1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_152 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
Gb_01902 (RLP53)
 0.1 0.0 0.0 0.0 0.03 0.22 0.01 1.37 1.05 0.83 1.07 0.42 1.1 0.42 0.71 0.04 0.42 0.03 0.01 0.12
Gb_02223 (EP3)
 61.6 6.73 5.64 1.56 1.92 28.26 18.6 102.92 51.86 42.11 72.19 90.8 197.22 303.19 44.36 1.11 17.35 22.67 22.95 150.62
Gb_02719 (SSL4)
 0.59 5.16 12.63 3.0 0.54 10.38 5.75 27.78 6.09 6.59 11.74 21.89 35.71 33.2 4.06 0.11 4.94 0.1 0.0 4.62
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.14 1.67 1.98 0.96 2.33 0.41 4.77 2.95 1.0 0.11 0.26 0.0 0.0 0.26
0.07 0.0 0.0 0.03 0.02 1.7 0.04 23.57 10.74 10.24 26.31 5.44 27.94 11.29 11.56 0.0 2.86 0.01 0.0 0.0
Gb_05285 (RLP15)
 0.35 0.12 0.02 0.51 0.75 0.27 0.0 23.67 11.94 8.47 14.21 3.42 30.82 11.22 8.48 0.74 3.41 0.35 0.02 0.24
0.46 0.18 0.17 1.05 0.3 1.94 0.17 7.4 3.75 3.46 4.74 3.48 8.04 4.42 2.18 0.4 1.56 0.18 0.16 0.44
Gb_06804 (CCR1)
 2.15 1.59 0.97 1.05 0.74 1.63 0.26 22.04 6.21 6.89 10.33 12.89 44.08 42.45 4.34 1.38 8.34 1.96 2.13 5.43
Gb_07082 (CRK25)
 0.1 0.05 0.09 0.07 0.22 0.2 0.06 11.6 5.14 7.89 3.32 3.01 15.22 7.02 2.4 0.09 1.62 0.32 0.06 2.74
Gb_08283 (CRK2)
 0.24 0.0 0.1 0.03 0.03 0.63 0.04 1.53 1.51 1.41 0.91 0.17 2.65 2.1 0.65 0.07 0.51 0.02 0.02 0.39
Gb_08868 (MLO12)
 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.22 0.04 0.05 0.46 0.05 2.4 0.71 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Gb_10836 (CRK2)
 6.31 11.08 6.86 4.35 3.63 2.52 0.24 14.25 2.39 1.69 6.66 7.16 17.78 11.76 11.7 7.4 7.97 1.13 0.15 0.17
0.53 0.59 0.0 0.08 0.0 13.81 0.0 280.46 98.92 171.52 29.09 25.68 572.54 418.27 25.3 0.29 1.51 0.25 0.01 2.88
0.06 0.19 1.18 0.11 0.25 1.43 0.06 3.31 3.4 4.49 5.86 0.35 18.07 4.97 3.31 0.0 0.02 0.02 0.69 1.08
Gb_13103 (RLK4)
 0.35 0.21 0.02 0.11 0.19 0.92 0.06 3.01 0.78 0.96 0.87 1.14 3.22 3.73 0.35 0.17 1.84 0.46 0.05 0.49
Gb_13104 (RLK4)
 0.24 0.38 0.23 0.31 0.62 0.37 0.0 1.75 0.51 0.45 0.49 0.98 2.2 2.78 0.25 0.15 0.55 0.21 0.02 0.18
0.03 0.04 0.03 0.12 0.0 0.14 0.0 0.91 0.2 0.26 0.3 0.33 1.42 1.05 0.15 0.06 0.49 0.02 0.0 0.0
0.04 0.06 0.05 0.3 0.04 0.03 0.68 1.32 0.44 0.35 1.41 0.52 8.15 5.21 0.74 0.02 0.0 0.1 0.0 0.14
Gb_13868 (CML43)
 0.23 0.91 0.88 0.44 0.24 1.79 0.03 13.91 7.75 9.27 15.68 7.6 33.57 33.97 7.68 0.0 0.57 0.55 0.05 1.98
0.1 0.15 0.15 0.11 0.28 0.17 0.02 26.7 18.75 19.64 21.35 25.75 32.28 27.08 14.87 0.22 2.32 0.79 0.0 0.06
Gb_14513 (RLP21)
 0.16 0.0 0.0 0.26 0.17 0.1 0.0 9.95 1.89 3.1 4.11 0.82 22.67 8.81 2.2 0.1 0.4 0.0 0.0 0.06
0.3 0.12 0.09 0.39 0.74 0.55 0.01 19.34 5.35 8.01 7.6 2.51 22.57 10.69 4.42 0.37 1.2 0.1 0.01 0.22
0.02 0.46 0.62 0.53 0.09 0.05 0.05 0.92 0.22 0.1 0.23 0.29 0.3 0.45 0.11 0.0 0.06 0.14 0.02 0.0
0.85 0.49 1.56 2.96 1.46 0.8 0.07 3.57 1.57 1.75 1.04 2.15 6.47 2.73 0.19 1.7 2.06 0.68 0.14 0.22
Gb_16449 (C4H)
 6.87 2.93 1.61 0.16 0.52 5.43 0.75 16.26 3.18 2.73 12.37 11.21 29.8 31.59 7.18 0.1 0.57 4.72 3.9 26.0
0.06 0.73 0.02 0.0 0.07 0.53 0.03 2.34 0.99 1.09 1.58 0.75 7.68 7.46 1.09 0.23 0.73 0.74 0.0 1.04
Gb_17188 (RLP35)
 1.59 0.34 0.92 1.43 0.59 0.49 0.12 7.6 2.44 2.53 2.98 1.76 6.9 4.93 1.8 0.26 1.04 0.18 0.07 0.3
0.98 5.79 0.0 9.48 3.17 6.75 47.96 34.41 16.49 15.19 22.54 32.0 121.2 126.48 5.41 2.76 17.16 2.57 2.96 1.7
Gb_20859 (RLP22)
 1.2 0.46 0.3 0.65 0.49 0.98 0.17 1.59 1.13 1.14 1.71 0.47 0.76 0.43 1.15 0.33 0.47 0.39 0.12 0.79
0.25 0.67 0.0 0.0 0.11 0.96 9.07 18.91 3.77 3.17 18.71 6.84 151.22 112.74 11.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
150.44 588.07 786.96 185.34 66.52 256.27 49.09 2749.57 1027.18 1164.7 1306.19 1642.35 5052.73 4905.28 716.58 57.99 1209.1 28.36 0.23 17.99
0.02 0.0 0.22 0.21 0.26 0.05 0.0 16.3 9.48 6.94 4.21 4.58 33.11 18.09 3.36 0.39 2.19 0.25 0.0 0.17
1.75 0.37 4.07 0.54 3.48 75.18 0.48 74.94 6.76 5.71 15.53 84.26 27.47 41.36 7.33 5.53 49.3 7.78 22.73 1.92
Gb_24536 (TT7)
 0.23 0.4 0.09 0.03 0.05 2.66 0.39 10.73 7.14 6.07 5.35 6.9 13.16 14.84 2.99 0.37 13.33 0.03 0.0 0.82
14.92 24.26 5.54 8.87 7.61 79.82 14.68 229.63 76.88 87.14 228.9 198.35 447.97 737.74 108.71 1.4 74.45 8.52 0.25 89.8
Gb_25990 (MLO6)
 0.1 0.0 0.0 0.0 0.04 0.03 0.01 0.11 0.04 0.03 0.18 0.04 0.96 0.33 0.03 0.0 0.01 0.0 0.0 0.05
Gb_26096 (HRE2)
 13.97 24.85 19.09 9.22 4.19 1.5 1.27 21.9 10.99 8.38 9.8 7.02 36.0 30.97 4.78 2.15 10.37 0.7 0.05 0.16
Gb_28651 (CRK5)
 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.12 14.18 13.14 15.07 2.98 0.6 132.83 27.12 2.84 2.17 4.11 0.07 0.03 2.33
0.0 0.82 0.0 0.0 0.0 4.38 4.65 9.93 10.01 13.53 3.94 0.09 43.82 9.43 1.31 0.6 1.31 0.0 0.0 12.84
1.9 0.18 0.5 0.13 0.16 0.52 0.28 3.67 2.84 2.98 1.34 0.8 6.13 4.49 1.27 0.29 1.95 0.65 0.81 0.74
Gb_30008 (CRK2)
 1.77 0.76 0.54 0.47 0.37 0.46 0.12 2.22 0.93 1.1 1.72 0.86 4.57 2.37 0.82 0.01 0.3 0.07 0.01 0.27
Gb_30448 (AMY1)
 5.57 8.51 2.16 3.59 4.29 6.02 2.97 28.62 3.74 4.98 5.8 16.5 15.5 24.59 2.46 2.43 35.6 0.95 0.42 0.61
17.72 44.28 9.93 3.02 4.93 18.72 17.22 79.16 20.28 17.72 55.78 50.73 167.57 174.42 28.21 1.41 7.01 3.21 0.01 9.37
0.0 0.1 0.0 0.0 0.31 1.55 0.01 5.02 1.15 1.14 0.32 0.69 6.54 7.68 0.16 0.06 1.1 0.27 0.0 0.59
Gb_35037 (CRK26)
 0.88 1.74 0.28 0.33 0.6 3.76 0.03 14.0 2.89 3.22 6.15 8.39 14.12 11.1 3.04 0.26 2.25 0.3 0.02 1.98
Gb_35038 (CRK15)
 0.2 0.16 0.05 0.05 0.12 0.7 0.03 2.52 0.81 1.09 1.59 1.61 3.34 2.48 0.65 0.07 0.3 0.04 0.01 0.08
Gb_37058 (MLO6)
 0.05 0.02 0.0 0.0 0.0 0.09 0.03 0.16 0.04 0.06 0.13 0.06 0.77 0.12 0.05 0.01 0.03 0.02 0.0 0.04
Gb_37863 (GST29)
 10.13 8.2 6.84 7.35 5.98 32.05 12.74 68.78 28.86 35.25 56.21 77.02 64.42 70.59 27.02 12.14 135.64 17.86 16.39 75.27
Gb_38916 (C4H)
 8.64 1.2 1.83 0.0 0.39 7.74 0.33 14.98 4.07 4.13 9.96 10.93 18.94 19.83 5.29 0.1 0.47 3.3 2.29 17.75
Gb_40308 (MLO6)
 0.54 0.3 0.02 0.0 0.43 0.27 0.05 0.84 0.28 0.43 1.09 0.34 5.31 1.76 0.35 0.02 0.05 0.02 0.01 0.24
Gb_40309 (MLO8)
 0.6 0.12 0.04 0.0 0.0 0.08 0.0 0.97 0.43 0.34 1.2 0.4 10.08 3.88 0.14 0.05 0.0 0.13 0.04 0.52

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)