Heatmap: Cluster_147 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Ovule	Ovule, mature	Ovule, pollinated	Strobilus, female	Ovulate strobilus	Microstrobilus	Kernel	Leaf	Leaf, female	Leaf, male	Leaf, salicylic acid	Leaf, seedling	Leaf, truncation control	Leaf, truncation treatment	Leaf, water	Yellow-green stripe leaves	Green leaves	Stem	Cambium	Root
Gb_00202	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.87	0.06	1.0	0.26	0.0	0.0	0.4	0.68	0.0	0.0	0.0	0.0	0.16	0.0
Gb_00758	0.3	0.42	0.12	0.5	1.0	0.61	0.0	0.18	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.08	0.05	0.49	0.0	0.03
Gb_00791	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_01074 (XYL1)	0.33	1.0	0.71	0.49	1.0	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02
Gb_01445	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.05	0.19	0.67	0.58	0.0	0.12	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_01793	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_02363	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.24	0.0	0.0	0.0	0.81	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0
Gb_02588	0.24	0.0	0.94	0.0	1.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_02836 (RSR4)	0.21	0.32	0.48	0.32	1.0	0.15	0.25	0.12	0.13	0.1	0.18	0.09	0.1	0.12	0.16	0.32	0.25	0.11	0.15	0.18
Gb_03131 (INT1)	0.47	0.17	0.4	0.25	0.91	0.23	0.42	0.46	0.65	0.37	0.59	0.26	0.28	0.46	0.31	0.31	0.57	1.0	0.44	0.76
Gb_04491 (PAP15)	0.24	0.52	0.21	0.4	1.0	0.45	0.26	0.14	0.14	0.13	0.16	0.14	0.25	0.16	0.13	0.25	0.27	0.44	0.28	0.28
Gb_04553	0.0	0.0	0.0	0.0	0.93	1.0	0.57	0.16	0.0	0.0	0.81	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_04766	1.0	0.0	0.14	0.43	0.98	0.15	0.31	0.22	0.5	0.15	0.0	0.07	0.12	0.09	0.23	0.42	0.28	0.35	0.46	0.23
Gb_04958	0.14	0.63	0.51	0.17	1.0	0.03	0.05	0.04	0.06	0.1	0.02	0.11	0.04	0.02	0.02	0.02	0.04	0.0	0.0	0.0
Gb_05069	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.17	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_05334	0.03	0.33	0.66	0.15	1.0	0.16	0.34	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.12	0.01	0.01
Gb_05386	0.14	0.11	0.2	0.64	0.68	0.04	0.48	0.21	0.03	0.03	0.15	0.11	0.18	0.3	0.14	0.1	0.29	1.0	0.08	0.03
Gb_06354 (PME3)	0.01	0.04	0.03	0.08	0.86	0.62	0.03	0.1	0.06	0.11	0.04	0.29	0.03	0.09	0.05	0.71	1.0	0.01	0.0	0.0
Gb_08035 (tny)	0.34	0.64	0.61	1.0	0.76	0.27	0.0	0.22	0.34	0.23	0.08	0.03	0.19	0.28	0.2	0.22	0.05	0.3	0.0	0.18
Gb_08313 (CYP94D2)	0.18	0.0	0.0	0.6	1.0	0.0	0.0	0.26	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.66	0.17	0.0	0.0
Gb_08650 (GSO1)	0.17	0.26	0.46	0.31	0.63	0.35	0.64	0.07	0.01	0.01	0.03	0.04	0.0	0.01	0.01	0.04	0.02	1.0	0.0	0.18
Gb_09308	0.37	0.0	0.0	0.0	0.0	0.3	1.0	0.05	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.17	0.39
Gb_09776	1.0	0.67	0.53	0.11	0.94	0.04	0.14	0.21	0.03	0.11	0.26	0.04	0.14	0.05	0.09	0.1	0.12	0.39	0.09	0.06
Gb_14195	0.03	0.03	0.06	0.11	1.0	0.17	0.46	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.16	0.01	0.02
Gb_14210 (CLH2)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_15720	0.0	0.0	1.0	0.0	0.81	0.0	0.76	0.32	0.24	0.46	0.48	0.2	0.0	0.09	0.22	0.0	0.0	0.45	0.2	0.24
Gb_16086	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.59	0.02	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.49	0.34	0.0
Gb_16173 (GAE1)	0.76	0.37	0.54	0.32	0.93	0.0	0.06	0.09	0.05	0.09	0.05	0.06	0.0	0.02	0.03	0.03	0.04	1.0	0.36	0.23
Gb_16181 (GAE1)	0.46	0.23	0.32	0.21	1.0	0.0	0.05	0.07	0.04	0.15	0.03	0.05	0.02	0.04	0.06	0.02	0.0	0.95	0.16	0.19
Gb_16269	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_16879 (MTO3)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_17170	0.08	0.16	0.24	0.28	1.0	0.32	0.38	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.0	0.02	0.29	0.35	0.06
Gb_19536	0.2	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.07	0.21	0.78	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.13	0.0
Gb_20041	0.38	0.38	0.35	0.08	1.0	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.03	0.0
Gb_21114	0.13	0.2	0.2	0.21	1.0	0.67	0.14	0.1	0.04	0.04	0.01	0.08	0.0	0.01	0.01	0.38	0.31	0.47	0.01	0.14
Gb_21400 (KP1)	0.48	0.0	0.39	0.0	1.0	0.71	0.48	0.26	0.18	0.42	0.0	0.1	0.15	0.34	0.0	0.0	0.0	0.0	0.46	0.16
Gb_22110 (FATB)	0.14	0.15	0.04	0.58	0.35	0.01	0.0	0.1	0.02	0.01	0.0	0.05	0.0	0.01	0.0	0.15	0.27	1.0	0.0	0.0
Gb_22181	0.1	0.36	0.39	0.15	1.0	0.06	0.66	0.17	0.18	0.21	0.16	0.13	0.13	0.08	0.14	0.01	0.02	0.19	0.37	0.19
Gb_26335	0.0	0.0	0.0	0.0	0.98	0.0	0.0	0.05	0.11	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0
Gb_26860 (ZFP8)	0.25	0.55	0.88	0.29	1.0	0.25	0.09	0.14	0.14	0.09	0.02	0.02	0.2	0.04	0.03	0.03	0.09	0.16	0.12	0.18
Gb_28237 (OMT1)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_28683 (CYP706A2)	0.0	1.0	0.07	0.24	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_29053	0.5	0.48	1.0	0.0	0.99	0.0	0.58	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.48	0.52	0.3
Gb_32305	0.11	0.0	0.0	0.0	0.8	0.18	0.65	0.08	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.16	0.0
Gb_32357 (CYP76G1)	0.05	0.0	0.15	1.0	0.7	0.03	0.01	0.1	0.03	0.03	0.13	0.19	0.06	0.05	0.14	0.06	0.13	0.73	0.0	0.01
Gb_32591 (PPCK1)	0.37	0.3	0.34	0.12	0.81	0.04	0.29	0.21	0.12	0.14	0.07	0.04	0.69	1.0	0.18	0.0	0.01	0.02	0.04	0.78
Gb_33066	0.18	0.14	0.26	0.39	1.0	0.95	0.25	0.23	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.4	0.24	0.14	0.0	0.01
Gb_34058	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_34754	0.06	0.78	0.13	0.0	0.76	0.0	1.0	0.03	0.07	0.0	0.23	0.03	0.0	0.0	0.1	0.0	0.0	0.32	0.36	0.33
Gb_35712 (FATB)	0.03	0.0	0.23	0.67	1.0	0.17	0.25	0.02	0.0	0.0	0.0	0.33	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.19	0.0	0.0
Gb_35943	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Gb_36596 (GH3.17)	0.05	0.18	0.59	0.08	1.0	0.0	0.27	0.02	0.02	0.01	0.02	0.01	0.0	0.0	0.04	0.17	0.07	0.16	0.01	0.09
Gb_37563	0.24	0.04	0.22	0.33	1.0	0.06	0.03	0.02	0.02	0.02	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.0	0.02	0.05	0.03	0.04
Gb_38105	0.18	0.21	0.36	0.36	0.94	1.0	0.06	0.14	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.5	0.26	0.16	0.0	0.0
Gb_38434	0.85	0.38	1.0	0.28	0.77	0.01	0.48	0.04	0.01	0.0	0.0	0.03	0.01	0.0	0.0	0.01	0.01	0.28	0.22	0.07
Gb_40170	0.25	0.61	0.38	0.33	1.0	0.06	0.1	0.02	0.01	0.03	0.0	0.06	0.0	0.0	0.0	0.03	0.23	0.15	0.09	0.0
Gb_40645 (LBD3)	0.64	0.41	0.2	0.15	0.54	0.15	0.03	0.03	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.01
Gb_40981	0.66	0.77	0.62	0.57	1.0	0.17	0.35	0.19	0.15	0.16	0.11	0.31	0.04	0.03	0.11	0.15	0.08	0.58	0.45	0.45
Gb_41421	0.04	0.14	0.46	0.17	1.0	0.01	0.68	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.09	0.45	0.4
Gb_41822	0.0	0.0	0.0	0.05	1.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.0	0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)