0.72 0.75 0.53 0.52 1.0 0.69 0.77 0.39 0.28 0.24 0.28 0.21 0.35 0.32 0.34 0.26 0.18 0.75 0.48 0.73
0.71 0.46 0.59 0.7 0.92 1.0 0.94 0.38 0.31 0.22 0.24 0.3 0.18 0.18 0.36 0.66 0.59 0.64 0.72 0.34
0.51 0.98 0.86 0.61 0.76 0.56 1.0 0.48 0.54 0.56 0.48 0.55 0.47 0.52 0.51 0.48 0.62 0.56 0.44 0.5

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)