1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_49 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.1 0.16 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.04 0.0 0.02 0.09
0.01 0.03 0.01 0.0 0.0 0.0 11.25 0.02 0.0 0.0 0.04 0.02 0.11 0.92 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0
0.16 0.08 0.11 0.18 0.11 1.48 0.42 0.05 0.01 0.0 0.0 0.0 0.03 0.01 0.0 0.0 0.0 0.02 0.12 0.04
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.95 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 2.45
Gb_05591 (XTH2)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.05
Gb_06621 (CPS)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Gb_06791 (KT1)
 0.28 0.02 0.01 0.16 0.02 0.01 0.21 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.72
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.43 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 29.74 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.06 0.13 0.03 0.02 0.04 0.04 0.55 0.02 0.02 0.03 0.02 0.01 0.04 0.01 0.0 0.0 0.0 0.17 0.22 0.86
Gb_10948 (RR24)
 0.51 0.22 0.19 0.15 0.51 0.1 0.8 0.2 0.18 0.16 0.06 0.04 0.11 0.13 0.16 0.37 0.2 0.37 0.46 0.14
Gb_12813 (SUS3)
 0.21 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 53.75 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Gb_12814 (SUS5)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 9.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.04 0.02 0.0 0.0 0.0 0.14 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.58
0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.02
Gb_14726 (MRP6)
 0.01 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.16 0.01 0.01 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.05 0.02 0.01
Gb_14727 (MRP6)
 0.02 0.0 0.0 0.0 0.01 0.04 0.37 0.03 0.03 0.02 0.04 0.01 0.0 0.0 0.03 0.02 0.07 0.18 0.0 0.03
Gb_16597 (GSTU25)
 0.02 0.61 0.14 0.15 0.0 0.0 4.61 0.05 0.08 0.0 0.08 0.3 0.02 0.03 0.11 0.16 0.2 0.14 0.34 1.8
Gb_17660 (CLC-C)
 0.63 1.5 0.63 0.78 0.67 1.35 0.76 0.17 0.09 0.14 0.13 0.17 0.05 0.06 0.12 0.13 0.13 0.28 0.31 0.68
0.02 0.11 0.05 0.03 0.0 0.0 5.87 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Gb_18274 (PG2)
 0.83 1.04 0.66 3.61 4.43 4.28 8.98 0.61 0.05 0.03 0.02 1.16 0.02 0.2 0.07 0.45 0.43 4.07 3.21 2.65
Gb_20342 (PUP11)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.86 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Gb_21855 (SCP2)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 3.29 5.32 0.38 0.05 0.13 1.3 0.38 0.63 0.63 0.69 0.19 0.22 0.0 0.0 4.3
0.18 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 3.3 0.2 0.17 0.25 0.0 0.08 0.17 0.0 0.0 0.69 0.3 0.0 0.0 0.11
1.44 0.0 0.26 0.3 0.12 0.0 7.37 0.21 0.17 0.0 0.0 0.0 0.05 0.04 0.1 0.0 0.13 0.43 0.18 0.53
0.16 0.0 0.12 0.09 0.0 0.06 2.13 0.02 0.02 0.04 0.0 0.0 0.01 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.09 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08
Gb_23061 (ORP4B)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.12 0.94 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.35 0.0 0.0
0.3 0.22 0.28 4.42 8.86 40.66 16.72 1.4 0.7 0.46 0.33 0.33 0.19 0.64 0.37 3.22 5.17 19.85 8.69 13.71
Gb_24830 (XTH5)
 0.55 0.48 0.84 0.32 0.3 0.1 0.45 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.29 0.6 0.12
Gb_24831 (XTH5)
 0.55 0.48 0.84 0.32 0.3 0.1 0.45 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.29 0.6 0.12
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.58 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03
0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 2.96 21.93 1.15 0.2 0.26 1.52 1.6 2.1 6.38 1.89 0.38 0.76 12.84 0.64 19.61
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.04 1.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Gb_28918 (PDR12)
 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.43 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.05
0.14 0.0 0.02 0.07 0.0 0.0 0.63 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07
Gb_32942 (PG2)
 2.74 8.83 1.87 12.21 19.7 16.71 11.4 3.4 0.06 0.11 0.04 1.6 0.01 0.14 0.11 2.31 1.12 32.07 36.21 32.44
0.33 0.19 0.13 0.62 0.32 3.39 0.72 1.1 0.01 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 1.09 0.36 7.59 5.76 16.96
Gb_32947 (PG2)
 0.46 0.77 0.32 1.63 3.04 3.48 3.29 0.66 0.14 0.25 0.48 0.56 0.11 0.23 0.55 0.62 0.52 3.76 5.03 3.42
7.11 4.1 4.13 9.09 4.06 5.39 26.53 0.77 0.2 0.29 0.03 0.1 0.03 0.27 0.15 0.54 0.94 11.63 18.62 15.34
Gb_35083 (PGK)
 0.06 0.0 0.0 0.0 0.24 0.13 3.13 0.61 0.75 0.49 1.03 0.39 0.21 0.12 0.72 1.53 1.92 0.05 0.01 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 4.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Gb_36804 (SWEET3)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.46 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.68 1.92
Gb_36887 (ALDH11A3)
 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.42 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0
Gb_37526 (GSO1)
 0.04 0.02 0.03 0.05 0.04 0.02 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.02
Gb_37534 (GSO1)
 0.06 0.0 0.02 0.0 0.03 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06
0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.35 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.03 0.04 0.09 0.0 0.04 0.1 2.0 0.09 0.01 0.0 0.08 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.64 1.48 3.46
0.04 0.26 0.04 0.13 0.08 0.0 1.8 0.06 0.01 0.0 0.04 0.03 0.0 0.0 0.03 0.0 0.11 0.22 0.76 2.59
Gb_39510 (CYP76G1)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.3 0.04
0.05 0.67 0.0 0.0 0.0 0.0 12.26 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.06 0.0 0.0 0.24 0.04 0.07 0.3 0.01 0.02 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.11 0.02 0.31
Gb_41422 (PG2)
 19.25 49.8 23.85 26.63 148.59 286.07 313.13 17.83 2.17 2.05 0.92 40.44 1.37 11.83 4.99 19.54 21.92 130.44 85.31 73.0
0.38 0.46 0.25 1.5 0.81 0.09 0.64 0.18 0.01 0.04 0.14 0.04 0.06 0.13 0.08 0.22 0.32 0.13 0.04 0.33

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)