Heatmap: Cluster_109 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Ovule	Ovule, mature	Ovule, pollinated	Strobilus, female	Ovulate strobilus	Microstrobilus	Kernel	Leaf	Leaf, female	Leaf, male	Leaf, salicylic acid	Leaf, seedling	Leaf, truncation control	Leaf, truncation treatment	Leaf, water	Yellow-green stripe leaves	Green leaves	Stem	Cambium	Root
Gb_00039	0.68	1.0	0.62	0.26	0.66	0.35	0.32	0.48	0.33	0.36	0.54	0.42	0.38	0.27	0.63	0.26	0.24	0.38	0.64	0.45
Gb_00045 (QPT)	0.99	0.5	1.0	0.65	0.69	0.44	0.56	0.59	0.59	0.61	0.85	0.39	0.56	0.46	0.78	0.65	0.49	0.67	0.38	0.41
Gb_01143	1.0	0.56	0.72	0.0	0.71	0.0	0.11	0.84	0.61	0.15	0.59	0.22	0.85	0.79	0.72	0.58	0.09	0.48	0.23	0.15
Gb_01804	0.9	0.5	1.0	0.32	0.69	0.4	0.26	0.66	0.47	0.4	0.54	0.31	0.68	0.43	0.48	0.34	0.31	0.48	0.12	0.4
Gb_02334	1.0	0.86	0.68	0.73	1.0	0.49	0.54	0.72	0.84	0.69	0.68	0.53	0.7	0.63	0.74	0.83	0.65	0.74	0.6	0.45
Gb_02503 (OTP84)	1.0	0.46	0.68	0.41	0.34	0.04	0.29	0.46	0.46	0.48	0.7	0.15	0.28	0.24	0.45	0.33	0.39	0.16	0.25	0.52
Gb_03846 (EIF3A)	0.94	0.37	0.46	0.42	0.69	0.4	0.65	0.51	0.49	0.44	0.95	0.35	0.43	0.46	1.0	0.68	0.54	0.54	0.35	0.56
Gb_03979	0.55	0.67	1.0	0.39	0.49	0.32	0.47	0.4	0.4	0.36	0.49	0.18	0.27	0.27	0.45	0.25	0.24	0.4	0.47	0.48
Gb_04302 (QPT)	0.94	0.3	1.0	0.41	0.73	0.38	0.48	0.61	0.56	0.51	0.81	0.24	0.57	0.45	0.91	0.37	0.41	0.61	0.22	0.46
Gb_04937	1.0	0.77	0.98	0.56	0.58	0.44	0.18	0.65	0.42	0.4	0.32	0.41	0.64	0.51	0.31	0.24	0.32	0.47	0.23	0.3
Gb_05609	0.48	0.71	0.64	0.36	0.41	0.43	1.0	0.45	0.39	0.34	0.59	0.36	0.35	0.24	0.76	0.44	0.55	0.48	0.31	0.38
Gb_05824	0.27	1.0	0.65	0.22	0.42	0.32	0.22	0.27	0.16	0.14	0.17	0.09	0.16	0.14	0.3	0.12	0.12	0.74	0.3	0.22
Gb_06217	0.3	1.0	0.63	0.45	0.71	0.44	0.13	0.45	0.39	0.43	0.79	0.4	0.37	0.42	0.78	0.19	0.22	0.5	0.66	0.28
Gb_06246	0.58	0.67	1.0	0.16	0.69	0.36	0.33	0.68	0.23	0.17	0.55	0.34	0.27	0.23	0.41	0.28	0.37	0.56	0.0	0.32
Gb_06409	0.54	1.0	0.75	0.21	0.77	0.6	0.69	0.64	0.34	0.43	0.54	0.34	0.36	0.29	0.75	0.32	0.39	0.89	0.58	0.7
Gb_06528	1.0	0.73	0.66	0.79	0.89	0.62	0.45	0.55	0.39	0.29	0.3	0.41	0.68	0.7	0.26	0.25	0.44	0.55	0.52	0.48
Gb_06915	0.35	0.34	0.54	0.53	0.68	0.36	0.4	0.59	0.34	0.32	0.83	0.51	0.5	0.44	1.0	0.21	0.27	0.84	0.89	0.32
Gb_07855 (MFP1)	0.77	0.41	0.56	0.53	0.7	0.49	0.19	0.47	0.28	0.26	0.42	0.21	0.02	0.0	0.63	0.6	0.42	1.0	0.47	0.44
Gb_08301	0.83	0.68	1.0	0.82	0.49	0.39	0.5	0.62	0.52	0.48	0.47	0.3	0.4	0.51	0.51	0.71	0.6	0.45	0.58	0.33
Gb_09584	0.72	0.78	0.69	0.66	0.92	0.66	0.51	0.75	0.66	0.67	1.0	0.57	0.99	0.84	0.95	0.65	0.65	0.81	0.86	0.73
Gb_12161	0.36	0.86	1.0	0.47	0.64	0.36	0.43	0.73	0.37	0.3	0.8	0.42	0.85	0.73	0.84	0.5	0.57	0.56	0.28	0.52
Gb_12632	0.52	0.84	0.57	0.0	1.0	0.23	0.58	0.27	0.13	0.06	0.24	0.16	0.39	0.35	0.27	0.11	0.16	0.28	0.0	0.31
Gb_13287	0.48	0.59	0.85	0.23	0.81	0.2	0.81	0.46	0.31	0.3	1.0	0.33	0.36	0.35	0.82	0.41	0.38	0.55	0.78	0.3
Gb_15142	0.54	0.36	0.48	0.56	0.94	0.18	0.24	0.53	0.64	0.45	0.49	0.25	0.2	0.16	0.47	0.78	1.0	0.43	0.38	0.16
Gb_15724	0.75	1.0	0.76	0.34	0.66	0.5	0.37	0.52	0.3	0.35	0.32	0.17	0.97	0.85	0.38	0.22	0.21	0.58	0.3	0.3
Gb_16340	0.7	0.68	1.0	0.42	0.61	0.38	0.46	0.59	0.42	0.39	0.55	0.41	0.59	0.55	0.58	0.3	0.43	0.45	0.44	0.45
Gb_18345	0.69	0.88	1.0	0.35	0.63	0.24	0.37	0.51	0.5	0.46	0.63	0.3	0.51	0.52	0.35	0.4	0.39	0.46	0.35	0.53
Gb_18590	0.56	0.98	1.0	0.0	0.48	0.22	0.22	0.3	0.11	0.02	0.27	0.17	0.27	0.37	0.37	0.1	0.07	0.27	0.0	0.22
Gb_18973 (APG7)	0.62	1.0	0.83	0.49	0.73	0.4	0.32	0.48	0.4	0.36	0.57	0.36	0.44	0.31	0.52	0.54	0.38	0.52	0.56	0.52
Gb_19801 (GRF12)	0.59	0.53	0.65	0.54	0.63	0.23	0.44	0.5	0.46	0.43	1.0	0.47	0.55	0.48	0.94	0.42	0.48	0.56	0.46	0.58
Gb_21483 (CSTF77)	0.97	0.55	0.72	1.0	0.8	0.44	0.58	0.57	0.47	0.44	0.84	0.31	0.58	0.56	0.83	0.61	0.35	0.69	0.37	0.5
Gb_22796	0.76	0.43	0.74	0.97	0.62	0.3	0.31	0.5	0.46	0.43	0.74	0.37	0.84	1.0	0.75	0.48	0.42	0.62	0.87	0.71
Gb_24669 (PEX2)	0.74	0.71	0.83	0.84	1.0	0.65	0.52	0.6	0.56	0.51	0.92	0.48	0.65	0.55	0.92	0.52	0.59	0.77	0.58	0.6
Gb_25716	0.7	0.51	0.63	0.48	0.55	0.14	0.23	0.57	0.53	0.56	1.0	0.4	0.69	0.66	0.94	0.58	0.56	0.6	0.16	0.39
Gb_26680 (ELP3)	0.9	0.8	1.0	0.45	0.84	0.34	0.27	0.58	0.41	0.36	0.37	0.35	0.5	0.37	0.37	0.4	0.62	0.53	0.26	0.33
Gb_26882	0.42	0.63	1.0	0.37	0.62	0.47	0.61	0.42	0.45	0.52	0.74	0.65	0.25	0.35	0.74	0.53	0.55	0.48	0.45	0.45
Gb_27659	0.76	1.0	0.64	0.74	0.68	0.24	0.58	0.5	0.28	0.17	0.47	0.25	0.74	0.52	0.41	0.28	0.39	0.45	0.7	0.32
Gb_27860	0.92	0.85	0.8	0.32	0.83	0.66	0.62	0.98	0.38	0.37	1.0	0.56	0.86	0.61	0.98	0.47	0.51	0.81	0.49	0.67
Gb_28686	0.72	1.0	0.67	0.35	0.48	0.53	0.71	0.68	0.34	0.31	0.64	0.3	0.76	0.65	0.67	0.28	0.42	0.61	0.27	0.72
Gb_28736	0.47	0.73	0.55	0.41	0.43	0.33	1.0	0.55	0.7	0.55	0.93	0.48	0.6	0.48	0.86	0.57	0.5	0.45	0.58	0.33
Gb_29401 (ACS)	0.63	0.48	0.48	0.39	0.58	0.81	0.2	0.7	0.4	0.41	1.0	0.49	0.89	0.52	0.88	0.26	0.45	0.45	0.26	0.52
Gb_29621	0.91	0.8	1.0	0.61	0.85	0.6	0.75	0.8	0.76	0.62	1.0	0.57	0.76	0.81	0.83	0.72	0.58	0.75	0.73	0.79
Gb_29665	1.0	0.55	0.81	0.76	0.84	0.43	0.41	0.69	0.76	0.6	0.87	0.48	0.43	0.57	0.73	0.95	0.74	0.86	0.27	0.58
Gb_30671	0.63	0.21	0.48	0.43	0.76	0.33	0.49	0.56	0.58	0.55	1.0	0.42	0.46	0.38	0.89	0.56	0.53	0.53	0.3	0.6
Gb_30781	0.56	0.54	0.54	0.44	0.51	0.23	0.59	0.49	0.48	0.48	1.0	0.42	0.52	0.54	0.87	0.53	0.47	0.44	0.41	0.45
Gb_31899	0.47	0.38	0.29	0.26	0.59	0.31	0.42	0.62	0.43	0.51	1.0	0.38	0.49	0.42	0.82	0.38	0.47	0.69	0.33	0.4
Gb_32772	0.94	1.0	0.97	0.39	0.64	0.12	0.54	0.33	0.31	0.27	0.45	0.13	0.48	0.34	0.47	0.52	0.12	0.32	0.3	0.33
Gb_32792	0.72	0.59	1.0	0.56	0.85	0.28	0.8	0.57	0.51	0.49	0.9	0.6	0.45	0.37	0.97	0.61	0.57	0.52	0.66	0.55
Gb_33226	0.31	1.0	0.67	0.29	0.75	0.26	0.52	0.35	0.23	0.2	0.44	0.28	0.43	0.33	0.55	0.24	0.22	0.35	0.36	0.34
Gb_33251	0.49	0.76	0.61	0.41	1.0	0.38	0.74	0.37	0.39	0.37	0.52	0.38	0.25	0.2	0.59	0.28	0.31	0.46	0.68	0.52
Gb_34407	0.61	0.91	0.63	0.24	0.61	0.48	0.78	0.61	0.45	0.44	0.83	0.44	0.12	0.1	1.0	0.46	0.29	0.77	0.87	0.68
Gb_34795	0.47	0.55	0.49	0.2	0.37	0.25	0.55	0.49	0.39	0.46	1.0	0.33	0.32	0.26	0.83	0.48	0.38	0.41	0.26	0.42
Gb_37130 (ARI8)	0.75	0.76	0.77	0.46	0.88	0.55	0.43	0.63	0.47	0.45	0.74	0.44	0.36	0.35	0.75	0.41	0.52	0.78	0.74	1.0
Gb_37546	0.76	1.0	0.96	0.17	0.43	0.26	0.14	0.47	0.47	0.32	0.89	0.31	0.47	0.39	0.82	0.13	0.3	0.22	0.15	0.17
Gb_38734 (ARA7)	0.38	0.53	0.43	0.4	0.73	0.73	0.33	0.77	0.63	0.64	0.96	0.65	0.77	0.75	0.93	0.63	0.68	0.87	1.0	0.92
Gb_39850	0.67	0.8	1.0	0.44	0.39	0.31	0.45	0.7	0.43	0.41	0.62	0.41	0.68	0.68	0.62	0.26	0.39	0.44	0.18	0.37
Gb_40412 (EMB2753)	0.94	0.43	0.68	0.49	0.65	0.32	0.54	0.72	0.48	0.45	0.94	0.34	0.78	0.61	1.0	0.44	0.46	0.69	0.48	0.59
Gb_41189 (TDT)	0.46	1.0	0.77	0.34	0.78	0.19	0.44	0.58	0.4	0.33	0.72	0.51	0.47	0.43	0.76	0.61	0.33	0.59	0.58	0.64

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)