1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_89 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
0.31 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.29 0.0 0.0 0.0 1.94 1.61 0.0 0.0 0.35 0.0
Gb_01049 (HSP17.6II)
 0.1 0.0 0.47 0.0 0.0 0.07 0.83 0.1 22.41 5.54 9.86 0.27 0.0 0.03 30.32 0.0 0.0 0.55 5.6 20.36
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.05 0.05 0.4 0.0 0.0 0.01 0.32 0.07 0.0 0.0 0.04 0.0
0.02 0.04 0.02 0.06 0.0 0.02 0.02 0.04 0.1 0.03 0.17 0.02 0.0 0.02 0.32 0.06 0.05 0.0 0.01 0.02
0.12 0.0 0.0 0.15 0.11 0.0 0.0 0.26 2.88 0.41 3.17 0.09 0.19 0.0 2.57 0.19 0.07 0.08 0.83 0.08
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.99 0.0 0.0 0.0 0.0 0.89
0.0 0.0 0.0 0.17 0.03 8.65 0.25 0.22 6.97 2.77 10.3 0.06 0.36 0.2 9.48 0.22 1.46 0.07 0.13 1.02
0.12 0.0 0.06 0.0 0.06 0.34 0.04 0.17 0.5 0.52 2.4 0.02 0.1 0.02 2.04 0.61 0.06 0.05 0.15 0.1
Gb_04498 (CSLE1)
 0.06 0.12 0.04 0.09 0.09 0.11 0.06 0.41 0.39 0.38 1.56 0.31 0.33 0.29 1.4 0.07 0.02 0.39 0.17 0.59
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.43 0.03 0.51 0.01 0.0 0.0 0.23 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0
Gb_05044 (PMR2)
 2.47 7.88 9.44 3.7 3.79 1.77 1.05 3.8 8.5 9.57 21.34 3.5 7.33 4.52 22.45 1.45 1.64 0.26 0.29 23.88
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.27 0.07 0.72 0.0 0.0 0.0 0.81 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.16 0.02 0.24 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0
Gb_08930 (PREP2)
 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.01 0.02 0.03 0.23 0.0 0.0 0.0 0.21 0.01 0.03 0.0 0.01 0.0
Gb_09487 (CAD9)
 1.61 2.49 2.36 3.99 1.83 1.13 2.03 5.13 6.64 4.82 8.2 4.28 7.9 7.1 7.52 7.2 5.72 1.6 0.57 7.78
Gb_10996 (TSBtype2)
 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.11 0.0 0.02 0.02 0.03 0.13 0.0 0.02 0.0 0.19 0.05 0.07 0.0 0.01 0.01
0.0 0.03 0.07 0.11 0.06 0.03 0.03 0.79 1.14 1.53 1.43 0.82 1.02 0.97 0.93 0.59 0.94 0.05 0.07 0.35
0.19 0.07 0.03 0.31 0.1 0.02 0.13 0.09 0.17 0.09 0.11 0.02 0.02 0.01 0.36 0.1 0.05 0.17 0.18 0.15
0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.03 0.0 0.45 0.0 0.29 0.0 0.0 0.02 0.36 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.08 0.04 0.04 0.1 0.1 0.07 0.02 0.22 0.97 0.56 5.24 0.18 0.13 0.04 5.39 0.21 0.15 0.15 0.72 0.45
Gb_16465 (CRSH)
 0.07 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.05 0.05 0.24 0.19 0.45 0.0 0.0 0.0 0.53 0.0 0.05 0.03 0.32 0.28
Gb_16642 (XDH1)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.04 0.02 0.09 0.0 0.01 0.03 0.09 0.0 0.0 0.0 0.02 0.03
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.12 0.07 0.0 0.0 0.0 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.44 1.98 0.69 0.28 0.27 0.01 1.23 0.38 0.95 0.25 1.85 0.84 0.69 1.34 4.63 0.0 0.0 0.01 0.0 2.84
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.04 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.04 0.06 0.12 0.19 0.26 0.01 0.03 0.03 0.3 0.11 0.12 0.07 0.18 0.17
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.22 0.0 0.0 0.0 0.43 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Gb_21128 (CRSH)
 0.06 0.0 0.0 0.13 0.04 0.0 0.05 0.04 0.24 0.02 1.16 0.0 0.02 0.0 1.17 0.15 0.12 0.0 0.3 0.09
Gb_21573 (BTS)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.0 0.01 0.0 0.02 0.0 0.01 0.52 0.75 0.85 0.96 0.4 0.81 0.59 0.71 0.59 0.75 0.03 0.0 0.53
1.07 0.11 0.4 2.31 0.6 0.15 0.42 0.68 0.89 0.62 5.85 0.06 0.54 0.68 7.19 1.23 0.61 0.12 1.62 0.55
0.09 0.07 0.02 0.0 0.02 0.08 0.02 0.29 0.41 0.25 0.56 0.14 0.25 0.13 0.71 0.11 0.13 0.03 0.06 0.91
1.76 0.71 1.07 0.96 1.01 7.38 0.33 3.86 5.19 6.26 10.61 2.02 3.15 3.46 9.1 2.41 3.18 0.63 0.11 9.31
0.08 0.09 0.0 0.27 0.04 0.0 0.0 0.02 0.43 0.02 0.6 0.02 0.0 0.03 0.53 0.0 0.0 0.2 0.07 0.03
Gb_23537 (CRK8)
 0.02 0.0 0.02 0.2 0.01 0.0 0.02 0.03 0.09 0.09 0.16 0.01 0.01 0.0 0.28 0.0 0.07 0.0 0.19 0.0
0.23 0.24 0.24 1.06 0.12 0.12 0.4 2.61 6.97 3.53 27.22 1.28 3.81 0.67 22.69 0.0 0.27 0.2 5.65 1.22
Gb_24407 (CRK8)
 0.03 0.0 0.0 0.07 0.06 0.01 0.01 0.1 0.48 0.41 2.63 0.06 0.03 0.02 2.71 0.1 0.22 0.03 1.2 0.13
0.35 0.24 0.16 1.39 0.56 0.07 0.17 0.93 3.47 2.08 21.99 0.99 0.69 0.37 19.19 1.58 0.89 0.64 3.33 4.2
3.28 1.82 3.52 4.7 2.63 3.24 0.71 9.46 13.29 10.23 9.84 6.91 6.52 6.79 8.45 15.35 10.18 2.94 0.13 10.39
0.41 0.34 0.16 0.64 0.39 1.14 0.85 0.4 0.93 0.52 1.83 0.09 0.6 0.34 2.3 0.32 0.14 0.37 1.77 0.58
0.11 0.04 0.02 0.14 0.6 2.16 0.17 2.16 3.51 2.85 5.42 2.36 4.03 6.12 6.09 4.16 4.12 1.19 0.32 4.29
Gb_31064 (STA1)
 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.05 0.04 0.32 0.0 0.01 0.0 0.45 0.03 0.07 0.0 0.01 0.01
0.03 0.0 0.12 0.37 0.0 0.0 0.07 0.11 0.43 0.07 1.41 0.03 0.02 0.0 0.73 0.71 0.2 0.1 0.58 0.21
0.27 0.3 0.13 0.0 0.3 1.34 0.39 1.19 3.84 1.55 4.69 0.14 0.17 0.36 6.7 0.0 0.15 0.26 3.26 2.5
0.5 0.04 0.11 0.71 0.44 0.25 0.17 0.33 0.46 0.27 0.95 0.23 0.57 0.49 0.89 0.4 0.21 0.42 0.27 0.5
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.93 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.31 0.49 1.26 1.26 0.35 0.0 0.0 4.14 1.11 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.32 0.0 0.45 0.1 0.55 0.01 0.0 0.0 0.65 0.0 0.05 0.0 0.02 0.19
0.02 0.0 0.01 0.04 0.02 0.01 0.01 0.02 0.05 0.02 0.12 0.01 0.02 0.0 0.18 0.08 0.1 0.01 0.05 0.12
Gb_38020 (GolS1)
 5.68 0.35 1.1 1.2 0.97 1.36 1.14 1.32 105.92 44.25 208.82 0.97 0.25 0.28 143.82 3.11 30.17 5.41 4.96 66.91
Gb_38204 (BTS)
 0.01 0.0 0.01 0.04 0.0 0.01 0.0 0.01 0.03 0.03 0.13 0.0 0.0 0.0 0.18 0.15 0.01 0.0 0.0 0.0
0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.04 0.02 0.08 0.2 0.43 0.73 0.06 0.11 0.13 0.77 0.18 0.21 0.0 0.01 0.03
0.15 0.09 0.08 0.19 0.3 0.09 0.2 0.23 0.42 0.33 1.01 0.19 0.21 0.14 1.19 0.34 0.73 0.2 0.25 0.35
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.56 0.33 1.9 0.28 0.0 0.0 1.67 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.01 0.22 0.0 0.0 0.0 0.29 0.0 0.0 0.03 0.01 0.09

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)