Heatmap: Cluster_35 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Internodes of Aerial Stem
Leaf Sheath at Stem Node
Root
12.87 12.37 15.92
34.43 35.19 43.91
2.4 3.16 3.93
Ehy_g01296 (KAT2)
118.33 131.22 145.19
Ehy_g01504 (SKB1)
9.88 13.05 18.44
1.59 1.25 2.39
3.06 2.74 4.47
1.83 1.69 2.62
Ehy_g01666 (DDB1A)
5.55 6.19 8.63
61.89 64.77 78.22
12.56 13.49 20.75
4.37 4.79 6.8
5.39 4.67 7.53
8.91 9.86 14.2
Ehy_g02862 (EMB2217)
2.02 2.88 3.77
8.19 9.49 11.77
14.46 14.87 19.82
Ehy_g03655 (TRM11)
2.39 2.71 4.6
Ehy_g03753 (OWL1)
19.29 21.74 27.9
7.65 8.59 11.93
6.94 7.28 11.4
Ehy_g04329 (SEC14)
25.45 31.3 61.85
193.03 198.42 276.75
81.45 144.41 330.5
Ehy_g04734 (SK31)
10.3 11.03 15.09
Ehy_g04743 (RH1)
3.83 3.85 5.46
8.29 8.82 12.16
27.18 30.03 39.77
7.13 7.65 9.42
Ehy_g05120 (UPL1)
10.57 11.47 16.76
Ehy_g05515 (IDH-V)
3.76 3.55 6.88
Ehy_g05541 (TG1)
11.06 11.59 15.69
Ehy_g05990 (AP2)
4.57 3.99 10.61
Ehy_g06009 (OTP84)
1.86 1.82 3.08
3.04 3.49 4.73
3.94 2.9 7.67
27.42 27.4 34.92
23.7 23.27 33.15
Ehy_g07029 (PAB2)
42.61 47.92 74.24
Ehy_g07805 (PAB2)
30.2 32.78 45.45
10.75 11.22 20.61
Ehy_g07865 (CI76)
65.8 74.65 102.82
11.09 12.36 16.67
Ehy_g07914 (HOS1)
4.72 4.9 7.15
16.97 17.69 22.94
7.83 7.96 10.41
Ehy_g07959 (emb1579)
26.39 30.56 52.84
11.52 11.45 18.44
Ehy_g08326 (SNL3)
2.24 2.39 3.22
11.91 14.92 21.91
88.09 93.24 113.87
Ehy_g08537 (TIP1)
6.34 6.94 7.87
Ehy_g08602 (HSS)
13.85 13.41 20.48
2.91 3.64 4.81
4.73 4.31 6.35
Ehy_g09325 (SIK1)
3.81 3.12 8.21
11.96 16.06 23.76
Ehy_g09792 (PTB3)
10.92 11.66 18.06
12.16 13.79 18.47
14.3 13.34 20.73
10.19 13.39 18.54
Ehy_g10341 (TOPP4)
2.12 1.81 3.49
14.55 16.61 26.42
0.89 0.54 2.79
7.3 9.03 11.84
20.14 18.61 32.49
2.69 3.01 18.33
3.8 4.06 5.37
3.86 3.93 6.18
14.45 11.3 22.74
Ehy_g12707 (SBP1)
4.32 4.32 7.05
10.68 12.79 15.36
2.64 2.94 4.04
Ehy_g13641 (LRP1)
4.05 4.42 7.31
6.01 6.72 8.67
2.04 1.64 13.0
0.76 0.41 2.55
1.36 1.81 2.5
4.48 4.1 7.53
Ehy_g15292 (HB-1)
2.65 3.07 3.9
2.17 1.28 5.25
3.71 2.96 6.26
1.51 0.98 3.58
Ehy_g15906 (OTP51)
1.55 1.65 2.69
1.84 1.69 2.43
Ehy_g16157 (emb2734)
18.16 17.3 23.47
Ehy_g16404 (PAT2)
6.32 6.22 9.06
5.27 5.67 7.41
11.6 15.37 20.09
17.26 20.41 29.46
Ehy_g17221 (AE3)
122.03 143.14 170.54
Ehy_g17314 (UVR7)
4.67 4.84 7.02
16.61 18.33 24.17
3.83 4.05 8.01
Ehy_g18047 (NLP7)
3.43 4.05 6.34
Ehy_g18049 (FIPS5)
3.06 3.47 4.6
3.01 3.91 5.01
Ehy_g18387 (CHR5)
7.92 8.54 11.14
Ehy_g19025 (MED8)
5.21 5.41 9.99
Ehy_g19061 (MDH)
36.32 38.49 47.27
8.67 9.87 15.7
4.84 6.77 9.42
2.01 2.41 3.31
Ehy_g19241 (ESP4)
3.64 4.06 6.64
10.02 8.39 16.1
Ehy_g19877 (CAC2)
36.34 50.28 70.5
42.83 48.12 61.44
1.0 1.72 3.08
37.52 42.33 67.27
Ehy_g20667 (UVR1)
5.66 5.13 7.76
Ehy_g21129 (VIIIA)
2.46 2.45 3.7
3.64 2.7 8.07
60.78 69.03 83.68
1.3 1.21 2.4
Ehy_g21450 (HAM3)
4.86 4.46 11.73
4.32 4.51 7.71
15.99 19.36 44.57
Ehy_g21603 (MRP10)
1.14 1.4 3.2
2.47 2.4 4.5
10.26 10.64 12.07
1.37 1.46 2.33
3.5 3.69 4.94
0.31 0.89 6.91
6.42 7.11 8.78
1.12 0.91 2.87
7.16 6.78 13.35
5.61 4.88 10.51
12.52 8.85 20.62
12.43 9.83 23.27
3.9 3.98 5.37
0.44 1.03 2.7
2.04 2.33 3.39
Ehy_g23831 (OTP84)
2.02 2.15 4.29
1.9 2.37 2.87
32.24 41.38 50.81
1.38 1.25 2.6
1.13 1.39 2.28
1.81 1.71 2.86
Ehy_g25712 (HUA2)
3.07 3.89 5.2
29.97 32.42 39.91
8.87 9.45 12.8
Ehy_g26392 (PIN1)
0.52 0.84 3.53
1.16 1.39 2.57
2.24 1.91 5.62
3.33 4.14 5.91
17.5 28.39 40.11
29.52 32.68 46.28
4.69 5.71 16.33
Ehy_g28214 (DRB1)
34.62 37.45 46.52
4.43 4.23 5.96
4.35 3.58 7.46
5.81 5.18 10.59
Ehy_g30945 (CEF)
15.22 15.13 19.54
0.67 0.37 3.02
1.58 1.64 2.56
4.73 6.46 9.62
0.15 0.39 2.34
Ehy_g32163 (SUVR4)
1.96 2.29 3.5

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)