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Heatmap: Cluster_16 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
Internodes of Aerial Stem
Leaf Sheath at Stem Node
Root
0.01 -0.22 0.18
0.02 0.02 -0.04
-0.04 -0.31 0.28
-0.01 -0.04 0.04
0.21 -0.22 -0.01
-0.11 0.19 -0.1
Ehy_g00296 (UBC1)
 0.11 -0.18 0.05
-0.08 -0.02 0.1
0.11 -0.06 -0.06
Ehy_g00588 (ARA7)
 0.24 -0.31 0.02
Ehy_g00989 (CLE41)
 0.15 -0.49 0.23
-0.12 -5.41 1.04
Ehy_g01461 (EDR3)
 0.0 -0.02 0.01
0.09 -0.2 0.09
-0.06 0.1 -0.04
Ehy_g02365 (DIN4)
 0.06 -0.06 0.0
Ehy_g02662 (PK5)
 -0.02 -0.25 0.23
0.06 -0.04 -0.02
0.25 -0.31 0.01
0.16 -0.07 -0.1
0.09 -0.07 -0.02
-0.04 -0.06 0.09
0.06 0.0 -0.07
-0.09 0.13 -0.05
0.01 -0.62 0.42
0.03 -0.13 0.09
-0.11 0.09 0.01
0.17 -0.01 -0.18
-0.03 -0.11 0.13
0.25 -0.18 -0.11
Ehy_g06487 (SUM3)
 -0.03 -0.04 0.07
Ehy_g06733 (PUP1)
 -0.14 -0.66 0.54
0.55 -0.24 -0.55
0.15 -0.44 0.21
-0.07 0.03 0.03
-0.08 -0.2 0.24
0.05 0.02 -0.07
Ehy_g08872 (TL2)
 -0.18 0.34 -0.23
0.16 -0.18 0.0
0.03 -0.24 0.18
Ehy_g09128 (IQD3)
 -0.07 0.14 -0.07
0.16 -0.09 -0.08
Ehy_g09770 (MPK4)
 -0.03 0.01 0.01
Ehy_g09882 (BAM4)
 -0.04 0.13 -0.1
-0.14 0.06 0.07
0.05 -0.07 0.02
0.08 -0.15 0.06
-0.03 0.06 -0.04
0.15 -0.12 -0.04
0.26 0.11 -0.46
0.36 0.17 -0.76
0.24 -0.4 0.09
0.21 -0.2 -0.04
0.02 0.04 -0.06
0.22 -0.42 0.12
0.09 -0.16 0.05
Ehy_g12273 (HTA6)
 0.14 -0.67 0.35
0.02 -0.37 0.28
Ehy_g12619 (POLD4)
 0.07 -0.06 -0.01
-0.02 0.01 0.02
-0.15 0.14 -0.01
0.21 -0.18 -0.06
0.45 -1.02 0.18
-0.09 0.1 -0.01
0.09 -0.05 -0.05
Ehy_g14252 (PAP15)
 0.26 -0.06 -0.25
0.06 -1.07 0.57
-0.29 -0.31 0.46
-0.3 -0.37 0.5
-0.07 0.1 -0.04
0.08 -0.01 -0.07
0.29 -0.12 -0.22
0.09 -0.24 0.13
0.07 -0.22 0.12
Ehy_g17085 (MMZ3)
 0.02 -0.06 0.04
0.2 -0.26 0.03
0.44 0.01 -0.66
Ehy_g17886 (SR30)
 0.03 0.04 -0.08
0.03 -0.19 0.14
-0.07 -0.17 0.21
0.03 -0.19 0.14
0.28 -0.49 0.11
-0.03 0.34 -0.4
0.09 -0.1 0.0
0.17 -0.0 -0.2
0.17 -0.14 -0.06
-0.1 0.48 -0.58
0.0 -0.11 0.1
-0.55 -0.4 0.64
-0.0 -0.05 0.05
Ehy_g20913 (RR17)
 0.31 -0.37 -0.03
0.39 -0.76 0.13
0.14 0.01 -0.16
0.33 -0.08 -0.32
0.24 -0.2 -0.08
-0.04 -0.08 0.12
0.11 -0.05 -0.07
0.53 -0.23 -0.5
0.15 0.02 -0.18
0.03 -0.02 -0.01
-0.1 0.31 -0.27
-0.03 -0.35 0.3
0.06 0.23 -0.35
Ehy_g24005 (CIPK8)
 0.13 -0.07 -0.07
-0.22 0.34 -0.19
0.17 -0.18 -0.01
0.21 -0.81 0.34
Ehy_g24761 (CCT1)
 -0.09 0.14 -0.06
0.13 -0.28 0.12
0.28 -0.35 0.0
-0.25 -3.72 1.06
-0.22 0.26 -0.08
-0.63 0.41 0.03
-0.33 -0.21 0.42
Ehy_g26091 (SAD1)
 -0.0 0.03 -0.03
0.22 -0.43 0.12
0.01 -0.26 0.21
Ehy_g26458 (IBM1)
 -0.56 0.02 0.39
0.16 -0.63 0.3
Ehy_g26622 (SPPL1)
 -0.12 -0.02 0.13
0.13 -0.17 0.02
0.07 0.01 -0.09
-0.16 -0.93 0.66
0.14 -0.79 0.4
-0.35 0.16 0.14
-0.88 -0.07 0.59
0.09 -0.0 -0.09
0.27 -0.64 0.21
0.09 -0.19 0.08
0.0 0.02 -0.03
Ehy_g30517 (SK 11)
 0.73 -0.71 -0.45
0.06 -0.78 0.46
0.22 0.07 -0.36
0.2 -0.09 -0.14
0.17 -0.21 0.01
0.23 -0.21 -0.06
-0.16 0.05 0.1

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.