Heatmap: Cluster_63 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Internodes of Aerial Stem
Leaf Sheath at Stem Node
Root
0.51 -1.83 0.37
0.12 -0.43 0.23
Ehy_g00740 (ATG3)
0.28 -0.67 0.21
0.1 -0.23 0.11
0.14 -0.38 0.18
0.24 -0.78 0.3
0.22 -0.48 0.16
Ehy_g01542 (LGT1)
0.11 -0.44 0.25
Ehy_g01712 (GRV2)
0.34 -0.84 0.24
0.4 -0.78 0.14
0.37 -1.54 0.45
0.15 -0.49 0.24
0.1 -0.47 0.27
Ehy_g02603 (CPK28)
0.16 -0.48 0.22
0.15 -0.55 0.28
0.34 -0.92 0.27
Ehy_g03228 (ADF8)
0.23 -0.61 0.23
Ehy_g03235 (ENODL18)
0.27 -0.84 0.31
Ehy_g03566 (D6PKL1)
0.65 -2.2 0.28
0.18 -0.33 0.11
Ehy_g03646 (ENO1)
0.1 -0.77 0.43
Ehy_g03849 (BAC2)
0.08 -0.35 0.21
0.62 -1.81 0.24
Ehy_g04390 (PA2)
0.42 -6.99 0.73
Ehy_g04894 (HMG1)
0.2 -1.25 0.52
Ehy_g04898 (QUA1)
0.41 -1.15 0.29
0.32 -1.62 0.51
Ehy_g05014 (PI4K GAMMA 4)
0.12 -0.48 0.26
0.21 -0.74 0.32
0.25 -0.85 0.33
0.46 -1.44 0.33
Ehy_g05609 (XTR2)
0.65 -5.58 0.49
0.24 -0.38 0.07
0.18 -0.43 0.17
0.52 -2.4 0.46
Ehy_g05773 (BPC6)
0.23 -0.5 0.17
0.18 -0.53 0.24
Ehy_g06014 (MAP65-1)
0.34 -2.25 0.61
Ehy_g06126 (MAP70-4)
0.25 -0.54 0.17
Ehy_g06215 (ZWI)
0.26 -0.99 0.38
0.31 -0.76 0.22
0.41 -1.68 0.44
0.34 -1.01 0.3
0.32 -0.96 0.3
Ehy_g06944 (iqd2)
0.26 -0.91 0.35
0.39 -1.0 0.25
Ehy_g07764 (ZFN1)
0.24 -0.69 0.26
Ehy_g07826 (ATB BETA)
0.21 -0.47 0.16
0.4 -1.03 0.25
Ehy_g08242 (SDF2)
0.17 -0.48 0.21
Ehy_g08421 (LAC17)
0.48 -7.66 0.68
Ehy_g08571 (GAUT9)
0.4 -1.03 0.25
Ehy_g08584 (ATMS1)
0.21 -0.6 0.24
0.23 -0.74 0.3
0.24 -1.39 0.52
0.27 -0.64 0.2
Ehy_g09056 (PUB12)
0.31 -1.37 0.45
0.25 -0.58 0.2
0.2 -5.58 0.87
0.14 -0.32 0.14
0.36 -1.16 0.34
0.33 -0.63 0.14
0.1 -0.46 0.27
0.07 -0.14 0.06
Ehy_g10333 (DHS2)
0.57 -4.37 0.55
0.37 -2.3 0.59
0.22 -0.44 0.13
0.53 -1.85 0.36
0.27 -1.19 0.44
0.14 -0.76 0.39
Ehy_g11282 (UBC10)
0.09 -0.57 0.33
0.3 -1.19 0.41
0.28 -2.49 0.69
Ehy_g12118 (ALA2)
0.14 -0.2 0.04
Ehy_g12561 (CLCF)
0.17 -0.38 0.14
0.38 -1.1 0.3
0.07 -0.4 0.25
Ehy_g13203 (ACA7)
0.22 -6.14 0.87
0.64 -2.05 0.26
0.61 -5.7 0.54
0.43 -1.23 0.3
Ehy_g13492 (SPL12)
0.18 -0.79 0.37
0.35 -1.04 0.31
Ehy_g14071 (THA1)
0.22 -0.76 0.32
0.61 -1.59 0.19
Ehy_g15156 (GAE2)
0.29 -0.72 0.23
0.33 -1.21 0.39
Ehy_g15895 (NFA3)
0.32 -1.16 0.39
0.26 -0.84 0.31
Ehy_g17212 (RGP)
0.18 -0.48 0.2
0.1 -0.55 0.32
0.34 - 0.8
0.19 -0.49 0.2
0.32 -0.72 0.2
Ehy_g18309 (IBR5)
0.1 -0.24 0.11
Ehy_g18636 (AP2)
0.29 -0.8 0.27
Ehy_g19909 (DRIP2)
0.11 -0.54 0.3
0.29 -0.53 0.12
0.31 -1.07 0.36
Ehy_g21442 (PI4K GAMMA 4)
0.21 -0.67 0.28
Ehy_g21567 (HK3)
0.23 -1.01 0.41
0.12 -0.7 0.38
0.25 -1.27 0.48
0.16 -0.34 0.13
0.13 -0.38 0.18
0.13 -0.41 0.2
Ehy_g24072 (TLP10)
0.19 -0.46 0.18
0.53 -1.25 0.19
Ehy_g24548 (ML5)
0.16 -0.37 0.15
Ehy_g24834 (IRE1-1)
0.19 -0.42 0.15
0.35 -1.16 0.35
0.32 -1.67 0.53
0.15 -1.18 0.53
0.22 -0.99 0.42
0.2 -1.43 0.57
0.37 -0.61 0.08
0.36 -1.89 0.53
0.42 - 0.73
Ehy_g31657 (PA2)
0.53 -6.44 0.63
0.35 -1.65 0.5

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.