Heatmap: Cluster_44 (HCCA)

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(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	Ovule	Ovule, mature	Ovule, pollinated	Strobilus, female	Ovulate strobilus	Microstrobilus	Kernel	Leaf	Leaf, female	Leaf, male	Leaf, salicylic acid	Leaf, seedling	Leaf, truncation control	Leaf, truncation treatment	Leaf, water	Yellow-green stripe leaves	Green leaves	Stem	Cambium	Root
Gb_00163	0.42	-0.12	0.35	0.81	0.07	-1.72	-0.87	-0.29	-0.45	-0.39	0.67	-0.55	-0.01	-0.09	0.58	0.32	-0.12	-0.18	0.07	-0.52
Gb_00648	0.72	-0.11	-0.12	0.53	0.51	-0.68	-0.54	-0.23	-0.26	-0.36	0.02	-0.83	-0.74	-0.8	-0.03	0.16	0.01	0.42	0.59	0.21
Gb_00740	0.21	-0.58	0.11	0.14	0.2	-0.03	-0.31	-0.25	0.0	0.02	0.5	-0.51	-1.22	-1.31	0.33	0.2	0.24	-0.03	0.62	0.2
Gb_00752	1.07	-0.59	0.93	1.24	0.26	-1.54	-0.77	0.18	-0.57	-0.57	0.24	-0.28	-0.78	-1.23	0.05	-0.41	-0.06	-0.01	0.11	-0.93
Gb_00921	0.65	0.52	0.41	-0.32	0.43	-1.47	-0.35	-0.26	-0.09	-0.3	0.2	-0.55	-1.03	-1.17	0.39	0.52	-0.09	0.24	0.27	-0.07
Gb_01244	-0.24	-0.12	-0.31	-0.05	0.05	-1.04	-0.73	0.19	0.56	0.35	0.79	-0.38	-0.44	-0.77	0.8	0.56	0.18	-0.33	-0.39	-0.48
Gb_01582	0.82	0.92	0.64	0.76	0.74	-1.94	-0.68	-0.63	-0.52	-0.67	0.75	-1.45	-1.25	-1.59	0.87	-0.04	-1.08	0.03	0.17	-1.58
Gb_02172	0.45	-0.42	-0.06	0.63	0.6	-1.75	-0.15	-0.25	-0.49	-0.56	0.92	-0.99	-1.31	-1.76	0.95	0.3	0.22	-0.09	0.77	-1.46
Gb_02475 (ELF3)	0.25	-0.18	0.17	-0.35	0.4	-1.01	-0.49	-0.31	0.01	0.07	0.88	-0.68	-1.27	-1.29	0.59	0.35	0.5	-0.67	0.84	-0.46
Gb_02516	0.74	0.0	0.6	0.72	1.14	-2.86	-1.34	-0.75	-0.96	-1.2	1.28	-1.59	-1.74	-1.91	0.86	0.85	0.8	-1.05	-0.89	-2.7
Gb_03162	0.42	-1.47	-0.52	-0.23	0.03	-1.45	-0.92	-0.04	-0.1	-0.13	1.42	-0.63	-0.72	-0.57	1.37	0.71	0.15	0.18	-0.34	-2.7
Gb_03945	0.36	1.09	-0.09	0.26	0.23	-0.98	-0.68	-0.32	-0.48	-0.44	0.7	-0.95	-0.97	-1.24	1.09	-0.34	-1.11	0.14	0.46	-0.05
Gb_04017	0.6	0.38	0.18	0.96	0.93	-2.96	-0.96	-0.6	-0.71	-0.62	0.7	-1.35	-1.79	-1.98	0.57	0.15	-0.29	0.21	1.01	-1.02
Gb_04677	0.71	0.06	0.56	0.3	0.42	-2.53	-0.62	-0.28	-0.62	-0.34	0.82	-1.0	-1.08	-1.11	0.87	-0.18	-0.26	0.3	0.66	-0.65
Gb_05355	-0.13	-0.69	-0.14	0.71	-0.07	-2.68	0.48	-0.5	0.3	0.34	0.96	-1.6	-0.83	-0.87	0.46	0.98	-0.83	-1.34	1.18	-1.93
Gb_05760 (NFD5)	0.67	-0.38	0.24	0.82	0.81	-2.6	-0.92	-0.46	-0.4	-0.37	0.54	-1.06	-2.36	-1.92	0.35	0.69	0.59	-0.16	1.02	-1.87
Gb_05881	0.5	-0.61	0.26	0.46	-0.04	-3.0	-1.17	-0.36	0.11	0.19	1.33	-0.95	-1.33	-1.15	0.77	0.88	0.75	-0.5	-0.29	-2.5
Gb_06324	0.71	0.64	0.27	0.79	0.53	-0.53	-0.17	-0.38	-0.87	-0.92	0.44	-1.08	-0.97	-0.88	0.33	-0.3	-0.76	0.11	0.82	-0.7
Gb_06545	0.55	-0.15	0.39	0.54	0.51	-0.65	-0.52	-0.19	-0.32	-0.14	0.31	-0.64	-0.46	-0.47	0.49	0.13	0.08	0.08	-0.06	-0.64
Gb_06893	1.07	0.16	0.8	0.83	0.87	-3.91	-0.7	-0.52	-0.28	-0.12	0.8	-1.39	-0.96	-1.11	0.35	0.51	-0.17	-0.41	-1.02	-1.41
Gb_08052	0.67	0.17	-0.21	0.82	0.39	-1.92	-1.17	-0.36	0.06	-0.08	1.18	-0.73	-2.05	-1.87	0.8	0.43	-0.26	-0.55	0.45	-0.95
Gb_08261	0.6	0.4	0.4	0.3	0.23	-1.11	-0.3	-0.37	-0.15	-0.08	0.63	-0.64	-0.75	-0.94	0.54	0.38	0.34	-0.28	0.08	-1.55
Gb_08857	-0.16	-1.03	-0.54	0.34	-0.88	-4.96	-0.74	-0.05	0.35	0.45	1.8	-0.9	-1.67	-1.94	1.53	0.43	0.65	-0.39	-0.91	-2.43
Gb_08861	0.47	0.53	0.3	0.73	-0.1	-1.71	-1.31	-0.26	0.01	-0.17	0.96	-1.13	-0.93	-1.04	0.89	0.5	-0.03	0.02	-0.06	-1.86
Gb_09435	-0.19	-0.57	0.63	0.27	0.3	-0.7	-0.11	-0.03	-0.11	-0.07	0.5	-0.34	-2.24	-1.86	0.45	-0.02	-0.23	0.46	0.5	0.46
Gb_09652	0.97	0.54	0.49	0.37	0.92	-1.51	-1.03	-0.14	-0.62	-0.44	0.67	-0.86	-0.84	-0.97	0.43	-0.41	-0.41	0.48	0.19	-1.93
Gb_10360	0.57	0.17	0.19	0.15	0.17	-0.65	-0.33	-0.12	-0.21	-0.22	0.89	-0.92	-0.36	-0.69	0.85	-0.25	0.1	-0.19	-0.02	-0.8
Gb_10939	-0.67	-1.78	-1.22	-0.42	-0.32	-1.64	-0.78	-0.91	-0.54	-0.56	1.73	-0.68	-0.45	-0.51	1.68	0.36	0.17	-0.32	0.33	0.35
Gb_11603 (AL5)	0.76	0.22	0.97	0.42	0.22	-1.8	-0.62	-0.3	-0.33	-0.17	0.61	-0.73	-0.46	-0.7	0.59	-0.76	-0.93	-0.21	0.44	-0.12
Gb_11871	0.4	0.42	0.78	0.13	-0.55	-2.35	-0.79	-0.18	0.14	0.03	1.03	-0.82	-1.35	-1.47	0.82	0.84	0.33	-0.21	-0.48	-1.78
Gb_12744	0.63	0.27	0.47	0.51	0.52	-2.42	-1.12	-0.61	-0.31	-0.17	0.46	-0.81	-2.51	-2.48	0.41	0.52	0.27	0.51	0.69	-0.53
Gb_13319	0.86	-0.31	0.64	0.54	0.38	-1.15	-1.17	-0.14	0.02	-0.34	0.87	-0.48	-0.98	-1.11	0.56	-0.34	-0.38	0.15	0.03	-0.36
Gb_13343 (DHDPS2)	0.52	0.33	0.46	0.67	0.13	-1.59	0.31	0.09	-0.16	-0.23	0.54	-0.5	-0.9	-1.05	0.47	-0.44	-0.48	-0.21	0.31	-0.42
Gb_13589	0.08	-0.1	-0.31	0.05	-0.13	-1.25	-1.28	-0.42	0.23	-0.08	1.18	-0.95	-1.61	-1.26	0.97	1.09	0.88	-0.25	0.03	-2.08
Gb_13938	0.19	-0.41	0.32	-0.23	0.09	-0.9	-0.21	-0.22	-0.02	-0.07	1.22	-0.79	-2.0	-1.92	0.94	0.33	-0.23	0.34	0.52	-0.77
Gb_14436	0.03	0.43	0.36	-0.3	0.27	-0.45	-0.61	-0.1	-0.03	-0.04	0.65	-0.56	-0.65	-0.66	0.6	0.01	0.06	-0.02	0.3	-0.41
Gb_14617 (CRR22)	0.27	-0.81	-0.48	-0.39	-0.49	-3.47	-0.64	-0.46	0.35	0.04	1.84	-1.83	-0.92	-1.15	1.62	0.56	-0.56	-0.85	-0.18	-0.36
Gb_15132	-0.1	-0.14	0.03	-0.15	-0.18	-0.96	0.19	0.09	-0.1	0.07	0.68	-0.19	0.04	-0.33	0.69	-0.35	-0.17	-0.43	0.46	-0.09
Gb_15357	-0.5	0.15	-0.39	-0.82	-0.29	-0.57	-0.64	0.05	-0.05	0.06	1.33	-0.46	-0.22	-0.5	1.28	-0.08	-0.25	-0.08	0.11	-0.68
Gb_15832 (EDA6)	0.5	0.14	-0.01	0.27	0.08	-2.82	-1.64	-0.33	-0.28	-0.17	0.69	-0.8	-0.54	-0.55	0.99	0.57	-0.01	0.54	0.41	-1.16
Gb_16098	0.74	0.49	0.37	0.52	0.68	-1.47	0.01	-0.34	-0.65	-0.44	0.43	-0.94	-1.25	-1.72	0.56	-0.33	-0.77	0.36	0.85	-0.89
Gb_16502	0.67	0.45	0.17	0.65	0.98	-0.21	-1.34	-0.07	-0.63	-0.61	0.3	-0.38	-1.67	-1.89	0.45	-0.56	-0.5	0.58	0.1	-0.04
Gb_18168 (GR-RBP3)	0.93	-0.55	1.13	0.56	-0.06	-3.79	-0.59	-0.34	-0.07	-0.15	0.74	-0.81	-1.07	-1.38	0.64	0.37	-0.39	-0.96	0.34	-0.12
Gb_18297	0.31	0.09	0.17	0.05	0.16	-0.26	-0.62	-0.26	-0.25	-0.25	0.72	-0.36	-0.21	-0.32	0.76	-0.16	-0.13	-0.06	-0.11	-0.1
Gb_18462	0.72	-0.49	0.26	0.46	0.76	-2.98	-1.17	-0.39	-0.05	0.03	1.04	-1.43	-1.18	-1.31	0.8	0.94	0.39	-0.16	-0.8	-1.54
Gb_18638	0.12	0.42	-0.13	-0.13	-0.2	-1.4	-0.38	-0.33	-0.18	0.12	1.13	-0.43	-1.41	-1.6	1.1	0.74	0.28	0.03	-0.39	-0.92
Gb_19411 (EMB975)	0.28	0.19	0.3	0.39	0.49	-2.22	-1.3	-0.42	0.21	0.09	1.01	-0.9	-1.85	-1.99	0.84	0.27	0.23	-0.17	0.7	-1.48
Gb_19514	0.39	0.17	0.47	0.12	0.49	-1.21	-0.86	0.02	-0.01	0.1	0.57	-0.43	-0.87	-1.09	0.5	0.18	0.08	0.12	0.39	-1.43
Gb_19783	-1.38	0.16	-1.1	-1.17	-0.74	-1.06	-0.73	-0.13	-0.46	-0.13	1.79	-0.91	0.05	-0.07	1.57	0.41	-0.14	-0.62	-0.21	-0.64
Gb_19785	-0.36	0.45	-0.73	-0.35	-0.15	-0.52	-0.86	-0.09	-0.5	-0.36	1.22	-1.07	0.55	0.24	1.12	0.19	-0.3	-0.29	-0.12	-0.81
Gb_19811	0.87	-0.1	0.4	-0.22	0.45	-2.13	-0.49	-0.2	0.02	-0.01	0.8	-0.51	-1.59	-1.53	0.71	0.17	-0.01	-0.18	0.6	-0.73
Gb_20168 (HSP91)	-0.09	-1.78	-1.09	0.23	0.43	-1.1	-1.29	-0.52	-0.86	-0.64	1.52	-1.44	-0.31	-0.08	1.73	-0.76	-0.05	-0.11	-0.21	0.43
Gb_20239	0.84	0.07	0.56	0.56	0.73	-1.82	-0.35	-0.49	-0.56	-0.69	0.43	-1.32	-2.39	-1.74	0.41	0.74	0.42	0.58	0.01	-1.36
Gb_20410	-0.54	-0.08	-0.31	-0.67	-0.17	-0.23	-0.24	-0.01	0.09	0.14	1.09	-0.55	-0.37	-0.56	1.03	-0.06	0.15	-0.41	0.35	-0.34
Gb_20524	0.01	0.24	-0.46	-0.35	0.35	-3.15	-1.25	-0.19	0.42	0.08	1.33	-0.25	-2.11	-2.92	0.9	0.25	-0.5	-0.23	0.85	0.13
Gb_21161 (bZIP16)	0.32	0.19	0.34	0.36	0.21	-0.72	-0.72	-0.12	-0.12	-0.15	0.76	-0.78	-0.23	-0.63	0.83	-0.35	-0.28	-0.17	-0.11	-0.04
Gb_21593	0.29	-0.91	-0.55	-0.81	-0.4	-2.71	-2.31	-0.03	-0.05	-0.03	1.63	-0.78	-1.55	-1.4	1.61	0.72	0.9	-0.04	-0.44	-1.79
Gb_22043	0.77	-0.1	-0.05	-0.01	0.24	-0.77	-0.31	-0.16	-0.1	-0.21	1.04	-0.97	-0.8	-1.14	1.12	0.09	-0.49	0.09	-0.18	-0.64
Gb_22225 (RPD1)	0.77	-0.53	0.51	0.56	0.14	-2.89	-0.32	-0.1	-0.38	-0.05	0.72	-0.3	-1.09	-1.37	0.66	0.35	0.25	-0.63	0.66	-1.33
Gb_22849 (SDG2)	0.22	-0.65	-0.67	-0.51	0.01	-0.99	-1.2	-0.23	-0.11	0.05	1.5	-0.86	-0.15	-0.67	1.46	0.15	-0.31	-0.11	-0.18	-0.51
Gb_22860	0.71	-0.26	-0.15	0.06	0.06	-1.08	-0.63	-0.02	-0.25	-0.25	1.11	-0.44	-0.96	-1.16	1.04	0.26	0.07	0.11	0.01	-0.92
Gb_23196	0.81	0.33	0.37	0.8	0.76	-0.97	-1.18	-0.25	-0.51	-0.51	0.68	-0.81	-2.24	-1.98	0.66	0.0	-0.3	0.33	0.31	-0.9
Gb_23255	-0.1	-0.27	-0.53	-1.02	0.05	-2.35	-0.36	-0.21	0.37	0.31	1.37	-0.15	-1.39	-1.64	1.16	0.21	-0.04	-0.02	0.21	-0.06
Gb_23263	0.91	-0.13	0.17	0.76	0.22	-2.12	-0.66	-0.0	-0.21	-0.42	0.78	-1.14	-1.03	-0.92	0.64	0.72	-0.22	0.1	-0.07	-1.07
Gb_23333	0.62	-0.14	-0.44	0.24	0.01	-2.37	-1.31	-0.19	-0.24	0.11	1.17	-1.07	-1.25	-0.91	1.08	1.06	0.42	0.14	-0.57	-2.08
Gb_23453	0.48	-0.05	0.4	0.11	0.11	-2.46	-0.64	-0.2	-0.03	0.03	0.89	-0.46	-1.48	-1.51	1.0	0.64	0.04	-0.13	0.53	-2.15
Gb_23597	0.87	0.58	0.08	0.26	0.57	-0.86	-0.29	-0.1	-0.57	-0.31	0.49	-0.78	-0.61	-0.89	0.44	0.04	-0.26	0.1	0.4	-1.44
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Gb_29766	0.37	0.32	0.81	0.55	0.15	-0.69	-0.04	0.1	-0.07	-0.31	0.18	-0.45	-1.07	-1.35	0.41	-0.42	-0.2	0.11	0.46	-0.83
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Gb_30165	-1.84	0.66	-0.14	-0.65	-0.71	-1.62	0.22	-0.27	0.25	0.18	1.6	-0.94	-1.35	-1.6	1.28	0.21	-0.55	-0.69	0.42	-0.26
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Gb_30638	0.33	-0.3	0.16	0.52	0.24	-2.13	-1.21	-0.13	-0.07	-0.12	0.6	-0.69	-0.9	-1.07	0.67	0.32	0.04	0.51	0.82	-0.87
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Gb_31530	1.01	-0.24	0.41	1.17	0.67	-2.19	-0.74	-0.66	-0.71	-0.68	0.66	-1.32	-1.63	-1.61	0.42	0.61	0.32	-0.37	0.59	-1.96
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Gb_32787 (ADSS)	1.05	0.35	0.72	0.79	0.64	-0.73	-1.4	-0.11	-0.43	-0.71	0.13	-0.54	-0.75	-0.86	-0.02	0.16	0.02	-0.5	0.09	-0.64
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Gb_38049	0.58	-0.11	0.35	1.38	0.15	-0.76	-1.43	-0.31	0.36	0.14	0.51	-1.16	-4.7	-2.34	0.38	1.11	-0.04	-0.32	-0.42	-1.59
Gb_38400	0.62	0.63	0.34	0.02	0.06	-2.04	-0.42	-0.41	-0.27	-0.32	0.49	-0.66	-2.06	-1.6	0.54	0.57	0.64	0.16	0.66	-1.24
Gb_38415	0.36	-0.16	0.32	-0.17	-0.03	-0.73	-0.1	-0.14	0.24	0.11	0.85	-0.43	-1.71	-1.27	0.6	0.19	0.3	0.12	0.09	-0.5
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Gb_39700	0.82	0.18	-0.29	0.1	0.57	-1.22	-0.32	-0.24	0.06	0.19	1.02	-0.46	-2.17	-3.16	0.61	0.25	-0.18	0.01	0.52	-1.49
Gb_40070 (PPR40)	0.38	0.53	0.03	0.15	0.11	-2.0	-0.66	-0.34	0.22	0.18	1.31	-0.56	-1.32	-1.27	1.28	0.27	0.01	-1.09	-0.44	-2.11
Gb_40341	-0.05	0.17	-0.52	-0.22	-0.03	-1.2	-0.28	0.12	0.05	0.01	0.74	-0.77	0.22	-0.32	0.68	-0.0	-0.99	-0.03	0.63	0.18
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Gb_40456	0.34	-0.03	-0.89	0.17	0.09	-3.07	-0.26	-0.19	0.33	0.12	0.84	-1.81	-0.87	-0.76	1.1	1.03	-0.49	-0.64	0.31	-0.22
Gb_40457 (TERT)	0.47	0.44	-0.43	0.09	0.34	-1.26	-0.41	-0.2	0.38	-0.07	0.79	-1.45	-1.73	-1.87	0.67	0.57	-0.79	-0.18	0.94	-0.36
Gb_40515	-0.61	0.12	-0.08	-0.56	-0.62	-1.55	-0.31	-0.15	0.05	0.12	1.3	-0.16	-1.51	-1.22	1.19	0.1	0.24	-0.03	0.39	-0.22
Gb_41674	0.56	-0.06	-0.22	0.77	0.51	-2.24	-0.53	-0.56	-0.62	-0.7	1.28	-0.66	-1.77	-1.7	1.16	-0.2	-0.5	-0.04	0.89	-1.21

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.