1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_132 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
Gb_00056 (LYC)
 15.87 16.83 10.68 21.9 22.97 27.66 6.55 18.03 19.48 16.15 26.04 13.72 7.01 6.23 23.64 25.63 20.08 27.9 46.32 20.1
2.44 1.23 0.77 3.07 2.23 2.71 0.33 1.68 0.93 0.88 1.12 0.54 0.53 0.65 1.23 1.03 0.97 5.2 2.89 6.43
0.71 0.15 0.13 5.56 7.31 4.9 0.1 2.53 1.32 2.16 0.59 2.13 0.47 0.44 0.49 2.81 4.91 4.91 0.08 4.16
7.75 0.0 0.49 35.52 6.28 0.95 0.25 1.65 0.11 0.0 0.04 0.02 0.03 0.04 0.07 1.62 1.07 19.76 0.04 1.25
3.02 0.0 0.0 98.08 45.69 19.46 0.05 4.3 0.23 0.3 0.06 1.06 0.12 0.38 0.06 39.4 43.63 29.89 0.0 10.41
Gb_02422 (MYB16)
 0.55 0.08 0.0 0.62 0.13 0.31 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.03 0.02 0.01 0.0 0.2 0.23 1.35 0.17 0.34
3.03 0.02 0.04 44.66 51.04 122.27 0.0 22.42 12.31 16.07 1.81 13.91 4.18 13.09 3.26 116.96 104.85 49.47 2.31 25.59
Gb_05206 (NRT1.7)
 0.02 0.0 0.0 0.06 0.02 0.96 0.05 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.6 0.06 6.71
0.08 0.0 0.02 1.39 1.09 6.36 0.0 0.07 0.0 0.02 0.03 0.09 0.08 0.07 0.0 0.26 0.36 0.4 0.01 1.75
Gb_05697 (BGLU15)
 6.46 6.37 0.09 29.58 21.69 2.02 0.06 4.18 2.85 2.39 1.75 8.74 3.3 16.55 1.89 13.18 8.46 0.12 0.0 0.02
Gb_05934 (PLP2)
 0.08 1.67 0.18 0.0 0.27 0.13 0.54 1.35 0.0 0.01 0.0 0.03 0.0 0.0 0.02 0.03 0.09 22.8 1.32 50.48
0.56 0.0 0.0 3.0 1.93 0.93 0.01 0.3 0.02 0.0 0.0 0.15 0.0 0.01 0.02 1.7 4.89 2.89 1.17 1.25
Gb_07562 (RD20)
 0.3 0.0 0.03 8.98 5.68 9.28 1.46 0.57 0.07 0.05 0.0 0.28 0.01 0.07 0.0 3.18 5.61 2.63 0.01 2.39
7.79 3.12 4.1 8.88 12.1 15.16 0.9 12.91 6.34 6.47 7.77 7.07 8.19 6.92 7.78 7.19 13.74 29.42 16.65 21.68
0.04 0.02 0.0 1.57 4.55 1.1 0.01 0.3 0.05 0.09 0.05 0.3 0.13 0.17 0.01 4.07 5.25 1.72 0.0 5.97
Gb_08848 (MAN6)
 0.06 0.0 0.0 5.15 5.16 2.29 0.07 0.59 0.25 0.31 1.46 0.51 0.12 0.25 3.38 9.19 13.15 5.03 0.06 9.28
Gb_10174 (PAP26)
 0.18 0.13 0.0 1.13 1.15 1.91 0.44 0.97 0.23 0.43 1.0 0.96 0.69 0.63 0.98 0.28 0.97 3.55 0.2 1.41
Gb_10408 (RD20)
 5.49 7.95 10.63 83.29 14.46 40.39 16.11 14.2 1.02 0.99 1.67 11.68 1.0 2.45 4.52 10.7 21.18 65.13 1.55 0.23
Gb_10737 (PMR5)
 1.73 0.92 3.46 4.69 9.95 59.57 0.53 15.09 9.38 9.85 7.81 32.92 7.07 6.88 9.81 46.28 44.77 44.84 12.41 61.76
Gb_10738 (PMR5)
 1.25 0.0 0.51 3.84 3.48 18.75 0.13 5.16 2.37 2.04 0.45 12.09 5.35 4.6 1.95 8.02 8.67 18.6 3.45 48.37
0.02 0.1 0.0 0.07 0.12 0.0 0.05 0.02 0.0 0.05 0.0 0.02 0.0 0.0 0.02 0.07 0.28 0.44 0.12 1.16
18.66 15.81 16.62 19.62 21.15 19.64 17.58 27.08 15.31 17.36 29.74 20.04 15.0 14.63 27.63 16.75 24.48 37.98 20.7 31.5
5.42 1.25 2.05 4.57 5.14 3.29 0.55 1.13 0.29 0.29 0.34 1.53 0.53 0.56 0.63 1.88 2.35 4.07 4.15 18.5
Gb_13957 (VND4)
 1.2 0.0 0.03 9.49 3.83 1.26 0.02 0.33 0.02 0.03 0.0 0.07 0.03 0.03 0.0 1.82 2.0 2.83 0.4 1.33
0.17 0.0 0.0 0.28 0.01 0.29 0.0 0.47 0.14 0.16 0.13 0.53 0.05 0.07 0.08 0.55 1.03 2.49 0.01 14.18
0.05 0.0 0.0 1.13 0.63 3.88 0.01 0.13 0.01 0.01 0.02 0.0 0.0 0.01 0.04 0.86 1.35 0.4 0.01 1.68
35.76 0.88 0.99 269.8 472.41 560.81 5.02 51.68 27.68 63.66 3.0 38.01 3.11 6.19 3.01 368.29 547.54 535.55 21.25 213.2
Gb_18532 (RCI3)
 0.01 0.0 0.0 0.57 0.24 21.86 0.01 1.77 0.08 0.14 1.24 2.12 0.13 0.73 1.99 5.96 5.39 6.29 1.23 24.57
2.04 0.0 0.01 25.7 8.38 5.17 11.09 1.32 0.18 0.13 0.04 0.32 0.1 0.56 0.04 8.77 11.38 9.95 2.24 5.76
0.26 2.07 0.29 1.89 3.88 4.76 0.59 1.61 3.06 2.36 0.81 2.09 0.36 0.75 0.77 2.39 2.31 5.79 2.43 20.46
0.01 0.0 0.0 0.83 7.94 2.13 0.02 0.55 0.34 0.35 0.05 0.05 0.01 0.12 0.08 0.24 0.48 5.14 0.47 0.49
0.19 0.54 0.14 5.97 16.66 3.5 0.05 4.32 4.9 4.71 1.1 1.47 0.52 1.97 0.4 1.33 1.97 7.92 1.58 0.71
1.06 0.56 0.0 1.39 7.65 94.76 1.91 6.32 0.83 1.58 0.95 4.55 1.15 1.82 1.65 0.5 1.2 72.67 3.03 56.31
0.15 0.11 0.01 6.62 32.71 141.16 0.2 3.15 11.66 13.43 0.84 30.05 0.24 0.26 1.14 1.46 3.01 24.01 21.37 2.83
0.07 0.0 0.0 0.37 0.88 1.84 0.22 0.08 0.09 0.13 0.09 0.03 0.0 0.04 0.1 0.69 1.29 0.64 0.22 0.44
20.69 20.62 19.19 72.41 163.66 365.29 181.55 162.39 63.98 136.76 113.44 179.69 130.75 101.65 93.82 43.5 152.52 540.79 283.06 892.32
0.0 0.0 0.0 0.56 0.69 0.15 0.0 0.07 0.01 0.04 0.01 0.0 0.01 0.01 0.01 0.27 0.35 1.31 1.83 0.23
0.01 0.0 0.0 1.06 6.0 1.56 0.0 0.64 0.25 0.36 0.04 0.02 0.03 0.04 0.0 0.0 0.0 2.46 1.35 0.29
250.6 49.91 34.06 1629.36 2463.65 2629.39 6.44 462.35 535.89 589.03 54.79 744.53 462.74 1030.42 100.7 1425.18 1805.93 755.17 0.5 17.05
85.92 13.46 12.27 557.41 745.85 673.25 2.6 186.8 138.17 157.0 28.53 261.85 94.14 216.28 32.8 486.56 621.38 310.85 0.61 24.8
4.45 2.12 1.76 20.54 23.17 63.38 0.77 8.36 9.26 8.23 6.48 5.37 5.91 9.63 7.45 16.53 23.07 31.58 7.3 20.28
20.54 0.0 0.08 107.04 21.95 39.44 0.83 6.8 0.0 0.02 0.0 0.08 0.0 0.01 0.03 0.4 0.38 57.94 0.33 0.12
0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.31 0.52 0.03 0.04 0.19 0.0 0.24 0.02 0.18 0.04 4.26 5.38 0.54 0.84 5.46
10.72 9.5 5.54 10.67 13.77 15.36 5.66 11.17 8.81 7.37 14.45 7.62 7.88 6.82 15.37 10.97 9.91 18.63 17.89 11.47
Gb_27289 (RBOHF)
 0.01 0.0 0.03 1.04 1.98 3.45 0.28 1.19 0.49 0.51 0.17 0.76 0.12 0.18 0.17 3.23 1.88 6.04 0.08 9.12
0.01 0.0 0.0 1.1 2.1 2.42 0.11 1.08 0.53 0.46 0.11 0.87 0.07 0.09 0.1 3.12 1.91 5.59 0.02 8.68
Gb_27893 (RNS1)
 0.15 0.16 0.1 5.25 2.11 15.99 0.6 0.88 0.7 0.67 0.55 0.1 0.32 0.47 0.6 0.6 1.29 1.55 0.26 1.52
Gb_28159 (PMEPCRF)
 0.02 0.02 0.13 0.75 2.29 10.32 0.0 2.65 4.17 2.6 0.93 0.85 0.46 0.83 1.32 8.71 6.74 5.39 7.68 12.42
Gb_28315 (CYP86B1)
 0.06 0.25 0.7 0.0 1.19 0.68 0.01 1.09 1.31 1.11 0.34 0.11 0.32 0.47 0.3 0.64 2.59 1.59 2.87 60.82
14.43 0.76 1.2 463.82 722.78 620.21 0.73 92.93 40.24 34.05 7.87 47.31 21.43 24.85 13.73 143.02 298.46 608.6 6.04 58.26
0.0 77.34 0.0 0.0 104.23 186.96 1.42 22.97 14.37 7.86 4.38 7.89 38.56 33.17 16.63 10.29 8.23 16.7 3.22 59.43
Gb_30274 (CYP722A1)
 0.0 0.0 0.0 0.33 0.11 0.0 0.0 0.68 0.43 0.37 0.16 0.82 0.32 0.33 0.28 0.95 0.61 0.24 0.04 8.31
Gb_30836 (RNS1)
 0.09 0.0 0.0 4.25 2.64 10.15 0.02 0.42 0.09 0.05 0.13 0.17 0.11 0.15 0.14 2.17 2.05 1.41 0.11 3.49
0.86 0.21 0.19 2.16 14.79 14.79 4.35 5.24 4.73 7.28 1.62 2.97 4.82 4.58 1.48 3.85 6.01 10.65 1.88 5.61
Gb_32543 (XTH32)
 0.31 2.86 0.93 0.0 2.01 7.25 0.05 5.43 7.3 5.77 0.5 8.83 3.54 2.6 0.62 14.98 24.48 16.66 2.42 256.56
0.49 0.08 0.0 10.41 5.14 2.3 0.0 0.62 0.05 0.1 0.0 0.53 0.15 0.11 0.0 4.37 6.55 3.11 0.23 2.67
0.63 0.37 0.35 1.21 1.86 0.7 0.39 1.98 2.37 3.18 0.14 1.05 0.05 0.03 0.22 3.71 3.32 5.04 2.26 8.07
0.01 0.0 0.02 0.07 0.0 0.1 0.0 0.23 0.32 0.19 0.04 0.1 0.02 0.04 0.33 0.02 0.12 2.03 0.01 25.02
Gb_35364 (PTC52)
 0.34 0.05 0.54 0.33 0.28 0.0 0.36 0.19 0.1 0.16 0.43 0.15 0.08 0.07 0.26 0.18 0.25 0.31 1.07 9.76
Gb_35365 (PTC52)
 0.36 0.07 0.45 0.87 0.13 0.2 0.36 0.24 0.13 0.28 0.52 0.15 0.08 0.15 0.33 0.14 0.31 0.39 0.79 11.3
Gb_37828 (RSH3)
 0.19 0.0 0.0 1.75 2.81 13.63 0.66 0.8 0.43 0.37 0.2 0.48 0.21 0.35 0.38 1.62 4.6 2.23 2.14 0.74
0.65 0.0 0.03 7.19 1.18 0.83 0.01 0.28 0.0 0.0 0.0 0.03 0.01 0.01 0.0 1.01 1.41 2.08 0.04 0.11
Gb_39667 (LPR1)
 18.06 15.6 10.12 29.99 22.48 12.19 0.34 15.98 9.04 10.9 21.04 15.08 10.74 10.37 19.61 16.68 18.43 45.55 15.67 33.93
5.43 0.12 0.04 40.07 22.11 45.06 3.25 2.4 0.41 0.64 2.64 0.81 0.16 0.41 5.71 8.78 14.32 19.63 1.33 4.24
Gb_40198 (ATCWINV1)
 22.6 2.82 6.62 64.05 35.26 18.21 4.33 5.13 1.67 1.85 1.19 15.42 1.15 3.85 0.78 6.29 5.47 29.13 0.02 0.24
Gb_40805 (VND1)
 2.63 0.75 0.96 6.31 2.02 1.77 0.06 0.52 0.09 0.18 0.29 0.69 0.26 0.16 0.22 0.56 0.57 2.41 0.08 0.71
Gb_41026 (FEZ)
 0.01 0.0 0.06 0.22 0.02 0.13 0.01 0.12 0.03 0.05 0.11 0.03 0.05 0.01 0.06 0.0 0.05 1.38 0.15 2.48
Gb_41377 (UNE17)
 2.96 0.0 0.02 23.82 15.13 5.69 0.29 1.18 0.05 0.07 0.0 0.28 0.07 0.19 0.0 12.89 11.51 9.59 0.0 0.03

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)