Heatmap: Cluster_111 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Ovule	Ovule, mature	Ovule, pollinated	Strobilus, female	Ovulate strobilus	Microstrobilus	Kernel	Leaf	Leaf, female	Leaf, male	Leaf, salicylic acid	Leaf, seedling	Leaf, truncation control	Leaf, truncation treatment	Leaf, water	Yellow-green stripe leaves	Green leaves	Stem	Cambium	Root
Gb_00322 (ENODL13)	0.01	0.0	0.01	0.0	0.01	0.31	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.01
Gb_00366	0.03	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	1.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.02
Gb_00370	0.23	0.18	0.15	0.18	0.22	0.31	1.0	0.24	0.24	0.23	0.33	0.14	0.26	0.22	0.37	0.23	0.17	0.24	0.26	0.31
Gb_00829	0.05	0.22	0.12	0.03	0.19	0.06	1.0	0.03	0.02	0.02	0.01	0.03	0.0	0.0	0.0	0.02	0.04	0.05	0.13	0.02
Gb_01411	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.03	1.0	0.05	0.03	0.06	0.06	0.1	0.08	0.09	0.05	0.3	0.13	0.0	0.01	0.04
Gb_01675	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_01799	0.01	0.0	0.01	0.01	0.01	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.02
Gb_02444 (XK2)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.01	0.08	0.0	0.0	0.06	0.21	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_03049	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.33	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_03058	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.06	1.0	0.02	0.01	0.0	0.01	0.01	0.0	0.0	0.02	0.03	0.03	0.03	0.03	0.01
Gb_03394 (CYP71A26)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.49
Gb_03395 (CYP76C4)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.16
Gb_04367	0.34	0.39	0.34	0.21	0.2	0.05	1.0	0.19	0.17	0.19	0.23	0.15	0.32	0.23	0.21	0.18	0.13	0.11	0.2	0.1
Gb_04622 (FAH1)	0.08	0.03	0.15	0.11	0.05	0.08	1.0	0.1	0.06	0.1	0.05	0.17	0.11	0.06	0.09	0.08	0.04	0.1	0.26	0.86
Gb_04916 (ACX4)	0.18	0.3	0.16	0.16	0.25	0.5	1.0	0.29	0.22	0.23	0.3	0.18	0.32	0.25	0.32	0.18	0.17	0.2	0.23	0.44
Gb_05182	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.02	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.01
Gb_05323	0.03	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	1.0	0.01	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.01	0.0	0.02	0.01	0.04	0.04	0.01
Gb_06160 (CYP71B37)	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.11	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_06162 (CYP71A23)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.46	1.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0
Gb_06641	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.21	0.0
Gb_06777	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.23	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.47	0.0
Gb_06867	0.14	0.0	0.27	0.0	0.18	0.0	1.0	0.05	0.11	0.05	0.69	0.0	0.03	0.0	0.16	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_07342 (SD2-5)	0.61	0.54	0.73	0.38	0.4	0.39	1.0	0.29	0.11	0.04	0.08	0.01	0.39	0.19	0.12	0.33	0.2	0.09	0.07	0.52
Gb_07343 (SD2-5)	0.06	0.0	0.0	0.2	0.42	0.0	1.0	0.06	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.06	0.05
Gb_07429 (PIRL8)	0.03	0.0	0.0	0.05	0.0	1.0	0.22	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_07464	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.33	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0
Gb_08228 (DSO)	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_08321 (TGA10)	0.01	0.01	0.01	0.0	0.01	0.03	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05
Gb_09434	0.02	0.08	0.0	0.12	0.2	0.22	1.0	0.25	0.09	0.21	0.0	0.09	0.14	0.07	0.08	0.21	0.73	0.63	0.43	0.41
Gb_09438	0.0	0.0	0.0	0.04	0.11	0.09	1.0	0.2	0.14	0.16	0.13	0.15	0.13	0.1	0.13	0.2	0.18	0.36	0.12	0.34
Gb_09716	0.0	0.0	0.0	1.0	0.65	0.0	0.92	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.37	0.75
Gb_09821 (PAL2)	0.09	0.2	0.23	0.48	0.11	0.26	1.0	0.07	0.18	0.12	0.02	0.03	0.0	0.01	0.07	0.0	0.0	0.55	0.13	0.07
Gb_10391	0.0	0.15	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.02	0.01	0.0	0.04	0.01	0.03	0.02	0.12	0.0	0.0	0.0	0.06	0.04
Gb_10567	0.11	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.21	0.26	0.07	0.06	0.0	0.03	0.2	0.33	0.0	0.0	0.0	0.1	0.46	1.0
Gb_10823 (HDS)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_10921	0.37	0.24	0.36	0.3	0.22	0.33	1.0	0.23	0.09	0.06	0.14	0.01	0.18	0.09	0.13	0.28	0.15	0.05	0.04	0.4
Gb_11401 (RK3)	0.37	0.21	0.29	0.42	0.2	0.37	1.0	0.2	0.09	0.04	0.06	0.01	0.23	0.09	0.11	0.22	0.06	0.04	0.05	0.3
Gb_11496	0.29	0.0	0.11	0.73	0.0	0.14	0.36	0.25	0.1	0.13	0.64	0.0	0.04	0.0	0.2	0.18	1.0	0.11	0.31	0.32
Gb_11933	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0
Gb_12092	0.1	0.0	0.01	0.08	0.15	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.03
Gb_13827 (SD2-5)	0.09	0.31	0.35	0.16	0.1	0.96	1.0	0.04	0.02	0.03	0.0	0.01	0.01	0.01	0.02	0.06	0.04	0.03	0.02	0.35
Gb_14017	0.0	0.17	0.17	0.0	0.25	0.0	0.73	0.07	0.07	0.04	0.15	0.0	0.12	0.0	0.06	0.0	0.0	0.0	0.05	1.0
Gb_14896	0.09	0.17	0.06	0.05	0.32	0.02	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_15347 (DSO)	0.04	0.04	0.05	0.02	0.01	0.01	1.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0
Gb_15487	0.02	0.02	0.02	0.08	0.08	0.08	1.0	0.05	0.01	0.02	0.03	0.06	0.0	0.01	0.08	0.06	0.09	0.36	0.34	0.23
Gb_15636	0.01	0.0	0.06	0.01	0.0	0.01	1.0	0.01	0.01	0.01	0.02	0.0	0.01	0.0	0.01	0.01	0.01	0.0	0.01	0.0
Gb_15637	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_15696 (CYP71B37)	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.09	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_15949 (LIG1)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.66	0.21	0.0	0.21	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.29	0.0	0.0	0.0	1.0
Gb_15992 (GLIP6)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_16074 (CYP71A25)	0.01	0.18	0.02	0.01	0.02	0.06	1.0	0.02	0.03	0.04	0.03	0.03	0.01	0.02	0.06	0.01	0.0	0.04	0.11	0.18
Gb_16388	0.27	0.27	0.08	0.23	0.24	0.11	1.0	0.14	0.03	0.03	0.13	0.03	0.08	0.07	0.08	0.0	0.05	0.51	0.01	0.11
Gb_18980	0.03	0.26	0.04	0.04	0.13	0.56	1.0	0.14	0.15	0.16	0.13	0.09	0.26	0.22	0.14	0.1	0.09	0.29	0.47	0.16
Gb_19214 (ERF110)	0.04	0.03	0.01	0.02	0.04	0.07	1.0	0.04	0.02	0.02	0.18	0.06	0.04	0.06	0.13	0.01	0.01	0.01	0.01	0.2
Gb_19520	0.19	0.0	0.0	1.0	0.0	0.13	0.0	0.13	0.0	0.0	0.09	0.01	0.0	0.07	0.0	0.47	0.16	0.01	0.0	0.0
Gb_20032	0.35	0.21	0.18	0.3	0.17	0.05	1.0	0.19	0.18	0.15	0.23	0.15	0.22	0.15	0.26	0.21	0.12	0.12	0.18	0.1
Gb_21350	0.21	0.49	0.27	0.1	0.14	0.01	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.02
Gb_21581 (DSO)	0.02	0.0	0.02	0.16	0.1	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0
Gb_21675	0.0	0.0	0.28	0.0	0.0	0.0	1.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_22053	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.01	1.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.02	0.01	0.0
Gb_22054	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_22451	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_23308 (MYB98)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_24433	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.1
Gb_26276	0.1	0.28	0.05	0.15	0.0	0.27	1.0	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0
Gb_26679	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.09
Gb_26686	0.21	0.14	0.1	0.1	0.09	0.01	1.0	0.07	0.05	0.04	0.1	0.03	0.05	0.03	0.05	0.04	0.01	0.07	0.08	0.0
Gb_26757	0.36	0.25	0.48	0.26	0.2	0.51	1.0	0.32	0.12	0.09	0.11	0.01	0.18	0.09	0.17	0.26	0.26	0.15	0.15	0.39
Gb_26790	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.94	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_26895	0.01	0.08	0.0	0.04	0.03	0.0	1.0	0.0	0.01	0.0	0.08	0.0	0.0	0.0	0.03	0.02	0.0	0.04	0.1	0.0
Gb_27149	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.03	0.0	0.04	0.0	0.0	0.12	0.33	0.0	0.09	0.0	0.0	0.05	0.0
Gb_27312	0.0	0.08	0.0	0.0	0.0	0.66	1.0	0.02	0.02	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.09	0.0	0.0	0.03	0.04	0.0
Gb_27874	0.24	0.19	0.31	0.14	0.32	0.0	0.82	0.19	0.1	0.3	0.08	0.0	1.0	0.6	0.15	0.23	0.06	0.12	1.0	0.37
Gb_28301 (ZOU)	0.01	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01
Gb_29165	0.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.35	1.0	0.11	0.39	0.11	0.19	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.27	0.0	0.0	0.0
Gb_30094	0.16	0.6	0.18	0.14	0.11	0.26	1.0	0.11	0.15	0.11	0.29	0.08	0.24	0.18	0.26	0.16	0.1	0.11	0.34	0.25
Gb_30145	0.64	0.66	1.0	0.37	0.45	0.0	0.7	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.0	0.0
Gb_30479 (PAP18)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.01	0.0	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.07	0.05	0.01	0.0	0.0
Gb_30914	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_32122	0.15	0.18	0.19	0.05	0.08	0.13	1.0	0.11	0.04	0.03	0.03	0.0	0.09	0.05	0.04	0.08	0.06	0.02	0.02	0.17
Gb_32123 (SD2-5)	0.15	0.14	0.17	0.07	0.1	0.11	1.0	0.11	0.05	0.02	0.06	0.01	0.14	0.05	0.03	0.09	0.11	0.03	0.02	0.27
Gb_32232 (TET10)	0.06	0.06	0.09	0.06	0.08	0.41	1.0	0.06	0.06	0.07	0.08	0.02	0.04	0.04	0.1	0.03	0.02	0.07	0.24	0.12
Gb_32697	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.02	0.1
Gb_32740 (TT7)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_32909 (HISN4)	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.27	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_32930 (GSTL3)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.04	0.0	0.0	0.14	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.0
Gb_33839	0.02	0.13	0.2	0.15	0.19	0.0	0.91	0.11	0.09	0.17	0.57	0.22	0.18	0.19	0.29	0.05	0.0	0.32	0.1	1.0
Gb_35333	0.83	0.72	0.0	0.0	1.0	0.12	0.26	0.04	0.0	0.0	0.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.17	0.0	0.19	0.26	0.45
Gb_35909	0.35	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.21	0.14	0.05	0.04	0.0	0.06	0.09	0.02	1.0	0.0	0.01	0.26	0.94	0.45
Gb_35984 (MGP)	0.1	0.21	0.1	0.13	0.14	0.02	1.0	0.23	0.35	0.3	0.3	0.14	0.43	0.26	0.32	0.47	0.23	0.15	0.06	0.13
Gb_36157	0.03	0.0	0.0	0.19	0.0	0.07	1.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.69
Gb_36203	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.08	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_36374	0.03	0.0	0.07	0.0	0.0	0.0	1.0	0.06	0.07	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.18	0.0	0.13
Gb_36375	0.1	0.0	0.12	0.12	0.04	0.04	1.0	0.13	0.09	0.12	0.12	0.03	0.05	0.06	0.14	0.06	0.1	0.05	0.08	0.07
Gb_37824 (FLS2)	0.11	0.07	0.0	0.04	0.02	0.14	1.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.04	0.15	0.26
Gb_37997 (MYB98)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_38039	0.27	0.0	0.19	0.04	0.56	0.12	0.28	0.3	0.14	0.01	0.83	0.0	0.0	0.31	0.09	0.0	0.0	1.0	0.0	0.64
Gb_38314	0.14	0.29	0.0	0.0	0.0	0.0	0.07	0.11	0.0	0.07	0.0	0.0	0.0	0.0	0.34	0.37	0.14	0.0	1.0	0.0
Gb_38846 (LBD18)	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.02
Gb_40019	0.62	0.38	0.56	0.62	1.0	0.15	0.52	0.17	0.09	0.09	0.09	0.2	0.02	0.02	0.14	0.1	0.5	0.17	0.3	0.6
Gb_40547	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.12	0.04	0.0	0.06	0.0	0.0
Gb_40713 (FMO1)	0.09	0.0	0.06	0.11	0.41	0.02	1.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.05	0.01	0.0	0.19	0.18	0.28
Gb_40815 (CYP71B34)	0.01	0.0	0.0	0.07	0.04	0.04	1.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.07	0.01	0.01	0.0	0.02	0.02	0.22	0.01	0.0
Gb_41669 (PB)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)