Heatmap: Cluster_51 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Ovule
Ovule, mature
Ovule, pollinated
Strobilus, female
Ovulate strobilus
Microstrobilus
Kernel
Leaf
Leaf, female
Leaf, male
Leaf, salicylic acid
Leaf, seedling
Leaf, truncation control
Leaf, truncation treatment
Leaf, water
Yellow-green stripe leaves
Green leaves
Stem
Cambium
Root
2.24 1.59 1.89 1.56 1.15 -2.63 -0.85 -2.0 -4.61 -6.64 -4.56 -5.21 -3.31 -3.77 -5.57 -3.47 -3.65 0.01 -0.83 -1.48
2.41 0.76 1.67 2.02 1.27 -1.46 -2.66 -1.67 -6.46 -7.89 -7.14 -6.08 -7.54 -8.01 -7.48 -4.11 -4.26 0.32 -0.91 -0.75
2.16 1.48 2.46 1.43 0.71 -1.4 -2.02 -2.29 -6.84 - - - -4.16 - -5.5 -3.98 - -0.16 -0.27 -2.44
Gb_01761 (CYCB3;1)
2.27 1.02 1.93 1.65 1.16 -2.78 -1.61 -1.7 -7.85 -5.61 -6.61 -6.31 -6.31 -5.38 -8.31 -3.64 -4.17 0.34 -0.02 -0.53
2.12 1.56 2.1 1.64 1.21 -1.32 -3.94 -2.07 - - - -6.82 - -6.27 -7.13 -5.22 -5.83 0.33 -1.59 -0.69
2.26 1.67 1.85 1.52 0.88 -0.53 -1.81 -2.3 -6.43 -7.24 -6.59 -6.68 -7.03 -6.68 -7.64 -5.63 -6.36 0.31 -1.26 -0.3
2.78 0.42 1.82 1.81 1.21 -2.1 -3.05 -1.81 -4.9 -4.83 -4.91 -5.57 -4.43 -5.46 -3.92 -4.1 -5.6 -0.21 -2.75 -1.17
2.67 1.02 1.81 1.95 0.99 -1.72 -3.21 -2.11 -4.91 -4.42 -4.87 -6.58 -5.89 -6.42 -4.54 -5.96 -5.86 -0.24 -1.95 -1.97
Gb_03404 (TPX2)
2.35 0.85 1.62 1.73 0.93 -0.94 -1.45 -1.21 -4.89 -5.27 -2.61 -4.07 -5.28 -5.05 -3.27 -4.27 -4.38 0.62 -0.29 -0.78
Gb_03506 (CYCB1;4)
2.57 0.96 1.99 1.86 0.82 -1.3 -1.04 -2.3 -9.37 -9.57 -9.82 -6.82 -8.51 -8.2 -9.89 -6.33 -5.83 -0.16 -1.27 -1.64
2.16 1.61 2.21 0.9 0.76 -1.62 -1.78 -1.77 -3.69 -3.63 -3.45 -3.49 -5.16 -6.3 -3.64 -2.85 -3.47 0.41 -0.94 -0.23
Gb_04850 (MAD2)
2.07 1.57 2.25 1.82 0.84 -1.42 -3.21 -1.88 -9.11 -9.35 -10.16 -7.4 -9.87 -8.98 -8.69 -6.46 -8.62 0.08 -1.3 -0.99
Gb_04984 (HTA9)
2.12 1.86 2.54 1.5 0.22 -0.55 -5.37 -2.24 - - - -9.91 - - -8.31 -6.84 -7.01 0.08 -2.49 -4.18
2.4 0.72 1.81 2.26 1.01 -1.61 -3.43 -2.15 -9.34 -8.59 -9.07 -7.49 -9.59 -9.42 -10.76 -4.72 -5.21 0.22 -1.28 -1.02
2.26 1.59 1.89 1.6 0.94 0.12 -3.56 -2.28 -9.39 - - -9.34 -9.76 -9.27 -7.26 -5.96 -6.38 -0.05 -0.37 -1.28
2.37 0.75 1.84 1.98 0.87 -2.33 -0.51 -1.84 -8.42 -9.14 - -7.27 -9.58 -7.02 -7.93 -4.85 -6.26 0.08 -0.33 -0.52
1.92 1.89 2.11 1.57 0.72 -1.65 -2.58 -1.72 -3.67 -4.16 -3.56 -5.25 -7.9 -6.32 -4.12 -5.01 -4.68 0.17 -0.34 -1.06
2.2 0.81 1.58 1.47 0.55 0.13 -0.25 -1.12 -2.23 -2.32 -2.73 -1.72 -1.64 -1.49 -2.92 -2.66 -2.62 -0.37 -0.6 -0.69
Gb_07184 (IMK2)
2.24 0.84 1.85 2.03 0.97 -1.43 -4.25 -1.47 -11.17 -9.81 -8.69 -7.52 -9.63 -9.48 -8.78 -5.57 -6.29 0.7 -0.69 -0.4
1.99 1.29 1.87 1.56 1.11 -0.24 -2.77 -1.68 -3.85 -3.82 -3.98 -4.01 -4.22 -4.06 -4.16 -2.68 -2.37 0.38 -0.78 -0.22
2.26 1.27 1.86 1.55 0.7 -0.55 -2.55 -1.73 -3.63 -4.17 -3.2 -3.85 -3.83 -3.64 -3.11 -2.63 -2.54 0.18 -0.27 -0.74
2.55 0.77 1.71 2.0 0.92 -2.49 -1.92 -1.92 -8.3 -9.42 -9.61 -7.86 -8.76 -7.56 -7.79 -4.44 -5.83 0.11 -0.26 -0.87
Gb_08441 (ORC6)
1.95 1.3 2.44 1.2 0.89 -0.62 -3.77 -1.69 - - - -6.28 - - - -6.7 -5.88 0.48 0.32 -1.28
Gb_10619 (CYCA1;1)
2.17 0.34 1.73 2.04 1.4 -2.17 -3.34 -1.96 -5.63 -5.29 -7.17 -7.23 -9.68 -9.28 -6.39 -3.94 -3.84 0.53 0.27 -0.43
Gb_10664 (CYCB2;3)
2.36 1.2 1.9 2.08 0.74 -2.31 -4.45 -1.74 -3.82 -5.65 -3.64 -7.33 -9.12 -7.38 -3.96 -3.18 -4.86 0.17 -1.47 -0.95
2.19 0.96 1.64 1.65 1.18 -2.24 -1.2 -1.52 -4.0 -4.04 -2.97 -3.44 -3.99 -4.01 -3.15 -2.85 -2.78 0.56 -0.05 -0.58
Gb_11673 (TOPII)
2.5 1.57 1.8 1.85 1.19 -3.02 -4.6 -2.6 -8.9 -9.91 -9.15 -8.02 -11.0 -9.9 -8.94 -5.37 -6.06 -0.28 -1.21 -1.39
2.39 0.94 1.67 1.63 1.08 -1.29 -2.68 -1.36 -4.78 -4.86 -6.42 -5.56 -4.12 -4.51 -6.07 -3.05 -4.3 0.82 -0.89 -0.33
Gb_12824 (TOPII)
2.57 1.56 1.73 1.75 1.01 -1.68 -4.26 -2.57 -6.86 -8.1 -9.6 -8.05 -9.75 -9.46 -7.2 -3.89 -5.34 0.01 -1.38 -1.43
2.31 1.36 1.91 1.47 0.9 -0.66 -1.26 -1.86 -9.06 -8.3 -7.52 -6.23 - -8.89 -7.68 -3.79 -5.08 0.55 -1.04 -0.62
2.31 1.1 1.68 2.15 0.49 -1.88 -1.66 -1.88 -7.13 -7.98 -7.26 -7.32 -7.52 -6.37 -7.51 -5.37 -6.69 0.32 0.19 -0.93
2.62 1.16 1.47 2.25 0.82 -3.46 -4.06 -2.03 -6.65 -7.11 -6.43 -6.66 -7.99 -7.41 -7.15 -4.2 -5.24 -0.02 -1.19 -1.53
2.69 1.1 1.63 2.31 0.46 -1.97 -2.92 -2.2 -8.55 -8.79 -8.0 -7.9 -6.7 -9.37 - -5.96 -6.01 -0.08 -2.21 -2.56
1.86 1.57 1.66 1.83 1.06 -1.51 -2.29 -1.39 -3.37 -3.59 -3.21 -3.57 -2.95 -2.91 -3.42 -3.21 -3.36 0.32 -0.04 -0.92
Gb_18619 (BUBR1)
2.29 1.02 1.64 1.53 0.86 -0.14 -2.04 -1.11 -3.44 -3.68 -3.77 -3.24 -2.13 -2.24 -3.09 -3.02 -3.74 0.31 -0.64 -0.62
Gb_18795 (ICE1)
2.13 0.54 1.73 1.63 0.92 -1.13 -0.91 -1.09 -1.84 -1.84 -1.29 -2.21 -1.47 -2.08 -1.33 -2.67 -2.46 -0.25 -1.24 -0.71
Gb_19775 (UBQ9)
2.48 0.83 1.75 2.27 0.73 -2.15 -2.92 -1.73 -8.01 -7.57 -9.48 -7.71 -9.63 -10.78 - -6.77 -7.27 0.19 -0.63 -1.63
2.3 1.14 1.73 2.04 1.03 -1.74 -4.09 -1.89 -8.67 -8.23 -9.13 -6.94 - -10.43 -9.22 -4.66 -8.54 0.42 -0.76 -0.33
1.98 1.16 1.93 1.64 1.03 -1.09 -1.43 -1.23 -2.82 -2.92 -2.98 -2.8 -3.57 -3.62 -3.07 -3.33 -2.67 0.43 -0.69 -0.92
2.41 1.11 2.41 1.58 1.24 -1.43 -4.37 -2.15 -8.29 - -6.72 -7.01 - - - -6.41 -4.61 -0.31 -2.03 -3.74
2.5 1.61 2.05 0.6 0.81 -0.02 -2.21 -1.99 -4.17 -3.92 - -4.37 -6.44 -4.92 - -3.6 -3.99 -0.05 -0.9 -0.79
Gb_22242 (CHR25)
2.36 0.91 1.89 1.74 1.21 -0.31 -2.16 -1.9 -3.76 -3.02 - -5.12 -4.22 -4.05 -5.44 -3.19 - -0.03 -0.96 -1.43
Gb_23047 (ORC6)
1.95 0.65 2.39 1.68 1.0 -0.18 -3.35 -1.9 -7.75 -8.64 -7.31 -6.06 -7.44 -7.78 -7.49 -5.51 -4.94 0.19 0.2 -1.08
2.48 0.74 1.51 2.4 0.39 -1.83 -3.86 -2.04 - - - -7.97 - - - -6.36 -6.34 0.33 0.2 -1.92
2.85 0.17 1.36 2.23 0.5 -2.05 -4.05 -1.52 -8.14 - - -8.55 -6.94 -5.99 -6.82 -4.9 -3.83 0.09 -0.89 -0.78
2.51 1.12 1.36 1.7 0.9 -0.13 -2.6 -1.79 -3.12 -4.49 -3.15 -3.71 -2.71 -3.15 -4.88 -3.32 -2.54 -0.04 -1.16 -0.5
2.55 0.5 1.36 1.92 1.0 -1.61 -1.77 -1.41 -3.93 -4.14 -3.15 -4.04 -4.37 -4.42 -3.22 -3.79 -3.53 0.35 -0.29 -0.67
Gb_25132 (CDKB2;2)
1.89 1.2 2.11 2.31 0.91 -1.51 -4.26 -1.84 -8.98 -9.69 - -7.83 - -30.21 -8.48 -5.32 -6.82 0.1 -1.06 -0.84
Gb_25136 (CDKB2;2)
1.96 2.02 2.23 -0.24 0.93 -0.98 -5.31 -2.63 -10.96 -8.15 - -7.79 - -7.94 - - -4.05 0.89 0.45 -0.67
Gb_25397 (SOS6)
2.51 0.28 1.46 2.24 0.83 -1.63 -1.28 -1.69 -9.32 -8.38 -7.96 -7.99 -10.25 -9.02 -6.72 -5.03 -4.84 0.51 -0.55 -0.76
Gb_25923 (VPS60.2)
2.48 0.67 2.2 1.16 1.34 -0.58 -2.89 -1.69 -7.02 -7.78 -6.46 -5.43 -7.25 -5.6 -7.13 -5.34 -5.98 0.29 -1.51 -0.62
Gb_25924 (VPS60.2)
2.48 0.1 1.69 1.85 1.22 0.06 -2.91 -1.82 -7.98 -7.92 - -6.94 -6.74 -7.5 - -5.82 -5.27 0.42 -1.09 -0.21
2.51 0.97 1.62 1.8 0.92 -1.24 -1.86 -1.86 -5.8 -6.81 -6.49 -6.64 -6.38 -6.87 -5.5 -4.66 -5.69 0.39 -0.07 -0.95
2.34 0.73 1.63 2.1 0.84 -0.95 -1.86 -1.7 -7.73 -7.66 -8.49 -7.42 - -8.55 -7.79 -4.55 -4.49 0.53 -0.09 -0.97
Gb_26632 (ORC1B)
2.55 0.08 2.07 1.85 0.93 -0.14 -3.41 -2.45 -7.23 -6.46 -7.4 -6.12 -6.55 -5.89 -6.53 -5.36 -4.87 -0.11 -0.76 -0.95
2.48 0.88 1.81 2.12 1.2 -3.37 -4.26 -2.19 -5.21 -5.66 -4.33 -6.17 -5.51 -6.08 -4.39 -4.58 -4.66 -0.11 -1.21 -1.28
Gb_27795 (CYCB1;2)
2.51 0.76 1.7 2.0 0.75 -1.02 -3.93 -1.7 -6.45 -6.65 -7.47 -6.9 -8.16 -6.83 -7.77 -4.64 -4.88 0.46 -0.71 -0.56
2.64 0.8 1.56 2.53 0.22 -2.44 -2.28 -2.33 - - - -6.66 - - - -4.87 - 0.13 -2.27 -2.13
2.35 1.55 1.47 2.15 0.46 0.16 -0.81 -2.42 - - - -7.42 - - -8.43 -7.37 - -0.25 -1.09 -2.25
Gb_30131 (PLE)
2.28 0.9 1.63 1.81 0.78 -2.37 -2.02 -1.72 -2.52 -2.85 -2.11 -3.55 -3.01 -3.54 -2.54 -3.3 -2.72 0.31 -0.09 -0.41
Gb_31857 (EB1C)
2.09 1.67 1.73 1.63 0.71 -1.21 0.17 -2.15 -4.44 -5.64 -5.64 -5.7 -6.93 -6.05 -4.95 -4.35 -4.09 0.12 -0.56 -0.51
2.16 1.82 2.14 1.26 0.7 -0.38 -3.03 -1.95 -6.82 -6.41 -7.28 -5.08 -7.52 -6.6 - -5.67 -7.07 0.03 -0.44 -0.85
1.91 0.94 2.04 1.59 0.94 -2.92 -0.87 -1.55 -3.41 -3.45 -3.58 -4.12 -4.62 -4.68 -3.65 -4.19 -4.25 0.92 -0.46 0.08
Gb_33010 (DRP5A)
2.59 0.89 1.72 1.69 1.16 -1.26 -2.49 -2.01 -7.1 -8.76 -6.9 -7.61 -7.25 -6.21 -5.88 -4.61 -3.51 0.67 -2.4 -0.87
Gb_33015 (DRP5A)
2.6 0.78 1.86 1.92 0.92 -1.75 -3.69 -2.11 -5.91 -5.72 -5.91 -6.29 -6.56 -7.06 -6.62 -3.74 -4.67 0.34 -1.07 -1.38
Gb_33016 (DRP5A)
2.67 -0.18 1.49 2.23 1.41 -1.21 -4.96 -2.27 -7.88 - -7.08 -8.77 -6.64 -7.41 -7.07 -4.7 -5.67 0.22 -2.27 -1.13
2.22 1.21 1.93 1.73 1.0 -2.15 -0.5 -1.43 -2.53 -2.87 -3.2 -3.76 -3.59 -3.49 -3.18 -2.33 -2.62 -0.23 -1.82 -1.68
1.94 1.33 1.68 1.82 1.02 -1.97 -1.74 -1.27 -3.51 -3.98 -3.61 -4.11 -2.85 -3.37 -3.16 -3.85 -3.69 0.7 -0.32 -0.49
2.61 0.5 1.74 2.06 1.22 -2.4 -3.92 -1.81 -9.52 - - -7.2 -11.36 -9.33 -8.8 -5.93 -5.74 0.47 -1.6 -1.65
Gb_38629 (CDKB1;2)
2.32 1.22 2.01 1.81 1.05 -0.65 -3.62 -1.96 -7.7 -7.29 -7.79 -6.19 -6.65 -7.2 -7.48 -5.98 -5.47 0.19 -1.03 -1.43
2.47 1.14 1.72 1.86 0.69 -1.08 -4.61 -1.57 - - - -8.05 - - - -5.0 -4.75 0.63 -0.39 -1.09
Gb_39493 (AGO4)
1.88 1.07 1.66 1.61 0.57 -1.83 -3.89 -1.31 -1.09 -1.55 -1.97 -3.0 -2.37 -1.97 -2.02 0.08 -2.37 0.22 -0.18 -0.74
Gb_39636 (HIK)
2.5 0.94 1.34 2.07 0.89 -1.99 -2.82 -1.86 -6.37 -7.92 -6.87 -7.18 -9.11 -7.85 -6.98 -4.55 -5.77 0.57 -0.3 -0.4
Gb_41072 (PAKRP1L)
2.21 0.75 1.39 1.91 1.06 -0.24 -2.1 -1.47 -3.51 -4.38 -5.95 -4.21 -4.32 -3.68 -5.07 -2.55 -3.85 0.53 0.1 -0.6
2.46 1.08 2.0 1.73 1.11 -1.91 -4.15 -1.72 -9.04 -9.42 -9.66 -7.5 -8.36 -10.05 -7.92 -5.38 -4.97 0.24 -1.22 -0.7

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.