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Heatmap: Cluster_135 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
0.47 -0.01 0.24 0.74 -0.38 -2.44 -2.47 0.1 0.47 0.14 0.41 -0.42 -0.51 -0.42 0.27 1.27 0.46 -0.49 -0.62 -2.26
0.7 -0.5 0.15 0.41 -0.33 -2.61 -0.96 0.38 0.71 0.18 0.35 -0.56 0.53 0.45 0.28 0.7 -0.24 -1.31 -0.82 -1.89
Gb_00841 (SPP)
 -0.37 0.12 -1.55 -0.44 -0.38 -1.52 -1.1 0.49 0.09 0.01 0.81 -0.06 0.28 0.64 0.59 1.26 0.35 -0.32 -2.6 -1.41
Gb_03971 (emb1703)
 0.29 -0.79 -0.28 0.05 -0.08 -0.99 -1.12 0.19 0.59 0.21 0.83 -0.62 -0.18 -0.37 0.67 0.78 0.53 -0.56 -0.75 -0.98
0.37 0.15 0.3 0.02 -0.52 -0.44 -0.34 0.03 0.4 0.11 0.53 -0.67 0.28 0.34 0.45 0.87 -0.18 -1.18 -1.31 -2.07
-0.54 -0.35 -0.87 -0.25 -0.33 -1.39 -0.43 0.22 0.03 -0.47 0.26 -0.85 0.92 0.87 0.25 1.2 0.36 0.09 -0.86 -1.16
Gb_05325 (OVA5)
 0.51 0.04 0.32 0.65 -0.11 -1.42 -1.61 0.11 0.41 0.23 0.22 -0.4 -0.08 0.06 0.28 0.8 0.27 -0.62 -0.98 -1.75
Gb_05479 (SIGB)
 0.92 -0.1 0.32 0.29 0.1 -1.65 -1.03 0.35 0.44 0.01 0.58 -0.29 -0.06 -0.27 0.42 0.71 -0.1 -0.99 -1.13 -2.24
0.57 -0.38 0.06 0.6 0.03 -1.91 -1.24 0.35 0.41 -0.04 0.56 -0.22 0.58 0.62 0.45 0.49 -0.28 -1.34 -1.52 -2.36
Gb_05865 (TIM)
 0.2 -0.65 -0.07 -0.01 -0.26 -0.5 -2.21 0.07 0.43 -0.08 -0.01 -0.51 0.16 0.22 -0.08 1.02 0.61 -0.21 -0.42 0.13
0.96 0.03 0.67 0.55 0.41 -0.87 -1.52 -0.07 -0.06 -0.33 0.2 -0.64 -0.75 -0.68 0.16 0.83 0.23 -0.28 -0.86 -0.72
0.36 -0.11 -0.07 0.44 -0.32 -0.72 -2.56 0.31 0.59 0.07 0.17 -0.48 0.14 -0.04 0.12 1.19 0.38 -0.4 -1.05 -1.8
0.71 -0.82 0.01 1.09 -0.67 -1.91 -2.86 0.39 0.3 0.12 0.33 -0.4 0.06 0.31 0.07 1.03 0.57 -0.78 -1.41 -2.52
Gb_07283 (EMB2654)
 0.03 -0.04 -0.29 0.03 -0.07 -1.44 -0.31 0.09 0.37 0.1 0.76 -0.52 0.11 0.18 0.51 1.06 0.26 -0.78 -1.05 -1.99
Gb_07758 (EMB2219)
 0.48 0.2 -0.01 0.58 -0.47 -2.07 -1.59 0.13 0.9 0.36 0.15 -0.97 -0.38 0.02 0.07 1.37 0.54 -0.98 -2.27 -2.08
Gb_08037 (HMR)
 0.62 -1.83 -0.31 0.3 -0.57 -2.15 -1.82 0.2 0.89 0.53 0.49 -0.89 0.04 0.16 0.34 1.33 0.42 -0.54 -2.23 -1.29
0.32 -0.3 -0.0 0.61 -0.64 -1.92 -2.95 0.35 0.67 0.21 0.31 -0.59 0.04 -0.12 0.44 1.49 0.46 -0.75 -1.68 -3.89
Gb_08273 (NAP6)
 0.6 0.02 0.08 0.86 0.05 -0.75 -0.42 -0.09 0.01 -0.23 0.08 -0.22 -0.09 -0.05 0.04 0.42 0.16 -0.44 -0.39 -0.69
0.59 -1.17 -0.42 1.03 -0.49 -1.72 -2.32 0.21 0.35 -0.12 0.5 -0.64 0.39 0.34 0.37 1.28 0.4 -0.89 -1.77 -2.5
1.08 -0.84 0.13 0.56 0.24 -2.21 -1.42 0.02 0.33 -0.05 0.28 -0.69 -0.51 -0.6 0.13 1.05 0.37 -0.27 -0.59 -0.72
Gb_09981 (NSI)
 -0.61 0.62 -0.43 -0.28 -0.48 -1.14 -0.88 0.35 0.3 0.17 0.2 -0.5 0.57 0.34 0.28 1.07 -0.02 -0.3 -0.2 -1.69
0.76 0.33 -0.12 0.6 0.07 -1.86 -2.25 0.11 0.45 -0.04 0.08 -0.51 -0.15 -0.12 0.13 0.8 0.3 0.14 -0.44 -2.62
Gb_10855 (DEGP2)
 0.56 -0.36 -0.25 -0.48 -0.74 -1.09 -2.01 0.28 0.75 0.25 0.9 -0.36 -0.28 -0.3 0.82 1.44 0.21 -0.89 -2.57 -2.59
0.2 -0.79 -0.47 0.14 -0.41 -1.46 -2.21 0.23 0.68 0.22 0.67 -0.88 -0.09 0.24 0.65 1.21 0.7 -0.46 -1.24 -1.87
Gb_12060 (SQD1)
 0.28 0.14 0.31 0.38 0.01 -1.58 -1.9 -0.03 0.43 0.09 0.34 -0.25 -0.42 0.14 0.23 1.25 0.39 -0.36 -1.58 -2.16
Gb_12172 (SUFE1)
 0.14 -0.43 -0.34 0.24 -0.31 -0.95 -1.1 0.32 0.54 0.27 0.83 -0.62 -0.4 -0.57 0.7 0.93 0.64 -0.97 -0.28 -2.2
-0.53 0.42 0.17 0.2 -0.37 -0.68 -0.36 0.11 0.18 -0.09 0.49 -0.35 0.41 0.32 0.42 0.85 0.01 -0.83 -0.88 -1.59
0.01 -0.54 -0.59 -0.36 -0.15 -0.96 -0.76 0.17 0.66 0.16 0.3 -0.36 0.55 0.29 0.34 1.13 0.28 -0.56 -1.22 -0.81
Gb_13783 (EDD)
 0.18 0.45 -0.31 0.2 -0.33 -1.0 -1.83 0.1 0.54 0.18 0.28 -0.56 0.38 0.33 0.4 1.15 0.2 -0.63 -1.57 -2.34
Gb_13789 (HEMB1)
 -0.21 0.29 -0.02 0.51 -0.25 -0.72 -0.6 0.21 0.2 -0.29 0.34 -0.68 0.01 0.27 0.18 1.16 0.42 -0.33 -1.35 -1.89
0.33 -0.52 -0.53 0.39 -0.67 -1.39 -1.79 0.06 0.63 0.36 0.73 -0.43 0.01 -0.11 0.67 1.01 0.33 -0.6 -1.06 -0.9
0.35 -0.23 -0.22 0.16 -0.71 -1.24 -2.58 0.29 0.72 0.15 0.25 -0.44 0.0 -0.01 0.42 1.4 0.51 -0.49 -1.96 -1.29
-0.74 0.13 -0.71 -0.19 -0.73 -0.9 -1.32 0.18 0.45 0.05 0.44 -0.58 0.4 0.52 0.07 1.69 0.33 -0.63 -0.59 -3.08
Gb_15950 (SRS)
 0.02 -0.32 -0.24 0.21 -0.73 -0.92 -0.73 0.39 0.47 0.03 0.1 -0.25 0.52 0.37 0.07 1.19 0.78 -1.2 -1.52 -1.88
Gb_16208 (SHM3)
 0.51 -0.05 0.28 0.3 0.33 -1.55 -0.59 0.13 0.23 -0.05 -0.08 -0.5 0.34 0.27 -0.21 0.81 0.23 -0.44 -1.02 -0.9
0.94 -0.73 0.21 0.67 -0.33 -1.25 -2.07 0.34 0.13 -0.17 0.03 -0.76 0.63 0.58 0.02 0.69 0.22 -0.39 -1.09 -1.49
0.71 -0.21 -0.06 0.28 -0.11 -1.45 -1.4 0.14 0.79 0.3 0.22 -0.59 0.27 0.25 0.11 0.49 0.07 -0.05 -1.0 -1.49
Gb_17994 (emb2004)
 0.53 -1.16 -0.54 -0.05 0.01 -1.89 -1.6 0.23 0.43 -0.2 0.39 -0.55 0.69 0.65 -0.15 1.24 0.55 -0.18 -1.94 -1.21
Gb_18301 (CFM2)
 0.3 -0.92 -0.57 0.47 -0.38 -1.49 -1.91 -0.11 0.2 0.03 0.52 -1.48 0.73 0.72 0.36 1.43 0.3 -0.35 -1.82 -1.62
Gb_18302 (CFM2)
 0.56 -1.05 -0.3 0.79 0.16 -1.66 -2.35 -0.22 0.31 0.03 0.22 -1.49 0.39 0.28 0.02 1.61 0.26 -0.38 -1.59 -1.5
Gb_18303 (CFM2)
 0.65 -0.18 -0.3 0.29 -0.04 -1.57 -1.82 0.04 0.37 0.16 0.53 -1.3 0.09 -0.12 0.46 1.33 0.16 -0.35 -0.84 -1.77
0.9 0.27 0.26 0.83 0.25 -1.7 -1.33 0.35 0.46 0.04 -0.65 -0.72 -0.26 -0.2 -0.4 0.64 0.4 -0.05 -0.87 -1.85
0.73 -0.24 0.02 0.62 0.09 -1.4 -1.33 0.42 0.54 0.03 0.33 -0.31 -0.22 -0.14 -0.02 0.85 0.3 -0.34 -1.32 -1.9
0.47 -0.95 -0.48 0.67 -0.95 -1.79 -2.6 0.36 0.82 0.33 0.4 -0.85 0.43 0.29 0.26 1.3 0.74 -1.49 -2.04 -2.82
0.69 -0.09 0.15 0.81 0.06 -1.62 -1.24 0.11 0.31 -0.16 0.14 -0.61 -0.82 -0.68 0.12 1.03 0.5 -0.08 -0.28 -1.67
0.62 -0.28 -0.21 1.09 -0.16 -1.22 -0.19 -0.02 0.21 -0.22 0.09 -0.64 -0.1 -0.18 -0.02 1.05 0.67 -1.11 -1.18 -1.52
0.91 -0.89 -0.02 0.88 -0.3 -1.73 -1.96 0.0 0.54 -0.05 0.44 -0.88 -0.08 -0.21 0.39 1.2 0.24 -0.49 -1.59 -1.27
Gb_21443 (OTP86)
 0.83 -0.64 -0.14 0.18 -0.15 -1.72 -0.57 0.25 0.28 0.02 0.25 -0.57 -0.18 -0.14 0.5 1.07 0.57 -0.7 -0.25 -2.81
-0.39 -1.03 -1.16 -0.47 -0.53 -0.72 -0.57 0.11 0.48 0.13 1.23 -0.39 0.34 0.1 1.09 1.07 -0.16 -0.66 -1.2 -1.33
Gb_23256 (NAP7)
 0.61 -0.23 -0.21 0.37 -0.29 -0.86 -0.9 0.2 0.53 0.34 0.14 -0.47 0.4 0.41 0.14 0.64 0.05 -0.53 -1.26 -1.27
0.12 0.36 -0.25 0.76 -0.84 -2.51 -0.36 0.09 0.74 0.14 -0.07 -0.4 0.55 0.6 -0.18 1.05 0.16 -1.95 -1.42 -1.52
-0.08 -0.13 -0.41 -0.04 -0.29 -0.66 -0.72 0.35 0.34 0.05 0.3 -0.3 0.12 0.21 0.15 0.54 0.32 -0.13 0.09 -0.5
0.56 0.29 0.15 0.25 -0.01 -1.48 -1.15 0.32 0.38 -0.01 0.44 -0.44 0.02 -0.15 0.38 0.89 0.08 -0.52 -1.19 -1.71
0.1 -1.16 -0.42 -0.08 -1.4 -0.76 -0.86 0.19 0.53 0.06 0.32 -0.58 1.18 0.82 0.1 0.93 0.65 -1.06 -1.68 -1.46
Gb_25574 (MAP1C)
 0.14 -0.14 -0.25 0.18 -0.93 -1.24 -1.18 0.45 0.47 -0.03 0.42 -0.13 0.58 0.61 0.34 1.14 0.36 -1.31 -1.67 -2.66
Gb_26473 (FLU)
 -0.25 -0.02 0.05 0.74 -0.29 -1.34 -2.11 0.13 0.45 0.03 0.34 -0.73 0.17 0.36 0.24 1.1 0.4 -0.44 -1.03 -1.35
Gb_26634 (emb2746)
 0.27 -1.14 -0.45 0.35 -0.61 -1.89 -2.79 0.6 0.64 0.11 0.47 -0.61 0.2 0.28 0.34 1.15 0.84 -0.22 -1.43 -2.25
Gb_28420 (SCY2)
 0.94 -0.1 0.7 0.87 0.59 -2.1 -1.61 -0.12 0.02 -0.24 0.32 -0.55 -0.59 -0.75 0.31 0.54 0.21 -0.22 -1.19 -0.96
Gb_28496 (emb2458)
 1.1 -0.39 0.05 0.74 -0.03 -1.35 -1.85 -0.04 0.15 -0.14 0.09 -1.07 -0.04 -0.09 0.08 1.02 0.11 -0.3 -0.33 -0.9
Gb_29061 (RAP)
 -0.15 -1.07 -0.97 0.0 -0.73 -2.02 -2.05 0.29 0.66 0.23 0.89 -0.47 -0.21 -0.19 0.76 1.15 1.09 -0.45 -0.71 -1.55
Gb_29169 (emb2746)
 0.6 -0.69 -0.3 0.71 -0.94 -2.53 -2.15 0.44 0.58 -0.22 0.9 -1.21 -0.22 -0.33 0.71 1.56 0.54 -1.53 -1.61 -3.01
Gb_29585 (OVA2)
 0.43 -0.44 -0.22 0.02 -0.43 -1.17 -1.61 0.29 0.45 0.1 0.15 -0.48 0.67 0.14 0.33 1.15 0.61 -0.84 -1.0 -1.7
Gb_29948 (FTSZ2-1)
 0.07 -0.4 -0.15 0.07 -0.07 -1.5 -2.54 0.36 0.59 0.27 0.48 -0.08 -0.06 -0.27 0.48 1.01 0.45 -0.14 -1.15 -0.98
0.96 0.41 0.2 0.69 0.49 -0.75 -2.14 -0.32 0.33 -0.4 -0.52 -1.05 -0.44 -0.7 -0.8 1.7 0.5 -0.78 -1.63 -1.99
0.93 0.47 0.41 0.82 0.41 -0.37 -1.96 -0.16 -0.06 -0.52 -0.62 -1.02 0.06 -0.29 -0.71 1.38 0.15 -0.66 -0.9 -2.41
0.29 -1.32 -0.83 0.22 -0.8 -1.14 -2.54 0.38 0.99 0.56 0.31 -0.79 0.14 0.25 0.51 1.72 0.01 -0.61 -3.24 -3.32
Gb_30200 (PTAC2)
 0.53 -0.95 -0.15 0.28 -0.38 -1.69 -1.8 0.39 0.69 0.37 0.92 -0.35 -0.27 -0.36 0.75 0.84 0.54 -0.77 -1.83 -1.94
0.08 -0.43 -0.73 0.03 -0.29 -1.25 -0.66 0.37 0.79 0.55 0.9 -0.35 0.16 -0.02 0.82 0.18 -0.15 -0.68 -0.69 -1.23
Gb_30753 (PTAC10)
 0.51 -0.19 -0.05 0.0 -0.46 -3.34 -1.71 -0.02 0.79 0.4 0.35 -1.12 0.51 0.82 0.13 1.36 0.18 -1.44 -2.06 -2.17
Gb_30755 (PTAC10)
 0.85 0.09 0.0 0.02 -0.76 -5.49 -1.73 0.13 0.78 0.36 0.29 -0.88 0.27 0.26 0.26 1.34 0.19 -1.4 -1.36 -1.66
0.74 0.6 0.07 0.17 -0.47 -3.7 -1.58 0.31 0.79 0.33 0.29 -0.84 -0.04 -0.06 0.21 1.14 0.12 -1.24 -1.02 -2.41
Gb_31457 (EMB2261)
 1.03 -0.1 0.35 0.76 0.13 -2.96 -1.42 -0.1 0.14 -0.03 0.43 -0.83 -0.17 -0.48 0.25 0.82 0.31 -0.11 -0.62 -2.58
0.29 -0.94 -0.4 0.09 -0.58 -1.79 -2.06 0.28 0.58 0.1 0.8 -0.5 0.47 0.81 0.62 1.01 0.5 -1.53 -2.12 -1.58
0.62 -0.5 -0.2 0.59 -0.41 -1.38 -1.65 0.29 0.65 0.17 0.47 -0.48 -0.5 -0.49 0.43 1.09 0.74 -1.16 -0.76 -1.69
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0.3 -0.82 -0.53 0.29 0.02 -1.11 -1.7 0.44 0.32 0.02 0.63 0.13 0.48 0.32 0.58 0.54 -0.29 -0.54 -0.73 -0.91
Gb_32101 (RIF1)
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Gb_33379 (RH39)
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Gb_33545 (CRR22)
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Gb_33852 (RNR1)
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Gb_33853 (RNR1)
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Gb_34413 (RP1)
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Gb_34809 (WTF1)
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Gb_35745 (emb1138)
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Gb_35993 (ISE2)
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Gb_36197 (CPSAR1)
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Gb_36199 (ATPPR5)
 0.8 0.32 0.37 0.81 -0.12 -1.58 -1.27 -0.01 0.32 -0.03 0.46 -0.6 -0.73 -1.0 0.42 0.75 0.23 -0.47 -0.67 -1.34
Gb_36900 (PDK)
 0.49 -0.55 0.13 1.15 -0.12 -0.99 -3.1 0.31 0.16 -0.41 0.15 -0.64 0.07 0.01 0.32 1.1 0.34 -0.19 -1.56 -1.87
Gb_37638 (CFM3A)
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0.36 -0.55 -0.39 0.44 -0.59 -1.55 -2.8 0.61 0.84 0.36 0.35 -0.31 0.81 0.51 0.28 0.81 0.13 -0.85 -2.34 -3.38
Gb_39209 (EMB1865)
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Gb_39217 (EMB1865)
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Gb_39267 (EMB2247)
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Gb_39968 (HRS1)
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Gb_40053 (GLY1)
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Gb_40951 (GR)
 0.47 -0.37 0.22 0.38 -0.03 -0.96 -1.87 0.29 0.51 0.12 0.31 -0.22 0.43 0.35 0.17 0.58 0.11 -0.51 -1.08 -1.82
0.31 -0.14 -0.03 0.45 -0.32 -1.49 -0.88 0.08 0.29 -0.25 0.25 -0.04 0.07 0.2 -0.04 1.19 0.55 -0.47 -0.63 -2.14
Gb_41379 (ftsh7)
 -0.02 -0.46 -0.52 -0.35 -0.15 -0.99 -0.79 0.04 0.75 0.49 0.51 -0.59 0.37 0.21 0.52 0.57 0.18 -0.41 -0.23 -0.97

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.