Heatmap: Cluster_132 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
Gb_00056 (LYC)
0.34 0.36 0.23 0.47 0.5 0.6 0.14 0.39 0.42 0.35 0.56 0.3 0.15 0.13 0.51 0.55 0.43 0.6 1.0 0.43
0.38 0.19 0.12 0.48 0.35 0.42 0.05 0.26 0.14 0.14 0.17 0.08 0.08 0.1 0.19 0.16 0.15 0.81 0.45 1.0
0.1 0.02 0.02 0.76 1.0 0.67 0.01 0.35 0.18 0.3 0.08 0.29 0.06 0.06 0.07 0.38 0.67 0.67 0.01 0.57
0.22 0.0 0.01 1.0 0.18 0.03 0.01 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.03 0.56 0.0 0.04
0.03 0.0 0.0 1.0 0.47 0.2 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.4 0.44 0.3 0.0 0.11
Gb_02422 (MYB16)
0.41 0.06 0.0 0.46 0.1 0.23 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.01 0.0 0.15 0.17 1.0 0.13 0.25
0.02 0.0 0.0 0.37 0.42 1.0 0.0 0.18 0.1 0.13 0.01 0.11 0.03 0.11 0.03 0.96 0.86 0.4 0.02 0.21
Gb_05206 (NRT1.7)
0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.14 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.54 0.01 1.0
0.01 0.0 0.0 0.22 0.17 1.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.0 0.04 0.06 0.06 0.0 0.28
Gb_05697 (BGLU15)
0.22 0.22 0.0 1.0 0.73 0.07 0.0 0.14 0.1 0.08 0.06 0.3 0.11 0.56 0.06 0.45 0.29 0.0 0.0 0.0
Gb_05934 (PLP2)
0.0 0.03 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.45 0.03 1.0
0.11 0.0 0.0 0.61 0.39 0.19 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.35 1.0 0.59 0.24 0.26
Gb_07562 (RD20)
0.03 0.0 0.0 0.97 0.61 1.0 0.16 0.06 0.01 0.01 0.0 0.03 0.0 0.01 0.0 0.34 0.61 0.28 0.0 0.26
0.26 0.11 0.14 0.3 0.41 0.52 0.03 0.44 0.22 0.22 0.26 0.24 0.28 0.24 0.26 0.24 0.47 1.0 0.57 0.74
0.01 0.0 0.0 0.26 0.76 0.18 0.0 0.05 0.01 0.02 0.01 0.05 0.02 0.03 0.0 0.68 0.88 0.29 0.0 1.0
Gb_08848 (MAN6)
0.0 0.0 0.0 0.39 0.39 0.17 0.01 0.05 0.02 0.02 0.11 0.04 0.01 0.02 0.26 0.7 1.0 0.38 0.0 0.71
Gb_10174 (PAP26)
0.05 0.04 0.0 0.32 0.32 0.54 0.12 0.27 0.06 0.12 0.28 0.27 0.19 0.18 0.28 0.08 0.27 1.0 0.06 0.4
Gb_10408 (RD20)
0.07 0.1 0.13 1.0 0.17 0.48 0.19 0.17 0.01 0.01 0.02 0.14 0.01 0.03 0.05 0.13 0.25 0.78 0.02 0.0
Gb_10737 (PMR5)
0.03 0.01 0.06 0.08 0.16 0.96 0.01 0.24 0.15 0.16 0.13 0.53 0.11 0.11 0.16 0.75 0.72 0.73 0.2 1.0
Gb_10738 (PMR5)
0.03 0.0 0.01 0.08 0.07 0.39 0.0 0.11 0.05 0.04 0.01 0.25 0.11 0.1 0.04 0.17 0.18 0.38 0.07 1.0
0.02 0.09 0.0 0.06 0.1 0.0 0.05 0.01 0.0 0.05 0.0 0.02 0.0 0.0 0.02 0.06 0.24 0.38 0.1 1.0
0.49 0.42 0.44 0.52 0.56 0.52 0.46 0.71 0.4 0.46 0.78 0.53 0.4 0.39 0.73 0.44 0.64 1.0 0.55 0.83
0.29 0.07 0.11 0.25 0.28 0.18 0.03 0.06 0.02 0.02 0.02 0.08 0.03 0.03 0.03 0.1 0.13 0.22 0.22 1.0
Gb_13957 (VND4)
0.13 0.0 0.0 1.0 0.4 0.13 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.19 0.21 0.3 0.04 0.14
0.01 0.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.0 0.03 0.01 0.01 0.01 0.04 0.0 0.0 0.01 0.04 0.07 0.18 0.0 1.0
0.01 0.0 0.0 0.29 0.16 1.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.22 0.35 0.1 0.0 0.43
0.06 0.0 0.0 0.48 0.84 1.0 0.01 0.09 0.05 0.11 0.01 0.07 0.01 0.01 0.01 0.66 0.98 0.95 0.04 0.38
Gb_18532 (RCI3)
0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.89 0.0 0.07 0.0 0.01 0.05 0.09 0.01 0.03 0.08 0.24 0.22 0.26 0.05 1.0
0.08 0.0 0.0 1.0 0.33 0.2 0.43 0.05 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.02 0.0 0.34 0.44 0.39 0.09 0.22
0.01 0.1 0.01 0.09 0.19 0.23 0.03 0.08 0.15 0.12 0.04 0.1 0.02 0.04 0.04 0.12 0.11 0.28 0.12 1.0
0.0 0.0 0.0 0.1 1.0 0.27 0.0 0.07 0.04 0.04 0.01 0.01 0.0 0.02 0.01 0.03 0.06 0.65 0.06 0.06
0.01 0.03 0.01 0.36 1.0 0.21 0.0 0.26 0.29 0.28 0.07 0.09 0.03 0.12 0.02 0.08 0.12 0.48 0.1 0.04
0.01 0.01 0.0 0.01 0.08 1.0 0.02 0.07 0.01 0.02 0.01 0.05 0.01 0.02 0.02 0.01 0.01 0.77 0.03 0.59
0.0 0.0 0.0 0.05 0.23 1.0 0.0 0.02 0.08 0.1 0.01 0.21 0.0 0.0 0.01 0.01 0.02 0.17 0.15 0.02
0.04 0.0 0.0 0.2 0.48 1.0 0.12 0.05 0.05 0.07 0.05 0.02 0.0 0.02 0.06 0.37 0.7 0.35 0.12 0.24
0.02 0.02 0.02 0.08 0.18 0.41 0.2 0.18 0.07 0.15 0.13 0.2 0.15 0.11 0.11 0.05 0.17 0.61 0.32 1.0
0.0 0.0 0.0 0.3 0.38 0.08 0.0 0.04 0.01 0.02 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.15 0.19 0.71 1.0 0.13
0.0 0.0 0.0 0.18 1.0 0.26 0.0 0.11 0.04 0.06 0.01 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.41 0.23 0.05
0.1 0.02 0.01 0.62 0.94 1.0 0.0 0.18 0.2 0.22 0.02 0.28 0.18 0.39 0.04 0.54 0.69 0.29 0.0 0.01
0.12 0.02 0.02 0.75 1.0 0.9 0.0 0.25 0.19 0.21 0.04 0.35 0.13 0.29 0.04 0.65 0.83 0.42 0.0 0.03
0.07 0.03 0.03 0.32 0.37 1.0 0.01 0.13 0.15 0.13 0.1 0.08 0.09 0.15 0.12 0.26 0.36 0.5 0.12 0.32
0.19 0.0 0.0 1.0 0.21 0.37 0.01 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.54 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.06 0.09 0.01 0.01 0.03 0.0 0.04 0.0 0.03 0.01 0.78 0.99 0.1 0.15 1.0
0.58 0.51 0.3 0.57 0.74 0.82 0.3 0.6 0.47 0.4 0.78 0.41 0.42 0.37 0.83 0.59 0.53 1.0 0.96 0.62
Gb_27289 (RBOHF)
0.0 0.0 0.0 0.11 0.22 0.38 0.03 0.13 0.05 0.06 0.02 0.08 0.01 0.02 0.02 0.35 0.21 0.66 0.01 1.0
0.0 0.0 0.0 0.13 0.24 0.28 0.01 0.12 0.06 0.05 0.01 0.1 0.01 0.01 0.01 0.36 0.22 0.64 0.0 1.0
Gb_27893 (RNS1)
0.01 0.01 0.01 0.33 0.13 1.0 0.04 0.06 0.04 0.04 0.03 0.01 0.02 0.03 0.04 0.04 0.08 0.1 0.02 0.1
Gb_28159 (PMEPCRF)
0.0 0.0 0.01 0.06 0.18 0.83 0.0 0.21 0.34 0.21 0.07 0.07 0.04 0.07 0.11 0.7 0.54 0.43 0.62 1.0
Gb_28315 (CYP86B1)
0.0 0.0 0.01 0.0 0.02 0.01 0.0 0.02 0.02 0.02 0.01 0.0 0.01 0.01 0.0 0.01 0.04 0.03 0.05 1.0
0.02 0.0 0.0 0.64 1.0 0.86 0.0 0.13 0.06 0.05 0.01 0.07 0.03 0.03 0.02 0.2 0.41 0.84 0.01 0.08
0.0 0.41 0.0 0.0 0.56 1.0 0.01 0.12 0.08 0.04 0.02 0.04 0.21 0.18 0.09 0.06 0.04 0.09 0.02 0.32
Gb_30274 (CYP722A1)
0.0 0.0 0.0 0.04 0.01 0.0 0.0 0.08 0.05 0.04 0.02 0.1 0.04 0.04 0.03 0.11 0.07 0.03 0.0 1.0
Gb_30836 (RNS1)
0.01 0.0 0.0 0.42 0.26 1.0 0.0 0.04 0.01 0.0 0.01 0.02 0.01 0.01 0.01 0.21 0.2 0.14 0.01 0.34
0.06 0.01 0.01 0.15 1.0 1.0 0.29 0.35 0.32 0.49 0.11 0.2 0.33 0.31 0.1 0.26 0.41 0.72 0.13 0.38
Gb_32543 (XTH32)
0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.03 0.0 0.02 0.03 0.02 0.0 0.03 0.01 0.01 0.0 0.06 0.1 0.06 0.01 1.0
0.05 0.01 0.0 1.0 0.49 0.22 0.0 0.06 0.0 0.01 0.0 0.05 0.01 0.01 0.0 0.42 0.63 0.3 0.02 0.26
0.08 0.05 0.04 0.15 0.23 0.09 0.05 0.25 0.29 0.39 0.02 0.13 0.01 0.0 0.03 0.46 0.41 0.62 0.28 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.08 0.0 1.0
Gb_35364 (PTC52)
0.03 0.0 0.05 0.03 0.03 0.0 0.04 0.02 0.01 0.02 0.04 0.01 0.01 0.01 0.03 0.02 0.03 0.03 0.11 1.0
Gb_35365 (PTC52)
0.03 0.01 0.04 0.08 0.01 0.02 0.03 0.02 0.01 0.02 0.05 0.01 0.01 0.01 0.03 0.01 0.03 0.03 0.07 1.0
Gb_37828 (RSH3)
0.01 0.0 0.0 0.13 0.21 1.0 0.05 0.06 0.03 0.03 0.01 0.04 0.02 0.03 0.03 0.12 0.34 0.16 0.16 0.05
0.09 0.0 0.0 1.0 0.16 0.12 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.2 0.29 0.01 0.01
Gb_39667 (LPR1)
0.4 0.34 0.22 0.66 0.49 0.27 0.01 0.35 0.2 0.24 0.46 0.33 0.24 0.23 0.43 0.37 0.4 1.0 0.34 0.74
0.12 0.0 0.0 0.89 0.49 1.0 0.07 0.05 0.01 0.01 0.06 0.02 0.0 0.01 0.13 0.19 0.32 0.44 0.03 0.09
Gb_40198 (ATCWINV1)
0.35 0.04 0.1 1.0 0.55 0.28 0.07 0.08 0.03 0.03 0.02 0.24 0.02 0.06 0.01 0.1 0.09 0.45 0.0 0.0
Gb_40805 (VND1)
0.42 0.12 0.15 1.0 0.32 0.28 0.01 0.08 0.01 0.03 0.05 0.11 0.04 0.03 0.04 0.09 0.09 0.38 0.01 0.11
Gb_41026 (FEZ)
0.0 0.0 0.02 0.09 0.01 0.05 0.0 0.05 0.01 0.02 0.05 0.01 0.02 0.0 0.02 0.0 0.02 0.56 0.06 1.0
Gb_41377 (UNE17)
0.12 0.0 0.0 1.0 0.64 0.24 0.01 0.05 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.54 0.48 0.4 0.0 0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)