Heatmap: Cluster_32 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
Internodes of Aerial Stem
Leaf Sheath at Stem Node
Root
0.56 0.6 1.0
0.66 0.78 1.0
0.48 0.62 1.0
Ehy_g00540 (AtSec20)
0.5 0.61 1.0
0.56 0.65 1.0
Ehy_g00690 (AR192)
0.72 0.84 1.0
0.48 0.64 1.0
0.78 0.82 1.0
Ehy_g01533 (GCN4)
0.64 0.7 1.0
0.52 0.6 1.0
0.56 0.67 1.0
Ehy_g02270 (ACL5)
0.39 0.49 1.0
0.59 0.8 1.0
0.45 0.65 1.0
Ehy_g02399 (HMT2)
0.47 0.57 1.0
Ehy_g02589 (ZIP11)
0.54 0.55 1.0
0.52 0.7 1.0
0.46 0.62 1.0
0.63 0.7 1.0
Ehy_g03373 (HDA3)
0.45 0.64 1.0
0.44 0.58 1.0
0.27 0.56 1.0
Ehy_g03648 (EIF3G1)
0.47 0.65 1.0
Ehy_g04001 (WNK3)
0.56 0.71 1.0
0.34 0.64 1.0
Ehy_g04274 (MFDX1)
0.51 0.64 1.0
0.57 0.61 1.0
Ehy_g04921 (HOS15)
0.57 0.68 1.0
Ehy_g04954 (EIF3B)
0.62 0.64 1.0
Ehy_g05351 (CSD1)
0.69 0.77 1.0
Ehy_g05398 (RHA3A)
0.27 0.61 1.0
Ehy_g05443 (MBD10)
0.56 0.76 1.0
0.51 0.55 1.0
0.47 0.61 1.0
Ehy_g05762 (MDAR6)
0.53 0.79 1.0
Ehy_g05783 (EDA39)
0.67 0.73 1.0
Ehy_g06018 (GCN1)
0.57 0.62 1.0
0.59 0.73 1.0
0.59 0.68 1.0
Ehy_g06419 (RSZ21)
0.53 0.62 1.0
0.51 0.57 1.0
0.6 0.63 1.0
0.61 0.71 1.0
0.52 0.64 1.0
Ehy_g06617 (RPAC43)
0.46 0.61 1.0
0.65 0.75 1.0
0.39 0.7 1.0
0.45 0.54 1.0
Ehy_g06949 (emb2742)
0.33 0.54 1.0
Ehy_g07118 (emb2734)
0.43 0.66 1.0
0.05 0.51 1.0
Ehy_g07307 (NF-YB3)
0.46 0.48 1.0
0.68 0.75 1.0
Ehy_g07391 (EMB2296)
0.62 0.66 1.0
Ehy_g07574 (EER5)
0.47 0.6 1.0
0.55 0.68 1.0
0.67 0.65 1.0
Ehy_g07960 (BTS)
0.73 0.76 1.0
Ehy_g08188 (RAN2)
0.61 0.76 1.0
Ehy_g08223 (SC35)
0.52 0.59 1.0
0.65 0.77 1.0
Ehy_g08345 (ERF1-3)
0.6 0.62 1.0
0.78 0.87 1.0
0.56 0.53 1.0
0.52 0.7 1.0
Ehy_g09072 (TUB8)
0.65 0.67 1.0
Ehy_g09077 (EIF4A-2)
0.63 0.77 1.0
0.45 0.58 1.0
0.35 0.63 1.0
Ehy_g09990 (AK-HSDH)
0.48 0.66 1.0
0.19 0.39 1.0
Ehy_g10711 (AGL104)
0.44 0.38 1.0
0.6 0.72 1.0
0.36 0.47 1.0
0.58 0.68 1.0
Ehy_g11544 (ADSS)
0.5 0.57 1.0
0.71 0.75 1.0
0.17 0.42 1.0
Ehy_g11983 (NAC3)
0.19 0.28 1.0
0.55 0.71 1.0
0.15 0.29 1.0
0.16 0.42 1.0
0.43 0.56 1.0
0.4 0.6 1.0
0.24 0.42 1.0
0.59 0.72 1.0
0.58 0.62 1.0
0.26 0.44 1.0
Ehy_g13214 (DWA1)
0.66 0.72 1.0
0.3 0.52 1.0
0.48 0.69 1.0
0.55 0.55 1.0
Ehy_g14065 (ALS3)
0.56 0.6 1.0
0.32 0.54 1.0
Ehy_g14904 (PTR2)
0.28 0.54 1.0
Ehy_g14910 (MUR3)
0.14 0.47 1.0
Ehy_g14971 (CDF3)
0.57 0.61 1.0
Ehy_g15351 (TET8)
0.59 0.75 1.0
0.45 0.63 1.0
Ehy_g15515 (SWA1)
0.34 0.62 1.0
0.47 0.58 1.0
0.66 0.7 1.0
0.65 0.8 1.0
Ehy_g16029 (PTB2)
0.54 0.55 1.0
0.48 0.5 1.0
0.57 0.64 1.0
0.46 0.57 1.0
0.64 0.65 1.0
0.41 0.55 1.0
0.58 0.67 1.0
Ehy_g17516 (ATB' GAMMA)
0.52 0.56 1.0
Ehy_g17524 (FLK)
0.47 0.6 1.0
0.6 0.7 1.0
0.46 0.62 1.0
0.58 0.69 1.0
Ehy_g18168 (MED34)
0.41 0.53 1.0
Ehy_g18464 (HISN1A)
0.61 0.76 1.0
Ehy_g18499 (MYB7)
0.23 0.42 1.0
0.39 0.45 1.0
0.38 0.44 1.0
0.55 0.72 1.0
0.72 0.73 1.0
0.59 0.67 1.0
0.02 0.23 1.0
0.08 0.45 1.0
Ehy_g20217 (ACA7)
0.28 0.37 1.0
Ehy_g20392 (ICU2)
0.39 0.66 1.0
0.43 0.48 1.0
Ehy_g20508 (DNMT2)
0.55 0.72 1.0
0.56 0.59 1.0
Ehy_g21653 (ACT7)
0.6 0.68 1.0
0.09 0.42 1.0
0.44 0.51 1.0
0.12 0.16 1.0
0.19 0.41 1.0
0.36 0.54 1.0
0.11 0.13 1.0
Ehy_g23160 (PFL2)
0.77 0.8 1.0
0.48 0.63 1.0
Ehy_g23632 (GSTU20)
0.26 0.53 1.0
0.43 0.74 1.0
0.41 0.61 1.0
Ehy_g24344 (TFL2)
0.37 0.53 1.0
Ehy_g24378 (SPPL1)
0.69 0.71 1.0
0.15 0.42 1.0
0.48 0.7 1.0
Ehy_g25124 (CRCK1)
0.06 0.43 1.0
0.47 0.53 1.0
0.51 0.64 1.0
0.46 0.63 1.0
0.06 0.35 1.0
0.03 0.16 1.0
0.67 0.78 1.0
0.36 0.46 1.0
0.26 0.33 1.0
0.29 0.33 1.0
0.49 0.58 1.0
Ehy_g26908 (WOL)
0.22 0.47 1.0
0.24 0.3 1.0
0.68 0.65 1.0
0.63 0.73 1.0
Ehy_g27511 (SUFE1)
0.44 0.63 1.0
Ehy_g27592 (ORF240B)
0.23 0.32 1.0
0.22 0.3 1.0
0.45 0.66 1.0
0.08 0.29 1.0
0.34 0.52 1.0
0.13 0.28 1.0
Ehy_g29641 (CYP707A2)
0.19 0.45 1.0
0.4 0.6 1.0
0.15 0.32 1.0
Ehy_g30237 (GSTU20)
0.24 0.55 1.0
0.25 0.29 1.0
Ehy_g30896 (GA5)
0.07 0.23 1.0
0.54 0.6 1.0
0.54 0.57 1.0
Ehy_g32144 (ABF1)
0.49 0.6 1.0
0.02 0.2 1.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)