1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_39 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
Internodes of Aerial Stem
Leaf Sheath at Stem Node
Root
Ehy_g00053 (RPS8)
 1.93 2.38 0.26
489.6 427.73 339.65
Ehy_g00187 (NTF2A)
 8.48 16.97 3.89
197.72 157.43 123.31
61.42 49.72 36.23
Ehy_g00805 (HIS1-3)
 48.94 30.22 27.34
15.11 10.64 0.0
22.4 18.83 16.23
112.81 110.81 98.61
17.19 15.82 5.81
20.57 12.51 0.63
Ehy_g02621 (NRAMP6)
 22.5 18.27 10.47
3.21 1.2 1.29
14.91 18.37 4.29
19.45 13.83 0.42
2.77 2.84 1.1
4.93 3.67 1.55
58.59 58.77 0.59
2.33 2.23 0.86
Ehy_g04566 (LRX2)
 37.91 39.44 2.85
1.73 2.94 1.34
13.48 14.25 8.89
10.18 9.59 6.18
Ehy_g05349 (VPS2.1)
 6.62 8.77 6.12
Ehy_g05480 (PR3)
 60.93 54.64 6.02
3.31 2.75 1.47
Ehy_g06838 (NRAMP3)
 22.29 25.13 17.77
5.91 7.7 1.8
3.79 1.62 1.01
Ehy_g07509 (VTC2)
 1.99 1.3 0.81
Ehy_g08086 (CYTC-1)
 282.49 232.88 140.1
Ehy_g08300 (RBCL)
 3.58 4.12 0.17
Ehy_g08831 (CRK8)
 1.76 2.59 0.4
19.93 22.02 3.46
31.43 14.23 10.32
23.6 12.52 2.87
1.84 3.07 0.0
Ehy_g10637 (LHCB2)
 3.81 1.66 0.23
3.17 2.72 0.0
1.37 3.29 0.31
23.26 16.86 0.95
Ehy_g10947 (CHAL)
 2.89 1.13 0.51
2.67 2.37 0.0
2.76 1.93 0.36
Ehy_g11410 (MMZ3)
 29.95 51.05 27.55
2.07 3.13 0.0
1.97 4.35 0.66
59.06 79.75 0.0
3.93 3.89 0.0
2.49 2.88 0.94
13.11 12.91 8.4
6.49 5.0 3.38
Ehy_g13659 (PSAB)
 1.92 2.62 0.56
410.99 410.68 37.03
2.05 1.2 1.08
422.68 371.6 77.41
24.22 15.98 7.12
Ehy_g14736 (MIOX1)
 3.09 1.91 1.11
5.42 8.47 2.5
4.57 3.25 1.59
19.29 13.35 0.17
6.33 15.54 3.49
20.95 20.68 2.71
5.32 3.04 1.64
2.03 3.48 0.72
Ehy_g17300 (CXE17)
 2.06 2.3 0.35
Ehy_g17425 (BAS1)
 24.71 19.5 0.03
7.71 8.59 0.85
Ehy_g18226 (IDD2)
 10.13 9.15 6.95
20.09 15.54 5.72
Ehy_g18430 (HOL3)
 10.94 10.4 7.87
188.68 142.59 24.85
Ehy_g18584 (ENODL3)
 5.21 3.62 0.94
Ehy_g18658 (UGT85A2)
 4.16 3.43 1.46
7.14 8.06 1.49
7.68 9.47 0.0
49.09 44.04 34.32
8.4 6.31 4.47
2.49 2.06 0.49
11.68 5.7 2.73
Ehy_g19579 (GLR3.3)
 3.32 2.25 0.03
3.1 1.94 1.94
4.79 4.69 0.57
6.81 3.3 2.97
Ehy_g20611 (NF-YA10)
 24.06 20.09 16.31
2.86 3.02 0.97
3.41 2.5 1.51
2.21 4.21 1.68
219.0 207.2 17.36
3.63 3.6 1.84
Ehy_g21438 (PAP10)
 21.62 23.19 10.92
Ehy_g21819 (MYB86)
 2.45 1.68 0.0
2.89 2.28 1.25
17.82 10.75 7.66
16.36 16.25 0.66
1.1 1.96 0.14
12.1 14.07 3.04
2.21 3.03 0.58
10.69 7.83 1.62
2.69 1.63 1.67
3.43 1.7 0.95
0.75 2.06 0.16
5.28 4.01 0.59
133.01 118.91 86.22
Ehy_g23840 (IP5PI)
 2.26 1.75 0.0
2.71 3.08 0.57
7.53 7.81 0.3
9.5 8.75 1.43
3.17 3.15 0.26
2.28 1.45 0.0
0.96 1.86 0.07
3.66 3.81 2.22
9.79 9.23 6.3
Ehy_g27290 (COS1)
 15.18 17.15 8.76
7.23 15.9 6.2
Ehy_g27986 (SUM1)
 103.89 103.87 87.81
3.66 4.65 0.98
5.13 4.97 3.46
1557.57 2068.09 633.61
582.13 762.79 123.25
Ehy_g31406 (GPP1)
 5.31 5.89 3.15
2.1 1.55 1.52

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)