1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_153 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
Gb_00119 (VTC1)
 0.26 0.28 0.31 0.21 0.31 0.94 0.43 0.32 0.21 0.2 0.44 0.31 0.21 0.3 0.41 0.22 0.33 0.15 1.0 0.44
0.4 0.35 0.32 0.3 0.42 1.0 0.49 0.75 0.57 0.47 0.73 0.49 0.51 0.45 0.71 0.55 0.61 0.56 0.71 0.67
0.32 0.3 0.24 0.34 0.38 1.0 0.52 0.79 0.24 0.23 0.47 0.43 0.29 0.27 0.49 0.16 0.27 0.35 0.9 0.73
Gb_01104 (ATN1)
 0.19 0.08 0.12 0.29 0.35 0.8 0.26 0.37 0.34 0.26 0.35 0.35 0.25 0.29 0.25 0.16 0.24 0.11 1.0 0.32
0.07 0.1 0.07 0.09 0.18 0.33 0.16 0.18 0.11 0.13 0.1 0.17 0.11 0.11 0.11 0.05 0.11 0.24 1.0 0.35
0.19 0.46 0.3 0.24 0.56 0.77 0.47 0.92 0.54 0.63 0.77 0.47 0.5 0.46 0.9 0.39 0.54 0.36 1.0 0.41
0.09 0.24 0.16 0.14 0.25 0.46 0.33 0.5 0.5 0.45 0.72 0.39 0.08 0.06 0.77 0.16 0.19 0.78 1.0 0.64
Gb_03216 (GRIK1)
 0.27 0.27 0.26 0.24 0.26 0.54 0.31 0.66 0.33 0.33 0.68 0.6 0.41 0.42 0.57 0.38 0.28 0.43 1.0 0.73
0.26 0.67 0.27 0.35 0.72 0.76 0.5 0.73 0.53 0.44 1.0 0.6 0.69 0.58 0.93 0.3 0.38 0.62 0.9 0.52
0.5 0.64 0.53 0.41 0.71 0.97 0.41 0.74 0.56 0.53 0.59 0.58 0.63 0.52 0.65 0.53 0.68 0.79 0.66 1.0
Gb_05089 (SEL1)
 0.02 0.03 0.04 0.02 0.07 1.0 0.73 0.58 0.14 0.27 0.26 0.33 0.33 0.21 0.17 0.05 0.13 0.41 0.48 0.73
0.62 0.48 0.46 0.51 0.7 1.0 0.56 0.9 0.41 0.42 0.59 0.32 0.68 0.44 0.62 0.21 0.2 0.46 0.86 0.65
0.58 0.92 0.46 0.36 0.6 1.0 0.7 0.48 0.45 0.39 0.55 0.41 0.32 0.27 0.55 0.4 0.28 0.46 0.58 0.31
Gb_06865 (ECT2)
 0.53 0.33 0.24 0.4 0.59 1.0 0.56 0.7 0.36 0.33 0.66 0.46 0.55 0.5 0.73 0.52 0.63 0.44 0.91 0.44
0.44 0.52 0.42 0.61 0.7 0.92 0.28 1.0 0.39 0.4 0.6 0.64 0.76 0.64 0.62 0.21 0.35 0.58 0.5 0.7
Gb_07473 (VPS32)
 0.27 0.35 0.29 0.42 0.64 0.72 0.32 0.67 0.35 0.35 0.69 0.4 0.56 0.47 0.78 0.29 0.36 0.65 1.0 0.67
0.22 1.0 0.26 0.18 0.47 0.56 0.35 0.56 0.46 0.43 0.53 0.41 0.51 0.47 0.54 0.24 0.25 0.26 0.38 0.35
0.11 0.14 0.08 0.13 0.27 0.41 0.14 0.56 0.35 0.28 0.19 0.41 0.13 0.15 0.14 0.22 0.33 0.2 1.0 0.68
Gb_10630 (ARFB1B)
 0.2 0.61 0.3 0.24 0.34 0.42 0.35 0.59 0.49 0.49 0.64 0.47 0.43 0.36 0.59 0.46 0.57 0.49 1.0 0.58
Gb_10818 (UBC10)
 0.32 0.46 0.39 0.31 0.57 1.0 0.31 0.79 0.45 0.44 0.88 0.48 0.74 0.68 0.92 0.38 0.4 0.68 0.86 0.84
0.18 0.29 0.2 0.22 0.43 1.0 0.07 0.63 0.53 0.6 0.62 0.58 0.6 0.54 0.77 0.36 0.5 0.3 0.46 0.64
0.33 0.45 0.24 0.22 0.54 0.6 0.38 0.62 0.48 0.38 0.43 0.46 0.42 0.35 0.41 0.53 0.47 0.37 1.0 0.52
0.1 0.04 0.03 0.15 0.28 1.0 0.06 0.48 0.23 0.22 0.32 0.24 0.12 0.09 0.32 0.16 0.33 0.18 0.82 0.2
Gb_13930 (NAC038)
 0.25 0.09 0.12 0.06 0.09 0.42 0.03 0.27 0.04 0.04 0.08 0.02 0.03 0.03 0.1 0.03 0.02 0.14 0.28 1.0
0.5 0.44 0.36 0.41 0.32 1.0 0.18 0.59 0.33 0.34 0.38 0.32 0.38 0.42 0.39 0.19 0.34 0.24 0.8 0.65
Gb_17029 (PTP1)
 0.35 0.4 0.35 0.37 0.72 0.47 0.33 0.61 0.38 0.35 0.64 0.38 0.36 0.29 0.69 0.27 0.46 0.52 1.0 0.51
0.15 0.04 0.09 0.13 0.16 0.6 0.69 0.47 0.14 0.17 0.39 0.21 0.13 0.13 0.38 0.12 0.3 0.25 1.0 0.28
0.18 0.37 0.23 0.27 0.33 0.38 0.4 0.6 0.45 0.43 0.62 0.4 0.42 0.44 0.72 0.57 0.62 0.77 1.0 0.75
Gb_17908 (ICK5)
 0.11 0.24 0.22 0.28 0.63 0.86 0.23 0.9 0.46 0.38 0.82 0.73 0.51 0.44 0.77 0.75 0.65 1.0 0.57 0.18
Gb_18257 (UBC5)
 0.22 0.59 0.29 0.23 0.45 0.42 0.32 0.44 0.37 0.34 0.44 0.44 0.38 0.36 0.43 0.39 0.34 0.48 1.0 0.42
0.02 0.0 0.01 0.09 0.34 0.49 0.58 0.4 0.1 0.07 0.12 0.12 0.16 0.16 0.16 0.04 0.06 0.18 1.0 0.37
0.02 0.0 0.0 0.06 0.2 0.48 0.29 0.27 0.09 0.06 0.07 0.06 0.2 0.25 0.09 0.02 0.02 0.08 1.0 0.18
0.12 0.32 0.12 0.2 0.59 1.0 0.63 0.64 0.44 0.45 0.74 0.43 0.37 0.3 0.69 0.23 0.18 0.49 0.49 0.56
0.31 0.38 0.3 0.28 0.46 0.94 0.19 0.52 0.43 0.37 0.3 0.36 0.46 0.46 0.37 0.48 0.42 1.0 0.82 0.65
0.79 1.0 0.65 0.66 0.83 0.66 0.81 0.71 0.78 0.59 0.74 0.64 0.6 0.6 0.73 0.56 0.75 0.78 0.96 0.66
0.06 0.07 0.06 0.06 0.08 1.0 0.09 0.49 0.07 0.06 0.67 0.17 0.15 0.09 0.62 0.03 0.03 0.05 0.1 0.28
0.09 0.22 0.21 0.14 0.18 1.0 0.6 0.38 0.32 0.34 0.37 0.23 0.51 0.42 0.4 0.19 0.24 0.32 0.9 0.46
Gb_25885 (ENDO4)
 0.28 0.26 0.29 0.31 0.38 1.0 0.18 0.56 0.21 0.23 0.45 0.4 0.35 0.3 0.52 0.19 0.34 0.34 0.52 0.44
0.75 0.65 0.63 0.75 0.82 0.86 0.66 1.0 0.66 0.69 0.99 0.63 0.81 0.63 0.93 0.34 0.45 0.47 0.72 0.8
Gb_27066 (TAF7)
 0.28 0.38 0.36 0.38 0.6 0.67 0.95 0.49 0.47 0.47 0.6 0.35 0.36 0.29 0.61 0.29 0.41 0.5 1.0 0.51
Gb_27143 (CHUP1)
 0.19 0.25 0.18 0.2 0.27 1.0 0.17 0.44 0.2 0.21 0.41 0.23 0.28 0.17 0.49 0.08 0.11 0.15 0.37 0.28
0.19 0.19 0.15 0.32 0.52 0.73 0.16 0.7 0.49 0.56 0.95 0.4 0.43 0.38 1.0 0.62 0.6 0.47 0.58 0.18
0.09 0.2 0.1 0.28 0.38 0.91 0.56 0.89 0.5 0.53 0.85 0.79 0.79 0.73 0.84 0.38 0.56 0.81 1.0 0.71
0.12 0.15 0.11 0.11 0.25 0.64 0.14 0.26 0.23 0.21 0.45 0.21 0.21 0.2 0.43 0.17 0.22 0.34 1.0 0.22
Gb_28411 (AtATG18a)
 0.48 0.74 0.42 0.43 0.74 0.68 0.87 0.82 0.82 0.67 0.74 0.65 0.9 0.87 0.74 0.54 0.55 0.89 1.0 0.55
0.35 0.24 0.18 0.27 0.31 0.49 0.19 0.39 0.31 0.3 0.41 0.35 0.38 0.32 0.37 0.27 0.24 0.46 1.0 0.52
Gb_29712 (TUA3)
 0.04 0.08 0.04 0.07 0.31 1.0 0.17 0.31 0.19 0.18 0.33 0.21 0.29 0.24 0.34 0.1 0.15 0.1 0.82 0.18
0.15 0.36 0.14 0.13 0.41 0.59 0.08 0.3 0.26 0.26 0.2 0.21 0.33 0.28 0.26 0.12 0.11 0.16 1.0 0.23
Gb_30256 (UFD1)
 0.43 0.49 0.46 0.63 0.59 0.68 0.46 0.64 0.45 0.38 0.58 0.32 0.5 0.45 0.56 0.26 0.33 0.44 1.0 0.49
Gb_31864 (VPS2.1)
 0.4 0.29 0.42 0.31 0.49 0.57 0.37 0.63 0.32 0.34 0.42 0.46 0.29 0.23 0.42 0.34 0.63 0.49 1.0 0.63
Gb_31938 (VPS60.1)
 0.46 0.5 0.63 0.57 0.85 0.8 0.36 0.9 0.54 0.53 0.94 0.68 1.0 0.94 0.91 0.36 0.69 0.74 0.74 0.83
0.16 0.13 0.12 0.17 0.29 0.8 0.32 0.38 0.09 0.11 0.19 0.23 0.2 0.19 0.17 0.04 0.08 0.11 1.0 0.18
Gb_35217 (DELTA-OAT)
 0.14 0.52 0.12 0.29 0.3 1.0 0.61 0.52 0.46 0.35 0.67 0.28 0.34 0.37 0.76 0.45 0.19 0.46 0.94 0.39
0.33 0.37 0.33 0.39 0.54 0.73 0.24 1.0 0.51 0.49 0.61 0.78 0.48 0.38 0.62 0.38 0.29 0.3 0.65 0.5
Gb_37139 (SGP1)
 0.01 0.01 0.01 0.0 0.03 0.08 0.02 0.16 0.08 0.08 0.1 0.09 0.02 0.02 0.09 0.02 0.02 0.13 1.0 0.25
Gb_37252 (NHX6)
 0.28 0.35 0.38 0.36 0.59 1.0 0.29 0.71 0.46 0.49 0.88 0.56 0.56 0.49 0.8 0.41 0.39 0.58 0.65 0.48
Gb_38104 (URH2)
 0.14 0.17 0.15 0.18 0.34 0.85 0.28 0.68 0.39 0.4 0.6 0.52 0.27 0.22 0.63 0.26 0.4 0.5 0.85 1.0
0.28 0.42 0.26 0.3 0.44 1.0 0.4 0.72 0.56 0.44 0.77 0.51 0.72 0.56 0.71 0.6 0.5 0.42 0.72 0.53
0.54 0.61 0.51 0.49 0.75 0.68 0.36 0.84 0.51 0.42 1.0 0.67 0.67 0.62 0.88 0.53 0.59 0.61 0.79 0.56
0.27 0.13 0.12 0.15 0.17 1.0 0.23 0.4 0.11 0.14 0.23 0.12 0.2 0.13 0.25 0.11 0.16 0.28 0.5 0.67

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)