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Heatmap: Cluster_41 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
Gb_00344 (SUS2)
 1.05 -0.21 0.13 0.73 0.42 -1.21 -0.58 -0.35 -0.2 -0.43 0.57 -1.04 -0.61 -0.98 0.54 0.44 -0.13 -0.38 0.01 -0.28
Gb_00926 (CPK17)
 0.33 0.15 0.09 0.36 0.14 1.0 -0.18 -0.31 -0.97 -0.9 -0.28 -0.88 -0.78 -1.04 -0.16 -0.91 -1.11 0.52 1.06 0.68
0.1 -0.04 0.03 0.1 0.3 0.02 0.74 -0.33 -0.48 -0.42 0.51 -0.69 -0.57 -0.7 0.61 -0.58 -0.7 0.2 0.3 0.23
1.07 -0.78 0.15 0.99 0.33 -1.36 -0.61 -0.37 -0.15 -0.32 0.33 -1.08 -0.46 -0.54 0.11 0.49 -0.21 -0.16 -0.01 0.08
1.15 0.03 0.35 0.91 0.2 -2.02 -1.05 -0.4 -0.27 -0.28 0.3 -1.0 -0.85 -1.2 0.47 0.52 -0.8 0.3 0.41 -0.64
0.4 0.39 0.38 0.52 0.53 0.55 -0.21 -0.24 -0.85 -0.83 -0.12 -1.04 -0.56 -0.62 -0.26 -1.42 -1.04 0.52 0.89 0.22
0.95 -0.1 0.02 0.93 0.66 0.39 0.6 -0.33 -0.97 -1.05 0.39 -1.31 -1.37 -1.32 0.21 -0.3 -0.29 0.16 -0.0 -0.67
Gb_03025 (TAF5)
 -0.12 0.86 0.17 -0.07 -0.28 -0.82 0.47 -0.0 -0.15 -0.08 0.46 -1.16 -0.25 -0.8 0.71 -0.75 -1.55 -1.22 1.19 0.05
0.28 -0.1 0.17 0.36 0.17 0.47 1.06 -0.43 -0.3 -0.37 -0.06 -0.84 -0.9 -1.03 0.06 -0.21 -0.45 0.15 0.3 0.0
0.45 0.05 -0.68 0.26 0.28 -0.88 0.07 -0.24 -0.25 -0.34 0.81 -0.85 -0.06 -0.45 0.77 -0.13 -0.61 -0.36 0.4 0.14
Gb_03648 (ELF7)
 0.84 0.01 0.23 0.53 0.57 -0.21 -0.42 -0.12 -0.3 -0.58 0.21 -0.73 -0.41 -0.59 0.2 -0.12 -0.27 -0.07 0.3 -0.25
-0.04 -0.48 -0.5 -0.21 0.24 -0.35 -0.03 -0.1 -0.06 -0.22 0.4 -0.5 0.01 -0.23 0.39 -0.19 -0.2 0.06 0.89 0.28
1.04 0.23 0.63 -0.13 0.37 -1.18 -0.23 -0.36 -0.19 -0.34 0.37 -1.55 -0.2 -0.36 0.19 -0.11 -0.5 -0.13 -0.11 0.45
0.67 0.26 0.18 0.66 0.36 -0.26 -0.2 -0.22 -0.48 -0.67 0.07 -0.9 -0.23 -0.33 -0.05 -0.25 -0.19 0.2 0.31 0.0
Gb_04165 (HVE)
 0.7 -0.44 0.03 0.73 0.62 -0.86 0.0 -0.16 -0.24 -0.43 0.21 -0.94 -0.61 -0.77 0.11 -0.08 -0.36 0.31 0.26 0.3
0.96 0.18 0.31 0.91 0.52 -0.43 0.12 -0.16 -0.4 -0.57 -0.09 -0.95 -0.92 -1.06 -0.19 -0.47 -0.69 0.02 0.89 -0.58
Gb_04554 (CID7)
 0.12 -0.46 -0.39 0.35 -0.09 -0.21 -0.32 0.13 -0.26 -0.36 0.61 -0.68 0.03 -0.21 0.58 -0.43 -0.7 0.14 0.71 0.28
Gb_04695 (SLK2)
 0.38 0.6 -0.14 -0.21 0.29 -0.77 0.05 -0.19 -0.15 -0.39 0.35 -0.68 -0.13 -0.35 0.36 -0.13 -0.4 -0.17 0.65 0.0
0.92 -0.05 0.17 0.43 0.16 -0.76 -0.22 -0.32 -0.58 -0.55 0.82 -1.68 -0.49 -0.82 0.94 -0.58 -0.68 -0.4 0.15 0.6
0.3 -0.26 -0.58 0.17 0.06 -0.26 0.29 -0.04 -0.32 -0.42 0.56 -0.54 -0.26 -0.79 0.51 -0.07 -0.06 -0.24 0.42 0.49
Gb_05124 (FCA)
 0.99 -0.01 0.55 0.87 0.5 -1.07 -0.15 -0.23 -0.44 -0.58 -0.08 -1.08 0.01 -0.08 -0.03 -0.61 -0.65 -0.15 0.28 -0.15
0.28 -0.41 -0.25 0.7 0.96 0.08 0.03 -0.3 -0.88 -0.95 -0.39 -0.6 -0.14 -0.52 -0.49 -1.73 -1.41 0.53 0.83 1.02
0.27 0.4 -0.39 0.15 0.36 -0.76 0.76 -0.27 -0.38 -0.35 0.24 -1.05 -0.1 -0.34 0.38 -0.11 -1.04 -0.0 0.69 -0.11
Gb_05581 (ERF9)
 1.08 0.33 0.18 0.61 0.64 0.41 1.03 -1.14 -1.43 -1.54 -0.73 -1.66 -2.01 -1.99 -0.68 -0.77 -1.47 -0.35 1.22 0.83
Gb_05612 (CDC5)
 0.54 0.11 -0.1 0.79 0.21 -0.51 0.34 -0.41 -0.57 -0.65 0.44 -1.08 -0.29 -0.69 0.47 -0.23 -0.51 0.14 0.56 -0.27
-0.14 -0.37 -0.78 -0.3 0.45 0.02 0.55 -0.1 -0.19 -0.29 0.02 -0.57 0.39 0.32 0.12 -0.42 -0.65 0.49 0.3 0.13
Gb_07421 (PTB2)
 0.67 0.36 0.22 0.54 0.89 0.95 0.37 -0.21 -0.67 -0.7 -0.15 -1.38 -0.98 -1.11 0.04 -1.51 -1.31 0.02 0.26 0.08
0.81 -0.4 0.67 0.45 0.26 0.63 0.88 -0.5 -0.71 -0.98 -0.58 -1.2 -1.21 -1.23 -0.77 -0.69 -0.49 0.09 0.66 0.67
Gb_08409 (ILP1)
 0.55 0.0 0.05 0.51 0.04 -0.52 -0.11 -0.17 -0.35 -0.54 0.61 -0.58 0.11 -0.25 0.47 -0.61 -0.6 0.04 0.54 -0.39
Gb_08728 (CUL4)
 0.07 -0.01 -0.29 0.05 0.12 -0.46 0.44 -0.16 -0.01 -0.25 0.54 -0.9 -0.61 -0.77 0.58 -0.02 -0.58 0.12 0.74 0.1
Gb_09312 (RAPTOR1)
 0.82 -0.38 -0.18 0.27 0.36 -0.74 0.19 -0.23 -0.11 -0.31 0.33 -0.61 0.06 -0.15 0.07 -0.21 -0.3 0.25 0.24 -0.3
0.61 -0.32 -0.31 0.41 0.4 -0.52 0.31 -0.36 -0.41 -0.47 0.4 -1.18 -0.66 -0.88 0.33 -0.36 -0.59 0.13 1.15 0.12
Gb_09497 (MRE11)
 1.01 -0.01 0.55 0.89 0.73 -0.36 0.83 -0.96 -1.33 -1.38 -0.28 -1.57 -0.73 -1.49 -0.29 -0.74 -1.85 -0.16 0.67 0.9
0.35 0.67 0.33 0.09 -0.22 -0.14 0.9 0.33 -0.25 -0.06 -1.07 -1.61 0.24 -0.71 -1.09 -0.1 0.08 -0.67 0.61 -0.12
0.55 0.34 0.0 0.45 0.36 -0.47 0.18 -0.45 -0.64 -0.85 0.26 -1.02 -0.41 -0.71 0.19 -0.06 -0.4 -0.14 0.92 0.15
0.65 -0.08 0.34 0.21 0.35 0.29 -0.05 -0.04 -0.39 -0.57 -0.38 -0.39 -0.52 -0.75 -0.38 -0.57 -0.15 0.23 0.7 0.27
1.05 -0.02 0.3 0.66 0.71 -0.81 0.36 -0.45 -0.59 -0.79 0.13 -1.06 -1.32 -1.56 0.08 -0.26 -0.8 0.3 0.69 0.07
0.55 0.12 -0.32 0.12 -0.01 -0.3 0.56 -0.24 -0.47 -0.6 0.65 -0.62 -0.13 -0.19 0.6 -0.56 -0.72 0.06 0.15 0.1
-0.28 -0.36 -0.49 0.09 0.42 0.79 0.31 -0.14 -0.46 -0.47 0.6 -0.51 -0.49 -0.61 0.56 -0.44 -0.16 -0.07 0.2 0.21
-0.04 -1.21 -0.96 0.12 0.37 -0.78 -0.22 -0.59 -0.3 -0.17 0.4 -0.2 -0.01 -0.32 0.77 0.58 -0.77 0.03 0.98 0.18
Gb_11021 (KEG)
 0.29 -0.28 -0.55 -0.01 0.52 -0.33 0.37 -0.19 -0.16 -0.37 -0.15 -0.58 0.16 -0.05 -0.2 -0.03 -0.65 0.45 0.72 0.09
Gb_11357 (ERMO2)
 0.55 -0.58 -0.26 0.63 0.56 0.01 0.2 -0.17 -0.48 -0.54 0.35 -0.98 -0.97 -0.91 0.45 -0.59 -0.67 0.68 0.52 0.06
Gb_11687 (CTR1)
 0.56 -0.59 -0.28 0.36 0.37 -0.42 0.64 -0.3 -0.42 -0.24 0.37 -0.98 -0.34 -0.6 0.34 -0.32 -0.48 0.31 0.48 0.13
Gb_11947 (PRT6)
 0.53 -0.95 -0.65 0.46 0.71 0.76 0.17 -0.32 -0.47 -0.77 0.15 -0.96 -0.36 -0.59 0.09 -0.05 -0.44 0.05 0.49 0.25
Gb_12505 (BSL3)
 0.13 -0.53 -0.68 -0.38 0.32 0.31 0.41 -0.25 -0.45 -0.44 0.42 -0.7 0.12 -0.08 0.42 -0.38 -0.28 0.45 0.11 0.43
0.17 -0.21 -0.47 0.25 0.05 0.21 0.62 -0.2 -0.38 -0.5 0.54 -0.68 -0.83 -1.23 0.58 -0.11 -0.31 -0.15 0.92 -0.11
Gb_14196 (UPL5)
 0.13 -0.07 -0.43 0.14 0.41 -0.23 0.14 -0.12 -0.33 -0.36 0.4 -0.53 -0.54 -0.63 0.31 -0.02 -0.23 0.22 0.87 -0.16
Gb_14475 (TOR)
 0.35 -1.21 -1.2 0.32 0.19 -1.58 -0.7 -0.56 -0.21 -0.16 0.83 -1.33 -0.19 -0.5 0.95 0.47 -0.13 -0.5 1.38 -0.35
0.68 0.56 -0.24 0.47 0.53 0.33 -0.04 -0.16 -0.64 -0.74 -0.02 -1.28 0.24 -0.22 0.03 -1.07 -1.37 0.02 0.78 -0.27
0.34 0.57 -0.4 0.07 0.51 -0.02 0.43 -0.09 -0.58 -0.6 -0.11 -0.75 -0.27 -0.69 -0.07 -0.52 -0.97 0.3 0.92 0.2
-0.27 -0.81 -1.7 0.17 0.4 -1.02 0.01 -0.58 -0.43 -0.61 0.55 -0.21 -0.42 -0.38 0.73 0.3 -0.57 0.27 1.31 0.25
-0.2 -1.28 -0.66 -1.0 0.58 -0.28 0.08 -0.34 0.01 -0.34 0.55 -0.23 -0.94 -0.67 0.91 0.13 -1.76 -0.28 1.57 0.13
-0.08 0.03 -0.98 -0.23 0.43 -0.51 -0.11 -0.34 -0.37 -0.7 0.43 -0.45 -0.05 -0.48 0.48 -0.1 -1.37 0.23 1.58 -0.18
Gb_15358 (HSF3)
 -0.03 0.19 -0.42 -0.27 0.16 0.28 0.76 -0.23 -0.3 -0.35 0.41 -0.86 -0.39 -0.63 0.41 -0.27 0.03 -0.0 0.5 -0.08
-0.04 -0.32 -1.32 0.01 0.11 -0.03 0.27 -0.36 -0.31 -0.32 0.19 -0.92 -0.05 -0.58 0.39 -0.01 -0.67 0.15 1.31 0.41
0.73 -0.26 -0.26 0.69 0.6 -0.53 0.53 -0.09 -0.45 -0.74 -0.04 -0.75 -0.27 -0.35 -0.09 -0.01 -0.39 0.38 0.31 -0.48
0.18 -0.68 -0.67 0.5 0.65 0.13 0.61 -0.12 -0.82 -0.87 -0.06 -0.84 -0.56 -0.99 -0.08 -0.4 -0.35 0.93 0.8 0.2
Gb_16689 (AXR6)
 0.36 -0.39 0.0 0.19 0.49 -0.11 0.48 0.01 -0.44 -0.54 0.32 -0.47 -1.13 -1.19 0.23 -0.4 -0.14 0.43 0.57 0.17
Gb_16752 (MOS1)
 0.9 -0.01 -0.15 0.77 0.47 -0.71 -0.07 -0.33 -0.46 -0.69 0.28 -1.26 -0.18 -0.33 0.25 0.24 -0.32 -0.08 0.34 -0.39
Gb_16787 (SFR6)
 -0.1 -0.06 -0.71 -0.12 0.21 0.38 0.52 -0.27 -0.18 -0.26 0.08 -0.66 0.17 0.06 0.06 -0.26 -0.53 0.07 0.37 0.45
0.61 0.57 0.46 0.61 0.27 -0.97 0.0 -0.39 -0.59 -0.76 0.09 -0.7 -0.14 -0.23 0.1 -0.6 -0.69 -0.25 0.65 0.18
0.31 -0.14 -0.07 0.33 0.57 0.4 0.3 -0.23 -0.83 -0.71 0.13 -0.82 -0.49 -0.79 0.27 -0.83 0.18 0.27 0.74 -0.22
Gb_17176 (UPL5)
 0.03 -0.03 -1.03 -0.15 0.41 -0.43 0.44 -0.35 -0.21 -0.25 0.34 -0.73 -0.49 -0.74 0.37 -0.07 -0.29 -0.07 1.42 -0.29
Gb_17348 (PAB6)
 1.03 -0.15 0.33 0.91 0.06 -0.86 0.14 -0.28 -0.45 -0.57 -0.2 -1.25 0.28 -0.09 -0.23 -0.5 -0.81 -0.23 0.48 0.23
Gb_17412 (ELF8)
 0.63 0.11 0.14 0.32 0.54 -0.96 0.58 -0.33 -0.35 -0.6 0.01 -0.77 -0.35 -0.48 0.04 0.0 -0.23 0.03 0.41 -0.01
Gb_17424 (UPL1)
 1.15 -0.43 -0.45 1.12 0.35 -0.3 -0.38 -0.48 -0.47 -0.74 -0.19 -1.05 -0.49 -0.72 -0.09 0.27 -0.45 -0.05 1.0 -0.48
0.31 -0.15 0.06 -0.15 -0.44 -0.06 -0.13 0.17 -0.32 -0.27 0.36 -1.16 -0.33 -0.8 0.64 -0.99 -0.83 0.25 1.08 0.62
0.54 -0.53 0.01 0.18 0.21 0.57 0.09 0.02 -0.51 -0.81 -0.09 -0.66 -0.41 -0.53 -0.2 -0.5 0.18 0.34 0.65 0.23
0.56 -0.17 -0.33 0.35 0.49 -0.83 0.13 -0.32 -0.49 -0.74 0.5 -0.98 -0.38 -0.54 0.49 -0.62 -1.16 0.06 1.27 0.08
1.11 0.16 0.32 0.8 0.68 -1.27 0.09 -0.43 -0.28 -0.34 -0.09 -1.08 0.15 -0.2 -0.07 -0.44 -1.11 -0.54 0.1 -0.02
0.5 -0.19 -0.03 0.06 0.35 -0.8 0.41 -0.17 -0.38 -0.39 0.49 -0.73 -0.25 -0.55 0.51 -0.26 -0.49 -0.03 0.8 -0.21
0.83 0.35 -0.02 0.43 0.25 -0.96 -0.23 -0.46 -0.15 -0.49 0.33 -1.23 -0.41 -0.65 0.26 0.5 -0.16 -0.25 0.25 0.16
Gb_19472 (PAT2)
 0.64 -0.18 0.01 0.57 0.93 0.47 0.36 -0.34 -0.68 -0.86 -0.26 -0.73 -0.88 -0.95 -0.36 -0.69 -0.71 0.45 0.52 0.29
0.45 0.18 -0.41 0.49 0.77 0.1 0.33 -0.16 -0.61 -0.74 -0.2 -0.87 -0.18 -0.23 -0.23 -0.8 -0.83 0.58 0.28 0.4
Gb_19667 (RGD3)
 1.05 -0.16 -0.04 0.7 0.45 -0.05 -0.37 -0.35 -0.43 -0.59 0.2 -0.94 -0.46 -0.59 0.29 0.01 -0.26 0.12 0.26 -0.44
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Gb_20276 (KAK)
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Gb_23784 (MIA)
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Gb_25624 (RAD4)
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Gb_27895 (emb1507)
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Gb_28187 (SEC5B)
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Gb_28529 (PUM2)
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Gb_29862 (SIZ1)
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Gb_30550 (GCT)
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Gb_36567 (SWP)
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Gb_36757 (NUA)
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Gb_36990 (BSL1)
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Gb_38621 (CEF)
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Gb_39639 (PK1B)
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0.36 -0.36 -0.99 0.51 1.14 0.1 0.91 -0.4 -1.17 -1.1 -0.37 -1.02 -0.68 -0.94 -0.19 -0.81 -1.03 0.73 0.62 0.71
Gb_41266 (HAC1)
 0.33 -1.03 -0.64 0.42 -0.43 -0.11 0.05 -0.06 -0.22 -0.25 0.98 -0.51 0.32 0.16 0.69 -0.47 -0.92 -0.9 0.47 0.1
Gb_41268 (HAC12)
 0.25 -0.24 -0.2 -0.19 0.26 0.91 0.14 -0.11 -0.32 -0.7 0.39 -0.71 0.31 -0.28 0.29 -0.62 -1.59 -0.32 0.92 -0.27
1.05 -0.04 -0.07 1.01 0.57 -0.39 0.19 -0.25 -0.68 -0.83 -0.0 -1.0 -0.31 -0.63 -0.11 -0.49 -0.64 0.22 0.38 -0.16
0.02 -0.25 -0.39 -0.13 0.43 -0.32 0.62 -0.14 -0.2 -0.33 0.34 -0.58 -0.4 -0.63 0.27 -0.14 -0.22 0.1 0.66 0.31

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.