1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_33 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
0.03 0.18 1.24 0.13 12.28 0.0 0.58 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Gb_00289 (WBC27)
 0.0 0.0 0.12 0.0 9.98 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.03 0.06 0.09 0.0 1.22 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.02 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.01 0.0
Gb_02542 (DFR)
 0.11 0.12 2.43 0.45 19.73 0.02 1.36 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Gb_02579 (LAP5)
 4.84 1.89 2.93 1.74 12.08 0.46 0.42 0.11 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.07 0.48 0.03 0.08
0.07 0.11 0.1 0.32 0.0 0.0 0.14 0.08 0.07 0.11 0.0 0.0 0.08 0.2 0.05 0.0 0.0 0.05 0.11 0.04
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.48 0.0 0.0 0.0 0.0
0.81 0.74 0.88 1.07 7.22 1.28 0.0 1.18 0.56 0.68 0.64 0.59 0.28 0.13 0.51 0.56 1.75 4.17 1.54 2.22
0.0 0.0 0.0 0.0 2.91 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Gb_04409 (OCT2)
 0.49 0.0 0.28 0.04 2.17 0.37 0.03 0.44 0.95 0.98 0.0 0.37 0.92 0.69 0.0 0.14 0.02 2.54 0.39 0.26
913.56 554.71 745.92 1221.7 801.62 9.69 4.82 39.39 0.24 0.52 0.0 25.08 0.09 0.49 0.0 21.05 115.92 268.11 0.02 1.24
4.91 0.49 1.77 6.94 9.09 2.77 1.36 2.74 0.75 0.66 1.06 1.96 0.71 0.52 1.54 0.63 2.07 4.59 0.99 1.83
0.87 0.34 0.36 0.92 1.94 0.75 0.29 0.42 0.09 0.15 0.16 0.33 0.12 0.05 0.16 0.11 0.27 1.09 0.31 0.32
Gb_06235 (SLP3)
 0.0 0.0 0.0 0.0 1.66 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
38.53 21.48 41.79 20.8 34.92 3.66 3.38 3.99 10.43 9.87 1.29 0.0 1.26 2.67 2.04 41.22 30.31 22.57 0.0 5.01
Gb_06811 (NRT1.5)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Gb_07117 (AGAL2)
 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.12 0.04 0.09 0.2 0.03 0.0 0.32 0.0 0.21 0.0 0.03 0.0 0.0
Gb_07457 (KUP6)
 0.06 0.32 0.19 0.76 0.0 0.34 0.2 0.21 0.17 0.05 0.16 0.07 0.18 0.12 0.01 0.8 0.58 1.22 0.09 1.44
0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.34 0.68 1.79 0.19 7.84 0.02 0.02 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.07 0.16 0.13
Gb_08231 (YAB2)
 0.1 0.0 0.0 5.11 0.0 0.0 0.0 0.34 0.19 0.19 0.12 0.02 0.57 0.43 0.12 0.1 0.09 0.09 0.0 0.0
Gb_08802 (CHUP1)
 3.13 2.25 2.25 4.65 10.08 2.32 1.9 2.65 2.65 2.79 0.94 2.38 1.2 1.24 0.97 4.27 5.01 3.23 5.69 1.82
Gb_09403 (SWEET1)
 2.57 3.74 1.2 72.8 55.37 2.63 4.66 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.02 0.0 0.32 0.03 0.05
7.1 4.25 3.14 8.67 31.36 19.38 7.27 3.85 3.98 6.33 3.89 4.62 3.79 9.07 4.55 3.43 5.19 4.36 8.92 6.91
Gb_09713 (ILL6)
 3.08 4.88 9.5 2.58 5.92 4.12 1.33 0.72 0.8 0.81 0.99 1.18 0.76 2.12 1.91 1.04 1.13 2.06 0.71 2.93
Gb_09768 (XSP1)
 0.02 0.18 0.08 0.09 1.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.03 0.0 0.0 0.18 0.42 0.0 0.03 0.06 0.08 0.09 0.0 0.0 0.04 0.2 0.0 0.09 0.06 0.0 0.12 0.0
Gb_11313 (SWEET1)
 2.27 4.72 1.02 31.46 60.81 4.46 1.19 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.05 0.04 0.0 0.0
Gb_11917 (PRXR1)
 0.0 0.0 0.0 25.42 0.0 0.0 0.0 4.51 0.0 0.0 1.75 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
73.58 61.7 76.74 127.24 70.89 0.38 9.15 9.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 5.7 0.01 0.12
Gb_12948 (XCP2)
 0.01 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
2.94 0.71 2.54 0.78 5.18 0.67 3.37 1.22 0.72 0.78 0.69 0.63 0.54 0.58 0.29 0.68 0.79 1.45 1.41 1.25
Gb_15188 (CYP703)
 0.45 0.49 1.44 0.24 6.12 0.1 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Gb_15917 (DRL1)
 0.08 0.67 1.75 0.17 18.75 0.0 0.46 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Gb_15925 (DRL1)
 0.14 0.0 0.0 0.43 4.81 0.0 0.08 0.01 0.0 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.5 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Gb_16880 (MTO3)
 0.0 0.23 0.0 0.0 0.21 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Gb_17570 (TA1)
 0.0 0.0 0.02 0.0 16.42 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0
0.02 0.0 0.04 0.0 0.24 0.0 0.27 0.01 0.0 0.0 0.17 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.02 0.0
0.3 0.14 0.0 1.25 0.07 0.0 0.27 0.17 0.24 0.25 0.06 0.0 0.15 0.28 0.17 0.23 0.0 0.0 0.71 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.22 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0
8.82 1.27 20.03 30.45 13.58 0.01 0.1 0.42 0.03 0.0 0.0 0.73 0.01 0.01 0.0 1.62 2.74 3.0 0.02 0.02
Gb_19726 (OPCL1)
 1.89 0.52 0.72 0.39 2.04 1.14 1.65 0.14 0.05 0.02 0.04 0.02 0.04 0.05 0.06 0.01 0.04 0.57 0.89 0.36
0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02
0.0 0.0 0.03 0.0 23.21 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 97.88 0.09 0.46 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 16.26 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 16.94 0.0 2.87 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
2.8 0.57 5.33 2.02 7.74 1.8 0.33 0.54 0.26 0.15 0.51 0.17 0.02 0.43 0.57 0.03 0.98 1.52 0.0 0.1
Gb_20746 (HOT1)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.17 0.0 0.13 0.06 0.13 0.04 0.08 0.03 0.05 0.03 0.02 0.04 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.06 0.07 0.09
0.68 0.85 1.54 0.35 2.77 0.33 0.85 0.08 0.08 0.0 0.05 0.01 0.09 0.06 0.0 0.24 0.0 0.0 0.25 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0
Gb_23688 (LBD15)
 0.0 0.0 0.0 0.0 3.01 0.0 0.49 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 1.91
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.07 0.62 0.1 0.04 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Gb_23796 (SSI2)
 0.05 0.0 0.0 0.08 0.1 0.0 0.34 0.1 0.01 0.0 0.0 0.04 0.03 0.01 0.0 0.0 0.13 0.24 0.01 0.02
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.17 0.03 0.0 0.0 0.0 0.09 0.01 0.05 0.07 0.07 0.05 0.11 0.05 0.09 0.0 0.03 0.31 0.11 0.0 0.0
Gb_24615 (SERK2)
 11.06 0.23 0.95 35.07 99.74 31.56 0.12 0.1 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.43 0.13 0.06
Gb_25721 (TLP-3)
 0.19 0.96 1.06 0.17 23.87 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Gb_26470 (DFR)
 49.21 63.0 35.16 136.22 422.94 76.61 0.52 15.03 8.93 8.22 4.39 25.15 3.25 7.26 3.17 19.4 29.82 93.98 9.38 0.56
Gb_26519 (FMA)
 0.0 0.0 0.0 1.02 0.0 0.22 0.02 0.07 0.03 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.14 0.03 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.89 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.5 0.0 0.0
0.0 0.08 0.0 0.0 13.48 0.24 1.97 0.02 0.0 0.02 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06
0.44 1.93 6.85 0.47 304.64 0.0 0.28 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0
2.49 0.15 0.39 3.04 5.57 0.38 0.23 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.02 0.18 0.33 0.67
70.97 0.0 21.42 8.29 228.93 23.95 24.27 43.12 24.67 26.4 23.87 23.46 43.44 51.9 33.37 20.68 28.35 37.33 0.0 41.23
0.0 0.0 0.0 0.0 3.83 0.0 0.02 0.19 0.66 0.0 0.32 0.29 0.36 0.37 0.2 1.13 0.23 1.95 0.45 0.0
0.04 0.7 0.02 0.0 0.0 0.0 0.6 0.11 0.03 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0
Gb_30617 (UGT74E2)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Gb_30766 (FATB)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Gb_31399 (TA1)
 0.0 0.0 0.0 0.0 21.44 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
3.57 8.06 14.0 2.62 53.54 2.52 4.86 0.11 0.01 0.03 0.0 0.08 0.03 0.01 0.01 0.02 0.07 0.12 0.2 8.72
Gb_31626 (DCR)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01
0.3 0.0 0.0 0.0 1.39 1.3 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Gb_32012 (QRT1)
 1.5 0.94 1.97 2.55 12.44 0.02 0.27 0.07 0.01 0.02 0.0 0.02 0.0 0.0 0.01 0.1 0.0 0.0 0.01 0.08
0.32 0.08 0.51 2.66 19.23 4.26 0.01 0.26 0.11 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.32 0.28 0.01 0.0
0.11 0.0 0.1 0.0 0.47 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.03 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.26 0.0 0.62 0.05 19.65 0.0 4.71 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Gb_34128 (CYP704B1)
 0.44 0.74 4.58 0.67 32.59 0.05 8.61 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0
0.3 0.26 0.55 0.0 0.58 0.0 0.13 0.07 0.0 0.1 0.05 0.02 0.09 0.02 0.25 0.17 0.0 0.22 0.1 0.1
0.0 0.0 0.0 0.0 0.39 0.0 0.05 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0
3.25 2.43 5.01 2.25 8.74 1.68 1.83 0.53 0.48 0.9 0.91 0.51 0.46 0.87 0.65 0.18 0.92 0.83 0.85 1.58
Gb_35748 (CHUP1)
 3.13 2.25 2.25 4.65 10.08 2.32 1.9 2.65 2.65 2.79 0.94 2.38 1.2 1.24 0.97 4.27 5.01 3.23 5.69 1.82
0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02
1.68 3.23 7.93 7.6 20.05 4.75 3.37 0.67 0.85 0.78 1.39 3.11 0.82 1.01 1.03 0.21 0.7 2.07 0.39 2.12
0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Gb_36881 (UGT74D1)
 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0
0.01 0.0 0.0 0.0 5.71 0.08 0.08 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.17
0.0 0.0 0.0 0.0 2.64 0.13 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0
Gb_37190 (HKT1)
 0.15 0.22 0.47 0.14 1.3 0.0 0.01 0.01 0.02 0.01 0.08 0.02 0.03 0.01 0.05 0.04 0.02 0.0 0.0 0.0
0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.04 0.02 0.03 0.0 0.01 0.06 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0
2.78 0.33 4.0 16.11 36.79 0.0 0.34 0.31 0.0 0.0 0.03 0.0 0.01 0.0 0.19 0.21 0.24 3.95 0.0 0.0
0.39 0.51 0.16 1.76 6.35 1.17 0.3 0.16 0.14 0.32 0.13 0.16 0.09 0.09 0.19 0.11 0.2 0.03 0.01 0.04
0.54 0.0 0.0 0.0 1.89 0.01 0.08 0.14 0.33 0.12 0.0 0.05 0.11 0.16 0.0 0.0 0.0 0.33 0.0 0.11
Gb_39085 (TT7)
 0.01 0.02 0.0 0.0 0.5 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.03 0.02 0.02 0.01 0.0
Gb_39264 (CXE17)
 0.03 0.0 0.01 0.0 12.57 0.01 0.44 0.07 0.02 0.06 0.2 0.08 0.12 0.1 0.06 0.05 0.07 0.11 0.0 8.93

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)