Heatmap: Cluster_14 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Internodes of Aerial Stem
Leaf Sheath at Stem Node
Root
2.97 0.0 0.0
20.7 9.78 8.93
Ehy_g01101 (ZIP4)
5.22 0.93 0.96
21.9 3.46 4.65
Ehy_g01385 (DSO)
5.42 0.3 0.7
Ehy_g01472 (TBL11)
13.91 1.9 2.99
43.0 7.44 9.34
Ehy_g02538 (MAN7)
17.94 4.65 8.51
2.46 0.11 0.3
Ehy_g03446 (NAP4)
61.83 26.93 33.59
Ehy_g03635 (FLA17)
218.92 11.57 34.42
Ehy_g03666 (AUD1)
40.75 25.35 28.18
Ehy_g03668 (OFP4)
3.19 0.67 0.86
Ehy_g03724 (FUT12)
12.21 10.66 10.76
Ehy_g03788 (GALK)
19.87 1.85 2.01
17.74 4.83 7.55
Ehy_g03982 (RAT4)
127.92 14.32 43.32
35.12 4.17 12.63
12.92 3.74 6.76
7.03 2.97 3.85
4.14 0.35 1.15
37.18 3.93 4.07
15.31 3.26 1.96
16.51 9.61 9.96
Ehy_g05368 (ERD2B)
20.32 5.62 6.36
19.6 2.9 6.13
121.92 11.77 39.55
18.79 8.52 10.0
8.77 1.71 2.71
Ehy_g05827 (UTR6)
16.6 8.94 9.32
Ehy_g05917 (HSP70)
5.65 1.17 1.01
Ehy_g06081 (SRF6)
46.09 3.38 11.78
4.7 0.27 0.79
2.48 0.12 0.08
4.12 0.91 0.84
Ehy_g06700 (PUB26)
15.38 4.07 5.85
Ehy_g06790 (IQD3)
4.37 1.78 1.92
Ehy_g06867 (GATA9)
8.73 2.33 3.0
16.14 3.41 2.69
141.05 14.66 41.6
Ehy_g07707 (MSS1)
20.48 4.23 3.57
7.51 1.59 1.64
7.63 1.13 1.69
9.62 0.08 0.36
68.2 12.33 15.8
Ehy_g08429 (BON)
10.28 3.43 4.96
Ehy_g08494 (PIN1)
7.95 2.14 2.63
Ehy_g08634 (LOX1)
32.78 6.96 9.59
Ehy_g08663 (OSU1)
3.11 0.63 0.75
Ehy_g08913 (LOF1)
3.54 0.25 0.38
Ehy_g09058 (TBL7)
7.42 2.04 1.64
28.2 3.62 6.53
5.01 1.95 1.92
Ehy_g09962 (DSO)
21.55 1.32 4.45
Ehy_g09977 (BGAL8)
37.66 8.89 6.12
Ehy_g10270 (ANN5)
16.32 4.28 4.69
Ehy_g10634 (GAE2)
82.27 22.79 29.7
6.13 0.0 0.55
Ehy_g11258 (AGD8)
61.76 21.15 25.43
Ehy_g11436 (VTC1)
205.85 7.6 38.89
15.16 4.82 6.09
Ehy_g11684 (ELP)
1869.33 194.21 598.25
2.52 0.0 0.0
24.24 1.77 4.67
24.08 9.1 6.7
4.66 1.56 1.82
5.95 1.39 1.61
Ehy_g13625 (FLA17)
4.65 1.92 2.36
2.8 0.0 0.0
6.73 2.53 2.96
Ehy_g13895 (CP1)
3.41 0.21 0.37
3.22 0.86 1.5
1.91 0.1 0.11
2.99 0.81 0.93
9.39 2.43 2.51
6.7 0.11 2.25
Ehy_g14932 (XTH8)
2.3 0.12 0.12
Ehy_g15385 (RCI2B)
699.81 118.45 160.56
15.33 2.17 3.12
Ehy_g15665 (GAUT13)
25.02 10.31 9.97
5.5 0.02 0.18
23.8 12.16 11.55
4.8 0.95 1.47
3.35 0.12 0.49
6.69 0.35 1.98
5.22 0.27 0.39
7.48 0.16 0.2
5.89 0.25 0.55
Ehy_g18565 (CAT2)
2886.48 1340.14 1161.16
Ehy_g18789 (ALIS1)
3.82 1.06 1.25
Ehy_g18903 (SEC14)
35.33 11.5 16.42
9.05 0.59 2.42
9.23 1.06 0.75
27.21 3.03 5.86
Ehy_g19655 (HOL3)
9.03 2.31 3.29
Ehy_g19782 (LAC11)
18.15 0.82 0.55
39.67 6.03 4.76
14.48 1.91 2.92
25.37 4.44 8.64
281.2 35.07 109.51
Ehy_g22613 (XTR7)
112.27 12.42 13.62
25.26 7.51 6.94
5.93 1.25 2.09
45.84 10.6 7.95
Ehy_g24166 (AGAL2)
190.66 28.41 35.67
50.6 2.04 3.88
2.58 0.49 0.54
44.12 14.58 14.39
34.67 8.38 11.49
Ehy_g28459 (MPK16)
21.11 7.2 9.37
Ehy_g28460 (MPK16)
17.99 5.11 6.55
Ehy_g29738 (LAC17)
10.13 0.0 1.18
4.94 0.07 0.86
2.73 0.14 0.69
11.51 2.56 1.91
15.91 0.39 0.31
28.91 10.07 8.62
11.39 0.29 2.31
Ehy_g32093 (MYB50)
25.4 1.64 4.32

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)