1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_122 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
Gb_00174 (UPF3)
 0.2 0.63 0.12 0.37 0.18 0.21 8.31 0.18 0.17 0.22 0.27 0.27 0.16 0.27 0.0 0.0 0.12 0.11 0.36 0.29
0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 7.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.77
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 12.41 0.01 0.02 0.0 0.08 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
2.64 2.66 1.25 1.69 1.84 1.9 28.69 2.72 4.56 4.95 5.99 2.65 3.71 1.73 5.95 3.98 4.3 0.76 0.0 0.0
0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.16 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.76 0.93 8717.35 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0
0.04 0.0 0.04 0.0 0.0 0.14 4.6 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.04 0.02 0.02 0.19 0.2 0.04 125.82 0.17 0.17 0.3 0.19 0.07 0.09 0.19 0.1 0.03 0.02 0.09 1.62 0.81
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.38 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1120.7 0.03 0.0 0.04 0.05 0.0 0.35 0.22 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1884.68 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.05 0.0 0.0 0.0 1.39 0.0 22254.47 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Gb_07906 (CDKB2;2)
 5.61 9.23 7.92 1.84 2.19 1.11 20.24 0.75 0.92 0.61 1.83 1.08 1.06 1.14 1.83 0.94 0.41 0.11 0.08 1.84
0.34 0.72 0.56 0.42 0.72 0.83 10.4 0.84 0.55 0.84 0.65 1.01 0.48 0.38 0.8 0.47 0.48 1.53 1.71 1.76
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.56 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.07 0.01 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Gb_09492 (MSL5)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.67 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Gb_09530 (TBP2)
 0.21 0.0 0.2 0.0 0.4 0.0 7.6 0.06 0.03 0.0 0.07 0.09 0.01 0.01 0.1 0.0 0.0 0.0 0.21 0.35
0.23 2.82 1.5 0.61 0.81 0.46 71.99 0.19 0.16 0.22 0.06 0.25 0.0 0.12 0.16 0.1 0.22 0.76 1.21 0.52
1.12 1.85 3.1 1.19 1.91 2.37 39.23 3.06 1.87 2.09 2.45 1.19 1.97 2.04 2.49 1.71 0.85 2.44 4.14 2.66
0.16 0.7 0.16 0.25 0.04 0.09 14.84 0.28 0.3 0.53 0.49 0.2 0.6 0.28 0.0 0.16 0.18 0.07 0.32 0.07
Gb_10002 (DRP4C)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.24 0.48 0.03 2.76 1.7 0.03 3622.86 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.09 0.0 0.34 48.51 3.75
6.86 6.72 6.07 10.16 9.01 13.93 164.73 9.42 3.11 5.31 1.22 18.37 0.75 0.0 1.58 6.57 12.5 5.95 14.2 42.82
0.06 0.0 0.51 0.0 0.25 0.0 29.31 0.12 0.0 0.0 0.12 0.0 0.06 0.09 0.0 0.0 0.18 0.0 0.09 0.22
Gb_13112 (NEK2)
 0.13 0.07 0.33 0.21 0.0 0.74 13.24 0.02 0.04 0.0 0.03 0.0 0.03 0.06 0.09 0.08 0.0 0.09 0.0 0.0
1.22 0.32 0.67 0.69 0.46 0.18 32.33 0.34 0.2 0.29 0.38 0.21 0.21 0.3 0.25 0.0 0.09 0.26 0.37 0.15
0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.28 1840.54 1.03 0.43 0.34 0.06 1.36 0.6 0.79 0.0 3.93 8.93 0.0 0.19 0.05
0.22 0.0 0.32 0.0 0.44 0.07 13.51 0.1 0.04 0.04 0.0 0.05 0.05 0.05 0.05 0.0 0.07 0.59 1.13 0.21
0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.56 37.13 0.12 0.0 0.0 0.12 0.11 0.0 0.02 0.06 0.0 0.07 0.13 0.02 17.22
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.82 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Gb_18506 (CSP3)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 4.82 31.88 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.05
0.1 0.03 0.07 0.05 0.08 0.04 5.73 0.11 0.18 0.13 0.22 0.05 0.12 0.17 0.16 1.23 0.59 0.02 0.0 0.03
Gb_21050 (FAD2)
 6.03 9.04 4.88 5.34 4.66 21.26 56.98 0.22 0.1 0.09 0.13 0.05 0.01 0.01 0.04 0.12 0.15 1.56 0.06 24.37
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.11 0.44 0.09 0.08 0.06 0.0 11.51 0.31 0.35 0.53 0.22 0.13 0.29 0.6 0.24 0.04 0.1 0.54 0.14 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.3 24.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.01 0.0
0.03 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 2.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02
Gb_22916 (BAS1)
 0.01 0.0 0.0 0.0 0.03 0.01 5.69 0.04 0.03 0.03 0.01 0.03 0.02 0.0 0.0 0.0 0.05 0.01 0.0 0.07
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.36 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Gb_24653 (CYP707A3)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 10.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.12
Gb_25061 (UBQ11)
 0.08 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 18.14 0.44 0.16 0.2 0.0 3.5 0.02 0.0 0.05 0.0 0.0 0.38 0.09 0.04
250.88 111.47 258.06 23.26 5.62 771.17 17326.77 1.79 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.66 0.25 3.75
Gb_26167 (TIL)
 55.7 251.66 126.26 58.52 113.72 329.85 614.87 124.67 215.9 221.08 143.63 126.46 105.67 100.63 209.64 264.28 199.59 62.29 50.23 23.87
0.24 0.58 0.11 0.96 0.28 0.52 15.79 0.39 0.6 0.44 0.37 0.25 0.18 0.16 0.74 0.26 1.4 0.0 0.0 1.81
0.07 0.04 0.05 0.21 0.02 2.23 23.9 0.08 0.06 0.05 0.06 0.08 0.01 0.05 0.03 0.24 0.05 0.38 0.51 0.17
0.01 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.25 0.01 0.04 0.01 0.1 0.0 0.02 0.01 0.01 0.02 0.0 0.01 0.03 0.0
0.69 0.93 0.76 0.99 0.43 0.11 28.72 1.25 2.31 2.2 2.72 1.72 0.56 1.18 1.37 1.83 2.7 0.58 0.55 0.29
0.25 0.0 0.06 0.21 0.15 0.17 14.3 1.46 2.92 2.22 3.04 1.82 1.0 1.73 1.44 2.35 3.42 0.18 0.01 0.05
Gb_29249 (RKF3)
 0.15 0.04 0.04 0.72 0.32 0.48 29.42 1.42 2.71 2.33 4.02 2.28 1.32 2.32 2.06 2.14 3.24 0.12 0.0 0.03
0.0 0.02 0.0 0.0 0.05 0.72 1116.82 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Gb_33847 (UGT74D1)
 30.38 13.81 23.88 20.34 15.96 6.87 92.87 8.99 6.89 7.59 22.77 15.93 13.3 10.54 20.35 18.19 15.28 8.82 3.95 12.5
0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.29 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Gb_34495 (TT7)
 4.89 0.99 5.27 1.46 1.64 1.15 58.23 1.2 0.13 0.14 0.09 0.37 0.11 0.35 0.38 0.51 0.99 3.64 7.06 21.1
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.45 0.01 0.0 0.07 0.04 0.0 0.02 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.49 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.07 0.0 0.0 0.0 0.12 16.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0
Gb_39500 (CA4)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.26 0.13 0.11 0.21 0.13 0.18 13.24 0.06 0.05 0.08 0.08 0.07 0.03 0.02 0.08 0.04 0.04 0.2 0.29 0.64
Gb_40301 (ENS)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.04 0.0 0.13 0.0 0.69 0.62 421.25 0.26 0.04 0.07 0.09 0.02 0.0 0.2 0.0 0.06 0.11 0.51 0.14 1.62

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)