1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_163 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 9.84 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 7.46
Gb_01407 (ALDH2)
 0.17 0.15 0.05 0.04 0.02 0.9 9.06 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 53.31
0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.13 1.87 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.82
0.51 11.34 40.35 0.0 0.84 2.15 137.29 0.1 0.18 0.11 0.03 0.01 0.16 0.24 0.08 0.05 0.0 0.66 3.4 256.87
Gb_03212 (ADH)
 6.71 19.92 17.24 5.78 11.61 8.29 35.27 2.28 0.82 0.96 1.9 0.53 0.9 0.75 1.64 0.7 0.87 13.52 22.55 146.36
4.54 21.25 106.72 2.64 2.79 0.7 274.07 0.67 0.27 0.0 0.34 0.09 0.05 0.08 0.3 0.0 0.41 4.63 35.21 432.8
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.6
36.5 52.56 78.75 24.49 33.29 13.85 28.53 12.09 8.93 7.03 16.1 5.58 1.38 3.51 13.25 16.23 16.36 36.68 17.46 43.15
4.56 2.18 20.54 0.97 1.96 6.94 107.05 2.19 0.78 0.66 1.28 0.42 0.99 0.42 1.79 0.26 0.06 0.23 0.25 281.88
Gb_05958 (J20)
 0.27 0.0 0.07 0.0 0.34 0.6 17.67 0.62 1.45 1.26 2.66 1.06 3.41 2.45 3.07 0.04 0.69 0.43 6.2 41.22
0.0 0.0 0.21 0.0 0.0 0.0 5.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 13.04
3.63 11.35 56.22 0.18 3.61 0.0 46.21 0.07 0.07 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.69 0.26 73.51
9.64 14.35 20.49 4.53 11.91 13.64 71.92 2.88 12.96 7.37 14.99 2.7 1.52 1.24 17.76 2.99 1.6 13.6 16.63 181.86
8.37 9.95 8.97 4.75 8.46 3.81 16.39 7.68 7.38 6.76 8.18 5.32 4.04 4.34 6.94 5.91 9.07 7.71 26.91 37.83
0.43 0.54 0.49 0.79 0.9 0.63 1.78 0.46 0.18 0.16 0.63 0.29 0.23 0.48 0.5 0.19 0.05 0.88 2.03 1.24
22.19 55.0 35.91 9.26 41.15 38.06 74.91 14.26 9.67 10.14 13.72 5.3 7.11 6.48 11.97 5.21 6.47 16.55 36.98 109.29
Gb_09244 (BPS1)
 26.83 90.07 50.34 29.82 44.9 62.35 90.1 22.31 11.94 12.23 21.04 9.97 11.58 10.5 21.95 7.01 8.91 20.11 80.67 112.06
0.06 0.05 0.07 0.0 0.0 0.03 0.29 0.02 0.01 0.04 0.0 0.01 0.02 0.01 0.0 0.08 0.0 0.02 0.02 0.89
0.05 0.1 0.14 0.0 0.05 0.02 0.22 0.04 0.01 0.03 0.03 0.01 0.05 0.02 0.04 0.0 0.02 0.04 0.02 0.9
Gb_12852 (ACS8)
 0.04 0.06 0.03 0.04 0.0 0.1 1.24 0.01 0.02 0.0 0.03 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.06 0.02 2.79
3.37 7.73 2.67 0.88 3.66 3.37 9.49 0.93 0.32 0.0 0.1 1.34 0.43 0.96 0.94 0.35 0.81 2.34 2.81 25.16
8.42 88.75 467.73 3.06 4.46 9.73 378.71 1.73 0.22 0.21 0.18 0.19 0.23 0.54 0.16 0.53 0.2 1.74 1.96 2221.52
23.31 52.63 551.69 5.3 13.75 3.86 577.31 3.44 3.44 4.46 3.82 1.82 1.37 1.62 3.03 1.76 1.62 2.7 2.54 3043.58
9.3 9.8 41.3 4.49 6.43 0.21 6.77 0.34 0.02 0.0 0.12 0.02 0.02 0.06 0.04 0.0 0.18 6.19 3.38 30.12
10.74 18.04 40.71 4.13 11.35 0.24 13.34 1.37 0.03 0.09 0.07 0.04 0.0 0.0 0.06 0.31 0.05 8.87 3.48 30.36
5.51 51.38 102.61 2.59 4.31 2.92 103.34 2.13 2.25 2.13 1.71 1.2 1.93 1.93 1.47 1.32 0.37 3.02 2.9 230.11
0.31 11.6 14.02 0.64 0.56 0.21 48.24 0.24 0.14 0.18 0.5 0.19 0.05 0.03 0.19 0.66 0.57 0.92 1.05 56.64
103.6 576.17 191.2 36.67 81.41 238.8 233.31 30.54 49.89 27.48 15.67 33.93 13.74 16.63 21.61 90.18 13.08 69.82 22.82 583.26
0.12 0.0 2.18 0.0 0.22 0.0 4.63 0.19 0.07 0.17 0.0 0.04 0.06 0.26 0.05 0.0 0.05 0.0 0.0 42.97
0.32 0.0 0.0 1.62 1.0 0.28 30.71 0.12 0.01 0.11 0.04 0.09 0.04 0.11 0.0 0.89 0.96 0.18 0.11 67.8
Gb_18735 (ADH)
 18.22 45.9 41.84 20.41 27.42 24.62 146.83 7.1 2.11 2.38 4.12 2.02 5.96 4.17 5.05 2.46 2.2 33.49 47.55 421.85
2.1 22.34 34.26 2.85 4.88 48.23 474.24 4.73 2.88 4.96 3.95 0.94 2.35 2.28 4.96 0.19 0.48 7.27 10.08 670.55
0.21 20.39 18.88 0.0 2.08 0.67 805.75 0.19 0.12 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.46 0.0 2.85 1.65 530.98
6.06 32.3 254.26 1.94 18.27 0.3 214.55 0.25 0.02 0.1 0.1 0.15 0.02 0.0 0.13 0.0 0.0 2.78 0.42 235.5
3.2 53.45 84.39 0.82 10.16 0.26 128.33 0.06 0.08 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.84 0.3 220.54
11.92 59.15 142.65 0.29 6.56 0.46 100.74 0.4 0.0 0.0 0.06 0.02 0.0 0.06 0.0 0.19 0.27 2.45 0.35 640.1
5.32 74.32 40.48 0.74 8.66 0.0 91.35 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.24 0.21 348.42
0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 2.53 0.03 0.06 0.0 0.0 0.02 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 1.1
0.32 0.24 0.28 0.42 0.17 0.06 5.14 0.55 0.58 0.75 1.28 0.31 0.97 0.63 0.87 0.18 0.22 0.08 0.33 6.49
11.67 58.65 35.75 0.64 12.86 4.51 109.06 1.3 0.99 0.9 0.95 0.53 0.5 0.15 2.45 0.32 0.28 4.75 1.75 173.14
2.08 2.08 3.54 1.24 1.06 0.15 3.84 0.3 0.09 0.13 0.45 0.25 0.07 0.07 0.17 0.15 0.13 0.58 1.45 12.33
0.11 0.0 0.22 0.21 0.1 0.23 0.47 0.05 0.02 0.0 0.06 0.01 0.07 0.03 0.04 0.07 0.08 0.02 0.02 2.08
Gb_26437 (HRE2)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.61 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 7.89
13.79 61.83 206.82 7.26 23.0 2.22 307.16 3.07 0.66 0.82 1.31 0.84 0.53 0.73 1.24 2.36 0.49 8.23 22.89 1056.29
4.2 14.97 65.24 0.71 5.22 0.35 42.06 0.64 0.12 0.14 0.29 0.22 0.1 0.17 0.36 0.35 0.25 1.68 6.6 307.1
2.35 7.68 13.18 1.86 10.58 2.15 56.92 1.27 2.79 2.05 1.15 1.15 1.37 2.09 2.34 0.8 0.19 4.68 8.01 197.15
0.8 2.5 3.09 1.41 5.76 0.44 30.36 0.59 1.65 1.33 1.15 0.96 1.01 5.13 1.89 0.53 0.14 3.73 0.71 97.14
0.67 7.39 20.72 2.74 16.88 1.22 165.94 1.26 3.02 2.49 1.2 0.43 1.98 5.03 1.27 0.28 0.12 2.44 0.61 162.06
0.42 2.5 4.41 0.61 2.69 0.8 22.0 0.17 0.55 0.35 0.21 0.02 0.15 0.16 0.37 0.05 0.0 0.54 2.65 67.0
1.66 7.17 5.86 1.9 4.93 0.95 36.57 0.36 0.26 0.87 0.19 0.26 0.16 0.85 1.04 0.0 0.12 2.62 7.79 144.36
10.69 66.56 132.36 10.34 34.95 16.07 307.39 20.5 26.97 21.1 24.56 13.83 15.4 22.28 25.62 9.17 12.26 18.54 146.45 652.77
0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.72 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 2.14
1.38 2.56 3.63 1.11 2.65 0.06 35.0 0.67 3.74 2.55 0.21 0.72 0.88 0.83 0.49 1.14 0.31 0.6 0.12 68.49
Gb_36212 (MEE59)
 95.41 530.93 345.64 58.39 173.18 186.43 636.55 31.74 2.12 1.39 5.95 4.72 1.4 2.08 9.22 1.65 1.63 178.89 172.91 965.36
0.02 0.48 0.38 0.0 0.12 0.06 18.26 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.9 93.19
2.07 5.42 20.72 1.84 2.22 0.59 54.46 0.28 0.13 0.11 0.24 0.24 0.11 0.07 0.13 0.08 0.32 0.27 2.01 165.13
5.83 9.44 23.03 14.24 26.68 4.19 18.24 9.73 12.96 11.96 16.23 6.51 5.17 9.57 23.57 6.56 9.15 13.39 30.19 158.89
4.39 11.97 25.68 0.0 0.35 0.0 89.4 0.02 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 223.58
0.31 0.27 0.58 0.49 0.78 0.08 18.82 1.42 2.36 2.12 5.56 1.79 1.83 2.2 4.74 2.43 1.81 0.27 0.14 23.94
Gb_40050 (WES1)
 0.25 0.61 0.88 0.23 0.73 0.63 9.07 0.87 0.55 0.66 0.81 0.53 1.11 1.37 0.98 0.2 0.22 1.6 1.43 22.57
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.69 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.65
0.12 0.14 0.1 0.08 0.17 0.06 0.95 0.17 0.12 0.23 0.07 0.06 0.26 0.21 0.04 0.15 0.19 0.14 0.04 3.42

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)